Systematic Analysis of Duplications and Deletions in the Malaria Parasite P. falciparum: A Dissertation

Duplications and deletions are a major source of genomic variation. Duplications, specifically, have a significant impact on gene genesis and dosage, and the malaria parasite P. falciparum has developed resistance to a growing number of anti-malarial drugs via gene duplication. It also contains highly duplicated families of antigenically variable allelic genes. While specific genes and families have been studied, a comprehensive analysis of duplications and deletions within the reference genome and population has not been performed. We analyzed the extent of segmental duplications (SD) in the reference genome for P. falciparum, primarily by a whole genome self alignment. We discovered that while 5% of the genome identified as SD, the distribution within the genome was partition clustered, with the vast majority localized to the subtelomeres. Within the SDs, we found an overrepresentation of genes encoding antigenically diverse proteins exposed to the extracellular membrane, specifically the var, rifin, and stevor gene families. To examine variation of duplications and deletions within the parasite populations, we designed a novel computational methodology to identify copy number variants (CNVs) from high throughput sequencing, using a read depth based approach refined with discordant read pairs. After validating the program against in vitro lab cultures, we analyzed isolates from Senegal for initial tests into clinical isolates. We then expanded our search to a global sample of 610 strains from Africa and South East Asia, identifying 68 CNV regions. Geographically, genic CNV were found on average in less than 10% of the population, indicating that CNV are rare. However, CNVs at high frequency were almost exclusively duplications associated with known drug resistant CNVs. We also identified the novel biallelic duplication of the crt gene – containing both the chloroquine resistant and sensitive allele. The synthesis of our SD and CNV analysis indicates a CNV conservative P. falciparum genome except where drug and human immune pressure select for gene duplication

Novas tendências da recepção dos tratados internacionais de proteção aos direitos humanos no ordenamento jurídico brasileiro e o deslocamento de competência em casos de violação

Orientador: Tatyana Sheila FriedrichMonografia (graduação) - Universidade Federal do Paraná,Setor de Ciências Jurídicas, Curso de Direit

Educação de jovens e adultos em um currículo de vivências: um direito conquistado

Este trabalho tem como objetivo compreender como o currículo da Educação de Jovens e Adultos / EJA é estruturado, ou seja, como ele está organizado nesta modalidade educacional. Percebe-se, a partir da leitura de diferentes teóricos que abordam esta temática, como Freire (2005; 2006), Arroyo (2005) e Haddad (2007), que as experiências de vida que estes estudantes carregam consigo são conhecimentos essenciais para serem explorados dentro da sala de aula, no processo de escolarização. Todavia, há que se destacar que nem sempre esta perspectiva é contemplada na escolarização destes jovens e adultos que viram, por diferentes motivos, o seu direito à educação ser negado. A metodologia deste estudo é de abordagem qualitativa, de tipo bibliográfico e de campo. Como forma de geração de dados fundamentou-se em observações, registros em diário de campo, entrevista semiestruturada com professores e com o secretário da educação do município investigado e análise documental do Projeto Político-Pedagógico. Com a sua institucionalização a EJA passa a ter o direito a uma sala de aula com professor que atende a turma presencialmente e outros direitos como ao transporte escolar, por exemplo. Mas há também perdas, como a identidade popular, passando a ter uma lista de conteúdos a serem alcançados. Sendo assim, algumas escolas passam a transmitir conhecimentos ao invés de formar, junto a isso, cidadãos críticos e conscientes da sua realidade. Como resultados desta pesquisa pode-se perceber que a cultura está presente na sala de aula da EJA da escola investigada de duas formas distintas: 1) uma que aborda a cultura do aluno no discurso dos professores, em que é enfatizada como importante na aprendizagem do aluno, mas que está pouco presente nas práticas dos mesmos; e 2) outra, como uma cultura validada como apoio pedagógico, que é utilizada para auxiliar na transmissão dos conteúdos, ou seja, essa cultura é apropriada pelo professor para explicar conteúdos e não parte do aluno e de sua realidade como processo essencial para a reflexão e transformação social

A eficiencia dos mecanismos brasileiros de combate e prevençao a lavagem de dinheiro

