Excess tuberculosis risk during and following incarceration in Paraguay : a retrospective cohort study

Corresponding author. Cátedra de Salud Pública, Universidad Nacional de Asunción (UNA), Paraguay. E-mail address: [email protected] (G. Sequera).Background. The increased risk of tuberculosis (TB) among people deprived of liberty (PDL) is due to individual and institution-level factors. We followed a cohort of PDL from 5 prisons in Paraguay to describe the risk of TB during incarceration and after they were released. Methods. We linked a 2013 national census of prisons with TB records from the TB Program from 2010 to 2021 to identify TB notifications among incarcerated and formerly incarcerated individuals. We used multivariable Cox regression models to quantify the risk of TB during and following incarceration and to identify risk factors associated with TB. Findings. Among 2996 individuals incarcerated, 451 (15.1%) were diagnosed with TB. Of these, 262 (58.1%) cases occurred during incarceration and 189 (41.9%) occurred in the community after release. In prison, the hazard ratio of developing TB was 1.97 (95% CI: 1.52–2.61) after six months of incarceration and increased to 2.78 (95% CI: 1.82–4.24) after 36 months compared with the first six months. The overall TB notification rate was 2940 per 100,000 person-years. This rate increased with the duration of incarceration from 1335 per 100,000 person-years in the first year to 8455 per 100,000 person-years after 8 years. Among former prisoners, the rate of TB decreased from 1717 in the first year after release to 593 per 100 000 person-years after 8 years of follow up. Interpretation. Our study shows the alarming risk of TB associated with prison environments in Paraguay, and how this risk persists for years following incarceration. Effective TB control measures to protect the health of people during and following incarceration are urgently needed.Consejo Nacional de Ciencia y TecnologíaPrograma Paraguayo para el Desarrollo de la Ciencia y Tecnología. Proyectos de investigación y desarroll

Attitudes towards the COVID-19 vaccine in the general paraguayan population

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Novel genes and sex differences in COVID-19 severity

[EN] Here, we describe the results of a genome-wide study conducted in 11 939 coronavirus disease 2019 (COVID-19) positive cases with an extensive clinical information that were recruited from 34 hospitals across Spain (SCOURGE consortium). In sex-disaggregated genome-wide association studies for COVID-19 hospitalization, genome-wide significance (P < 5 × 10−8) was crossed for variants in 3p21.31 and 21q22.11 loci only among males (P = 1.3 × 10−22 and P = 8.1 × 10−12, respectively), and for variants in 9q21.32 near TLE1 only among females (P = 4.4 × 10−8). In a second phase, results were combined with an independent Spanish cohort (1598 COVID-19 cases and 1068 population controls), revealing in the overall analysis two novel risk loci in 9p13.3 and 19q13.12, with fine-mapping prioritized variants functionally associated with AQP3 (P = 2.7 × 10−8) and ARHGAP33 (P = 1.3 × 10−8), respectively. The meta-analysis of both phases with four European studies stratified by sex from the Host Genetics Initiative (HGI) confirmed the association of the 3p21.31 and 21q22.11 loci predominantly in males and replicated a recently reported variant in 11p13 (ELF5, P = 4.1 × 10−8). Six of the COVID-19 HGI discovered loci were replicated and an HGI-based genetic risk score predicted the severity strata in SCOURGE. We also found more SNP-heritability and larger heritability differences by age (<60 or ≥60 years) among males than among females. Parallel genome-wide screening of inbreeding depression in SCOURGE also showed an effect of homozygosity in COVID-19 hospitalization and severity and this effect was stronger among older males. In summary, new candidate genes for COVID-19 severity and evidence supporting genetic disparities among sexes are provided.S

Clonal chromosomal mosaicism and loss of chromosome Y in elderly men increase vulnerability for SARS-CoV-2

The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2, COVID-19) had an estimated overall case fatality ratio of 1.38% (pre-vaccination), being 53% higher in males and increasing exponentially with age. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, we found 133 cases (1.42%) with detectable clonal mosaicism for chromosome alterations (mCA) and 226 males (5.08%) with acquired loss of chromosome Y (LOY). Individuals with clonal mosaic events (mCA and/or LOY) showed a 54% increase in the risk of COVID-19 lethality. LOY is associated with transcriptomic biomarkers of immune dysfunction, pro-coagulation activity and cardiovascular risk. Interferon-induced genes involved in the initial immune response to SARS-CoV-2 are also down-regulated in LOY. Thus, mCA and LOY underlie at least part of the sex-biased severity and mortality of COVID-19 in aging patients. Given its potential therapeutic and prognostic relevance, evaluation of clonal mosaicism should be implemented as biomarker of COVID-19 severity in elderly people. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, individuals with clonal mosaic events (clonal mosaicism for chromosome alterations and/or loss of chromosome Y) showed an increased risk of COVID-19 lethality

