In silico identification and expression of SLC30 family genes: An expressed sequence tag data mining strategy for the characterization of zinc transporters' tissue expression

BACKGROUND: Intracellular zinc concentration and localization are strictly regulated by two main protein components, metallothioneins and membrane transporters. In mammalian cells, two membrane transporters family are involved in intracellular zinc homeostasis: the uptake transporters called SLC39 or Zip family and the efflux transporters called SLC30 or ZnT family. ZnT proteins are members of the cation diffusion facilitator (CDF) family of metal ion transporters. RESULTS: From genomic databanks analysis, we identified the full-length sequences of two novel SLC30 genes, SLC30A8 and SLC30A10, extending the SLC30 family to ten members. We used an expressed sequence tag (EST) data mining strategy to determine the pattern of ZnT genes expression in tissues. In silico results obtained for already studied ZnT sequences were compared to experimental data, previously published. We determined an overall good correlation with expression pattern obtained by RT-PCR or immunomethods, particularly for highly tissue specific genes. CONCLUSION: The method presented herein provides a useful tool to complete gene families from sequencing programs and to produce preliminary expression data to select the proper biological samples for laboratory experimentation

In vivo expression and functional characterization of the zinc transporter ZnT8 in glucose-induced insulin secretion.

International audienceInsulin-secreting pancreatic beta cells are exceptionally rich in zinc. In these cells, zinc is required for zinc-insulin crystallization within secretory vesicles. Secreted zinc has also been proposed to be a paracrine and autocrine modulator of glucagon and insulin secretion in pancreatic alpha and beta cells, respectively. However, little is known about the molecular mechanisms underlying zinc accumulation in insulin-containing vesicles. We previously identified a pancreas-specific zinc transporter, ZnT-8, which colocalized with insulin in cultured beta cells. In this paper we studied its localization in human pancreatic islet cells, and its effect on cellular zinc content and insulin secretion. In human pancreatic islet cells, ZnT-8 was exclusively expressed in insulin-producing beta cells, and colocalized with insulin in these cells. ZnT-8 overexpression stimulated zinc accumulation and increased total intracellular zinc in insulin-secreting INS-1E cells. Furthermore, ZnT-8-overexpressing cells display enhanced glucose-stimulated insulin secretion compared with control cells, only for a high glucose challenge, i.e. >10 mM glucose. Altogether, these data strongly suggest that the zinc transporter ZnT-8 is a key protein for both zinc accumulation and regulation of insulin secretion in pancreatic beta cells

Etude de l'implication électrophysiologique des ganglions de la base lors de crises focales motrices chez le primate.

