High relative expression of two genes of a melon near-isogenic line versus its parental during ripening

[SPA] Con el fin de comparar la expresión génica de una línea casi isogénica (NIL) SC10-2 de melón y su Piel de Sapo (PS) parental durante la maduración y para comprender los mecanismos de diferenciación, se realizó una secuenciación de transcriptoma. Los genes CmTCP15 (Factor de actividad de transcripción) y CmGDSL (actividad de la esterasa y la lipasa) tenían una alta expresión diferencial en el NIL SC10-2 en comparación con el PS debido a la introgresión en LG X. En consecuencia, algunos atributos de calidad de fruto como el aroma, dulzura y, probablemente otros pueden estar afectados por tales genes. [ENG] In order to compare the gene expression of a melon Near-isogenic Line (NIL) SC10-2 and its parental Piel de Sapo (PS) during ripening and to understand the differentiate mechanisms, a transcriptome sequencing was performed. CmTCP15 (Transcription factor activity) and CmGDSL (Esterase and lipase activity) genes were high differentially expressed in the NIL SC10-2 compared with PS due to the introgression in LG X. Consequently, some fruit quality traits such as aroma, sweetness and probably others can be affected by such genes.Financial support: Fundación Séneca de la Región de Murcia (11784/PI/09), MINECO & UE-FEDER funds (AGL2010-20858). Thanks for the technical assistance to P. Varó and his team in CIFEA-Torre Pacheco (Consejería de Agricultura, Región de Murcia), N. Dos-Santos, E. Cuadros, M. García-Gutiérrez, A. Hakmaoui (UPCT), M.J. Roca (SAIT-UPCT), and IRTA-CRAG for the seeds of the NIL

Gene expression and volatile production during melon ripening

[SPA] Se realizó una secuenciación de transcriptoma para analizar los genes implicados en la formación de aromas expresados durante la maduración y para comprender los mecanismos moleculares que diferencian una línea casi isogénica (NIL) SC10-2 de melón y su parental Piel de Sapo (PS). El gen CmLOX18 (similar a la lipoxigenasa 4) se expresó diferencialmente comparando la NIL SC10-2 y PS y se asoció a la producción de hexanal, un compuesto diana e indicador del proceso de maduración no climatérica. La expresión del gen de la CmACO1 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 1) implicado en la biosíntesis de etileno no manifestó diferencias durante la maduración. La introgresión en LG X estuvo asociada a la diferente producción de hexanal entre la NIL y PS. Se propone un eQTL en el LG X que controla la producción de aromas del gen CmLOX18 localizado en LG I. [ENG] Transcriptome sequencing was performed in order to analyze the genes associated to volatile synthesis expressed during ripening and to understand the molecular mechanisms that differentiate a melon Near-isogenic Line (NIL) SC10-2 and its parental Piel de Sapo (PS). CmLOX18 gene (Similar to Lipoxygenase 18) was differentially expressed in the NIL SC10-2 compared with PS associated with the aroma volatile compound hexanal as a target compound of the non-climacteric ripening. The expression of CmACO1 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase 1) gene associated with ethylene biosynthesis did not change during ripening. The introgression in LG X was associated with the differential hexanal production of the NIL and PS. An eQTL located in LG X is probably controlling the production of aroma volatiles due to CmLOX18 in LG I.Financial support: Fundación Séneca de la Región de Murcia (11784/PI/09), MINECO & UE-FEDER funds (AGL2010-20858). Thanks for the technical assistance to P. Varó and his team in CIFEA-Torre Pacheco (Consejería de Agricultura, Región de Murcia), N. Dos-Santos, E. Cuadros, M. García-Gutiérrez, A. Hakmaoui (UPCT), M.J. Roca (SAIT-UPCT), and IRTA-CRAG for the seeds of the NIL

Lower relative differential expression of two genes is associated with delayed ripening in melon