Sobrepeso, obesidad e ingesta de líquidos en niños y adolescentes en Capital, Central y Caaguazu, 2016

Introducción: En niños y adolescentes de países latinoamericanos la tendencia en el aumento de obesidad es alarmante, esta población tiene una alta probabilidad de padecer a edades más tempranas, enfermedades no transmisibles. Objetivo: Determinar la prevalencia de sobrepeso, obesidad e ingesta de líquidos en niños y adolescentes de Capital, Central y Caaguazú durante el año 2016. Material y Métodos: Estudio Observacional, descriptivo, de corte transversal, con muestreo probabilístico estratificado, en niños y adolescentes de Capital, Central y Caaguazu, durante el 2016. Se realizaron 3 recordatorios de ingesta de líquidos en las 24 horas anteriores a la entrevista y determinación de las medidas antropométricas en las instituciones educativas de los departamentos. Los datos se expresan en medidas de tendencia central (Media) y dispersión (Desvío Estándar). Resultados: Participaron del estudio 2279 niños y adolescentes de Capital, Central y Caaguazu, de los cuales el 51,2% (1166) fue del sexo femenino, y el 54,9% (1245) tenía una edad comprendida entre 10 a 14 años. El 18,6% y 26,8% presentaron obesidad y sobrepeso respectivamente. El sobrepeso en las edades de 7 a 9, 10 a 14 y 15 y más años fue de 25,3%, 19,1% y 5,8% respectivamente (p<0,05). El volumen de ingesta diaria de agua, infusiones, jugos naturales y líquidos carbonatados se incrementa con la edad (p<0,05), en cambio el volumen de ingesta diaria de leche disminuye con la edad (p<0,05). Conclusión: La proporción de niños y adolescentes con sobrepeso y obesidad en de Capital, Central, y Caaguazu fue elevada, se ha visto una disminución en la proporción de sobrepeso a mayor edad, el incremento en el promedio del volumen diario ingerido de leche disminuye con la edad, en cambio se incrementa el de líquidos carbonatados.   Correspondencia: Gabriela Sanabria Correo: [email protected] Conflicto de Interés: Los autores declaran no poseer conflicto de interés Financiación: El proyecto de investigación fue financiado por el Programa Paraguayo para el Desarrollo de la Ciencia y Tecnología (PROCIENCIA) del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT). Recibido: 13/06/2018 Aceptado: 31/08/201

Prevalencia de anemia en niños de 1 a 4 años de edad en Asunción y Central. Paraguay 2017

Introducción: Los niños constituyen el grupo más afectado por la anemia. En Paraguay no existen datos actualizados sobre prevalencia de anemia en menores de 5 años. Objetivos: Determinar la prevalencia de anemia en niños previamente sanos de 1 a 4 años que acuden a consultorios de servicios de salud y guarderías de Asunción y Central de Paraguay, durante el año 2017. Materiales y Métodos: Estudio prospectivo, de corte transverso, observacional, descriptivo. Muestreo aleatorio, estratificado. Nivel de confianza: 95% Error de muestra: 5%. Variables: edad, sexo, hemoglobina, índices hematimétricos, ferritina, Proteína C reactiva (PCR), albúmina, zPeso/Edad, zPeso/Talla, zTalla/Edad, peso al nacer. Fueron analizadas medidas paramétricas y no paramétricas, χ2. La anemia se definió por criterios OMS para el grupo de 1 a 5 años de edad: Hemoglobina Hb<11 g/dL y Volumen Corpuscular Medio VCM< 72 fL Se utilizó el Programa Anthro v 3.2.2 y SPSS 16.0. Aprobado por Comité de Ética del Instituto de Medicina Tropical, se obtuvo consentimiento informado. Nivel de significancia<0,05. Resultados: Fueron reclutados 806 pacientes. Se determinó Hb, VCM y ferritina en 706 pacientes.327 (46,3%) fueron varones. El promedio de Hb fue 11,9±1,03 g/dL. Volumen corpuscular medio promedio 71,2±26 fL. Se encontraron 83/706 pacientes con anemia (11,8%), 44/83 (53%) fueron microcíticas (VMC<72 fL). PCR negativa 640/706 (90,7%) pacientes. El promedio de albuminemia fue 4,5±0,2 g/dL. El promedio de z Peso/Edad fue 0,29±1,33, z Peso/Talla -0,38±1,52 y el z Talla/Edad fue 0,92±1,64. Ferritina < 12µg/L fue del 17,6 %. No se encontró relación entre el peso al nacer y la anemia [p=0,11. RR: 1,45 (0,6- 2,3)]. La prevalencia de anemia en el grupo de 12 a 23 meses fue del 39 % vs el 6,9 % en preescolares (χ2 p<0,05). Conclusiones: La prevalencia de anemia en lactantes de Asunción y Central constituye un problema de salud pública. Conflicto de interés: Los autores declaran no poseer conflicto de interés. Financiamiento: Este proyecto fue financiado por el CONACYT a través del Programa PROCIENCIA con recursos del Fondo para la Excelencia de la Educación en Investigación FEEI. Recibido: 19/04/2021 Aceptado: 18/06/202

