Student Fieldwork Training in St Petersburg (2006

Zgodnie z umową o współpracy zawartą pomiędzy Uniwersytetem Łódzkim i Rosyjskim Państwowym Hydrometeorologicznym Uniwersytetem w Sankt Petersburgu, w dniach od 3 do 15 lipca 2006 r. studenci III roku geografii turyzmu i hotelarstwa wzięli udział w specjalizacyjnych ćwiczeniach terenowych w Federacji Rosyjskiej. Grupa składała się z pięciu studentów i dwóch pracowników Katedry Geografii Miast i Turyzmu. Ćwiczenia odbyły się już po raz czwarty, ponieważ współpraca naukowo- dydaktyczna obu uczelni rozpoczęła się w 2002 r., a coroczna wymiana studentów to jeden z jej ważniejszych elementów

Seed dispersal in six species of terrestrial orchids in Biebrza National Park (NE Poland)

Knowledge about seed dispersal is required to explain problems in ecology, phylogeography, and conservation biology. Even though seed dispersal is a fundamental mechanism to understand problems at different levels of biological organization (individual, population, species, landscape), it remains one of the least recognized processes. Similar to other groups of plants, very little is known regarding patterns and distances of seed dispersal in orchids. Orchid seeds are generally assumed to be widely dispersed by wind because of their small size and low weight. Between 2006 and 2008, we conducted a field study of the distances at which orchid seeds are dispersed, and determined factors affecting dispersal. Investigations included 13 populations of six terrestrial orchid species – Cypripedium calceolus, Cephalanthera rubra, Epipactis helleborine, Goodyera repens, Neottia ovata, and Platanthera bifolia. To evaluate seed dispersal in orchid populations, 8.5-cm Petri dishes (traps) with self-adhesive paper were placed along transects, starting from a group of fruiting plants, which were considered to be the dispersal source. Seeds of the investigated orchid species were dispersed over relatively short distances. There were statistically significant negative correlations between seed density and distance from the fruiting plants. Seeds of species with taller fruiting shoots were dispersed farther than those with shorter ones (R = 0.68, p < 0.05). We discuss the causes and consequences of the dispersal patterns of orchid seeds

Impact of clinical phenotypes on management and outcomes in European atrial fibrillation patients: a report from the ESC-EHRA EURObservational Research Programme in AF (EORP-AF) General Long-Term Registry

Background: Epidemiological studies in atrial fibrillation (AF) illustrate that clinical complexity increase the risk of major adverse outcomes. We aimed to describe European AF patients\u2019 clinical phenotypes and analyse the differential clinical course. Methods: We performed a hierarchical cluster analysis based on Ward\u2019s Method and Squared Euclidean Distance using 22 clinical binary variables, identifying the optimal number of clusters. We investigated differences in clinical management, use of healthcare resources and outcomes in a cohort of European AF patients from a Europe-wide observational registry. Results: A total of 9363 were available for this analysis. We identified three clusters: Cluster 1 (n = 3634; 38.8%) characterized by older patients and prevalent non-cardiac comorbidities; Cluster 2 (n = 2774; 29.6%) characterized by younger patients with low prevalence of comorbidities; Cluster 3 (n = 2955;31.6%) characterized by patients\u2019 prevalent cardiovascular risk factors/comorbidities. Over a mean follow-up of 22.5 months, Cluster 3 had the highest rate of cardiovascular events, all-cause death, and the composite outcome (combining the previous two) compared to Cluster 1 and Cluster 2 (all P &lt;.001). An adjusted Cox regression showed that compared to Cluster 2, Cluster 3 (hazard ratio (HR) 2.87, 95% confidence interval (CI) 2.27\u20133.62; HR 3.42, 95%CI 2.72\u20134.31; HR 2.79, 95%CI 2.32\u20133.35), and Cluster 1 (HR 1.88, 95%CI 1.48\u20132.38; HR 2.50, 95%CI 1.98\u20133.15; HR 2.09, 95%CI 1.74\u20132.51) reported a higher risk for the three outcomes respectively. Conclusions: In European AF patients, three main clusters were identified, differentiated by differential presence of comorbidities. Both non-cardiac and cardiac comorbidities clusters were found to be associated with an increased risk of major adverse outcomes

