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Desarrollo de una metodología no invasiva basada en espectroscopía infrarroja, para la detección del potencial reproductivo de embriones previo a su transferencia en tratamientos de fertilización asistida
Entre los mayores desafíos de la investigación actual en Fertilización Asistida se encuentran el mejoramiento de la tasa de embarazo y la disminución de los embarazos múltiples. La gran dificultad que existe para estimar el potencial de implantación embrionaria lleva en la práctica a implementar la transferencia de más de un embrión.
Desarrollar un nuevo método que incremente la eficacia de la selección embrionaria permitiría aumentar la tasa de embarazo disminuyendo embarazos múltiples. En la última década, han surgido una serie de tecnologías alternativas no invasivas para estimar el potencial de implantación de embriones empleando técnicas “OMICAS” (transcriptómica, genómica, perfiles proteómicos y metabolómicos). Los métodos más frecuentemente empleados en el estudio de las OMICAS de los sistemas biológicos son las cromatográficas, espectroscópicas, espectrométricas de última generación. El análisis de muestras biológicas mediante espectroscopía infrarroja con transformada de Fourier (FTIR) proporciona información de la composición química y estructural de las mismas.
Esta información cuando es procesada mediante el uso de sistemas estadísticos multivariantes resulta esencial para el diagnóstico de enfermedades, caracterización y discriminación de células. El objetivo de esta investigación fue aplicar FTIR para desarrollar una nueva estrategia no invasiva que permita determinar, con mayor precisión que los métodos actualmente en uso, el potencial de implantación de embriones obtenidos en procedimientos de fertilización asistida.
El estudio se realizó en el marco de un trial clínico sobre una base de 224 parejas de las cuales se obtuvieron de 1 a 10 embriones mediante cultivos in vitro. Los datos clínicos de los pacientes, la información asociada a los embriones, los datos inherentes a la transferencia y la evolución del embarazo fueron registrados en una base de datos OpenClinica (http://OpenClinica/pages/login). Luego de 3 días de incubación el sobrenadante de cultivo de cada embrión fue transferido a una celda de ZnSe (apropiada para la lectura de espectros FTIR). Luego de registrados los espectros en el rango 4000 - 650 cm-1, con 6 cm-1 de resolución, los mismos fueron pre-procesados (test de calidad espectral, técnicas de aumento de resolución, derivadas primera o segunda y normalización vectorial) y evaluados por diferentes técnicas quemométricas supervisadas y no supervisadas.
El estudio realizado por un grupo multidisciplinario de médicos, biólogos, bioquímicos, estadísticos e informáticos permitió el desarrolló un modelo basado en redes neuronales artificiales que permite predecir el potencial de implantación de embriones previo a su transferencia en un tratamiento de fertilización (66% de sensibilidad, 85% de especificidad y 81% de exactitud). La nueva metodología de diagnóstico desarrollada resulta no invasiva, rápida, simple, confiable y se independiza de interpretaciones subjetivas del operador. Asimismo, a través de la aplicación de método multivariantes no supervisados como Análisis de Componente Principal y Análisis Factorial hemos demostrado que si bien la metabolómica embrionaria juega un rol fundamental en la implantación, ésta constituye un fenómeno multifactorial, alguno de los factores que podrían estar influenciando los ciclos de fertilización incluyen la edad de la madre, tabaquismo, el índice de masa corporal. Esta investigación constituyó un aporte significativo en el área de fertilización asistida donde la conclusión no exitosa de un ciclo genera graves consecuencias en los pacientes.Facultad de Ciencias Exacta
Analytical techniques for deoxynivalenol detection and quantification in wheat destined for the manufacture of commercial products
The concern regarding toxicity from the presence of deoxynivalenol (DON) in wheat that affects both economy and public health leads to the need to find appropriate detection methods for determining the degree of DON contamination in terms of the equipment available and the speed required for obtaining the incidence. The objective of this study was to compare the performance of two alternative analytical techniques for DON quantification for use in the food industry with a reference technique. Samples of wheat and the commercial by-products were analysed by high-performance liquid chromatography (HPLC) with an ultraviolet detector as the reference method and the results compared with those obtained from a rapid lateral-flow immunochromatographic device (Reveal Q+) and of a Fourier-transform-infrared (FTIR) spectroscopy technique. Pearson’s correlation coefficient between the HPLC and Reveal-Q+ data (0.45), although significant (P<0.0003), was lower than that obtained between HPLC and the FTIR method (0.94, P<0.0001). Both methods were considered efficient in quantifying DON levels in wheat-flour samples. This study was aimed at assisting the producers in choosing an appropriate tool for the purpose of analysis and upon consideration of the available equipment.Facultad de Ciencias ExactasCentro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales (CINDEFI
Characterization of <i>Fusarium graminearum</i> isolates recovered from wheat samples from Argentina by Fourier transform infrared spectroscopy: phenotypic diversity and detection of specific markers of aggressiveness
Fusarium graminearum is the primary causal agent of Fusarium head blight of wheat in Argentina. This disease affects crop yields and grain quality also reducing the wheat end-use, and causing mycotoxin contamination.
