Profiles of learner readers and their early literacy skills and environmental predictors: a large-scale longitudinal study from preschool to grade 1

As part of the French national cohort ELFE, a two-year longitudinal study was conducted and children’s literacy skills were assessed twice (N = 2,767), namely at the end of preschool (t1) and at the end of Grade 1 (t2). At t1, letter-name knowledge (LNK), phonological skills (PhoSk) and vocabulary were assessed and at t2, phonemic segmentation, word reading, listening and reading comprehension. Latent profile analyses conducted at t2 resulted in five profiles, ranging from good readers (48.8%), to average readers above the mean (16.2%), readers with very low phonological awareness skill (8.2%), poor readers with low reading comprehension skill (19.4%), and poor readers with general difficulties (7.4%). Two early literacy skills (LNK and PhoSk) and two environmental variables (parents’ educational level and household income) constituted good predictors of membership of a profile. However, home literacy practices also predicted membership of the good reader/poor reader profiles, albeit at a lower level

cancers Targeting Focal Adhesion Kinase Using Inhibitors of Protein-Protein Interactions

International audienceFocal adhesion kinase (FAK) is a cytoplasmic non-receptor protein tyrosine kinase that is overexpressed and activated in many human cancers. FAK transmits signals to a wide range of targets through both kinase-dependant and independent mechanism thereby playing essential roles in cell survival, proliferation, migration and invasion. In the past years, small molecules that inhibit FAK kinase function have been developed and show reduced cancer progression and metastasis in several preclinical models. Clinical trials have been conducted and these molecules display limited adverse effect in patients. FAK contain multiple functional domains and thus exhibit both important scaffolding functions. In this review, we describe the major FAK interactions relevant in cancer signalling and discuss how such knowledge provide rational for the development of Protein-Protein Interactions (PPI) inhibitors

Rôle de DMRT1 dans la détermination du sexe et la fertilité – Analyse du phénotype de lapins DMRT1 KO

