Flora of the basophilic fens Ljubica and Raketa (Baške Oštarije, Mt Velebit) with possible conservation measures

Cretovi su danas među najugroženijim staništima u Hrvatskoj. Unatoč tomu što su velikim dijelom stavljeni pod različite kategorije zaštite, oni i dalje ubrzano propadaju. S ciljem pronalaska načina na koji zaštititi neke od posljednjih cretova na Velebitu provedena je inventarizacija vaskularnih biljnih svojti na bazofilnim cretovima Ljubica i Raketa smještenim na području naselja Baške Oštarije na srednjem Velebitu. Utvrđeno je prisustvo 140 biljnih svojti na području creta Ljubica te 85 svojti na području creta Raketa, od čega se 52 svojte pojavljuju na oba creta. Očuvanje ovih cretova moguće je uz sprječavanje daljnjeg smanjenja dotoka vode na cret Ljubica te uz uklanjanje agresivnijih biljnih svojti i invazivnih vrsta koje na oba creta onemogućavaju opstanak svijetloljubivih cretnih svojti. S obzirom na snažan utjecaj čovjeka koji je doveo do značajnog smanjenja dotoka vode na područje creta jedini način da se cret Ljubica pokuša zaštiti je da ga se proglasi botaničkim rezervatom. Za praćenje učinkovitosti predloženih mjera zaštite potrebno je kontinuirano pratiti prisutnost i pokrovnost biljnih svojti karakterističnih za bazofilne cretove.Fens are among the most endangered habitats in Croatia today. Despite the fact that they are largely placed under different categories of protection, they continue to deteriorate rapidly. With the aim of finding a way to protect some of the last fens on Velebit Mountain, an inventory of vascular plants was carried out on the basophilic fens Ljubica and Raketa located in the area of the settlement Baške Oštarije on the middle part of Velebit Mountain. During the inventory, the presence of 140 plant taxa was determined in the Ljubica fen and 85 taxa in the Raketa fen. Of these, 52 taxa appear on both fens. Preservation of both fens is possible by preventing a further decrease in water flow to the Ljubica fen and by removing more aggressive plant taxa and invasive species that disable the survival of heliophilic fen taxa. Considering the strong influence of human, which led to a considerable reduction of the water flow in the fen area, the only way to try to protect the Ljubica fen is to declare it a botanical reserve. To see if the proposed measures produce results, it is necessary to continuously monitor the presence and coverage of plant species characteristic for basophilic fens

Fizikalno-kemijska, melisopalinološka i senzorska svojstva meda od unšijske mandarine (Citrus unshiu Marc.)

The honey bee forage resources in the Neretva Valley enable production of unifloral Satsuma mandarin (Citrus unshiu Marc.) honey. Given the insufficient knowledge about this type of honey, the aim of this study was to establish its botanical origin (pollen spectrum), as well as physico-chemical and sensory properties. In total nine samples of Satsuma mandarin unifloral honey collected from Neretva Valley in the period from 2014 to 2015 were analysed. Floristic observations have recorded 78 plant species and the results of qualitative melissopalynological analysis revealed pollen originating from 50 plant species in analysed honey samples. The number of determined types of pollen in individual honey samples varied from 8 to 19 with an average of 13 pollen types. Proportion of Satsuma mandarin pollen ranged from 3 to 35% with average of 10.88%. The average water content in honey samples range from 17.1% to 17.3%, electrical conductivity from 0.22 mS/cm to 0.27 mS/cm, pH value from 3.82 to 4.02 and diastase activity from 7.78 to 9.36. The main sensory attributes of Satsuma mandarin were determined by sensory analysis: colour ranging from light to dark yellow, orange blossom odour with medium intensity, weak to medium taste persistence characterised by medium sweetness and poorly expressed acidity, and floral and fruity aroma. Due to almost monocultural orchards of Satsuma mandarin in the Neretva Valley, the possibility of producing this rare type of honey in this region should certainly be utilized.Na osnovu pašnih resursa u dolini Neretve značajnu proizvodnju uniflornog meda od unšijske mandarine (Citrus unshiu Marc.) omogućavaju površine pod navedenim agrumom. Međutim, zbog nedovoljnih saznanja o ovoj vrsti meda cilj je ovog istraživanja bio utvrditi njegovo botaničko podrijetlo te fizikalno-kemijska i senzorska svojstva. S navedenog je područja analizirano ukupno 9 uzoraka meda od unšijske mandarine prikupljenih u razdoblju od 2014. do 2015. godine. Florističkim je opažanjima zabilježeno 78 biljnih vrsta, a kvalitativnom je melisopalinološkom analizom u uzorcima meda utvrđena pelud 50 biljnih vrsta. Broj se utvrđene peludi po uzorku meda kretao od 8 do 19, a prosjek je bio 13. Udio peludnih zrnaca unšijske mandarine u istraživanim se uzorcima kretao od 3 do 35% s prosjekom od 10.88 %. Prosječni se udio vode u uzorcima meda kretao od 17.1 do 17.3%, električne provodnosti od 0.22 mS/cm do 0.27 mS/cm, pH vrijednosti od 3.82 do 4.02, dok se aktivnost dijastaze kretala od 7.78 do 9.36. Senzorskom je analizom utvrđeno da boja meda varira od svijetlo do tamno žute, miris meda je po parfemu narančina cvijeta i srednjeg je intenziteta, okus je slabo do srednje postojan sa srednje izraženom slatkoćom i slabo izraženom kiselošću, dok je aroma srednje postojana, cvjetna, odnosno voćna. Na osnovu gotovo monokulturnih nasada unšijske mandarine u dolini Neretve trebalo bi iskoristiti mogućnost proizvodnje ove raritetne vrste meda