Orientador: Murilo SchmittMonografia(Graduaçao) - Universidade Federal do Paraná,Setor de Ciencias Sociais Aplicadas, Curso de Ciencias EconômicasResumo: Lavagem de dinheiro é o processo pelo qual o dinheiro obtido de forma ilícita transforma-se, aparentemente, em lícito, sendo utilizado principalmente pelo crime organizado, que o reinveste em novos crimes. Observa-se, então, que a lavagem de dinheiro sempre está relacionada a um crime anterior, denominando-se "crime acessório". Sua atividade é prejudicial à sociedade e instituições financeiras e não financeiras, o que as tornam responsáveis, juntamente com o Estado, pelo seu combate. O processo de lavagem de dinheiro é dinâmico e articulado em ciclo, no qual, inicialmente, o dinheiro ilícito é introduzido no sistema econômico através de depósitos ou aquisição de bens negociáveis. Posteriormente, em diversas parcelas, é transferido de uma conta para outra, dificultando seu rastreamento. Essas contas são as chamadas "fantasmas" ou "de laranjas". Finalmente, o dinheiro é incorporado legitimamente ao sistema financeiro, por meio do seu investimento em outros negócios. Essas três etapas são respectivamente denominadas colocação, ocultação e integração. Atualmente, devido à globalização e às tecnologias avançadas, é cada vez mais fácil realizar lavagem de dinheiro. Suas conseqüências são desastrosas tanto no âmbito social quanto no econômico, podendo atingir até o sistema financeiro internacional. Com a conscientização internacional da gravidade do problema vários órgãos e entidades foram criados visando a prevenção e o combate à lavagem de dinheiro. Entre eles destacam-se o Conselho de Controle de Atividades Financeiras, o Comitê da Basiléia e o Grupo de Ação Financeira sobre Lavagem de Dinheiro. Os bancos são os principais veículos da lavagem de dinheiro, portanto, estão diretamente expostos aos riscos proporcionados por esta. Os principais riscos associados a esse crime são o risco legal, o risco de reputação e o risco operacional. Através da análise de dados a respeito da quantidade de comunicações de operações com indícios de lavagem de dinheiro feitas pelo COAF a outro órgãos e a respeito do número de inquéritos instaurados e pessoas indiciadas por crime de lavagem de dinheiro pela Polícia Federal verificou-se a falta de eficiência dos mecanismos existentes no Brasil para prevenção e combate à lavagem de dinheiro. Considerando-se a variedade de mecanismos e entidades criadas para prevenir e combater a lavagem de dinheiro e o tempo considerável de existência destas conclui-se que os dados expostos acima não são representativos

Phase I clinical trial of the Src inhibitor dasatinib with dacarbazine in metastatic melanoma.

BackgroundSrc inhibitors sensitise melanoma cells to chemotherapy in preclinical models. The combination of dasatinib and dacarbazine was tested in a phase I trial in melanoma.MethodsPatients had ECOG performance status 0-2 and normal organ function. Dacarbazine was administered on day 1 and dasatinib on day 2 through 19 of each 21-day cycle. Both were escalated from 50 mg b.i.d. of dasatinib and 800 mg m(-2) of dacarbazine. Available pre-treatment biopsies were sequenced for BRAF, NRAS, and C-Kit mutations.ResultsDose-limiting toxicity was reached at dasatinib 70 mg b.i.d./dacarbazine 1000 mg m(-2), and was predominantly haematological. In 29 patients receiving dasatinib 70 mg b.i.d., the objective response rate (ORR) was 13.8%, the clinical benefit rate (ORR+SD) was 72.4%, the 6-month progression-free survival (PFS) was 20.7%, and the 12-month overall survival (OS) was 34.5%. Two out of three patients who were wild type for BRAF, NRAS, and c-KIT mutations had confirmed partial responses, and one had a minor response.ConclusionThe recommended phase II dose is dasatinib 70 mg b.i.d with dacarbazine 800 mg m(-2). PFS and OS data for dasatinib at 70 mg b.i.d. with dacarbazine compared favourably with historical controls. Preliminary data support evaluating tumour mutation status further as a biomarker of response

Plasmodium vivax chloroquine resistance links to pvcrt transcription in a genetic cross

Mainstay treatment for Plasmodium vivax malaria has long relied on chloroquine (CQ) against blood-stage parasites plus primaquine against dormant liver-stage forms (hypnozoites), however drug resistance confronts this regimen and threatens malaria control programs. Understanding the basis of P. vivax chloroquine resistance (CQR) will inform drug discovery and malaria control. Here we investigate the genetics of P. vivax CQR by a cross of parasites differing in drug response. Gametocytogenesis, mosquito infection, and progeny production are performed with mixed parasite populations in nonhuman primates, as methods for P. vivax cloning and in vitro cultivation remain unavailable. Linkage mapping of progeny surviving \u3e 15 mg/kg CQ identifies a 76 kb region in chromosome 1 including pvcrt, an ortholog of the Plasmodium falciparum CQR transporter gene. Transcriptional analysis supports upregulated pvcrt expression as a mechanism of CQR

