SARS-COV-2. Origin, vaccines, variants and the future of the pandemic

Desde fines de 2019 estamos viviendo un evento pandémico único en la historia de la humanidad. El antecedente más cercano, por su duración ysus consecuencias fue la pandemia de la gripe de 1918. A pesar de las múltiples consecuencias de este evento para salud pública, hoy nos encontramos mucho mejor preparados para combatir esta virosis y tratar a los pacientes con COVID-19. Conocimos rápidamente la identidad y las principales características del agente etiológico y apoco másde un año de declarada la emergencia sanitaria se han desarrollado vacunas que vienen mostrando ser efectivas y seguras. El objetivo de este trabajoes repasar las principales características del virus SARS-COV-2ylas diferencias y similitudes con otros coronavirus relacionados. Revisaremos los tipos yel desempeño de las vacunas actualmente en uso, y los desafíos que enfrentamos ante el surgimiento de ciertas variantes virales.Since the end of 2019 we are living a unique pandemic event in the human history. The closest precedent, for its lasting and consequences was the 1918 influenza pandemic. Despite the multiple consequences for public health, we are now much better prepared to fight this agent and to provide a better treatment to COVID-19 patients. The scientific community discovered soon the identity and the key biologic characteristics of the COVID-19 etiologic agent, and just over a year and a half from the pandemic declaration, safe and effective vaccines were developed. In the present work, we aim to look over the main characteristics of SARS-CoV-2, as well as the differences and similarities with related coronaviruses. We will review the different vaccine platforms and the performances of the vaccines in use and discuss the future challenges of the emergence of viral variants

Intervenção auxiliar no controle da hanseníase na área adscrita da equipe de saúde da família Planalto em Passos-MG

A hanseníase é uma doença que possui tratamento e cura, com fácil acesso a todos os doentes, no entanto, ainda falta informação na sociedade dificultando o diagnóstico da doença e contribuindo para formação de conceitos falsos e preconceituosos na população. Dentre as responsabilidades e ações estratégicas a serem desenvolvidas no âmbito da ESF encontra-se o controle da hanseníase. Com o objetivo de propor um projeto de intervenção para controle da hanseníase na área adscrita da ESF Planalto, em Passos-MG, optou-se pelo modelo de Planejamento Estratégico Situacional (PES) embasado em um estudo da literatura de forma descritiva e qualitativa. O plano de intervenção proposto tem a finalidade de capacitar a equipe de saúde para que a comunidade possa ser informada dos aspectos relacionados, principalmente, ao quadro clínico e tratamento da hanseníase. O conhecimento real da doença e a desmistificação de conceitos antigos contribuem para acabar com o preconceito relacionado aos portadores da doença. Outro ponto chave do plano de intervenção é o diagnóstico precoce e a instituição do tratamento adequado. A equipe capacitada e a população informada favorece o diagnóstico adequado e a procura pelo serviço diante dos sinais e sintomas identificados. Assim, a equipe necessita de insumos e medicamentos necessários que são distribuídos pelo Ministério da Saúde visando o tratamento supervisionado e a cura do paciente. Sendo o controle da hanseníase uma das ações estratégicas do Ministério da Saúde no âmbito da APS, verifica-se a relevância do presente estudo bem como o incentivo a pesquisas sobre a temática

Juquitiba-like Hantavirus from 2 Nonrelated Rodent Species, Uruguay

Serologic and genetic analyses indicate that a Juquitiba-like hantavirus circulates in Maldonado, Uruguay. This virus is carried by 2 rodent species, Oligoryzomys nigripes and Oxymycterus nasutus. The same hantavirus in 2 nonrelated species can be explained by a spillover infection or a host-switching event

Ecological and conservation significance of herpesvirus infection in Neotropical bats

Bats are the second most diverse order of mammals and key species for ecosystem functioning, providing a wide range of ecosystem services, from pest control to seed dispersal. Chiropterans are known for hosting a large diversity of viruses, in some cases with little or no effect to their health. Here, we report on the results of a screening for DNA (Herpesviridae) and RNA viruses (Rhabdovirus and Pneumovirus), finding a high prevalence and wide diversity of both Beta- and Gamma-Herpesvirus in insectivorous and hematopha-gous bats of the southern cone of South America. Our findings suggest that bats in the southern neotropics harbor a high diversity of herpesviruses and, at least in some cases, the viral community in the bat species is more strongly associated with ecological traits of the hosts, rather than their taxonomy. The presence of a separate clade into the Gammaherpesvirinae subfamily in the common vampire bat suggests the independent circulation of herpesviruses in hematophagous and insectivorous bats and highlights the properness of these viruses to track vampire bats’ population structure for rabies studies. Hence, we suggest that as other pathogens viruses may be used to track the population dynamics of their hosts, including movement and demographics.ANII: FCE_1_2019_1_15557

Biogeografía de los roedores Akodontini como reservorio de hantavirus en Sudamérica.