Motor seizures can be pharmaco-resistant but resective surgery, although possible, is usually not offer as a therapeutic option. Deep brain stimulation is supposed to be a promising therapy but requires better understanding of the physiology of new target such as basal ganglia (BG). Although BG have been proposed to be involved in the propagation and the control of seizure, the electrophysiological mechanisms underlying the control of seizure have not been yet elucidated. Here we aimed at determining the effect of neocortical seizures on BG structures involved in the motor loop (striatum, pallidum, STN and SNr). To address this issue, we developed a monkey model induced by cortical injection of penicillin. This model was very focal and had a good reproducibility. During interictal period, electrophysiological modifications were only found after the interictal spike. These spikes induced modification on unit activity and on LFP. Strong modifications were found during ictal period with an increase of the firing rate, a modification of the firing pattern, a hyper-synchronisation of cells and a coherence between the cortex et the BG activity. However, these modification wasn't similar between the different BG structures. We conclude that these major modifications constitute an evidence of BG reorganization during focal motor seizure. The cortico-subthalamo-nigrale loop seems to be implicated in the propagation of seizure whereas the cortico-putamino-pallidale loop seems to be more implicated in the control of seizure. The second part of the study had showed that the pathways implicated in seizure are specific to the type of the seizure. Indeed, the implication of the SNr and the caudate were more important during focal premotor seizure than during motor seizure. To conclude, this study a permit us to prove the implication of the BG structures during focal motor seizure and also to put in evidence the existence of further functional loops implicated in a different manner in the propagation and the control of this kind of seizure. . The fact that oscillatory frequency in the putamen and GPi differ with the cortical EEG frequency and that the coherence between GPi, the Putamen and the cortex appears only at the end of the seizure (especially for GPi, while it appears at the onset of the seizure for the STN and GPe) might create an imbalance between the direct and the indirect BG pathway at the onset of seizure, facilitating its propagation. Whether the modulation of BG will restore a balance between the 2 systems, leading to a cessation of the seizure, is still a scientific and therapeutical challenge.Dans le cas des épilepsies focales motrices pour lesquels la chirurgie résective n'est pas indiquée, la stimulation à haute fréquence a été proposée comme une technique alternative. Afin de mieux comprendre le rôle des ganglions de la base (GB) dans ce type de crise, il est tout d'abord nécessaire de déterminer l'impact des décharges néocorticales paroxystiques sur l'ensemble du circuit des GB (le striatum, le pallidum, le NST et la SNr). Pour cela nous avons tout d'abord mis en point un modèle de crises focales chez le primate par injection intra-corticale de pénicilline. Les crises obtenues étaient très focales et avaient une bonne reproductibilité inter et intra individuelle. Durant les périodes interictales, les changements électrophysiologiques n'apparaissaient qu'à la suite des pointes interictales. En effet, aucune différence n'a pu être notée entre l'activité unitaire de l'état de base et durant les périodes interictales exemptes de pointe alors que d'importantes modifications ont pu être observées dans les millièmes de secondes qui suivaient la pointe. Ces pointes interictales induisaient des changements tant au niveau unitaire qu'au niveau des potentiel de champs locaux. L'analyse de ces mêmes activités électrophysiologiques durant les périodes ictales nous a permis de montrer que les modifications n'étaient pas homogènes pour les différentes structures. Ces résultats nous ont amené à envisager l'existence de 2 boucles impliquées de façon différente dans la propagation et le contrôle des crises. La boucle cortico-subthalamo-nigrale serait préférentiellement impliquée dans la propagation des crises alors que la boucle cortico-putamino-pallidale serait peut être impliquée dans le contrôle des crises. Une seconde étude a été faite sur des crises focales prémotrices afin d'évaluer la spécificité des réseaux impliqués en fonction du types de crises. Nous avons ainsi pu montrer que l'implication des structures étaient différentes avec notamment de ce cas là une plus forte implication du noyau caudé et de la SNr. Cette étude a donc permis d'établir l'implication des GB lors de crises focales motrices chez le primate, de mettre en évidence l'existence de plusieurs boucles fonctionnelles pouvant être impliquées dans de ce type de crises

Observations dans une classe de maternelle d’une petite école privée de Zaouiat Cheikh (Haut-Moyen-Atlas) : état des lieux et propositions de remédiation aux dysfonctionnements observés

Résumé — J’ai eu l’occasion d’intervenir en tant que formatrice bénévole, en français oral, des enseignants d’une école privée de Zawyat Cheikh (Beni-Mellal). J’ai pu observer ainsi le fonctionnement des classes de maternelle. Cette communication dresse un état des lieux en situation réelle, suivi de propositions d’améliorations pour un meilleur épanouissement des préscolaires, en faisant appel à une pédagogie différente, éprouvés depuis longtemps, et en portant une grande attention à la formation des futures éducatrices de maternelles

Impact of Seizures in Memory Performance on a NHP Model of Temporal Lobe Epilepsy

