Copy Number Variation (CNV): A New Genomic Insight in Horses

This study aimed to contribute to our knowledge of CNVs, a type of genomic marker in equines, by producing, for the first time, a fine-scale characterization of the CNV regions (CNVRs) in the Pura Raza Española horse breed. We found not only the existence of a unique pattern of genomic regions enriched in CNVs in the PRE in comparison with the data available from other breeds but also the incidence of CNVs across the entire genome. Since these regions could affect the structure and dose of the genes involved, we also performed a gene ontology analysis which revealed that most of the genes overlapping in CNVRs were related to the olfactory pathways and immune response.Fil: Nora Laseca. Universidad de Córdoba; EspañaFil: Antonio Molina. Universidad de Córdoba; EspañaFil: Mercedes Valera. Universidad de Sevilla; EspañaFil: Alicia Antonini. Facultad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional de la Plata; ArgentinaFil: Demyda Peyrás, Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Facultad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional de la Plata; Argentin

Study of genetic variability in goats, runs of homozygosity and copy number variation

La producción caprina a nivel mundial está en expansión, debido a la rusticidad que presentan este tipo de animales para el aprovechamiento de áreas marginales, en las cuales otro tipo de especies pecuarias no podrían producir. En nuestro país, la cabra podría ser una excelente alternativa en la zona patagónica, como así también en el NOA, debido a la presencia de climas secos y recursos forrajeros limitados. Sin embargo,la producción de esta especie se caracteriza por la utilización de recursos genéticos poco conocidos, así como la ausencia de un plan de mejora yconservación de su variabilidad. Es por esto, que urge la implementación de un sistema de caracterización de los recursos genéticos; puede plantearse como el primer paso para comenzar a mejorar las condiciones productivas de los pequeños productores caprinos.Universidad Nacional de La Plat

Efeito genético de estações climáticas no crescimento pré-desmame de bovinos de corte: uma primeira abordagem para os bezerros Retinta

Background: Heat stress derived from global warming is causing major economic losses in the livestock industry. Objective: To develop a novel methodological approach for determining the influence of climatic factors on the estimation of genetic parameters for growth traits in Retinta cattle breed by using reaction-norm models. Methods: Live weight records (n=7,753) from 3,162 Retinta calves born from 1,249 dams and 85 sires and raised in the Andalusian region (Spain) were analyzed. The effect of heat stress was measured using the temperature-humidity index, calculated with climatological data obtained from four weather stations. A bivariate-random-regression reaction-norm model was used to estimate the (co)variance components of weight until weaning in two different climatic seasons corresponding to warm and cold months. Results: The heritability pattern of individuals reared under diverse environments during the first 90 days of age was different. However, differences were not significant at the end of the growing period. Weaned calves reared during the cold season showed greater growth from 70 to 160 days in comparison with those reared during the warm season. Conclusions: Overall, this assessment did not show significant effects of the genotype-environment interaction. However, highly significant evidence of genotype-climatic condition interaction was found during the calf´s first three months of age.Antecedentes: El estrés térmico derivado del calentamiento global está causando pérdidas económicas en la industria ganadera. Objetivo: Desarrollar un enfoque metodológico para estimar la influencia de algunos factores climáticos sobre la estimación de parámetros genéticos en las variables de crecimiento de la raza bovina Retinta. Métodos: Se analizaron registros de peso vivo (n=7.753) de 3.162 terneros hijos de 1.249 vacas y 85 toros, criados en la región de Andalucía (España). El efecto del estrés térmico se midió mediante un índice de temperatura-humedad obtenido a partir de los datos de cuatro estaciones meteorológicas. Se usó un modelo bivariado de regresión aleatoria de “norma-reacción” para estimar la (co)varianza del peso hasta el destete en dos diferentes épocas climáticas correspondientes a los meses cálidos y fríos. Resultados: Se encontraron diferencias en el patrón de heredabilidad de individuos criados en diferentes ambientes durante los primeros 90 días de vida. Sin embargo, tales diferencias no fueron significativas al final del periodo de crecimiento. Los terneros destetados en la época fría mostraron un mayor crecimiento entre 70 y 160 días en comparación con los criados en la temporada cálida. Conclusiones: Se encontró una evidencia altamente significativa de la interacción genotipo-condición climática durante los primeros tres meses de crecimiento del ternero.Antecedentes: O estresse térmico devido ao aumento da temperatura média está produzindo grandes perdas econômicas na indústria pecuária. Objetivo: Realizar uma nova abordagem metodológica para estimar a importância dos fatores climáticos em parâmetros genéticos em variáveis de crescimento da população da raça Retinta. Métodos: Foram analisados registros de peso vivo (n=7.753) de 3.162 Retinta bezerros, nascidos de 1.249 vacas e 85 touros criados na região da Andaluzia (Espanha). O efeito do estresse térmico foi medido utilizando o índice de temperatura-umidade obtido com dados climatológicos de quatro estações meteorológicas. Um modelo de regressão aleatória bivariado de norma-reação foi usado para estimar os componentes da (co)variância do peso à desmama em duas estações climáticas com correspondência aos meses quentes e fríos. Resultados: Diferenças foram encontradas no padrão de herdabilidade de indivíduos criados em diferentes ambientes nos primeiros 90 dias de idade. No entanto, essas diferenças não foram significativas no final do período de crescimento. Os bezerros desmamados globalmente na estação fria apresentaram um crescimento maior dos 70 aos 160 dias em comparação com os indivíduos criados na estação quente. Conclusões: Uma evidência altamente significativa da interação genótipo-ambiente foi encontrada durante os primeiros três meses de crescimento do bezerro.Instituto de Genética Veterinari