Temporalidade e Interpretabilidade na Análise de Narrativas

This paper highlights the importance of maintaining vertical consistence in narrative studies investigating human psyche. The principles of temporality and interpretability, proposed by classic authors as Bruner, Polkinghorne, Ricoeur e Sarbin, are taken as guidelines to maintain this consistence. To illustrate this idea, two narratives dealing with different themes are analyzed: one referring to school experience and the other to academic supervision of psychotherapy. For the first one the processes of segmentation and entanglement of the engaging time in the world of action compose the key-elements to analyze the meaning of school experience. For the second, different narrating times - one of the trainee and the other of the supervisor - create an interdiscourse from which meaning emerges as a consequence of the interrelationships of diverse narrating times.Destacamos a importância de manter uma consistência vertical nos estudos que versam sobre narrativas para a compreensão da psique humana. Nessa direção, os princípios da temporalidade e sua íntima relação com a interpretabilidade, propostos por autores clássicos como Bruner, Polkinghorne, Ricoeur e Sarbin, são tomados como guias na manutenção dessa consistência. Para ilustrá-la, analisamos duas narrativas versando sobre temas diversos: experiência escolar e supervisão acadêmica em psicoterapia. Na primeira, os processos de segmentação e encadeamento do tempo engajado no mundo da ação constituem elementos-chave de análise na significação da experiência escolar. Na segunda, o interdiscurso entre a estagiária e a supervisora se interliga e cria significado pela própria inter-relação entre tempos narrativos diversos

REHABILITACIÓN ESTÉTICA CON PRÓTESIS PARCIAL FIJA: REPORTE DE CASO CLÍNICO

O aumento da expectativa de vida e melhora nas condições bucais têm gerado grandes mudanças quando se trata de reabilitação com prótese dentária. Este trabalho trata-se de um relato de caso clínico realizado na Clínica de Odontologia do Centro Universitário da Serra Gaúcha – FSG - Caxias do Sul, partindo do diagnóstico, tratamento e acompanhamento de paciente do sexo masculino com necessidade de reabilitação protética com Prótese Parcial Fixa. O objetivo deste estudo consiste em considerar as alternativas mais comuns de reabilitação com prótese parcial fixa, devolvendo estética, função mastigatória e saúde aos pacientes parcialmente edentulos.The increase in life expectancy and improvement in oral conditions have generated major changes when it comes to rehabilitation with dental prostheses. This work is a clinical case report carried out at the Dentistry Clinic of the Centro Universitario da Serra Gaúcha – FSG - Caxias do Sul, based on the diagnosis, treatment and monitoring of a male patient in need of prosthetic rehabilitation with Fixed Partial Prosthesis. The objective of this study is to consider the most common rehabilitation alternatives with fixed partial dentures, restoring aesthetics, masticatory function and health to partially edentulous patients.  O aumento da expectativa de vida e melhora nas condições bucais têm gerado grandes mudanças quando se trata de reabilitação com prótese dentária. Este trabalho trata-se de um relato de caso clínico realizado na Clínica de Odontologia do Centro Universitário da Serra Gaúcha – FSG - Caxias do Sul, partindo do diagnóstico, tratamento e acompanhamento de paciente do sexo masculino com necessidade de reabilitação protética com Prótese Parcial Fixa. O objetivo deste estudo consiste em considerar as alternativas mais comuns de reabilitação com prótese parcial fixa, devolvendo estética, função mastigatória e saúde aos pacientes parcialmente edentulos.El aumento de la esperanza de vida y la mejora de las condiciones bucales han generado grandes cambios a la hora de la rehabilitación con prótesis dentales. Este trabajo es un relato de caso clínico realizado en la Clínica de Odontología del Centro Universitario da Serra Gaúcha – FSG - Caxias do Sul, a partir del diagnóstico, tratamiento y seguimiento de un paciente masculino con necesidad de rehabilitación protésica con Prótesis Parcial Fija. El objetivo de este estudio es considerar las alternativas de rehabilitación más comunes con prótesis parcial fija, devolviendo la estética, función masticatoria y salud a pacientes parcialmente edéntulos

Avaliação de clones de videira "Bordô" para elaboração de sucos tintos.

O trabalho objetivou avaliar seis clones de videira da cv. Bordô, uma das principais uvas comuns cultivadas para processamento no Rio Grande do Sul, devido à tonalidade violácea intensa, ao paladar apreciado pelo consumidor e pela resistência às principais doenças fúngicas. Clones de "Bordô" foram prospectados pela Embrapa Uva e Vinho com o apoio de empresas vitícolas entre 2012 e 2013, considerando: taxa de abortamento floral, estabilidade de produção, tamanhos de cacho e bagas, nos seguintes municípios: Videira (V), Antônio Prado (AP), Garibaldina (GA), Garibaldi (G), Nova Roma do Sul (NRS) e Farroupilha (F)