DMRT1 is the Testis Determining Factor in many vertebrates. Discovered in Drosophila and worms, it has recently been shown to be the Testis Determining Factor in birds, where the Z chromosome carries it and acts in two copies to induce testicular differentiation in ZZ males. SRY is the testis-determining gene in mammals with an XX/XY system. According to the mouse species, DMRT1 has no further functions in testis determination since Dmrt1 mutations only affect postnatal testis differentiation and fertility in this rodent model. Nevertheless, human patients with DMRT1 mutations exhibit testicular dysgenesis (46, XY DSD – Woman XY), suggesting an earlier role for DMRT1 in non-rodent mammals. My thesis characterizes the involvement of DMRT1 in (i) gonadal differentiation and (ii) male and female fertility thanks to the analysis of DMRT1 mutant rabbits generated using CRISPR/Cas9. The rabbit, representing lagomorphs, was used as a non-rodent mammalian model. From the earliest stages of gonadal development, XY homozygous rabbits showed a male-to-female sex reversal (XY female) and developed ovaries. DMRT1 is a critical player in sex determination in rabbits. We have also demonstrated that it regulates the RSPO1/WNT4/β- catenin signaling pathway in females. DMRT1-/- gonads, whether XX or XY, showed a delay in ovarian somatic cell differentiation. This role in early ovarian differentiation has never been described in any vertebrate and non-vertebrate species. In females, we also highlighted the DMRT1 implication in germ cell meiosis for the first time. Its absence is associated with meiotic blockade, leading to the absence of primordial follicle formation and sterility in DMRT1-/- rabbits, whether XX or XY. The DMRT1 expression detected in germ cells more than a week before the onset of meiosis leads to the recruitment of critical factors such as DMC1, REC8, and STRA8, which it directly regulates. Due to its expression in the two main cell types of the gonad (supporting somatic cell and germ cell), DMRT1 plays key roles throughout gonadal differentiation and development in both sexes. Our work shows that DMRT1 must be considered as a major player in gonadal differentiation and fertility in both sexes in non-rodent mammals. The implications of this gene in various human reproductive pathologies need to be reassessed. Like the NR5A1 gene, DMRT1 gene variants may be responsible for other cases of azoospermia and ovarian failure, in addition to the few cases of female XY gonadal dysgenesis already described.DMRT1 est considéré comme le facteur déterminant du testicule chez de nombreux vertébrés. Découvert chez la drosophile et le ver Caenorhabditis elegans, il a été montré récemment qu’il est le déterminant testiculaire chez les oiseaux où il est localisé sur le chromosome sexuel Z et agit en double dose pour induire la différenciation testiculaire chez les mâles ZZ. Chez les mammifères présentant un système XX/XY, SRY est le gène déterminant du testicule. Selon les résultats obtenus chez la souris, DMRT1 n’est pas impliqué dans la détermination testiculaire puisque les mutations de ce gène affectent uniquement la différenciation testiculaire post-natale et la fertilité dans ce modèle représentatif des rongeurs. Néanmoins, des patients humains avec des mutations affectant DMRT1 ont une dysgénésie testiculaire (46, XY DSD – femme XY) suggérant un rôle plus précoce de ce gène dans la différenciation gonadique chez les mammifères non rongeurs. Cette thèse a ainsi consisté à caractériser l’implication de DMRT1 dans (i) la différenciation gonadique ainsi que dans (ii) la fertilité des mâles et des femelles grâce à l’analyse de lapins mutants pour DMRT1 générés par le système CRISPR/Cas9. Le lapin, représentant des lagomorphes, est utilisé ici comme un modèle animal des mammifères non- rongeurs. Dès le développement gonadique précoce, les lapins XY homozygotes pour la mutation ont un phénotype d’inversion sexuelle de type mâle vers femelle (femelle XY) et développent des ovaires. DMRT1 est donc un facteur clé de la détermination testiculaire chez le lapin. Nous avons aussi mis en évidence que chez les femelles, il régule la voie RSPO1/WNT4/β-caténine. En l’absence de DMRT1, les gonades DMRT1-/-, qu’elles soient XX ou XY, présentent un retard de différenciation des cellules somatiques ovariennes. Ce rôle dans la différenciation précoce de l’ovaire n’avait jusque- là jamais été décrit chez toutes les différentes espèces étudiées (vertébrés et non vertébrés). Chez les femelles, nous démontrons également pour la première fois que DMRT1 est également crucial pour la méiose des cellules germinales. Son absence est en effet associée à un blocage méiotique très précoce entrainant une absence de formation des follicules primordiaux et donc une stérilité des lapines DMRT1-/-, qu’elles soient XX ou XY. Son expression dans les cellules germinales détectées plus d’une semaine avant l’initiation de la méiose permet le recrutement de facteurs clés tels que DMC1, REC8 et STRA8 qu’il régule directement. De par son expression dans les deux principaux types cellulaires de la gonade (cellule somatique de soutien et cellule germinale), DMRT1 exerce des rôles clés tout au long de la différenciation puis du développement gonadique dans les deux sexes. Nos travaux démontrent que le gène DMRT1 doit être considéré comme un acteur majeur de la différenciation gonadique et de la fertilité dans les deux sexes, chez les mammifères non-rongeurs. Les implications de ce gène dans différentes pathologies reproductives chez l’homme doivent être réévaluées. En effet, à l’image du gène NR5A1, des variants géniques de DMRT1 pourraient être à l’origine d’autres cas d’azoospermie et d’insuffisance ovarienne, en plus des quelques cas de dysgénésie gonadique de type femme XY déjà décrits

Role of interindividual differences in visual word recognition : effects of deletion orthographic neighborhood and confusability of the substituted letter

L’objectif de cette thèse était d’étudier les variations possibles des processus impliqués dans la reconnaissance visuelle des mots selon les différences d’habiletés lexicales de lecteurs adultes (niveaux de lecture, orthographe et vocabulaire). Ainsi, nous avons testé l’effet de fréquence du voisinage orthographique par suppression et par substitution d’une lettre dans des tâches de décision lexicale (Exp. 1, 4), démasquage progressif (Exp. 2, 5), dénomination (Exp. 3, 6), et catégorisation de couleur (Exp. 7). Un effet inhibiteur de fréquence du voisinage orthographique par suppression (Exp. 1-3) et par substitution (Exp. 6) d’une lettre a été obtenu. Les temps de réponse étaient plus longs et les taux d’erreurs plus élevés pour les mots avec au moins un voisin orthographique plus fréquent que pour ceux sans un tel voisin, ce qui peut être expliqué en termes de compétition lexicale. De plus, la compétition lexicale du voisin par suppression d’une lettre était plus importante pour les individus ayant des habiletés lexicales hautes plutôt que basses (Exp. 1, 3), ces derniers individus témoignant de difficultés d’inhibition du compétiteur. Par ailleurs, les individus ayant des habiletés lexicales basses étaient moins rapides et moins précis que ceux ayant des habiletés lexicales hautes (Exp. 1-7). Les données de la tâche de catégorisation (Exp. 7) suggèrent des difficultés dans la mise en place de l’inhibition pour ces individus. Enfin, nous avons montré que l’effet de fréquence du voisinage orthographique était influencé par la confusabilité de la lettre substituée, ce qui différait selon les habiletés lexicales des individus (Exp. 4-6). Dans le cadre théorique de l’activation interactive et de codage spatial des lettres, les données soulignent l’importance des différences d’habiletés lexicales des lecteurs pour rendre compte des différences dans la diffusion de l’activation et de l’inhibition lexicales dans la reconnaissance visuelle des mots.Word recognition, according to the adult readers’ lexical skill differences (reading, spelling and vocabulary levels). To do so, we tested the orthographic neighborhood frequency effect by deletion and substitution of a letter in lexical decision (Exp.1, 4), progressive demasking (Exp 2, 5), denomination (Exp. 3, 6), and color categorization tasks (Exp.7). Response times were longer and the error rates were higher for words with at least one higher frequency neighbor than for words without such a neighbor, which can be explained in terms of lexical competition. In addition, the lexical competition of the higher-frequency deletion neighbor seems more important for individuals with high lexical skills than for those with low lexical skills (Exp 1, 3), the latter showing difficulties in inhibiting the competitor. Furthermore, individuals with low lexical skills were slower and less accurate than those with high lexical skills (Exp 1-7). Data from the categorization task (Exp. 7) suggest difficulties in setting up inhibition for these individuals. Finally, we have shown that the orthographic neighborhood frequency effect was influenced by the confusability of the substituted letter, differing according to the lexical skills of the individuals (Exp 4-6). In the theoretical framework of activation-interactive and spatial coding, the data highlight the importance of readers’ differences in lexical skills for the diffusion of lexical activation and inhibition in visual word recognition