500 years of breeding in the Carthusian Strain of Pura Raza Español horse: An evolutional analysis using genealogical and genomic data

The Carthusian horse is a Pura Raza Español (PRE) strain (CS), bred as a closed population since its creation more than 500 years ago. The aim of this study was to analyse for the first time its population structure and situation of variability combining both genealogical (GEL) and genomic (GEN) data. The GEL data comprised 348,429 pedigree records (56,105 CS horses), while the GEN analysis included the high-density genotypes (670,804 SNPs) of 287 horses. Pedigree completeness demonstrated its accuracy, showing a good correlation of GEL (F) and GEN (FROH) inbreeding coefficient in the case of PRE subpopulations partially related and non-related to Carthusian strain (0.68) but a lower value in the 100% Carthusian horses (0.42), due to the high weight of founders not detected by GEL analysis. GEN (PCA, AMOVA, and Admixture) and GEL analysis showed a good differentiation of subpopulations, but also a high level of introgression of the CS in the breed during past decades. A recent change in this trend was noteworthy, with a considerable reduction in CS variability and a genetic bottleneck (effective population sizes of 31.57 and 30.20 in GEL and GEN analysis, respectively, in last generation). The PRE has maintained its variability, and a considerable difference in estimated Ne by GEL (60.77) and GEN (188.0) data was observed. Using two sources of complementary information, it was found the existence of an ancient PRE strain with a unique genetic landmark, practically free from the influence of other equine populations.Fil: Poyato Bonilla, Julia. Universidad de Sevilla; EspañaFil: Laseca, Nora. Universidad de Córdoba; EspañaFil: Demyda Peyrás, Sebastián. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Departamento de Clínica. Cátedra de Reproducción Animal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; ArgentinaFil: Molina Alcalá, Antonio. Universidad de Córdoba; EspañaFil: Valera Córdoba, Mercedes. Universidad de Sevilla; Españ

Impaired reproductive function in equines: From genetics to genomics

Fertility is one of the key factors in the economic and productive success of the equine industry. Despite this, studies on the genetic causes affecting reproductive performance are scarce, especially in mares, where the genetic architecture of the reproductive traits is extremely complex. Today, with the increasing availability of new genomic methodologies for this species, we are presented with an interesting opportunity to understand the genetic basis of equine reproductive disorders. These include, among others, novel techniques for detecting chromosomal abnormalities, whose association with infertility in horses was established over 50 years ago; new sequencing technologies permitting an accurate detection of point mutations influencing fertility, as well as the study of inbreeding and molecular homozygosity, which has been widely suggested as one of the main causes of low reproductive performance in horses. Finally, over the last few years, reproductive performance has also been associated with copy number variants and candidate genes detected by genome-wide association studies on fertility traits. However, such studies are still scarce, probably because they depend on the existence of large and accurate phenotypic datasets of reproductive and/or fertility traits, which are still difficult to obtain in equines.Fil: Laseca, Nora. Universidad de Córdoba; EspañaFil: Anaya, Gabriel. Universidad de Córdoba; EspañaFil: Peña, Zahira. Universidad de Córdoba; EspañaFil: Pirosanto, Yamila. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; ArgentinaFil: Molina, Antonio. Universidad de Córdoba; EspañaFil: Demyda Peyrás, Sebastián. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; Argentin

Nutraceutic Potential of Two Allium Species and Their Distinctive Organosulfur Compounds: A Multi-Assay Evaluation