[SPA] Con el fin de comparar la expresión génica de un melón cerca de la línea isogénica (NIL) SC10-2 y su parental Piel de Sapo (PS) durante la maduración y para comprender los mecanismos de diferenciación, se realizó una secuenciación transcriptoma. Dos genes de CmGGP (GDP-L-galactosa fosforilasa 1) y CmRAP2-11 (factor de transcripción sensible al etileno RAP2-11) mostraron menor expresión relativa en la NIL SC10 -2 versus PS debido a la introgresión en LG X. Sin embargo, no existieron diferencias en expresión de CmAP2-like X1 (factor de transcripción sensible al etileno, similar a AP2 TOE3 isoforma X1). En consecuencia, la expresión de genes que mapearon en el grupo de ligamiento X como un factor de transcripción de respuesta a etileno o del metabolismo del ácido ascórbico estuvieron probablemente asociados con el retraso de maduración. [ENG] The expression of selected genes during ripening was studied considering a melon Near-isogenic Line (NIL) SC10-2 and its parental “Piel de Sapo” (PS). The expression of CmGGP (GDP-L-galactose phosphorylase 1), CmAP2-like X1 (AP2-like ethylene-responsive transcription factor TOE3 isoform X1) and CmRAP2-11 (ethylene-responsive transcription factor RAP2-11) were differentially expressed in the NIL SC10-2 compared with PS. Consequently, expression of genes that mapped in LG X such as one ethylene response transcription factors or ascorbic acid metabolism gene were probably associated with delayed ripening.Financial support: Fundación Séneca de la Región de Murcia (11784/PI/09), MINECO & UE-FEDER funds (AGL2010-20858). Thanks for the technical assistance to P. Varó and his team in CIFEA-Torre Pacheco (Consejería de Agricultura, Región de Murcia) for crop management and IRTA-CRAG for the seeds of the NIL

Transcriptomic analysis of a near-isogenic line of melon with high fruit flesh firmness during ripening

BACKGROUND. A near-isogenic line (NIL) of melon (SC10-2) with introgression in linkage group X was studied from harvest (at firm-ripe stage of maturity) until day 18 of postharvest storage at 20.5 °C together with its parental control (‘Piel de Sapo’, PS). RESULTS. SC10-2 showed higher flesh firmness and whole fruit hardness but lower juiciness than its parental. SC10-2 showed a decrease in respiration rate accompanied by a decrease in ethylene production during ripening, both of which fell to a greater extent than in PS. The introgression affected 11 volatile organic compounds (VOCs), the levels of which during ripening were generally higher in SC10-2 than in PS. Transcriptomic analysis from RNA-Seq revealed differentially expressed genes (DEGs) associated with the effects studied. For example, 909 DEGs were exclusive to the introgression, and only 23 DEGs were exclusive to postharvest ripening time. Major functions of the DEGs associated with introgression or ripening time were identified by cluster analysis. About 37 genes directly and/or indirectly affected the delay in ripening of SC10-2 compared with PS in general and, more particularly, the physiological and quality traits measured and, probably, the differential non-climacteric response. Of the former genes, we studied in more detail at least five that mapped in the introgression in linkage group (LG) X, and 32 outside it. CONCLUSION. There is an apparent control of textural changes, VOCs and fruit ripening by an expression quantitative trait locus located in LG X together with a direct control on them due to genes presented in the introgression (CmTrpD, CmNADH1, CmTCP15, CmGDSL esterase/lipase, and CmHK4-like) and CmNAC18.This work was funded by grants 11784/PI/09 (Seneca Foundation, Region of Murcia) and Ministry of Economy and Innovation (AGL2010-20858)

Genotipado, análisis fenótípico y transcriptómico de accesiones seleccionadas de Vicia faba, Pisum sativum y Vigna unguiculata

Las legumbres son el segundo cultivo con mayor producción mundial después de los cereales, por lo que su importancia para consumo animal y humano es crucial. El haba (Vicia faba), el guisante (Pisum sativum) y el caupí (Vigna unguiculata) son especies de leguminosas con interés agronómico en la Unión Europea. La selección de variedades de estas especies, mediante técnicas de genotipado, fenotipado y transcriptómica, permitirá la obtención de líneas de mejora con cualidades nutricionales (p.ej. alto contenido en proteínas) y agronómicas (resistencia a estrés abiótico y biótico) óptimas para una producción sostenible y competitiva de proteínas en Europa.Al proyecto EUROLEGUME por financiar este proyecto de tesis doctoral

