PK-DB: pharmacokinetics database for individualized and stratified computational modeling

A multitude of pharmacokinetics studies have been published. However, due to the lack of an open database, pharmacokinetics data, as well as the corresponding meta-information, have been difficult to access. We present PK-DB (https://pk-db.com), an open database for pharmacokinetics information from clinical trials. PK-DB provides curated information on (i) characteristics of studied patient cohorts and subjects (e.g. age, bodyweight, smoking status, genetic variants); (ii) applied interventions (e.g. dosing, substance, route of application); (iii) pharmacokinetic parameters (e.g. clearance, half-life, area under the curve) and (iv) measured pharmacokinetic time-courses. Key features are the representation of experimental errors, the normalization of measurement units, annotation of information to biological ontologies, calculation of pharmacokinetic parameters from concentration-time profiles, a workflow for collaborative data curation, strong validation rules on the data, computational access via a REST API as well as human access via a web interface. PK-DB enables meta-analysis based on data from multiple studies and data integration with computational models. A special focus lies onmeta-data relevant for individualized and stratified computational modeling with methods like physiologically based pharmacokinetic (PBPK), pharmacokinetic/pharmacodynamic (PK/PD), or population pharmacokinetic (pop PK) modeling

Parental involvement in the education of students with learning difficulties: parent and teacher perspective with mixed-method approach

