Yeast Mitochondrial Biogenesis: A Role for the PUF RNA-Binding Protein Puf3p in mRNA Localization

The asymmetric localization of mRNA plays an important role in coordinating posttranscriptional events in eukaryotic cells. We investigated the peripheral mitochondrial localization of nuclear-encoded mRNAs (MLR) in various conditions in which the mRNA binding protein context and the translation efficiency were altered. We identified Puf3p, a Pumilio family RNA-binding protein, as the first trans-acting factor controlling the MLR phenomenon. This allowed the characterization of two classes of genes whose mRNAs are translated to the vicinity of mitochondria. Class I mRNAs (256 genes) have a Puf3p binding motif in their 3'UTR region and many of them have their MLR properties deeply affected by PUF3 deletion. Conversely, mutations in the Puf3p binding motif alter the mitochondrial localization of BCS1 mRNA. Class II mRNAs (224 genes) have no Puf3p binding site and their asymmetric localization is not affected by the absence of PUF3. In agreement with a co-translational import process, we observed that the presence of puromycin loosens the interactions between most of the MLR-mRNAs and mitochondria. Unexpectedly, cycloheximide, supposed to solidify translational complexes, turned out to destabilize a class of mRNA-mitochondria interactions. Classes I and II mRNAs, which are therefore transported to the mitochondria through different pathways, correlated with different functional modules. Indeed, Class I genes code principally for the assembly factors of respiratory chain complexes and the mitochondrial translation machinery (ribosomes and translation regulators). Class II genes encode proteins of the respiratory chain or proteins involved in metabolic pathways. Thus, MLR, which is intimately linked to translation control, and the activity of mRNA-binding proteins like Puf3p, may provide the conditions for a fine spatiotemporal control of mitochondrial protein import and mitochondrial protein complex assembly. This work therefore provides new openings for the global study of mitochondria biogenesis

Influence des caractéristiques turbulentes d'un écoulement sur l'érosion, la déformation et le transport d'un lit sédimentaire

This research work presents an experimental study on the influence of a vortex flow over a sediment bed. The experiments are conducted in a free-surface water channel in the Pprime Institute. Two specific apparatuses, generating isolated vortices of vertical or horizontal axis, were designed during this project. This study focuses on the vertical device. A parametric study is performed with optical measurements (PIV, stereoscopic PIV), in particular with two conditions for the wall roughness. Some behaviour laws are thus established. The characterization of those swirling flows depicts a strong three-dimensional effect, as well as the presence of specific turbulent structures related to sediment transport phenomenon. The secondary section of this work focuses on the sediment suspension caused by a vertical vortex. Turbulent structures related to transport are studied, like the sediment plume behaviour. Reconstruction of the bed over a long period of time, using a stereo-correlation method, highlights scour and accretion regions, induced by the isolated vortex. Finally, a numerical study based on OpenFOAM is proposed. The suggested methodology reproduces the observed fluid and sediment behaviours. Validation of this numerical tool could bring some new study parameters, providing an in-depth comprehension on the quantity of mobilized sediments.Ce travail de recherche présente une étude expérimentale de l’influence d’un écoulement tourbillonnaire sur un lit sédimentaire. Les expériences se déroulent dans un canal hydro-sédimentaire à surface libre, à l’Institut P’. Deux dispositifs permettant de générer des tourbillons isolés, d’axe vertical ou horizontal, ont été conçus lors de cette thèse. Ce travail se concentre sur le premier de ces montages : une étude paramétrique par mesures optiques (PIV, PIV stéréoscopique) est menée, notamment avec deux conditions de rugosité de paroi. Des lois de comportements sont ainsi établies. La caractérisation des écoulements tourbillonnaires révèle une forte tridimensionnalité, de même que la présence de structures turbulentes particulières, liées aux phénomènes de transport sédimentaire. Un second axe d’étude s’attache à la description de la mise en suspension de sédiments par un tourbillon d’axe vertical. Les structures turbulentes liées au transport sont étudiées, ainsi que le comportement du panache de sédiments. La reconstruction du lit sédimentaire sur un temps long, par l’utilisation d’une méthode de stéréo-corrélation, met en avant les régions d’affouillement et d’accrétion induites par le passage d’un seul tourbillon isolé. Enfin, une étude numérique basée sur OpenFOAM est proposée. La méthodologie exposée reproduit bien les comportements du fluide et des sédiments : la validation de cet outil permettrait d’aborder de nouveaux paramètres d’étude par la connaissance précise des quantités de sédiments mobilisés