Novi lokaliteti rijetkih NATURA 2000 vrsta: Pulsatilla grandis Wender., Genista holopetala (Koch) Bald. i Cypripedium calceolus L. na području sjeverozapadnih Dinarida u Hrvatskoj

New localities of three rare and floristically interesting NATURA 2000 species in the north-western Dinaric Mountains in Croatia are presented in this paper. Pulsatilla grandis Wender. was found on the mountains around Rijeka, above Vinodol valley (Croatian Littoral), and in the central part of Mt Velebit. Genista holopetala (Koch) Bald. was found on the mountains around Rijeka and above Vinodol valley (Croatian Littoral), while Cypripedium calceolus L. was noticed on the southern part of Mt Velebit. Information about new sites will be of great help in the future research that is essential for all three species to ensure protection and assist in setting up population monitoring. Additionaly, it was ascertained that afforestation of grassland habitats by natural forest vegetation represents the greatest threat to P. grandis and G. holopetala.U radu su navedeni novi, do sada neobjavljeni lokaliteti triju rijetkih i floristički zanimljivih NATURA 2000 vrsta na području sjeverozapadnih Dinarida u Hrvatskoj. Novi lokaliteti vrste Pulsatilla grandis Wender. zabilježeni su na planinama u zaleđu grada Rijeke, iznad Vinodola te na području srednjeg Velebita. Genista holopetala (Koch) Bald. pronađena je na novim lokalitetima na planinama u zaleđu Rijeke i iznad Vinodola, dok su novi mikrolokaliteti vrste Cypripedium calceolus zabilježeni na području južnog Velebita. Podaci o novim lokalitetima predstavljaju značajan doprinos budućim istraživanjima ovih triju vrsta koja su neophodna za njihovu adekvatnu zaštitu i moguću uspostavu monitoringa nad njihovim prirodnim populacijama. Također, utvrđeno je da zaraštanje prirodnih travnjačkih staništa drvećem i grmljem trenutno predstavlja najveću opasnost za populacije vrsta P. grandis i G. holopetala

Istraživanje flavonoida i aminokiselina brnistre – Spartium junceum L. (Fabaceae)

Spartium junceum L. or Spanish broom is a shrub that can reach up to five meters tall, with erect, round, bright green, almost leafless stems. It is the only species of this genus native to the Mediterranean region and Canary Islands which grows in areas with full sun and limited water in poor, rocky soils. Thin-layer chromatographic analysis of flavonoids and phenolic acids in the stem, leaves and flowers of S. junceum collected from five separated geographic locations of Croatia showed the presence of quercetin, caffeic acid, quercitrin, isoquercitrin and hyperoside. Leaves contained the highest content of flavonoids (0.35%). Thin-layer chromatographic analysis of amino acids in the investigated plant parts showed the presence of 8 amino acids: leucine, phenylalanine, g-aminobutyric acid, tyrosine, proline, glutamine, serine and histidine

Manually curated and harmonised transcriptomics datasets of psoriasis and atopic dermatitis patients