Presented on October 22, 2018 at 11:15 a.m. in the Krone Engineered Biosystems Building, Room 1005.Annaelle Devergnas is an Associate Professor in the Department of Neurology of Emory University and works at the Yerkes National Primate Center. She is an electrophysiologist expert with additional training in cognitive neurology.Runtime: 52:40 minutesThere is a lot of controversial finding on how epileptic activities (seizures and interictal epileptiform discharge) affect cognition in both animals and humans. Mesial temporal lobe epilepsy (MTLE) is one of the most common forms of epilepsy and is particularly resistant to current medications and surgeries. Although MTLE is generally characterized by memory deficits and impairments, the exact pathophysiology of this side effect of seizures is not well known. Here we propose to use a model of penicillin-induced temporal lobe epilepsy in monkey to study the effect of seizures on short and long term memory. The animal was first trained to do a Visual Paired Comparison task and an eye tracker was used to measure the amount of time that the animal spent looking at a new object vs. an old one. Sleep disturbances are also a common side effect of MTLE. To quantify the changes induced by the seizures in our model, we recorded the EEG activity of the animal at night before and after seizures induction, using a telemetry system. This new model of temporal lobe seizures in monkeys could help us develop new therapy, give us new inside on MTLE seizures, but could also help us better understand the mechanisms of the side effect of seizures

Etude de l'implication électrophysiologique des ganglions de la base lors de crises focales motrices chez le primate.

Motor seizures can be pharmaco-resistant but resective surgery, although possible, is usually not offer as a therapeutic option. Deep brain stimulation is supposed to be a promising therapy but requires better understanding of the physiology of new target such as basal ganglia (BG). Although BG have been proposed to be involved in the propagation and the control of seizure, the electrophysiological mechanisms underlying the control of seizure have not been yet elucidated. Here we aimed at determining the effect of neocortical seizures on BG structures involved in the motor loop (striatum, pallidum, STN and SNr). To address this issue, we developed a monkey model induced by cortical injection of penicillin. This model was very focal and had a good reproducibility. During interictal period, electrophysiological modifications were only found after the interictal spike. These spikes induced modification on unit activity and on LFP. Strong modifications were found during ictal period with an increase of the firing rate, a modification of the firing pattern, a hyper-synchronisation of cells and a coherence between the cortex et the BG activity. However, these modification wasn't similar between the different BG structures. We conclude that these major modifications constitute an evidence of BG reorganization during focal motor seizure. The cortico-subthalamo-nigrale loop seems to be implicated in the propagation of seizure whereas the cortico-putamino-pallidale loop seems to be more implicated in the control of seizure. The second part of the study had showed that the pathways implicated in seizure are specific to the type of the seizure. Indeed, the implication of the SNr and the caudate were more important during focal premotor seizure than during motor seizure. To conclude, this study a permit us to prove the implication of the BG structures during focal motor seizure and also to put in evidence the existence of further functional loops implicated in a different manner in the propagation and the control of this kind of seizure. . The fact that oscillatory frequency in the putamen and GPi differ with the cortical EEG frequency and that the coherence between GPi, the Putamen and the cortex appears only at the end of the seizure (especially for GPi, while it appears at the onset of the seizure for the STN and GPe) might create an imbalance between the direct and the indirect BG pathway at the onset of seizure, facilitating its propagation. Whether the modulation of BG will restore a balance between the 2 systems, leading to a cessation of the seizure, is still a scientific and therapeutical challenge.Dans le cas des épilepsies focales motrices pour lesquels la chirurgie résective n'est pas indiquée, la stimulation à haute fréquence a été proposée comme une technique alternative. Afin de mieux comprendre le rôle des ganglions de la base (GB) dans ce type de crise, il est tout d'abord nécessaire de déterminer l'impact des décharges néocorticales paroxystiques sur l'ensemble du circuit des GB (le striatum, le pallidum, le NST et la SNr). Pour cela nous avons tout d'abord mis en point un modèle de crises focales chez le primate par injection intra-corticale de pénicilline. Les crises obtenues étaient très focales et avaient une bonne reproductibilité inter et intra individuelle. Durant les périodes interictales, les changements électrophysiologiques n'apparaissaient qu'à la suite des pointes interictales. En effet, aucune différence n'a pu être notée entre l'activité unitaire de l'état de base et durant les périodes interictales exemptes de pointe alors que d'importantes modifications ont pu être observées dans les millièmes de secondes qui suivaient la pointe. Ces pointes interictales induisaient des changements tant au niveau unitaire qu'au niveau des potentiel de champs locaux. L'analyse de ces mêmes activités électrophysiologiques durant les périodes ictales nous a permis de montrer que les modifications n'étaient pas homogènes pour les différentes structures. Ces résultats nous ont amené à envisager l'existence de 2 boucles impliquées de façon différente dans la propagation et le contrôle des crises. La boucle cortico-subthalamo-nigrale serait préférentiellement impliquée dans la propagation des crises alors que la boucle cortico-putamino-pallidale serait peut être impliquée dans le contrôle des crises. Une seconde étude a été faite sur des crises focales prémotrices afin d'évaluer la spécificité des réseaux impliqués en fonction du types de crises. Nous avons ainsi pu montrer que l'implication des structures étaient différentes avec notamment de ce cas là une plus forte implication du noyau caudé et de la SNr. Cette étude a donc permis d'établir l'implication des GB lors de crises focales motrices chez le primate, de mettre en évidence l'existence de plusieurs boucles fonctionnelles pouvant être impliquées dans de ce type de crises