This study aimed to evaluate the biological activities of two Allium species (garlic and onion) as well as diallyl disulphide (DADS) and dipropyl disulphide (DPDS) as their representative bioactive compounds in a multi-assay experimental design. The genotoxic, antigenotoxic, and lifespan eects of garlic, onion, DADS, and DPDS were checked in Drosophila melanogaster and their cytotoxic, pro-apoptotic, and DNA-clastogenic activities were analyzed using HL60 tumoral cells. All compounds were non-genotoxic and antigenotoxic against H2O2-induced DNA damage with a positive dose-response effect and different inhibition percentages (the highest value: 95% for DADS) at all tested concentrations. Daily intake of Allium vegetables, DADS, or DPDS had no positive effects on flies’ lifespan and health span. Garlic and DADS exerted the highest cytotoxic effects in a positive dose-dependent manner. Garlic and DADS exerted a DNA-internucleosomal fragmentation as an index of induced proapoptotic activity on HL60 cells. Allium vegetables and DADS were able to induce clastogenic strand breaks in the DNA of HL60 cells. This study showed the genomic safety ofthe assayed substances and their protective genetic effects against the hydrogen peroxide genotoxine. Long-term treatments during the whole life of the Drosophila genetic model were beneficial only at low-median concentrations. The chemo-preventive activity of garlic could be associated with its distinctive organosulfur DADS. We suggest that supplementary studies are needed to clarify the cell death pathway against garlic and DADS.Fil: Fernández Bedmar, Zahira Noemí. Universidad de Córdoba; EspañaFil: Demyda Peyrás, Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Merinas Amo, Tania. Universidad de Córdoba; EspañaFil: del Río Celestino, Mercedes. Laboratorio agroalimentario; Españ

La unidad de garantía de calidad (UGC) en los nuevos estudios oficiales de postgrado en Europa: primeras experiencias en un máster en la Universidad de Córdoba, España

El presente trabajo tiene como objetivo dar a conocer los resultados provisionales realizados por las nuevas Unidades de Garantía de Calidad formadas dentro de los estudios de Postgrado Europeos (Másteres) basados en la Declaración de Bolonia, del año 1999. Esta declaración, en la cual se sientan las bases del Espacio Europea de Educación Superior (EEES), pretende unificar la adecuación y evaluación de todos los estudios Universitarios de pre-postgrado en la Unión Europea. Estas unidades, cuyo funcionamiento pleno comienza con el curso 2010/2011 son las encargadas de velar por el cumplimiento de los estándares de calidad previstos en los distintos programas de estudio a lo largo de las Universidades Europeas. Se exponen las experiencias obtenidas en el primer año de trabajo de esta UGC en el Master de Medicina, Sanidad y Mejora Animal de la Facultad de Veterinaria de la Universidad de Córdoba, en España. Los distintos procesos evaluativos de los colectivos que componen la estructura de este master son detallados, así como las acciones propuestas en búsqueda de la mejora de la calidad del mismo.Eje temático 3: Los procesos de evaluación y acreditación b - La evaluación de las prácticas pedagógicas, los docentes y las institucionesFacultad de Ciencias Agrarias y Forestale

La utilización de nuevas tecnologías pedagógicas basadas en el uso de evaluaciones en tiempo real mediante el uso de Smartphone en la práctica áulica