Influence of turbulent flow characteristics on the erosion, deformation, and transport of a sediment bed

Ce travail de recherche présente une étude expérimentale de l’influence d’un écoulement tourbillonnaire sur un lit sédimentaire. Les expériences se déroulent dans un canal hydro-sédimentaire à surface libre, à l’Institut P’. Deux dispositifs permettant de générer des tourbillons isolés, d’axe vertical ou horizontal, ont été conçus lors de cette thèse. Ce travail se concentre sur le premier de ces montages : une étude paramétrique par mesures optiques (PIV, PIV stéréoscopique) est menée, notamment avec deux conditions de rugosité de paroi. Des lois de comportements sont ainsi établies. La caractérisation des écoulements tourbillonnaires révèle une forte tridimensionnalité, de même que la présence de structures turbulentes particulières, liées aux phénomènes de transport sédimentaire. Un second axe d’étude s’attache à la description de la mise en suspension de sédiments par un tourbillon d’axe vertical. Les structures turbulentes liées au transport sont étudiées, ainsi que le comportement du panache de sédiments. La reconstruction du lit sédimentaire sur un temps long, par l’utilisation d’une méthode de stéréo-corrélation, met en avant les régions d’affouillement et d’accrétion induites par le passage d’un seul tourbillon isolé. Enfin, une étude numérique basée sur OpenFOAM est proposée. La méthodologie exposée reproduit bien les comportements du fluide et des sédiments : la validation de cet outil permettrait d’aborder de nouveaux paramètres d’étude par la connaissance précise des quantités de sédiments mobilisés.This research work presents an experimental study on the influence of a vortex flow over a sediment bed. The experiments are conducted in a free-surface water channel in the Pprime Institute. Two specific apparatuses, generating isolated vortices of vertical or horizontal axis, were designed during this project. This study focuses on the vertical device. A parametric study is performed with optical measurements (PIV, stereoscopic PIV), in particular with two conditions for the wall roughness. Some behaviour laws are thus established. The characterization of those swirling flows depicts a strong three-dimensional effect, as well as the presence of specific turbulent structures related to sediment transport phenomenon. The secondary section of this work focuses on the sediment suspension caused by a vertical vortex. Turbulent structures related to transport are studied, like the sediment plume behaviour. Reconstruction of the bed over a long period of time, using a stereo-correlation method, highlights scour and accretion regions, induced by the isolated vortex. Finally, a numerical study based on OpenFOAM is proposed. The suggested methodology reproduces the observed fluid and sediment behaviours. Validation of this numerical tool could bring some new study parameters, providing an in-depth comprehension on the quantity of mobilized sediments

La Chimiothérapie à domicile, qualité de vie, qualité des soins, implication des intervenants, et aspects organisationnels (expérience du Centre Léon Bérard et de son interface ville-hôpital )

LYON1-BU Santé (693882101) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

Experimental study of a vertical vortex propagating above a smooth wall

International audienceThis paper proposes an investigation of a vortex propagation over a smooth wall. An isolated vortex is generated experimentally by a pitching plate (chord of 5cm), and propagates along a water channel at a Reynolds of 13000. We focus our study on the near wall region, performing measurements of the flow characteristics with a stereo-PIV technique over five horizontal planes at different heights, and with a PIV technique over one vertical plane. A main vortex can be observed, rotating clockwise, followed by a small secondary vortex with opposite rotation. Those measurements highlight a strong three-dimensional effect, influenced by the characteristics of the pitching plate (maximum angle α_max and velocity K_c): a specific pattern with two patches of opposite spanwise velocity is observed, with fluctuations reaching the main flow velocity. The main vortex is columnar at first time steps, and curved itself as it moves forward, convected by the flow: the convection velocity seems to be constant along the streamwise axis, and the main axis of the vortex core does not visibly follow the boundary layer profile

Note du comité éditorial. Revue canadienne des sciences régionales

Depuis des décennies, à l’instar des travaux sur le développement inégal, les travaux en sciences régionale et territoriale s’emploient à comprendre les effets des disparités observées sur des espaces nationaux, comme entre les espaces régionaux mondiaux. Plusieurs théories explicatives et descriptives furent proposées, plusieurs outils réglementaires et territoriaux également. Force est de constater que ces écarts et disparités magistralement mis de l’avant jadis par Samir Amin et Immanuel Wallerstein, loin de disparaître, se perpétuent