The present study aims to investigate, via a concurrent mixed-methods research design, parent/teacher perceptions of parental involvement in the education of students with learning difficulties (LD). Specifically, based on Epstein’s typology (1992, 1995), for the purpose of quantitative data collection, the ‘Family and community involvement in the elementary and middle grades: parent survey’ (Sheldon & Epstein, 2007) was administered to 228 parents (151 mothers and 77 fathers), as well as the ‘School and family partnerships: Surveys’ (Epstein & Salinas, 1993) to 358 teachers (232 regular teachers, RET and 126 special education teachers, SET) in order to measure parent/teacher perceptions of parental involvement (involvement Types), parent/teacher practices and parent role in children’s with LD learning, as well as parent perceptions of their efficacy to enhance their children’s learning, school climate and networking in the education of their children with LD. The differences among parent and teacher-related socio-demographic characteristics, when linked with the above-mentioned variables, are also studied. On the other hand, for the purpose of qualitative data collection, the study in a comparative way examines parent/teacher perceptions of parental involvement of 20 mothers, 20 fathers, 20 RET and 20 SET of 20 children with LD, via person-to-person semi-structured interviews, regarding: 1. the concept and characteristics of parental involvement, 2. parent/teacher practices, 3. parent/teacher role and goals in the education of students with LD, 4. parent/teacher relations, and 5. the use of social networks in the education of children with LD. Parent/teacher protocols include five thematic parts, based on the Communities of Practice (CoP) (Wenger, McDermott, & Snyder, 2002) theoretical framework. Findings from the quantitative analysis point to the fact that the parents associate their involvement in the education of their children with LD more with Type 1- Parenting, whereas the teachers with Type 5- Decision making. As it concerns parent involvement practices, the data indicate that parents use more Type 4- Learning at home practices, whereas the teachers Type 2- Communicating. Notwithstanding, there are a series of statistical important findings concerning parent/teacher perceptions of parental involvement, involvement practices, parent role and efficacy in the education of children with LD, when compared to parent/teacher socio-demographic characteristics.On the other hand, findings from the qualitative analysis point to the fact that both parents and teachers relate parental involvement mostly with parent-teacher communication and less with decision making, as well as with parent/teacher participation in the assessment procedure of the child’s LD. Among other findings, it is revealed that, as it concerns “decision making”, half of the RET and the majority of the parents are neither informed about an IEP nor participate in the IEP’s designated for the child with LD. Notwithstanding, it should be noted that both parents/teachers mostly link school-family “collaboration” with “communication”, among other factors. Τhe above quantitative/qualitative findings are discussed in relation to their implications in promoting parental involvement in the education of students with LD, as well as inclusion.Η παρούσα διατριβή διερευνά με μεικτή μεθοδολογική προσέγγιση τις απόψεις εκπαιδευτικών και γονέων μαθητών με μαθησιακές δυσκολίες (ΜΔ) σχετικά με τη γονεϊκή εμπλοκή. Ειδικότερα, στην ποσοτική προσέγγιση, με βάση την τυπολογία της Epstein (1992, 1995) περί γονεϊκής εμπλοκής, διερευνώνται οι απόψεις των γονέων σχετικά με τους Τύπους και τις πρακτικές γονεϊκής εμπλοκής, το γονεϊκό ρόλο και την αποτελεσματικότητα τους, το σχολικό κλίμα, και τη χρήση των κοινωνικών τους δικτύων κατά την εκπαίδευση των παιδιών τους με ΜΔ. Επιπροσθέτως, διερευνώνται οι απόψεις των εκπαιδευτικών σχετικά με τη γονεϊκή εμπλοκή, τις πρακτικές γονεϊκής εμπλοκής, και το γονεϊκό ρόλο στην εκπαίδευση των μαθητών με ΜΔ. Οι παραπάνω μεταβλητές ελέγχονται ως προς τη διαφοροποίησή τους, με βάση τα κοινωνικό-δημογραφικά χαρακτηριστικά γονέων/εκπαιδευτικών. Στην ποιοτική προσέγγιση, με βάση τη θεωρία των Κοινοτήτων της Πρακτικής (ΚτΠ) των Wenger, McDermott, & Snyder (2002), διερευνώνται οι απόψεις γονέων/εκπαιδευτικών σχετικά με: (α) το περιεχόμενο και τα χαρακτηριστικά της γονεϊκής εμπλοκής, (β) τις πρακτικές εμπλοκής γονέων/εκπαιδευτικών, (γ) το ρόλο και τους στόχους γονέων/εκπαιδευτικών, (δ) τις σχέσεις γονέων/εκπαιδευτικών, και (ε) τη χρήση κοινωνικών δικτύων στην εκπαίδευση των μαθητών με ΜΔ.Στην ποσοτική προσέγγιση, χορηγήθηκε το ερωτηματολόγιο «H οικογενειακή και κοινοτική εμπλοκή στο δημοτικό και το γυμνάσιο: Το ερωτηματολόγιο για γονείς» των Sheldon και Epstein (2007) στους 228 συμμετέχοντες γονείς (151 μητέρες και 77 πατέρες) και το ερωτηματολόγιο «Συνεργασία Σχολείου και Οικογένειας» των Epstein και Salinas (1993) στους 358 συμμετέχοντες εκπαιδευτικούς (232 εκπαιδευτικοί γενικής εκπαίδευσης (Γ.Ε.) και 126 εκπαιδευτικοί ειδικής αγωγής και εκπαίδευσης (Ε.Ε.)). Στην ποιοτική μελέτη συμμετείχαν 40 γονείς (20 μητέρες και 20 πατέρες) και 40 εκπαιδευτικοί (20 εκπαιδευτικοί Γ.Ε., και 20 εκπαιδευτικοί Ε.Ε.) 20 μαθητών με ΜΔ. Ο οδηγός των ατομικών ημι-δομημένων συνεντεύξεων που πραγματοποιήθηκαν εμπεριέχει πέντε θεματικούς άξονες, σύμφωνα με τα χαρακτηριστικά των ΚτΠ (Wenger, McDermott, & Snyder, 2002). Κατά την ποσοτική προσέγγιση της γονεϊκής εμπλοκής, οι αναλύσεις καταδεικνύουν σημαντικά αποτελέσματα όσον αφορά τη γονεϊκή εμπλοκή, αφού για τους γονείς αναδεικνύεται σημαντικότερος ο Τύπος 1 (Γονεϊκή μέριμνα), ενώ για τους εκπαιδευτικούς ο Τύπος 5 (Λήψη αποφάσεων). Σε σχέση με τις πρακτικές ενίσχυσης της γονεϊκής εμπλοκής στην εκπαίδευση μαθητών με ΜΔ, σπουδαιότερος για τους γονείς φαίνεται ο Τύπος 4 (Κατ’ οίκον μάθηση), ενώ για τους εκπαιδευτικούς ο Τύπος 2 (Επικοινωνία σχολείου και οικογένειας). Επιπρόσθετα, τα ευρήματα αναδεικνύουν μία σειρά στατιστικά σημαντικών αποτελεσμάτων ως προς τις απόψεις γονέων και εκπαιδευτικών όσον αφορά τη γονεϊκή εμπλοκή και τις πρακτικές ενίσχυσής της, το γονεϊκό ρόλο, και την αποτελεσματικότητα των γονέων στην εκπαίδευση των παιδιών τους με ΜΔ σε σχέση με τα κοινωνικό-δημογραφικά χαρακτηριστικά τους.Κατά την ποιοτική προσέγγιση της γονεϊκής εμπλοκής, προκύπτει ότι η γονεϊκή εμπλοκή, για γονείς και εκπαιδευτικούς, συνδέεται περισσότερο με την επικοινωνία γονέα-εκπαιδευτικού και λιγότερο με τη λήψη αποφάσεων και τη συμμετοχή στη διαδικασία αξιολόγησης των ΜΔ του μαθητή. Σημαντικό εύρημα ως προς τη λήψη των αποφάσεων είναι ότι οι μισοί εκπαιδευτικοί Γ.Ε. και οι περισσότεροι γονείς δε συμμετέχουν στο σχεδιασμό και την εφαρμογή του Εξατομικευμένου Προγράμματος Εκπαίδευσης. Επιπλέον, γονείς και εκπαιδευτικοί συνδέουν το ρόλο τους στην εκπαίδευση των παιδιών με ΜΔ περισσότερο με την εκπαιδευτική και συναισθηματική στήριξη του παιδιού με ΜΔ. Η «συνεργασία» σχολείου/οικογένειας συνδέεται με την «επικοινωνία», μεταξύ άλλων παραγόντων.Τα αποτελέσματα της ποσοτικής/ποιοτικής προσέγγισης συζητούνται ως προς την προώθηση της γονεϊκής εμπλοκής στην εκπαιδευτική διαδικασία γενικότερα και την ένταξη ειδικότερα των μαθητών με ΜΔ

