High relative expression of two genes of a melon near-isogenic line versus its parental during ripening

Abstract

[SPA] Con el fin de comparar la expresión génica de una línea casi isogénica (NIL) SC10-2 de melón y su Piel de Sapo (PS) parental durante la maduración y para comprender los mecanismos de diferenciación, se realizó una secuenciación de transcriptoma. Los genes CmTCP15 (Factor de actividad de transcripción) y CmGDSL (actividad de la esterasa y la lipasa) tenían una alta expresión diferencial en el NIL SC10-2 en comparación con el PS debido a la introgresión en LG X. En consecuencia, algunos atributos de calidad de fruto como el aroma, dulzura y, probablemente otros pueden estar afectados por tales genes. [ENG] In order to compare the gene expression of a melon Near-isogenic Line (NIL) SC10-2 and its parental Piel de Sapo (PS) during ripening and to understand the differentiate mechanisms, a transcriptome sequencing was performed. CmTCP15 (Transcription factor activity) and CmGDSL (Esterase and lipase activity) genes were high differentially expressed in the NIL SC10-2 compared with PS due to the introgression in LG X. Consequently, some fruit quality traits such as aroma, sweetness and probably others can be affected by such genes.Financial support: Fundación Séneca de la Región de Murcia (11784/PI/09), MINECO & UE-FEDER funds (AGL2010-20858). Thanks for the technical assistance to P. Varó and his team in CIFEA-Torre Pacheco (Consejería de Agricultura, Región de Murcia), N. Dos-Santos, E. Cuadros, M. García-Gutiérrez, A. Hakmaoui (UPCT), M.J. Roca (SAIT-UPCT), and IRTA-CRAG for the seeds of the NIL

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