En la actualidad las nuevas tecnologías y formas de comunicación 2.0, basadas en el uso de internet, brindan una oferta interminable de conocimiento y acceso a mecanismos de aprendizaje impensados unos años atrás. Sin embargo, las mismas generan el desafío de hacer de ellas un uso correcto para aprovechar su potencial en las actividades docentes. Más aún en los tiempos actuales en los cuales internet es una interminable fuente de información, la cual en muchos de los casos es parcial, o directamente errónea. Es por ello que muchos estudiantes utilizan esta plataforma como fuente de información, probablemente debido a que su generación maneja estas tecnologías con mayor frecuencia y facilidad que los textos académicos. Tal es así que hemos pasado de una cultura basada en el átomo a otra basada en el bit. Los enfoques didácticos más tradicionales que se utilizan para el aprendizaje son muy amplios y diversos. Podemos nombrar por ejemplo el uso de diferentes paradigmas, teorías, estilos de aprendizaje, actividades basadas en el constructivismo, actividades motivacionales en el aula, así como el desarrollo de las competencias básicas, el uso de las TIC´s, etc. (Padial y Gómez, 2013). En los últimos años, y con el objetivo de promover el aprendizaje autónomo entre los alumnos, es cada vez más frecuente la inclusión de métodos de innovación docente. Movilizados por la problemática de captar y mantener la atención de los estudiantes durante las clases teórico-prácticas, el profesorado de la cátedra decidió implementar una herramienta didáctica ligada altamente con uno de los factores en conflicto al respecto, no solo aceptar, sino aún, promover el uso del dispositivo celular en clase. Los alumnos debían descargar la aplicación a sus teléfonos celulares al comienzo del cuatrimestre. Una vez finalizados los teóricos, se proyectaban las preguntas y las opciones en el frente, y los alumnos visualizaban las opciones en sus celulares. Cada clase finalizaba la parte teórica con 10 preguntas con 2 a 4 opciones de respuesta y un tiempo de 30 segundos para responder cada pregunta. No solo se consiguió captar la atención de los alumnos durante el teórico, ya que requerían adquirir los conocimientos, entenderlos e integrarlos para una actividad inmediatamente posterior. Sino que se logró generar un ámbito lúdico en la clase, ya que la actividad se desarrollaba en forma dinámica y distendida. Como beneficio extra se logró que guardaran los teléfonos, con el fin de conservar batería para el momento de preguntas.Trabajo publicado en Giordano, Carlos José y Morandi, Glenda (comps.). Memorias de las 2º Jornadas sobre las Prácticas Docentes en la Universidad Pública. La enseñanza universitaria a 100 años de la reforma: legados, transformaciones y compromisos. Universidad Nacional de La Plata: La Plata, 2019.Presidenci

Effect of inbreeding depression on bull sperm quality and field fertility

The present study investigated the effect of inbreeding depression on sperm quality using automated and objective methods and subsequent effects on beef bull field fertility. Individual inbreeding coefficient (F) values and field fertility data were determined using a dataset of AI bulls belonging to the Spanish Retinta Breeders Association (Asociación Nacional de Criadores de Ganado Vacuno Selecto de Raza Retinta (ANCRE)). Animals were clustered in two groups according to the F values as follows: (1) a high inbreeding group (HI; F≥13.5%, mean 16.3); and (2) a non-inbreeding group (NI; F≤0%). In total, 17 different assessments were performed in both experimental groups, including evaluation of sperm morphology, acrosomal and DNA status, sperm plasma membrane integrity and function (hypo-osmotic swelling test), 10 kinetic parameters and the structure of sperm subpopulations. Sperm morphology, acrosomal and DNA status and osmotic tolerance were similar in both groups. Three velocity parameters (curvilinear velocity, straight line velocity and average path velocity) and the amplitude of lateral head displacement were higher in HI (P<0.05). Cluster analysis of kinematic parameters revealed three different sperm subpopulations (sP1, sP2 and sP3), with the proportion of the sP1 population (highly active but non-progressive spermatozoa) being significantly (P<0.05) higher in the HI group. Field fertility was assessed using two calving record datasets. In a smaller database including only bulls evaluated in the present study, there was a significant increase in the calving interval of cows sired with HI bulls. Conversely, in an extended genetic analysis of the ANCRE database, inbreeding only explained a small part of the variation in calving interval, and the results of regression analysis were not significant among bulls. The findings of the present study suggest that high inbreeding levels have a moderate effect on bull semen quality, with an increased percentage of highly active but non-progressive spermatozoa, but only when F values reached a certain threshold. This motility pattern could explain, in part, the higher calving interval produced by inbred bulls under field conditions.Instituto de Genética Veterinari

Breeding beef cattle for an extended productive life: Evaluation of selection criteria in the Retinta breed

We characterized genetically the longevity and the productive life of beef cows considering three different traits: length of true life (LTL), the length of productive life (LPL) and a number of calvings (NC), in the Retinta breed. Data considered in the analysis were collected in 30 Spanish herds and consisted of 3187 cows born between 1993 and 2013: 1802 cows had complete information while 1385 cows had censored information. Pedigree information accounted for 7359 individuals and the genetic evaluation was performed under an animal model using the Weibull proportional hazard model for survival analysis. Results indicated that cow effects (age at first calving, herd, season-year of cow birth), as well as some calf effects (breed group, season-year of birth), were significant (P&lt;0.05) for all traits; however, sex of calves did not affect the traits. The low heritabilities obtained for LTL and LPL (0.14±0.01 and 0.14±0.01 respectively) and modest heritability for NC (0.30±0.01), suggest that a higher response to selection can be expected for NC than for LTL and LPL.Instituto de Genética Veterinari