BID protein fused with TAT cassette as a factor sensitizing cancer cells to anticancer drugs

Jedną z głównych przyczyn zgonów, zarówno w Polsce jak i na świecie, są nowotwory złośliwe. Problemem jest nie tylko stosunkowo wysoka zapadalność na choroby nowotworowe, ale także trudności terapeutyczne, wynikające m.in. z często obserwowanej oporności komórek nowotworowych na dostępne metody leczenia, w tym na leki przeciwnowotworowe. Komórki nowotworowe wykazują oporność na wiele leków cytostatycznych, zwykle na skutek silnej supresji apoptozy. Powszechnym źródłem supresji apoptozy jest spadek tzw. „funkcjonalnego poziomu” białek apoptotycznych, tzn. obniżenie efektywnego stężenia tych białek poniżej krytycznego minimum, niezbędnego dla uruchomienia apoptozy. Głównymi przyczynami takiego spadku są: (i) obniżenie ekspresji białek apoptotycznych; (ii) zwiększenie poziomu białkowych inhibitorów apoptozy, które dezaktywują białka apoptotyczne, oraz (iii) fosforylacja białek apoptotycznych, która uniemożliwia przekazywanie sygnału i ostatecznie zapobiega apoptozie w komórkach nowotworowych. Celem prezentowanej rozprawy doktorskiej było znalezienie sposobu zniesienia supresji apoptozy w komórkach nowotworowych i uwrażliwienie ich na działanie znanych leków przeciwnowotworowych. Uzyskane wyniki koncentrują się wokół dwóch głównych nurtów badań. W pierwszym podejściu wykazano, że przeciwdziałanie supresji apoptozy poprzez stosowanie inhibitorów kinazy białkowej CK2, podejrzewanej o dezaktywującą fosforylację białek apoptotycznych, obarczone jest ryzykiem. Jest to konsekwencją plejotropowych skutków wyeliminowania aktywności kinazy CK2 w komórkach nowotworowych. Co więcej, efekt działania inhibitora ściśle zależy od sekwencji jego podania w kombinacji z lekami przeciwnowotworowymi. Drugie podejście polegało na wprowadzeniu do wnętrza komórek nowotworowych rekombinowanego białka BID w fuzji z peptydem penetrującym komórki TAT, umożliwiającym swobodne przenikanie białka przez błonę komórkową (fuzyjne białko TAT-BID). Podejście to pozwoliło na dokonanie następujących obserwacji: 1. Białko TAT-BID wnika do komórek w sposób zależny od stężenia, czasu inkubacji oraz typu komórek nowotworowych, co pozwala na dostarczanie komórkom jego kontrolowanych ilości. 2. Białko TAT-BID samo nie indukuje apoptozy w komórkach nowotworowych i charakteryzuje się bardzo niską cytotoksycznością. 3. Białko TAT-BID uczula pewne linie komórek nowotworowych na działanie znanych leków przeciwnowotworowych, nawet jeśli wyjściowo były one na nie oporne, tym samym umożliwia obniżenie dawek stosowanych leków. 4. Dla niektórych linii komórkowych (PC3) i pewnych leków (doksorubicyna) ilość funkcjonalnego białka BID w komórce jest krytyczna dla indukcji apoptozy. 5. Dostarczone białko TAT-BID jest zaangażowane w komórkach PC3 w ścieżkę mitochondrialną szlaku indukcji apoptozy. 6. Fosforylacja białka BID przez kinazę CK2 nie jest mechanizmem odpowiedzialnym za wywołanie supresji apoptozy w komórkach badanych linii. Niniejsza praca doktorska posiada zarówno znaczenie podstawowe, jak i aplikacyjne. Z jednej strony umożliwia weryfikację mechanizmu apoptozy w niektórych komórkach nowotworowych (PC3). Z drugiej zaś pokazuje zdolność białka TAT-BID do uczulania niektórych linii komórek nowotworowych na leki przeciwnowotworowe, co stwarza potencjalną możliwość terapeutycznego wykorzystania tego białka, np. w stosunku do nowotworów, z których wyprowadzono komórki linii PC3, A549 i HeLa. W trakcie wykonywania prezentowanego projektu doktorskiego uzyskałam finansowanie ze środków Uniwersytetu Warszawskiego w postaci 3 grantów BW, którymi kierowałam (BW 501/86-1000030, BW 501/86-102341, DSM 501-86-104913). Otrzymałam także środki pochodzące z Projektu „Doktoraty dla Mazowsza II”. Wyniki stanowiące niniejszą rozprawę doktorską zostały opublikowane jako 3 oryginalne prace naukowe w czasopismach z listy filadelfijskiej (jedna praca w BMC Cancer, dwie prace w Oncology Reports), a także były prezentowane na 4 zjazdach międzynarodowych. Wyniki te wchodzą także w skład dwóch zgłoszeń patentowych (polskiego nr P.406626 i międzynarodowego nr PCT/IB2014/067117). Prezentowane jako wynalazek, wyniki zostały nagrodzone