Genetic Diversity and Population Differentiation of the Causal Agent of Citrus Black Spot in Brazil

One of the most important diseases that affect sweet orange orchards in Brazil is the Citrus Black Spot that is caused by the fungus Guignardia citricarpa. This disease causes irreparable losses due to the premature falling of fruit, as well as its severe effects on the epidermis of ripe fruit that renders them unacceptable at the fresh fruit markets. Despite the fact that the fungus and the disease are well studied, little is known about the genetic diversity and the structure of the fungi populations in Brazilian orchards. The objective of this work was study the genetic diversity and population differentiation of G. citricarpa associated with four sweet orange varieties in two geographic locations using DNA sequence of ITS1-5.8S-ITS2 region from fungi isolates. We observed that different populations are closely related and present little genetic structure according to varieties and geographic places with the highest genetic diversity distributed among isolates of the same populations. The same haplotypes were sampled in different populations from the same and different orange varieties and from similar and different origins. If new and pathogenic fungi would become resistant to fungicides, the observed genetic structure could rapidly spread this new form from one population to others

Genetic Diversity and Population Differentiation of Guignardia mangiferae from “Tahiti” Acid Lime

Among the citrus plants, “Tahiti” acid lime is known as a host of G. mangiferae fungi. This species is considered endophytic for citrus plants and is easily isolated from asymptomatic fruits and leaves. G. mangiferae is genetically related and sometimes confused with G. citricarpa which causes Citrus Black Spot (CBS). “Tahiti” acid lime is one of the few species that means to be resistant to this disease because it does not present symptoms. Despite the fact that it is commonly found in citric plants, little is known about the populations of G. mangiferae associated with these plants. Hence, the objective of this work was to gain insights about the genetic diversity of the G. mangiferae populations that colonize “Tahiti” acid limes by sequencing cistron ITS1-5.8S-ITS2. It was verified that “Tahiti” acid lime plants are hosts of G. mangiferae and also of G. citricarpa, without presenting symptoms of CBS. Populations of G. mangiferae present low-to-moderate genetic diversity and show little-to-moderate levels of population differentiation. As gene flow was detected among the studied populations and they share haplotypes, it is possible that all populations, from citrus plants and also from the other known hosts of this fungus, belong to one great panmictic population

Oportunidades de mercado para tipos especiais de arroz em Santa Catarina

Abstract: The market points out to a consumption increase of special products. The objective of this study was to evaluate the acceptance of two varieties of special rice, SCS119 Rubi (red rice) and SCS120 Ônix (black-rice), by consumers. The study was carried out in three grocery stores located in Balneário Camboriú, Blumenau and Chapecó and one food Market in Balneário Camboriú, Santa Catarina, Brazil. A total of 1068 shoppers were invited to taste samples of cooked rice. Each interviewed filled up a form, based on hedonic scale with nine grades, to express, upon previously selected attributes, their satisfaction with the products. They were also invited to evaluate some physical and organoleptic properties of the special rice varieties. The variety SCS120 Ônix (black rice) and SCS119 Rubi (red rice) were very well accepted by consumers. They showed willingness to change habits of consumption from the regular milled or parboiled rice to the special varieties. The presence of phenolic compounds in special rice is the main factor in consumers´ decision to accept the varieties SCS119 Rubi and SCS120 Ônix.Resumo: Os sinais do mercado apontam para a tendência de maior consumo de produtos diferenciados. O objetivo deste estudo foi conhecer a aceitação de mercado dos tipos especiais de arroz SCS119 Rubi (arroz-vermelho) e SCS120 Ônix (arroz -preto). Para a realização do teste sensorial foi solicitado a 1.068 julgadores não treinados que assinalassem em uma escala hedônica de 9 pontos o nível de satisfação provocado pelo consumo desses produtos. Os degustadores também foram motivados a externar sua opinião sobre atributos previamente selecionados para avaliação de suas propriedades físicas e organolépticas. As variedades SCS119 Rubi (arroz-vermelho) e SCS120 Ônix (arroz-preto) são bem aceitas pelo mercado consumidor, constituindo-se em novas alternativas de consumo. Existe pré-disposição dos consumidores para a substituição do padrão de consumo atual (arroz-branco e arroz parboilizado). A presença de compostos fenólicos nos tipos especiais de arroz avaliados são os atributos qualitativos com maior apelo para essa decisão. 