Perfil de utilización de antibióticos en hospitales de tercer y cuarto nivel de atención de tres departamentos de Paraguay, 2017 = Profile of antibiotic use in hospitals of third and fourth level of care of three departments of Paraguay, 2017

El objetivo del trabajo fue determinar el perfil de utilización de antibióticos en hospitales de tercer y cuarto nivel de atención de tres departamentos de Paraguay durante el 2017.CONACYT – Consejo Nacional de Ciencia y TecnologíaPROCIENCI

Phylogeography and transmission of Mycobacterium tuberculosis spanning prisons and surrounding communities in Paraguay

To role that carceral institutions play in Mycobacterium tuberculosis transmission remains somewhat unknown. Authors perform a prospective genomic surveillance study, to assess transmission dynamics in prisons and surrounding communities in Paraguay

Manifestaciones clínicas de la fiebre por Chikunguña en población adulta: un breve estudio descriptivo realizado en Caaguazú, Paraguay

Introducción. la infección por el virus del Chikunguña (CHIKV) se presenta típicamente como una enfermedad febril aguda que es autolimitada y se caracteriza predominantemente por poliartralgia y mialgias graves. Objetivo. el propósito de este estudio fue describir las características clínicas de la infección aguda por el virus del Chikunguña en una población adulta. Materiales y Método. este fue un estudio observacional, descriptivo y transversal. La población de estudio incluyó adultos de una región específica de Paraguay durante la epidemia de CHIKV en 2022-2023. Los criterios de inclusión abarcaron a todos los pacientes que se presentaron el Hospital Regional dentro de los cinco días posteriores al desarrollo de síntomas típicos de CHIKV, confirmados por RT-PCR, y tras excluir dengue y Zika. Resultados. se incluyeron un total de 803 adultos, con una edad media de 45,13 ± 18.63 años y una proporción de género masculino/femenino de 1:1.79. En las semanas epidemiológicas 8, 10 y 11 se documentaron 78, 120 y 132 casos, respectivamente. Las manifestaciones clínicas más comunes fueron fiebre en el 97% de los casos (n=583), artralgia y artritis en el 86,03% (n=653), mialgias en el 77,08% (n=585) y cefalea en el 73,91% (n=561). Hubo 6 muertes (0,75% del total de casos). Conclusión. la presentación clínica de CHIKV durante la epidemia 2023 en Paraguay es consistente con descripciones previas en otras regiones. La enfermedad generó un número significativo de consultas médicas y llevó a la saturación del sistema de salud pública, siendo fatal en un pequeño porcentaje de casos

Genomic epidemiology reveals how restriction measures shaped the SARS-CoV-2 epidemic in Brazil

Abstract Brazil has experienced some of the highest numbers of COVID-19 infections and deaths globally and made Latin America a pandemic epicenter from May 2021. Although SARS-CoV-2 established sustained transmission in Brazil early in the pandemic, important gaps remain in our understanding of local virus transmission dynamics. Here, we describe the genomic epidemiology of SARS-CoV-2 using near-full genomes sampled from 27 Brazilian states and an adjacent country - Paraguay. We show that the early stage of the pandemic in Brazil was characterised by the co-circulation of multiple viral lineages, linked to multiple importations predominantly from Europe, and subsequently characterized by large local transmission clusters. As the epidemic progressed, the absence of effective restriction measures led to the local emergence and international spread of Variants of Concern (VOC) and under monitoring (VUM), including the Gamma (P.1) and Zeta (P.2) variants. In addition, we provide a preliminary genomic overview of the epidemic in Paraguay, showing evidence of importation from Brazil. These data reinforce the need for the implementation of widespread genomic surveillance in South America as a toolkit for pandemic monitoring and providing a means to follow the real-time spread of emerging SARS-CoV-2 variants with possible implications for public health and immunization strategies