The aim of this work was to analyze the phenotypic characteristics associated with phenotypic diversity and aggressiveness of 34 F. graminearum sensu stricto isolates recovered from Argentinean fields in the 2008 growing season using the Fourier Transform Infrared (FTIR) dried film technology. We applied this technique also to search for spectral specific markers associatedwith aggressiveness. The combination of FTIR technologywith hierarchical cluster analysis allowed us to determine that this population constitutes a highly diverse and heterogeneous group of fungi with significant phenotypic variance. Still, when the spectral features of a set of these isolates were compared against their aggressiveness, as measured by disease severity, thousand grains weight, and relative yield reduction, we found that the more aggressive isolates were richer in lipid content. Therefore, we could define several spectroscopic markers (> C — H stretching modes in the 3000–2800 window, > C=O and — C — O vibrational modes of esters at 1765–1707 cm−1 and 1474–900 cm−1, respectively),, mostly assigned to lipid content that could be associated with F. graminearum aggressiveness. All together, by the application of FTIR techniques and simple multivariate analyses, it was possible to gain significant insights into the phenotypic characterization of F. graminearum local isolates, and to establish the existence of a direct relationship between lipid content and fungal aggressiveness. Considering that lipids have a major role as mediators in the interaction between plants and fungi our results could represent an attractive outcome in the study of Fusarium pathogenesis.Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriale
Regreso a la presencialidad: ¿qué aprendizajes nos dejó la pandemia para el desarrollo de nuestro curso?
Durante la pandemia el cambio a la virtualidad nos atravesó como materia y provocó el desarrollo de innovaciones en pos de adaptarnos a la nueva realidad. En el regreso a la presencialidad en el año 2022 nos propusimos, a partir de la experiencia ganada, implementar las estrategias desarrolladas durante la pandemia y renovar la antigua forma de dictado de la materia pre-pandemia. El presente trabajo busca evaluar el papel de las herramientas educativas desarrolladas durante la pandemia y estudiar su influencia en el desarrollo de las actividades académicas en relación al dictado presencial de la materia Ingeniería Bioquímica I. El equipo docente decidió mantener gran parte de las herramientas y actividades virtuales que debimos desarrollar para dar continuidad a la enseñanza durante los cursos realizados en etapas de aislamiento. Se analizó la aceptación de las herramientas y actividades propuestas mediante dos metodologías: evaluando el número de visualizaciones a cada actividad en el aula virtual y mediante una encuesta de opinión a los estudiantes. Mediante estas dos metodologías, pudimos observar que la mayoría de las propuestas tuvo una amplia aceptación por parte de los estudiantes. Por otro lado, las actividades con menor aceptación en su mayoría corresponden a actividades no obligatorias que fueron presentadas al final del curso.Especialización en Docencia UniversitariaFacultad de Ciencias Exacta
Evaluación diagnóstica como herramienta para la mejora continua de la materia de grado Ingeniería Bioquímica I
Con el objetivo de llevar una mejora continua en la enseñanza de la materia, Ingeniería Bioquímica I, perteneciente a la carrera de Ingeniería Química de la UNLP, realizamos durante dos años consecutivos una encuesta a los alumnos de la materia, para establecer, cómo podíamos mejorar algunos aspectos relevantes de la materia. El análisis de las encuestas, en ambos años, nos llevó a realizar cambios en contenidos y en la forma de dictar la materia, tendientes a adecuar la enseñanza al receptor de la misma, es decir al alumno. En estos dos años de experiencia, analizando los resultados obtenidos a partir de los cambios implementados, pudimos constatar que hemos logrado resolver algunas cuestiones, mientras que otras, como es lógico, quedaron como temas pendientes a encarar en el corto plazo. El camino de la docencia es arduo y no tiene fin, pero es sumamente necesario transitarlo tratando de mantenerse actualizados con la realidad que nos rodea y con las hipótesis que nos debemos plantear teniendo en cuenta nuestra concepción del futuro. Esto para nosotros es válido tanto para los docentes que pertenecemos a la cátedra, como para los alumnos que transitan nuestras aulas. Este trabajo nos permitió poner en evidencia la construcción colectiva del conocimiento, donde tanto los docentes como los alumnos somos parte, como protagonistas, transitando un viaje que nos permitiera modificar en forma continua nuestra labor de docentes universitarios.Secretaría de Asuntos Académico
Analytical techniques for deoxynivalenol detection and quantification in wheat destined for the manufacture of commercial products