Influence of solar radiation on the production of secondary metabolites in three rice (Oryza sativa) cultivars

Rice (Oryza sativa L.) is one of the most produced and consumed cereals worldwide and has its importance highlighted mainly in developing countries, where it plays a strategic economic and social role. Due to the importance of rice in the diet, its composition and nutritional characteristics are directly related to the health of the population. In the rice production systems, some climatic factors are determinants for the good performance of the crop, inducing the biosynthesis of primary and secondary metabolites. The present study determined the metabolic profiles through UV-visible spectrophotometry of leaf samples of three rice cultivars (Marques -- white, \\^Onix -- black, and Rubi -- red pericarp) throughout the rice's vegetative stages in two experimental times, from September to December 2015 and from January to April 2016. Solar radiation was recorded along the experimental period. To the organosolvent extracts of leaf samples, UV-vis spectrophotometric techniques were applied and the quantitative results of certain metabolites, e.g., chlorophylls, carotenoids, phenolics, flavonoids, and sugars, as well the antioxidant activity, which were analyzed by chemometrics tools. The results showed that biochemical parameters carotenoids, chlorophylls and sugars are more affected by the intensity of the radiation do que as vari\\'\a\veis phenolics, flavonoids and these alterations may be detected through statistical analysis of biochemical concentrations and UV-vis spectra.CAPES -Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior(407323/2013-9)info:eu-repo/semantics/publishedVersio

SCS121 CL e SCS122 Miura: riscos e oportunidades na adoção de cultivares de arroz irrigado em Santa Catarina

Nowadays, one of the 22 irrigated rice cultivars released by Epagri for  Santa Catarina, the SCS121 CL, has an hegemonic predominance in the rice fields of the State. Biologic and strategically, this is of great concern for the State’s rice production because it constitutes a risk for the Clearfield (CL) rice production system. Besides, it means an intense selection pressure even in the phytosanitary area, especially regarding blast. The rapid adoption of SCS121 CL is due to its good yield, unquestionable and easy weed management (also allowing the sow in drained soil), and its tolerance to blast. In this way, it is often used, in situations out of its purpose, which is the control of weedy rice. Data from field experiments and demonstration units indicate that there are cultivars with higher yield than the SCS121 CL and, therefore, they are good options for fields not infested with weedy rice. In this sense, one good option is the brand new cultivar SCS122 Miura.Resumo – Atualmente entre os 22 cultivares de arroz irrigado lançados pela Epagri para Santa Catarina, o SCS121 CL predomina hegemonicamente no Estado. Biológica e estrategicamente, isso é preocupante para a orizicultura, pois representa um risco para o sistema Clearfield® (CL), além de significar uma pressão de seleção intensa na área fitossanitária, especialmente quanto à brusone. A rápida adoção do SCS121 CL se deve à sua produtividade, inquestionável facilidade no manejo de plantas daninhas (permitindo também a adoção da semeadura em solo seco), e sua tolerância à brusone. Dessa forma, é usado muitas vezes em situações que fogem à sua finalidade: o controle do arroz daninho. Dados de ensaios de Valor de Cultivo e Uso e dados de Unidades Demonstrativas apontam a existência de cultivares mais produtivos do que o SCS121 CL, portanto bons para áreas não infestadas com arroz daninho, entre eles o novo cultivar SCS122 Miura.

Bacterial diversity of soil under eucalyptus assessed by 16S rDNA sequencing analysis

Estudos sobre impacto do Eucalyptus spp. em solos brasileiros têm focalizado propriedades químicas do solo e isolamento de microrganismos de interesse. No Brasil há pouco enfoque em ecologia e diversidade microbiana, devido às limitações dos métodos tradicionais de cultivo e isolamento. A utilização de métodos moleculares no estudo da ecologia microbiana baseados na amplificação por PCR do 16S rDNA têm enriquecido o conhecimento da biodiversidade microbiana dos solos. O objetivo deste trabalho foi comparar e estimar a diversidade bacteriana de comunidades simpátricas em solos de duas áreas: uma floresta nativa (NFA) e outra adjacente com arboreto de eucaliptos (EAA). Oligonucleotídeos iniciadores foram utilizados para amplificar o 16S rDNA metagenômico do solo, o qual foi clonado usando pGEM-T e seqüenciado para determinar a diversidade bacteriana. Foram analisados 134 clones do solo NFA e 116 clones do solo EAA. As seqüências foram comparadas às depositadas no GenBank. Análises filogenéticas revelaram diferenças entre os tipos de solos e alta diversidade em ambas comunidades. No solo de arboreto de Eucalyptus spp. foi encontrada maior diversidade bacteriana em comparação com o solo da área de floresta nativa.Studies on the impact of Eucalyptus spp. on Brazilian soils have focused on soil chemical properties and isolating interesting microbial organisms. Few studies have focused on microbial diversity and ecology in Brazil due to limited coverage of traditional cultivation and isolation methods. Molecular microbial ecology methods based on PCR amplified 16S rDNA have enriched the knowledge of soils microbial biodiversity. The objective of this work was to compare and estimate the bacterial diversity of sympatric communities within soils from two areas, a native forest (NFA) and an eucalyptus arboretum (EAA). PCR primers, whose target soil metagenomic 16S rDNA were used to amplify soil DNA, were cloned using pGEM-T and sequenced to determine bacterial diversity. From the NFA soil 134 clones were analyzed, while 116 clones were analyzed from the EAA soil samples. The sequences were compared with those online at the GenBank. Phylogenetic analyses revealed differences between the soil types and high diversity in both communities. Soil from the Eucalyptus spp. arboretum was found to have a greater bacterial diversity than the soil investigated from the native forest area