Las zoonosis emergentes conforman unas de las amenazas más relevantes para la salud pública global. En Sudamérica, la hantavirosis es una zoonosis autóctona causada por la transmisión a humanos a través de pequeños roedores de la tribu Akodontini, pertenecientes a distintas especies. La infección se produce principalmente por la inhalación de partículas virales presentes en la orina, heces y saliva de roedores infectados, o por el contacto directo. La enfermedad se caracteriza por causar fiebre hemorrágica o síndrome pulmonar por hantavirus (SPH), presentando una alta mortalidad. No existe tratamiento, por lo que es esencial adoptar medidas de prevención, como evitar el contacto con roedores infectados. La función la favorabilidad como modelo de distribución de las especies (SDM), permite determinar la relación entre las especies y el ambiente, con independencia de la prevalencia en sus distribuciones. A partir de la distribución de los roedores de la tribu Akodontini en Sudamérica (13 especies) y un conjunto de 35 predictores ambientales (espaciales, climáticas, hidrológicas, topográficas y antrópicas), se aplicó una regresión logística multifactorial y el algoritmo de la favorabilidad para determinar los factores explicativos de estas distribuciones, y predecir los territorios más favorables. Todos los factores ambientales resultaron representados en algún modelo. El componente espacial como factor histórico, y la influencia humana, fueron los factores más explicativos. Con excepción del noroeste de Sudamérica, el resto del subcontinente obtuvo valores altos de favorabilidad para alguna de las especies de roedores, por lo tanto, favorables para el reservorio de hantavirus. Los modelos se ajustaron adecuadamente a las presencias conocidas, e indicaron territorios favorables no ocupados, aportando un insumo cartográfico útil para adoptar medidas preventivas con la finalidad de reducir las posibilidades de contacto entre el humano y estos roedores.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Alphavirus Identification in Neotropical Bats

Alphaviruses (Togaviridae) are arthropod-borne viruses responsible for several emerging diseases, maintained in nature through transmission between hematophagous arthropod vectors and susceptible vertebrate hosts. Although bats harbor many species of viruses, their role as reservoir hosts in emergent zoonoses has been verified only in a few cases. With bats being the second most diverse order of mammals, their implication in arbovirus infections needs to be elucidated. Reports on arbovirus infections in bats are scarce, especially in South American indigenous species. In this work, we report the genomic detection and identification of two different alphaviruses in oral swabs from bats captured in Northern Uruguay. Phylogenetic analysis identified Río Negro virus (RNV) in two different species: Tadarida brasiliensis (n = 6) and Myotis spp. (n = 1) and eastern equine encephalitis virus (EEEV) in Myotis spp. (n = 2). Previous studies of our group identified RNV and EEEV in mosquitoes and horse serology, suggesting that they may be circulating in enzootic cycles in our country. Our findings reveal that bats can be infected by these arboviruses and that chiropterans could participate in the viral natural cycle as virus amplifiers or dead-end hosts. Further studies are warranted to elucidate the role of these mammals in the biological cycle of these alphaviruses in Uruguay.ANII:FCE_1_2019_1_15557

Genomic characterization and seroprevalence studies on alphaviruses in Uruguay

Alphaviruses (Togaviridae) are arboviruses frequently associated with emerging infectious diseases. In this study, we aimed to investigate the presence of alphaviruses in Uruguay by detecting the viral genome in mosquitoes and neutralizing antibodies in equines. A total of 3,575 mosquitoes were analyzed for alphavirus genome detection. Serologic studies were performed on 425 horse sera by plaque reduction neutralization test (PRNT80) against Venezuelan equine encephalitis virus (VEEV) subtype IAB, Pixuna virus (PIXV), Rio Negro virus (RNV), western equine encephalitis virus (WEEV), and Madariaga virus (MADV). Mosquitoes belonging to six genera were captured and 82.9% were identified as Culex pipiens. Two Cx. pipiens pools collected in Fray Bentos and Las Toscas localities were alphavirus positive, and phylogenetic analyses showed that the sequences grouped into two different clusters: the lineage I of eastern equine encephalitis virus and RNV (VEEV complex), respectively. Plaque reduction neutralization test assays showed antibodies against strains of the VEEV complex, MADV, and WEEV. Rio Negro virus was the most geographically widespread virus, showing higher seroprevalences (up to 20%). Seroprevalences against VEEV IAB ranged between 4.6% and 13%; antibodies against PIXV, WEEV, and MADV were less frequent (3–4%). In conclusion, RNV exhibited the highest seroprevalence in horses, a wide geographical distribution, and viral genome was detected in Cx. pipiens mosquitoes. Madariaga virus had a low seroprevalence in equines, but an epizootic lineage typical of North America was detected in Cx. pipiens mosquitoes. Taken together, our results show that alphaviruses are present in Uruguay with variable occurrence and geographical distribution being a potential threat for human and equine health