srebrnym medalem na międzynarodowych targach wynalazków „Ideas-Inventions-New Products” iENA 2014 w Norymberdze. Cancer is one of the main causes of death, both in Poland as well as in the world. The relatively high morbidity of cancer diseases is not the only problem faced by clinicians but also therapeutic difficulties, resulting from comparatively frequently observed resistance of cancer cells to available cancer treatments, including anticancer drugs. Cancer cells are resistant for many cytostatic drugs, mainly due to a strong suppression of apoptosis. A common reason for the suppression of apoptosis is decrease of the “functional dose” of proapoptotic proteins below the critical minimum which is essential to launch apoptosis. The main reasons of the decrease are: (i) lowered expression of proapoptotic proteins; (ii) increased level of inhibitors of apoptotic proteins (IAPs) which deactivate apoptotic proteins and (iii) phosphorylation of apoptotic proteins which prevents them from participating in signal transmission during apoptosis and as a result inhibits apoptosis in cancer cells. The aim of the study was to find a way to abolish the suppression of apoptosis in cancer cells and sensitize them to well-known anticancer drugs. Obtained results are focused on two main streams. According to the first approach it was proved that counteraction of suppression of apoptosis by CK2 protein kinase inhibitors usage (it is believed that phosphorylation by CK2 kinase can deactivate apoptotic proteins) is risky. Inhibition of CK2 activity results in pleiotropic consequences in cancer cells. Moreover, the effect of inhibitor strongly depends on the time-schedule of combination with anticancer drugs. Second approach was based on the direct delivery of recombinant BID protein fused with cell penetrating peptide TAT (TAT-BID), which allows to cross the plasma membrane. Due to the direct delivery of TAT-BID into the cells, it is was possible to observe that: 1. TAT-BID protein penetrate cancer cells in time-, concentration- and cell type-dependent manner. It makes possible to introduce strictly controlled amounts of the protein into the cell. 2. TAT-BID does not induce apoptosis in cancer cells and has very low cytotoxicity. 3. TAT-BID sensitize some of the cancer cell lines to well-known anticancer drugs even if initial resistance to them was observed. Moreover, this approach allows to reduce the dose of applied anticancer drugs, and as a consequence leads to lowered side effects resulting from the therapy. 4. For some cancer cell lines (PC3) and some anticancer drugs (doxorubicin) the amount of BID protein inside the cell is critical for induction of apoptosis. 5. Delivered TAT-BID protein is engaged in mitochondrial pathway of apoptosis in PC3 cells. 6. Phosphorylation of BID protein by CK2 protein kinase is not the main mechanism responsible for the suppression of apoptosis in tested cancer cell lines. Presented PhD dissertation possesses both, basic and applicable potential. On the one hand this work verifies the mechanism of apoptosis in some cancer cells (PC3). On the second hand it shows the possibility of sensitization some of the cancer cells to anticancer drugs, and opens up this way the opportunity to use it therapeutically, for example in the case of tumors which were a source of PC3, A549 and HeLa cells. The presented PhD project was supported by following sources of funding: three intramural grants from the donation of Ministry of Science and Higher Education for University of Warsaw (BW 501/86-1000030, BW 501/86-102341, DSM 501-86-104913), in which I was the manager. I also received funding from “Doktoraty dla Mazowsza II” project. Results that are the basis of this PhD dissertation were not only published as 3 original articles in journals from ISI Master Journal list (one paper in BMC Cancer, two papers in Oncology Reports) but they were also presented during four international congresses. These results also constitute the basis of two patent applications (Polish no. P.406626 and International no. PCT/IB2014/067117). Moreover, these results were awarded as an invention during International Trade Fair „Ideas-Inventions-New Products” iENA