Applicability of in silico tools for the prediction of dermal absorption for pesticides

Based on the “Human in vitro dermal absorption datasets” published as supporting information to the revised EFSA Guidance on Dermal Absorption, in silico models for prediction of absorption across the skin have been evaluated. For this evaluation, a systematic literature search and review was performed, identifying 288 publications describing mathematical models for prediction of dermal absorption. Eleven models potentially relevant to the regulatory assessment of pesticides and which cover a range of approaches were selected for in depth evaluation. This included three mixture models taking into account physicochemical properties of the co‐formulants such as polar surface area, hydrogen bonding or octanol‐water partition coefficients. Additional data on the pesticidal active substances and information on the composition of some of the formulations covered in the dermal absorption dataset were gathered, as these were required as input parameters for the selected models. The models were implemented with settings reflecting as much as possible realistic exposure scenarios and the experimental conditions under which the measured data were obtained. As the majority of the models predicted either maximum flux or the permeation coefficient, further combination with a model achieving translation into percentage absorption was required. This was done with and without consideration of the lag time. Only one model directly predicted percentage dermal absorption, which was a spreadsheet‐based single substance model taking into consideration several skin parameters, experimental conditions, various physicochemical properties of the active substance and the type of vehicle. Statistical analysis of model predictions revealed overall low concordance with measured values, thereby limiting regulatory acceptance. Additional analysis was performed on the results of two mixture models and the above mentioned complex single substance model which showed moderate correlation between predicted and measured data. Options to improve model performance were discussed and Bayesian random effects modelling was explored to adjust predicted percentage dermal absorption to measured data as was model combination. When taking into account observed uncertainties of predictions, one of the models may provide a Tier 2 tool to estimate dermal absorption value in the absence of adequate experimental data when the predicted values are in the range of 10 to 70%. However, further work is needed to better understand the effect of co‐formulants on dermal absorption of pesticides and to improve model predicitivity