Prevalência da síndrome de burnout em professores de uma universidade do Estado de Minas Gerais / Prevalence of burnout syndrome in teachers at a university of the State of Minas Gerais

As condições sociais de trabalho e o estresse psicológico vivenciado decorrido dele atuam como fator de risco ocupacional, sendo capaz de afetar na prática toda a população economicamente ativa. Diante disso, o objetivo desta pesquisa foi identificar a prevalência da síndrome de burnout em docentes do ensino superior de uma universidade do interior de Minas Gerais. Realizou-se uma pesquisa descritiva de abordagem quantitativa, com 29 docentes da área de exatas, 32 da área de humanas e 52 da área de biológicas. Os dados foram coletados a partir de um questionário sócio demográfico para a construção do perfil profissional e comportamental dos participantes. Já para avaliação da síndrome foi utilizada a escala Maslach Burnout Inventory (versão em português), tabulados em planilha eletrônica. Diante disso, verificou-se que 38% da área de exatas, 37,5 % da área de humanas e 25% da área de biológicas são acometidos pela síndrome de burnout devido à presença do Score alto na dimensão de Exaustão Emocional, Despersonalização e Score baixo em Realização Pessoal, o que impõe a constatação de que a área de exatas é a mais afetada pela síndrome, seguida pela área de humanas e por fim, a área de biológicas. É sugestivo que fatores como sexo, idade, estado civil, grau acadêmico, quantidade de vínculos empregatícios, jornada de trabalho semanal, turno de trabalho, renda mensal, tempo de trabalho, filiação, religião, prática de atividade física, horas dormida por noite, alimentação equilibrada podem exercer influências como potencializadores, ou fatores de proteção da síndrome

