European Confederation of Medical Mycology (ECMM) prospective survey of cryptococcosis : report from Italy

Italy is one of the countries participating in a prospective epidemiological survey of cryptococcosis set up in July 1997 by the European Confederation of Medical Mycology (ECMM). Over a 30-month period 156 cases, all caused by Cryptococcus neoformans var. neoformans, were reported by 29 hospitals in 9 regions. An ECMM questionnaire was used to report the clinical presentation and the diagnostic and treatment approach used. Cryptococcosis was associated with HIV infection in 147 cases and was considered indicative of AIDS in 65%. The estimated incidence in the Lombardy region was 0.85/100 in the AIDS population. One isolate from each of 129 patients was serotyped and genotyped. PCR fingerprinting using the primer (GACA)4 proved to be a more reproducible typing method than the slide agglutination test. Genotypes VN1 (serotype D), VN6 (serotype A) and VN3-VN4 (serotype AD hybrid strains) occurred in Italy at similar levels nationwide, but VN1 (D) was prevalent in the North. In vitro resistance to antifungals was uncommon

Development of best estimate numerical tools for LFR design and safety analysis

Nell’ambito della linea LP2, sono state condotte attività di ricerca al fine di sviluppare, aggiornare e convalidare codici di calcolo e modelli numerici per sostenere la progettazione ed effettuare analisi di sicurezza di un reattore veloce refrigerato a metallo liquido. Nell’ambito del PAR 2016, sono state messe in atto delle azioni al fine di integrare e coordinare tali attività. Si sono, pertanto, definite le aree di simulazione e le interconnessioni rilevanti per la progettazione e sicurezza di reattori Gen-IV. Il presente report rappresenta il proseguimento di tale azione. Ognuna di queste aree di simulazione è coperta da uno o più codici e simula un set di fenomeni multi-fisica e multi-scala rilevanti, e.g. termoidraulica di sistema, di contenimento, di sotto-canale, fluidodinamica tridimensionale, termo-meccanica della barretta di combustibile, del fuel assembly e di componenti, generazione di sezioni d’urto e sviluppo di metodi di aggiustamento delle stesse mediante utilizzo di dati sperimentali, dinamica neutronica tridimensionale, rilascio e trasporto di prodotti di fissione, etc. Tale attività fa parte di un’azione di sviluppo e convalida di una piattaforma di calcolo per sistemi nucleari innovativi. Relativamente a sviluppo e convalida, riportate nella parte 2 del presente report, sono state effettuate attività relative a: 1. termo-meccanica della barretta di combustibile – supporto allo sviluppo del codice TRANSURANUS. 2. termoidraulica di sistema – supporto alla validazione del codice RELAP5-3D per applicazione ai sistemi a piscina 3. accoppiamento codici CFD/SYS-TH e loro validazione a fronte delle campagne sperimentali TALL 4. dinamica accoppiata neutronica-termoidraulica tridimensionale - sviluppo e applicazione codice FRENETIC 5. modellazione multifisica neutronica – termoidraulica - accoppiamento OpenFoam-Serpent 6. termoidraulica multifluid/multiphase e analisi di incidenti severi – supporto allo sviluppo e alla validazione del codice SIMMER-III e –IV 7. applicazioni CFD alle analisi di fuel blockag

Antiretroviral genotyping resistance in plasma RNA and whole blood DNA in HIV-1 infected patients failing HAART

The extent to which HIV-1 proviral DNA mutations cause clinically relevant antiretroviral resistance is still controversial. Paired plasma HIV-1 RNA and whole blood DNA were compared in patients failing HAART to investigate if the additional knowledge of archived mutations could improve the selection of potentially active drugs. Seventy-three HIV-1-infected patients with first/second HAART failure were studied before starting a new regimen based on RNA genotyping. Follow-up data after a 12-week therapy were available. DNA genotyping was retrospectively performed on stored whole blood samples and mutational profiles were compared to those from RNA. The mean number of IAS pol mutations was significantly higher in RNA (4.45 +/- 2.76) than in DNA (2.88 +/- 2.47) (P or=1 mutation revealed by DNA genotyping alone, probably affecting therapy success in 2/16. However, neither RNA/DNA discordance nor detection of isolated DNA mutations were statistically associated with outcome. In conclusion, plasma RNA remains the elective choice for HIV genotyping in patients with therapy failure, even if the detection of proviral resistance-associated mutations, not simultaneously found in RNA, is a frequent event. Therefore, in some cases DNA plus RNA genotyping might assist in choosing more accurately subsequent antiretroviral regimen