Etude et caractérisation de l'expression de nouveaux transporteurs de zinc de la famille ZnT chez les mammifères

Le zinc est un oligo-élément essentiel pour la vie. Le zinc n'est pas seulement un nutriment important, ou un cofacteur de nombreuses enzymes et de facteurs de transcription, il est désormais considéré comme un médiateur intracellulaire. L'homéostasie du zinc résulte de la coordination de diverses protéines: les ZIP, les métallothionéines et les ZnT appartenant à la famille CDF. Le récent décryptage du génome humain a permis d'identifier de nouveaux gènes, ainsi nous avons pu caractériser deux nouveaux gènes de la famille SLC30, nommés SLC30A8 et SLC30A JO. L 'homéostasie du zinc est maintenue par l'action de ces protéines dont la transcription est ellemême dépendante en partie de la concentration en zinc extracellulaire. En cas de carence, les taux de transcription de ZnT -S,-Sc et 7 sont augmentés. Ces transporteurs, que nous avons localisés au niveau de l'appareil de Golgi, pourraient permettre aux protéines néo-synthétisées l'apport en zinc nécessaire à leur fonctionnalité. Nous avons également montré que la protéine ZnT-8 est un transporteur du zinc spécifique des cellules sécrétrices d'insuline, localisé au niveau même des vésicules contenant l'insuline, et dont la régulation de la transcription, tout comme l'insuline, est dépendante du taux de glucose extracellulaire. Le zinc est impliqué dans tous les aspects métaboliques et structuraux des différents compartiments cellulaires. C'est pourquoi la connaissance de ce contrôle cellulaire du zinc est indispensable à une modélisation et à une compréhension du fonctionnement de la cellule.GRENOBLE1-BU Sciences (384212103) / SudocSudocFranceF

Le monde animal, végétal et minéral dans l'imaginaire des écrivains marocains de langue française