Sonic Hedgehog and WNT Signaling Regulate a Positive Feedback Loop Between Intestinal Epithelial and Stromal Cells to Promote Epithelial RegenerationSummary

Background and aims: Active intestinal stem cells are prone to injury by ionizing radiation. We previously showed that upon radiation-induced injury, normally quiescent reserve intestinal stem cells (rISCs) (marked by BMI1) are activated by Musashi-1 (MSI1) and exit from the quiescent state to regenerate the intestinal epithelium. This study aims to further establish the mechanism that regulates activation of Bmi1-CreER;Rosa26eYFP (Bmi1-CreER) rISCs following γ radiation–induced injury. Methods: Bmi1-CreER mice were treated with tamoxifen to initiate lineage tracing of BMI1 (eYFP+) cells and exposed to 12 Gy of total body γ irradiation or sham. Intestinal tissues were collected and analyzed by immunofluorescence, Western blot, reverse-transcription quantitative polymerase chain reaction, enzyme-linked immunosorbent assay, and chromatin immunoprecipitation real-time polymerase chain reaction. Results: After irradiation, increased expression of Msi1 in eYFP+ cells was accompanied by increased expression of Axin2, a WNT marker. Promoter studies of the Msi1 gene indicated that Msi1 is a WNT target gene. Coculture of stromal cells isolated from irradiated mice stimulated Bmi1-CreER–derived organoid regeneration more effectively than those from sham mice. Expression of WNT ligands, including Wnt2b, Wnt4, Wnt5a, and Rspo3, was increased in irradiated stromal cells compared with sham-treated stromal cells. Moreover, expression of the Sonic hedgehog (SHH) effector Gli1 was increased in stromal cells from irradiated mice. This was correlated with an increased expression of SHH in epithelial cells postirradiation, indicating epithelial-stromal interaction. Finally, preinjury treatment with SHH inhibitor cyclopamine significantly reduced intestinal epithelial regeneration and Msi1 expression postirradiation. Conclusions: Upon ionizing radiation-induced injury, intestinal epithelial cells increase SHH secretion, stimulating stromal cells to secrete WNT ligands. WNT activators induce Msi1 expression in the Bmi1-CreER cells. This stromal-epithelial interaction leads to Bmi1-CreER rISCs induction and epithelial regeneration

SP and KLF Transcription Factors in Cancer Metabolism

Tumor development and progression depend on reprogramming of signaling pathways that regulate cell metabolism. Alterations to various metabolic pathways such as glycolysis, oxidative phosphorylation, lipid metabolism, and hexosamine biosynthesis pathway are crucial to sustain increased redox, bioenergetic, and biosynthesis demands of a tumor cell. Transcription factors (oncogenes and tumor suppressors) play crucial roles in modulating these alterations, and their functions are tethered to major metabolic pathways under homeostatic conditions and disease initiation and advancement. Specificity proteins (SPs) and Kr&uuml;ppel-like factors (KLFs) are closely related transcription factors characterized by three highly conserved zinc fingers domains that interact with DNA. Studies have demonstrated that SP and KLF transcription factors are expressed in various tissues and regulate diverse processes such as proliferation, differentiation, apoptosis, inflammation, and tumorigenesis. This review highlights the role of SP and KLF transcription factors in the metabolism of various cancers and their impact on tumorigenesis. A better understanding of the role and underlying mechanisms governing the metabolic changes during tumorigenesis could provide new therapeutic opportunities for cancer treatment