Rôle des différences interindividuelles dans la reconnaissance visuelle des mots : effets de voisinage orthographique par suppression d’une lettre et de confusabilité d’une lettre substituée

Word recognition, according to the adult readers’ lexical skill differences (reading, spelling and vocabulary levels). To do so, we tested the orthographic neighborhood frequency effect by deletion and substitution of a letter in lexical decision (Exp.1, 4), progressive demasking (Exp 2, 5), denomination (Exp. 3, 6), and color categorization tasks (Exp.7). Response times were longer and the error rates were higher for words with at least one higher frequency neighbor than for words without such a neighbor, which can be explained in terms of lexical competition. In addition, the lexical competition of the higher-frequency deletion neighbor seems more important for individuals with high lexical skills than for those with low lexical skills (Exp 1, 3), the latter showing difficulties in inhibiting the competitor. Furthermore, individuals with low lexical skills were slower and less accurate than those with high lexical skills (Exp 1-7). Data from the categorization task (Exp. 7) suggest difficulties in setting up inhibition for these individuals. Finally, we have shown that the orthographic neighborhood frequency effect was influenced by the confusability of the substituted letter, differing according to the lexical skills of the individuals (Exp 4-6). In the theoretical framework of activation-interactive and spatial coding, the data highlight the importance of readers’ differences in lexical skills for the diffusion of lexical activation and inhibition in visual word recognition.L’objectif de cette thèse était d’étudier les variations possibles des processus impliqués dans la reconnaissance visuelle des mots selon les différences d’habiletés lexicales de lecteurs adultes (niveaux de lecture, orthographe et vocabulaire). Ainsi, nous avons testé l’effet de fréquence du voisinage orthographique par suppression et par substitution d’une lettre dans des tâches de décision lexicale (Exp. 1, 4), démasquage progressif (Exp. 2, 5), dénomination (Exp. 3, 6), et catégorisation de couleur (Exp. 7). Un effet inhibiteur de fréquence du voisinage orthographique par suppression (Exp. 1-3) et par substitution (Exp. 6) d’une lettre a été obtenu. Les temps de réponse étaient plus longs et les taux d’erreurs plus élevés pour les mots avec au moins un voisin orthographique plus fréquent que pour ceux sans un tel voisin, ce qui peut être expliqué en termes de compétition lexicale. De plus, la compétition lexicale du voisin par suppression d’une lettre était plus importante pour les individus ayant des habiletés lexicales hautes plutôt que basses (Exp. 1, 3), ces derniers individus témoignant de difficultés d’inhibition du compétiteur. Par ailleurs, les individus ayant des habiletés lexicales basses étaient moins rapides et moins précis que ceux ayant des habiletés lexicales hautes (Exp. 1-7). Les données de la tâche de catégorisation (Exp. 7) suggèrent des difficultés dans la mise en place de l’inhibition pour ces individus. Enfin, nous avons montré que l’effet de fréquence du voisinage orthographique était influencé par la confusabilité de la lettre substituée, ce qui différait selon les habiletés lexicales des individus (Exp. 4-6). Dans le cadre théorique de l’activation interactive et de codage spatial des lettres, les données soulignent l’importance des différences d’habiletés lexicales des lecteurs pour rendre compte des différences dans la diffusion de l’activation et de l’inhibition lexicales dans la reconnaissance visuelle des mots