CONSEQUÊNCIAS DA PANDEMIA DO COVID-19 NA SOCIALIZAÇÃO INFANTIL: UMA REVISÃO DA LITERATURA

Introduction: the social isolation resulting from the COVID-19 pandemic represented an abrupt change in the routine of the entire population. The children found themselves removed from their main place of conviviality and learning: the schools. This withdrawal can have detrimental consequences for building social skills and mental health. Objective: to analyze publications on the consequences of child socialization resulting from social isolation. Methodology: a literature review was conducted in order to answer the following scientific question: what are the main consequences of social isolation resulting from the COVID-19 pandemic for child socialization? To obtain the scientific repertoire, the databases SciELo, PubMED and LILACS were used, searching for the descriptors "children", "socialization", "social isolation" and "COVID-19" together with the Boolean term AND. The inclusion criteria were articles in English, Spanish and Portuguese, with a sample of children. Incomplete articles, duplicates, literature reviews, that presented an escape from the theme and that did not answer the scientific question were excluded. Results: A total of 2595 were found, 9 of which were obtained as samples after selection based on the inclusion and exclusion criteria. Among the main consequences of social isolation found in the children analyzed, we can mention the difficulty of socialization, increase in the rates of depression, anxiety, hyperactivity and aggressiveness, difficulty in emotional control, reduction in the practice of physical activity and increase in screen time. Introducción: el aislamiento social resultante de la pandemia de COVID-19 representó un cambio abrupto en la rutina de toda la población. Los niños se encontraron alejados de su principal lugar de convivencia y aprendizaje: las escuelas. Esta abstinencia puede tener consecuencias perjudiciales para la construcción de habilidades sociales y salud mental. Objetivo: analizar publicaciones sobre las consecuencias de la socialización infantil como resultado del aislamiento social. Metodología: se realizó una revisión de la literatura para responder a la siguiente pregunta científica: ¿cuáles son las principales consecuencias del aislamiento social resultante de la pandemia de COVID-19 para la socialización infantil? Para obtener el repertorio científico se utilizaron las bases de datos SciELo, PubMED y LILACS, buscando los descriptores "niños", "socialización", "aislamiento social" y "COVID-19" junto con el término booleano AND. Los criterios de inclusión fueron artículos en inglés, español y portugués, con una muestra de población infantil. Se excluyeron los artículos incompletos, duplicados, revisiones de literatura, que presentaban un escape del tema y que no respondían a la pregunta científica. Resultados: Se encontraron un total de 2595, 9 de los cuales se obtuvieron como muestras después de la selección basada en los criterios de inclusión y exclusión. Entre las principales consecuencias del aislamiento social encontradas en los niños analizados, podemos mencionar la dificultad de socialización, aumento de las tasas de depresión, ansiedad, hiperactividad y agresividad, dificultad en el control emocional, reducción en la práctica de actividad física y aumento del tiempo de pantalla. Introdução: o isolamento social decorrente da pandemia do COVID-19 representou mudança abrupta na rotina de toda população. As crianças se viram afastadas de seu principal local de convívio e aprendizado: as escolas. Esse afastamento pode ter consequências prejudiciais para a construção de habilidades sociais e para a saúde mental. Objetivo: analisar publicações sobre as consequências na socialização infantil decorrentes do isolamento social. Metodologia: foi realizada uma revisão de literatura de modo a responder a seguinte pergunta-científica: quais as principais consequências do isolamento social decorrente da pandemia do COVID-19 para a socialização infantil? Para a obtenção de repertório científico, utilizou-se as bases de dados SciELo, PubMED e LILACS, buscando-se pelos descritores “children”, “socialization”, “social isolation” e “COVID-19” juntamente com o termo booleano AND. Como critérios de inclusão estabeleceram-se artigos em idiomas inglês, espanhol e português, com amostra populacional infantil. Foram excluídos artigos incompletos, duplicatas, revisões de literatura, que apresentassem fuga ao tema e que não respondessem à pergunta-científica. Resultados: Foram encontrados, no total, 2595, sendo 9 obtidos como amostra após a seleção com base nos critérios de inclusão e exclusão. Dentre as principais consequências do isolamento social encontradas nas crianças analisadas, pode-se citar a dificuldade de socialização, aumento nos índices de depressão, ansiedade, hiperatividade e agressividade, dificuldade no controle emocional, redução da prática de atividade física e aumento no tempo de tela. Considerações finais: são necessários estudos mais aprofundados sobre as consequências do isolamento social para a saúde mental das crianças, principalmente em relação aos prejuízos das habilidades sociais.Introdução: o isolamento social decorrente da pandemia do COVID-19 representou mudança abrupta na rotina de toda população. As crianças se viram afastadas de seu principal local de convívio e aprendizado: as escolas. Esse afastamento pode ter consequências prejudiciais para a construção de habilidades sociais e para a saúde mental. Objetivo: analisar publicações sobre as consequências na socialização infantil decorrentes do isolamento social. Metodologia: foi realizada uma revisão de literatura de modo a responder a seguinte pergunta-científica: quais as principais consequências do isolamento social decorrente da pandemia do COVID-19 para a socialização infantil? Para a obtenção de repertório científico, utilizou-se as bases de dados SciELo, PubMED e LILACS, buscando-se pelos descritores “children”, “socialization”, “social isolation” e “COVID-19” juntamente com o termo booleano AND. Como critérios de inclusão estabeleceram-se artigos em idiomas inglês, espanhol e português, com amostra populacional infantil. Foram excluídos artigos incompletos, duplicatas, revisões de literatura, que apresentassem fuga ao tema e que não respondessem à pergunta-científica. Resultados: Foram encontrados, no total, 2595, sendo 9 obtidos como amostra após a seleção com base nos critérios de inclusão e exclusão. Dentre as principais consequências do isolamento social encontradas nas crianças analisadas, pode-se citar a dificuldade de socialização, aumento nos índices de depressão, ansiedade, hiperatividade e agressividade, dificuldade no controle emocional, redução da prática de atividade física e aumento no tempo de tela. Considerações finais: são necessários estudos mais aprofundados sobre as consequências do isolamento social para a saúde mental das crianças, principalmente em relação aos prejuízos das habilidades sociais

A deletion in SARS-CoV- 2 ORF7 identified in COVID-19 outbreak in Uruguay

The analysis of genetic diversity in SARS-CoV-2 is the focus of several studies, providing insights into how the virus emerged and evolves. Most common changes in SARS-CoV-2 are single or point nucleotide substitutions; meanwhile, insertions and deletions (indels) have been identified as a less frequent source of viral genetic variability. Here, we report the emergence of a 12-nucleotide deletion in ORF7a, resulting in a 4-amino acid in-frame deletion. The Δ12 variant was identified in viruses from patients of a single outbreak and represents the first report of this deletion in South American isolates. Phylogenetic analysis revealed that Δ12 strains belong to the lineage B.1.1 and clustered separated from the remaining Uruguayan strains. The ∆12 variant was detected in 14 patients of this outbreak by NGS sequencing and/or two rapid and economic methodologies: Sanger amplicon sequencing and capillary electrophoresis. The presence of strong molecular markers as the deletion described here are useful for tracking outbreaks and reveal a significant aspect of the SARS-CoV-2 evolution on the robustness of the virus to keep its functionality regardless loss of genetic material