Przeszczep mikrobioty kałowej - analiza doniesień naukowych, rola pielęgniarki

Introduction and objective: Presentation of the subject of fecal microbiota transplantation including the role of a nurse. Review methods: Presentation of the subject of fecal microbiota transplantation including the role of a nurse. Material and methods: A non-systematic review of the literature on the subject of intestinal microflora transplantation was carried out in the available databases: PubMed, Scopus, Web of Science, Google Scholar, EBSCO, ARIANTA. The following keywords were taken into account: microbiota, fecal microbiota transplantation, Clostridium difficile, pseudomembranous enteritis, inflammatory bowel disease. 21 original and review works were qualified: 6 in Polish and 15 in English. An abbreviated description of the state of knowledge: Fecal microbiota transplantation (FMT) involves introducing into the body of a sick recipient a fecal suspension from a healthy donor. The rate of therapeutic success depends on the main disease entity, appropriate selection of the donor of the fecal suspension. The donor should be tested for the presence of numerous pathogens, determining their type and their quality. FMT is recommended when pharmacotherapy ceases to be effective, it is also an adjunctive treatment in the treatment of many dysbiotic diseases. Summary Fecal microbiota transplantation is indicated in severe pseudomembranous enteritis in patients with Clostridium difficile infection. In the experimental phase, there are new indications for the use of FTM, for example, Parkinson's disease, Alzheimer's disease, but it is contraindicated in irritable bowel syndrome. The role of the nurse is limited to preparing the patient, assisting during the procedure, postoperative care, and educating the patient.Wprowadzenie i cel: Przedstawienie tematyki przeszczepu mikrobioty kałowej, ze szczególnym uwzględnieniem roli pielęgniarki. Metody przeglądu: Przeprowadzono niestystematyczny przegląd piśmiennictwa dotyczącego tematyki przeszczepu mikroflory jelitowej w dostępnych bazach danych: PubMed, Scopus, Web of Science, Google scholar, EBSCO, ARIANTA, pod względem następujących słów kluczowych: mikrobiota, przeszczep mikrobioty jelitowej, Clostridium difficile, rzekomobłoniaste zapalenie jelit, choroba zapalna jelit. Zakwalifikowano 21 prac o charakterze prac oryginalnych i przeglądowych: 6 w języku polskim oraz 15 w języku angielskim. Opis stanu wiedzy: Przeszczep mikrobioty kałowej (FTM) polega na wprowadzeniu do organizmu chorego biorcy zawiesiny kałowej pochodzącej od zdrowego dawcy. Wskaźnik sukcesu terapeutycznego zależny jest od głównej jednostki chorobowej, odpowiedniego doboru dawcy zawiesiny kałowej. Osoba ta powinna zostać dokładnie przebadana pod kątem obecności licznych patogenów, oznaczenia ich rodzaju oraz określenia ich jakości. FMT zaleca się w przypadkach, gdy farmakoterapia przestaje być efektywna, jest także zabiegiem wspomagającym w leczeniu wielu chorób przebiegających z dysbiozą. Podsumowanie Przeszczep mikrobioty kałowej jest wskazany w ciężkim przebiegu rzekomobłoniastego zapalenia jelit w przypadku zakażenia Clostridium difficile. W fazie eksperymentalnej są nowe wskazania wykorzystania FTM np. choroba Parkinsona, choroba Alzheimera, jednak jest on przeciwwskazany w zespole jelita drażliwego. Rola pielęgniarki ogranicza się do przygotowania pacjenta, asystowania podczas zabiegu, opieki pozabiegowe oraz edukacji chorego. &nbsp; &nbsp