Génétique de la différenciation gonadique, une étape clé du déterminisme du sexe et de la fertilité à l’âge adulte

International audienceThe knowledge of sex determination and gonads differentiation processes have made significant progress these three last decades since the SRY gene discovery, the testis determining factor in mammals. Human genetics, high throughput sequencing, and functional genomic studies allowed us to have a clear vision of both sexes' cellular interactions and genetic pathways involved in gonad differentiation. This short review takes stock of the current knowledge of gonadal differentiation in mammals replaced in a more general context of sexual characteristics development in vertebrates.Les connaissances concernant les processus de détermination du sexe et de différenciation des gonades ont énormément progressé ces trois dernières décennies, à la suite de la découverte du gène Sry, déterminant testiculaire chez les mammifères. Les travaux de génétique humaine, le séquençage à haut débit et les études de génomique fonctionnelle ont permis d'avoir une vision claire des interactions cellulaires et des cascades génétiques impliquées dans la différenciation des gonades des deux sexes. Cette brève revue fait l'état des lieux des connaissances actuelles de la différenciation gonadique chez les mammifères, replacées dans le contexte plus général de la mise en place des caractères sexuels chez les vertébrés

Effects of deletion neighbourhood frequency and individual differences in lexical decision, progressive demasking, and naming.

This study investigates whether deletion neighbourhood frequency influences the processing of French written words, and whether it might also be influenced by individual differences in skilled adult readers. For this purpose, words with at least 1 higher-frequency deletion neighbour (e.g., pliage [folding]/plage [beach]) and others with no higher-frequency neighbour (e.g., morose [gloomy]) were presented in lexical decision (Experiment 1), progressive demasking (Experiment 2), and naming (Experiment 3) tasks. For each experiment, the participants’ lexical skills were assessed by spelling, reading, and vocabulary tests. In Experiments 1–3, participants responded more slowly to words with at least 1 higher-frequency deletion neighbour than they did to words with no such neighbour. We also found evidence that the inhibitory effect of deletion neighbourhood frequency was sensitive to lexical skills in the naming task. These findings are discussed in terms of lexical competition underlying visual word recognition according to individual differences

The neighbourhood frequency effect in naming is influenced by substituted-letter confusability and lexical skills

International audienc

Effects of lexical skills and orthographic neighborhood size in word memory

International audienceTwo experiments were designed to investigate the relationship between individual lexical skills in young adults and memory performance on words varying by their orthographic neighborhood size. In Experiment 1, a sample of 100 university students were administrated a set of spelling, reading, and vocabulary tests to assess their lexical skills. Then, they had to learn mixed lists of words from high and low neighborhood size and perform free recall and memory recognition tasks. Importantly, high lexical skills were found to enhance free recall and, to a lesser extent, recognition. In addition, a typical mirror effect of neighborhood size was found in recognition as words were better recognized and also produced less false alarms when they had a low neighborhood size. In Experiment 2, pure lists of words were designed and a new sample of 90 university students was assessed. We replicated the effect of lexical skills in free recall and the effect of neighborhood size for hits in recognition. Spelling skills were found to interact with neighborhood size in free recall in that low spelling skills were associated with a facilitatory effect of neighborhood size. In recognition, a relation between reading skills and neighborhood size was found such that the higher the reading skills, the higher was the inhibitory effect of neighborhood size. These results provide new evidence of an influence of lexical skills in word memory performance and underline the role of orthographic neighborhood size in episodic memory tasks

Evaluation informatisée du vocabulaire chez les enfants de 8 à 11 ans

International audienceCette étude pilote a pour objectif de construire une nouvelle épreuve informatisée d’évaluation du vocabulaire en langue Française, destinée aux élèves de primaire. Des tâches à choix multiples mesurant l’étendue (i.e., Image) et la profondeur du vocabulaire (i.e., Synonyme, Définition) ont été administrées à 255 enfants. La rapidité et l’exactitude des réponses ont été enregistrées. Comme attendu, les analyses ont révélé que le niveau scolaire, le genre, et la fréquence lexicale des items impactaient les temps de réponse et/ou réponses correctes. Les performances s’améliorent avec le niveau scolaire et pour les mots fréquents. Les filles semblent avoir un vocabulaire plus riche que celui des garçons (e.g., profondeur) et elles semblent moins sensibles à la fréquence des mots que les garçons. Une analyse des qualités psychométriques de l’épreuve a permis de retenir une épreuve en 36 items ayant une consistance interne satisfaisante. Enfin, une analyse factorielle confirmatoire n’a pas permis de mettre en évidence une structure en deux facteurs du vocabulaire (e.g., profondeur, étendue). Les résultats sont discutés en termes de qualité de représentations lexicales et de choix des tâches