@In this study, my aim was to find out wether the Moroccan literature in French, in its whole, refers to a specific imaginary animal, vegetal and mineral world. My first part points out a prolific use of quotations, reflecting a polycultural heritage : Muslim tradition as well as the influence of French school, the anteislamic poetry and the ancient mythology. The quotations are also noticeable in a great number of clichés. The importance of orality is revealed through quotations of tales, folksongs, and a great number of proverbs and traditional insults throughout the corpus. In a second part I studied the descriptive methods of the writers, concerning landscapes, animals or plants. They sometimes develop in comparisons and in lists whose purpose is to catalogue the natural world. I then analysed the interpersonal relationship linking the writers to nature. Its attractive power is to be seen in friendship, sexuality, dreams, ecological awareness, as well as in stylistic choices. On the other hand, a repulsive power is to be found in the descriptions of a threatening natural world, while the characters become aggressive towards nature ; nightmares, visions of horror and death also belong to this negative aspect of relationships. Finally I studied the immanence of supernatural forces and the sacred in this literature, which appears through superstitions, sacrificial scenes, sacred trees, the myths of Mother Earth, as well as in exemples of identification between man and nature and anthropomorphism. It seems to me that the very Moroccan culture reveals itself through the imaginary animal, vegetal and mineral world of its writers. It is worth noticing that those who best illustrate this study are mainly the best known of them.Dans un corpus aussi exhaustif que possible, tous genres littéraires confondus, nous avons recherché s'il existait un lexique imaginaire du monde animal, végétal et minéral, propre aux écrivains marocains de langue française. Nous avons d'abord relevé une forte tendance citationnelle qui s'appuie sur un héritage polyculturel : la tradition musulmane, mais aussi les influences de l'école française, de la poésie antéislamique et de la mythologie antique ; la citation se traduit encore par un grand nombre de clichés. L'oralité est omniprésente dans notre corpus, sous forme de citations de contes, de textes chantés, et surtout dans un grand nombre de proverbes et d'injures traditionnelles. Nous avons ensuite observé la démarche descriptive des écrivains, appliquée à la nature : force d'attraction, qui s'exprime dans l'amitié, la sexualité, les rêves, la conscience écologique, qui détermine aussi des attitudes stylistique. Force répulsive, qui dépeint la nature sous un jour menaçant, ou pousse les personnages à agresser la nature ; les cauchemars, les visions d'horreur, la mort, révèlent encore ces relations négatives. Nous terminons par l'étude de l'immanence du surnaturel et du sacré dans les oeuvres, rendue sensible par la présence des superstitions, des scènes sacrificielles, des arbres vénérés, l'accent porté sur le mythe de la Terre-Mère, voire les cas d'identification de l'homme à la nature et d'anthropomorphisme. Il nous semble qu'à travers l'étude de l'imaginaire du monde animal, végétal et minéral, ce sont toutes les caractéristiques culturelles marocaines qui se font jour. Quant aux écrivains qui illustrent le plus abondamment ce travail, il s'agit le plus souvent de ceux dont l'oeuvre est pécisément déjà la mieux reconnue.RENNES2-BU Centrale (352382101) / SudocSudocFranceF

Empirical analysis of phase-amplitude coupling approaches.

Analysis of the coupling between the phases and amplitudes of oscillations within the same continuously sampled signal has provided interesting insights into the physiology of memory and other brain process, and, more recently, the pathophysiology of parkinsonism and other movement disorders. Technical aspects of the analysis have a significant impact on the results. We present an empirical exploration of a variety of analysis design choices that need to be considered when measuring phase-amplitude coupling (PAC). We studied three alternative filtering approaches to the commonly used Kullback-Leibler distance-based method of PAC analysis, including one method that uses wavelets, one that uses constant filter settings, and one in which filtering of the data is optimized for individual frequency bands. Additionally, we introduce a time-dependent PAC analysis technique that takes advantage of the inherent temporality of wavelets. We examined how the duration of the sampled data, the stability of oscillations, or the presence of artifacts affect the value of the "modulation index", a commonly used parameter describing the degree of PAC. We also studied the computational costs associated with calculating modulation indices by the three techniques. We found that wavelet-based PAC performs better with similar or less computational cost than the two other methods while also allowing to examine temporal changes of PAC. We also show that the reliability of PAC measurements strongly depends on the duration and stability of PAC, and the presence (or absence) of artifacts. The best parameters to be used for PAC analyses of long samples of data may differ, depending on data characteristics and analysis objectives. Prior to settling on a specific PAC analysis approach for a given set of data, it may be useful to conduct an initial analysis of the time-dependence of PAC using our time-resolved PAC analysis