We present manually curated transcriptomics data of psoriasis and atopic dermatitis patients retrieved from the NCBI Gene Expression Omnibus and EBI ArrayExpress repositories. We collected 39 transcriptomics datasets, deriving from DNA microarrays and RNA-Sequencing technologies, for a total of 1677 samples. We provide quality-checked, homogenised and preprocessed gene expression matrices and their corresponding metadata tables along with the estimated surrogate variables. These data represent a ready-made valuable source of knowledge for translational researchers in the dermatology field.Peer reviewe

Kvantitativna analiza arbutina i hidrokinona u listovima obične planike (Arbutus unedo L., Ericaceae) plinskokromatografskom metodom uz detekciju masenim spektrometrom

The phenolic glycoside arbutin and its metabolite with uroantiseptic activity hydroquinone occur naturally in the leaves of various medicinal plants and spices. In this study, an extraction procedure coupled with gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) was developed to determine arbutin and hydroquinone content in strawberry tree (Arbutus unedo L., Ericaceae) leaves. The method showed good linearity (R2>0.9987) in the tested concentration range (0.5-200 μg mL-1), as well as good precision (RSD0,9987) u ispitivanom koncentracijskom rasponu (0,5-200 μg mL-1), kao i dobru preciznost (RSD<5 %), analitički povrat (96,2-98,0 %) i osjetljivost (granica detekcije=0,009 μg mL-1 za arbutin i 0,004 μg mL-1 za hidrokinon). Rezultati dobiveni validiranom GC-MS metodom u dobroj su suglasnosti s rezultatima dobivenim metodom tekućinske kromatografije visoke učinkovitosti (HPLC). Predložena metoda je primijenjena za određivanje sadržaja arbutina i hidrokinona u metanolnom ekstraktu lišća. Sadržaj arbutina određen u lišću obične planike prikupljenom na otoku Koločepu (6,82 mg g-1 suhe mase) bio je veći u usporedbi sa sadržajem arbutina u lišću prikupljenom na otoku Malom Lošinju (2,75 mg g-1 suhe mase). Hidrokinon nije detektiran ni u jednom uzorku. Analitičke značajke predložene GC-MS metode pokazale su da se arbutin i hidrokinon mogu alternativno određivati plinskom kromatografijom. S obzirom na široki koncentracijski raspon, metoda je pogodna za analizu arbutina i hidrokinona, ne samo u lišću obične planike, nego također i u lišću biljaka drugih porodica (Rosaceae, Lamiaceae, itd.)

Kvantitativna analiza arbutina i hidrokinona u listovima obične planike (Arbutus unedo L., Ericaceae) plinskokromatografskom metodom uz detekciju masenim spektrometrom

The phenolic glycoside arbutin and its metabolite with uroantiseptic activity hydroquinone occur naturally in the leaves of various medicinal plants and spices. In this study, an extraction procedure coupled with gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) was developed to determine arbutin and hydroquinone content in strawberry tree (Arbutus unedo L., Ericaceae) leaves. The method showed good linearity (R2>0.9987) in the tested concentration range (0.5-200 μg mL-1), as well as good precision (RSD0,9987) u ispitivanom koncentracijskom rasponu (0,5-200 μg mL-1), kao i dobru preciznost (RSD<5 %), analitički povrat (96,2-98,0 %) i osjetljivost (granica detekcije=0,009 μg mL-1 za arbutin i 0,004 μg mL-1 za hidrokinon). Rezultati dobiveni validiranom GC-MS metodom u dobroj su suglasnosti s rezultatima dobivenim metodom tekućinske kromatografije visoke učinkovitosti (HPLC). Predložena metoda je primijenjena za određivanje sadržaja arbutina i hidrokinona u metanolnom ekstraktu lišća. Sadržaj arbutina određen u lišću obične planike prikupljenom na otoku Koločepu (6,82 mg g-1 suhe mase) bio je veći u usporedbi sa sadržajem arbutina u lišću prikupljenom na otoku Malom Lošinju (2,75 mg g-1 suhe mase). Hidrokinon nije detektiran ni u jednom uzorku. Analitičke značajke predložene GC-MS metode pokazale su da se arbutin i hidrokinon mogu alternativno određivati plinskom kromatografijom. S obzirom na široki koncentracijski raspon, metoda je pogodna za analizu arbutina i hidrokinona, ne samo u lišću obične planike, nego također i u lišću biljaka drugih porodica (Rosaceae, Lamiaceae, itd.)