Universidad, género, docencia e igualdad

La Red de investigación en docencia universitaria “Universidad, docencia, genero e igualdad” persigue avanzar en la calidad e innovación de las enseñanzas universitarias a partir de la inclusión de la perspectiva de género. Se busca dar cumplimiento a las directrices generales de los nuevos planes de estudio respecto del principio de igualdad de oportunidades entre hombres y mujeres en la formación universitaria (Real Decreto 1393/2007. BOE nº 260, 30 de octubre de 2007). En la cuarta edición de la Red, y dada su composición multidisciplinar, se desarrollaron tres líneas de investigación: 1) mantenimiento del “Portal web con recursos docentes con perspectiva de género”, proyecto financiado por el Instituto de la Mujer (PACUI, 2012) e iniciado en el curso 2012-2013; 2) desarrollo (primera versión) de “iLengUA”, una herramienta informática para un discurso inclusivo e igualitario; y 3) diseño de la Guía para una orientación universitaria inclusiva

Red “Universidad, género, docencia e igualdad”

La Red de investigación en docencia universitaria “Universidad, docencia, genero e igualdad” persigue avanzar en la calidad e innovación de las enseñanzas universitarias a partir de la inclusión de la perspectiva de género. Se busca dar cumplimiento a las directrices generales de los nuevos planes de estudio respecto del principio de igualdad de oportunidades entre hombres y mujeres en la formación universitaria (Real Decreto 1393/2007. BOE nº 260, 30 de octubre de 2007). En la quinta edición de la Red, y dada su composición multidisciplinar, se ha trabajado en tres líneas de investigación: 1) mantenimiento del “Portal web con recursos docentes con perspectiva de género”, proyecto financiado por el Instituto de la Mujer (PACUI, 2012) e iniciado en el curso 2012-2013; 2) desarrollo de la primera versión de “iLengUA”, una herramienta informática para un discurso inclusivo e igualitario; y 3) diseño de una Guía de recomendaciones para la inclusión de la perspectiva de género en la docencia universitaria

Cuidemos del Garbancillo de Tallante : guía didáctica sobre la conservación Astragalus nitidiflorus en su hábitat potencial en la Región de Murcia

Astragalus nitidiflorus, el Garbancillo de Tallante, es una planta que vive exclusivamente al oeste del Campo de Cartagena y que tiene una historia fascinante para la Botánica. Después de haber estado desaparecida durante casi 100 años, en 2004 fue redescubierta para formar parte de la identidad de las poblaciones de Tallante y Los Puertos de Santa Bárbara. Esta guía forma parte del material educativo dirigido a alumnos de educación primaria en el marco de la acción E1 del Proyecto LIFE11 BIO/ES/727 “Conservación de Astragalus nitidiflorus en su hábitat potencial en la Región de Murcia".Programa LIFE+ Biodiversit

Universidad, género, docencia e igualdad

La Red de investigación en docencia universitaria “Universidad, docencia, genero e igualdad” persigue avanzar en la calidad e innovación de las enseñanzas universitarias a partir de la inclusión de la perspectiva de género. Se busca dar cumplimiento a las directrices generales de los nuevos planes de estudio respecto del principio de igualdad de oportunidades entre hombres y mujeres en la formación universitaria (Real Decreto 1393/2007. BOE nº 260, 30 de octubre de 2007). En la cuarta edición de la Red, y dada su composición multidisciplinar, se desarrollaron tres líneas de investigación: 1) mantenimiento del “Portal web con recursos docentes con perspectiva de género”, proyecto financiado por el Instituto de la Mujer (PACUI, 2012) e iniciado en el curso 2012-2013; 2) desarrollo (primera versión) de “iLengUA”, una herramienta informática para un discurso inclusivo e igualitario; y 3) diseño de la Guía para una orientación universitaria inclusiva

Red “Universidad, género, docencia e igualdad”

La Red de investigación en docencia universitaria “Universidad, docencia, género e igualdad” persigue avanzar en la calidad e innovación de las enseñanzas universitarias a partir de la inclusión de la perspectiva de género. Se busca dar cumplimiento a las directrices generales de los nuevos planes de estudio respecto del principio de igualdad de oportunidades entre hombres y mujeres en la formación universitaria (Real Decreto 1393/2007. BOE nº 260, 30 de octubre de 2007). En la sexta edición de la Red, y dada su composición multidisciplinar, se ha trabajado en cuatro líneas de investigación: 1) mantenimiento del “Portal web con recursos docentes con perspectiva de género”, proyecto financiado por el Instituto de la Mujer (PACUI, 2012) e iniciado en el curso 2012-2013; 2) diseño de una Guía de recomendaciones para la inclusión de la perspectiva de género en la docencia universitaria;3) elaboración de una lista de auto-chequeo de verificación de inclusión de la perspectiva de género en la docencia universitaria y 4) diseño de una Guía para la orientación universitaria inclusiva