The concern regarding toxicity from the presence of deoxynivalenol (DON) in wheat that affects both economy and public health leads to the need to find appropriate detection methods for determining the degree of DON contamination in terms of the equipment available and the speed required for obtaining the incidence. The objective of this study was to compare the performance of two alternative analytical techniques for DON quantification for use in the food industry with a reference technique. Samples of wheat and the commercial by-products were analysed by high-performance liquid chromatography (HPLC) with an ultraviolet detector as the reference method and the results compared with those obtained from a rapid lateral-flow immunochromatographic device (Reveal Q+) and of a Fourier-transform-infrared (FTIR) spectroscopy technique. Pearson’s correlation coefficient between the HPLC and Reveal-Q+ data (0.45), although significant (P<0.0003), was lower than that obtained between HPLC and the FTIR method (0.94, P<0.0001). Both methods were considered efficient in quantifying DON levels in wheat-flour samples. This study was aimed at assisting the producers in choosing an appropriate tool for the purpose of analysis and upon consideration of the available equipment.Facultad de Ciencias ExactasCentro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales (CINDEFI
Prácticas docentes en tiempos de pandemia : La experiencia de la cátedra Ingeniería Bioquímica I durante el año 2020
En el presente artículo deseamos contar nuestra experiencia de adaptación del dictado de Ingeniería Bioquímica I durante el 2020, así como evaluar los aspectos más relevantes de las prácticas docentes en tiempos de pandemia.Facultad de Ingenierí
Biotransformation of grape pomace from <i>Vitis labrusca</i> by <i>Peniophora albobadia</i> LPSC # 285 (Basidiomycota)
Grape pomace from Vitis labrusca is an important sub-product of the "American table wine" industry. It is recalcitrant to degradation, and its accumulation is a serious problem with negative environmental impacts. We analyzed the ability of five white-rot fungi to transform this residue in-vitro. Mass loss and phenol removal in grape pomace treated with each fungus were compared after 30-day solid-state fermentation. Since Peniophora albobadia isolate LPSC 285 was the fungus that showed the highest degradative ability and the lowest free phenol levels in the residue transformed, we selected this fungus to monitor its effect on this residue after 30, 60, and 90 days of incubation. We analyzed mass loss of the residue caused by the fungus activity and its chemical changes using Fourier transform infrared spectroscopy. After 90 days of incubation, Peniophora albobadia isolate LPSC 285 reduced grape pomace mass by 20.48%, which was associated with degradation of polysaccharides and aromatic structures. We concluded that Peniophora albobadia LPSC # 285 isolate is a promising fungus to transform grape pomace from Vitis labrusca under solid-state fermentation conditions.Facultad de Ciencias Agrarias y ForestalesCentro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones IndustrialesCentro de Investigaciones en FitopatologíaInstituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y AplicadasFacultad de IngenieríaInstituto de Fisiología VegetalInstituto de Botánica "Dr. Carlos Spegazzini
Cystic fibrosis cloud database: An information system for storage and management of clinical and microbiological data of cystic fibrosis patients
Este artículo tiene como objetivo principal estudiar las formas burlescas en el poema épico Argentina y conquista del Río de la Plata, de Martín del Barco Centenera. En primer lugar, se abordará el concepto «tradiciones discursivas» que permitirá un encuadre más amplio del texto. Luego, se comentará la presencia de la heteroglosia en la construcción del poema, la que se ejemplificará en el uso de anécdotas y de tres recursos humorísticos: la ironía dramática y la sátira, vinculadas con cierta retórica del infortunio, y el grotesco. Estas características se unen al estilo didáctico presente en el poema, todo lo cual produce un texto que aporta innovaciones a la propia tradición.The epidemiological and clinical management of cystic fibrosis (CF) patients suffering from acute pulmonary exacerbations or chronic lung infections demands continuous up dating of medical and microbiological processes associated with the constant evolution of pathogens during host colonization. In order to monitor the dynamics of these processes, it is essential to have expert systems capable of storing and subsequently extracting the information generated from different studies of the patients and microorganisms isolated from them. In this work we have designed and developed an on-line database based on an information system that allows to store, manage and visualize data from clinical studies and microbiological analysis of bacteria obtained from the respiratory tract of patients suffering from cysticfibrosis. The information system, named Cystic Fibrosis Cloud database is available on the http://servoy.infocomsa.com/cfc database site and is composed of a main database and a web-based interface, which uses Servoy’s product architecture based on Java technology. Although the CFC database system can be implemented as a local program for private use in CF centers, it can also be used, updated and shared by different users who can access the stored information in a systematic, practical and safe manner. The implementation of the CFC database could have a significant impact on the monitoring of respiratory infections, the prevention of exacerbations, the detection of emerging organisms, and the adequacy of control strategies forlung infections in CF patients.Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriale
Fortalecimiento de las capacidades de diagnóstico e investigación del Laboratorio de Salud Pública de Ciencias Exactas (UNLP) integrado a la Red de Diagnóstico SARS-Cov2 de la Provincia de Buenos Aires
En el marco de la pandemia declarada en 2020 se gestan diversos grupos de trabajo e investigación en la Facultad de Ciencias Exactas de la UNLP. En esta videopresentación se relatan las experiencias de algunos de ellos, vinculados a la temática del COVID-19.Facultad de Ciencias Exacta