Recomendações técnicas para a produção de arroz irrigado em sistema orgânico em Santa Catarina

O arroz irrigado em Santa Catarina possui grande importância econômica e social. O cereal é cultivado em cerca de 150 mil hectares, distribuídos por 83 municípios da faixa litorânea catarinense e do Vale do Itajaí. O arroz catarinense é beneficiado no próprio Estado, com destaque para a produção industrial de arroz parboilizado.  Nos últimos anos, tem se tornado crescente o apelo para a produção agrícola  sustentável e diversas tecnologias dos sistemas produtivos tem sido  adaptadas para a conservação ambiental. Nesse contexto, se insere a produção de arroz em sistema orgânico, não apenas como opção de cultivo de baixo impacto ambiental, mas também para a oferta de produtos com maior segurança alimentar. O desenvolvimento de tecnologias para viabilizar  o cultivo orgânico de arroz irrigado tem sido foco da pesquisa oficial. Em Santa Catarina, os estudos se iniciaram na década de 1990, na Estação Experimental da Epagri de Itajaí, com a implementação de um projeto Embrapa/Prodetab, específico para a produção de arroz em sistema orgânico de cultivo. Novo impulso foi dado em 2009, no sul do estado, com apoio da Fundação de Amparo à Pesquisa e Inovação do Estado de Santa Catarina (Fapesc); tornando-se o Centro de Treinamento da Epagri de Araranguá (Cetrar), o polo irradiador das tecnologias para cultivo orgânico de arroz irrigado em Santa Catarina.  O Sistemas de Produção Recomendações técnicas para a produção de arroz irrigado em sistema orgânico em Santa Catarina reúne as tecnologias básicas  para o cultivo de arroz irrigado em sistema orgânico e é destinado a técnicos, estudantes e aos cerca de 8,5 mil agricultores vinculados a essa cultura. A publicação também é utilizada como guia em cursos e treinamentos realizados pela Epagri sobre a cultura do arroz irrigado.

Revisão integrativa: avaliação da atividade cicatrizante da Aloe vera (L.) Burm. F., comparada a sulfadiazina de prata, na cicatrização de feridas

Objetivo: Identificar na literatura científica as propriedades cicatrizantes da Aloe vera comparadas às da sulfadiazina de prata 1%. Método: O presente estudo trata-se de uma revisão integrativa da literatura, sendo selecionados artigos a partir de pesquisas nas bases de dados: LILACS, SciELO e NIH-PUBMED. Optou-se por realizar um estudo no período dos últimos 10 anos por conta das atualizações sobre a temática abordada. Resultados: Após a aplicação desses critérios de pesquisa nas bases de dados, inicialmente foram encontrados 247 artigos nas bases de dados, sendo que desses, 7 estudos foram incluídos na amostra final. É possível verificar que a Aloe vera apresenta propriedades farmacológicas que comprovaram sua ação anti-inflamatória, antimicrobiana e cicatrizante, observando que a sulfadiazina não apresentou a mesma eficácia cicatrizante. Considerações finais: ao longo deste artigo, mostra-se que a terapia tópica com sulfadiazina de prata, assim como auxilia na prevenção de complicações, tem alta eficácia e baixo custo, mas também é valido considerar que a associação do medicamento fitoterápico à base de Aloe vera à sulfadiazina de prata no tratamento de queimaduras é promissora para melhores resultados no tempo e qualidade do processo de cicatrização