Genome-wide metabolic re-annotation of Ashbya gossypii: new insights into its metabolism through a comparative analysis with Saccharomyces cerevisiae and Kluyveromyces lactis

BACKGROUND:Ashbya gossypii is an industrially relevant microorganism traditionally used for riboflavin production. Despite the high gene homology and gene order conservation comparatively with Saccharomyces cerevisiae, it presents a lower level of genomic complexity. Its type of growth, placing it among filamentous fungi, questions how close it really is from the budding yeast, namely in terms of metabolism, therefore raising the need for an extensive and thorough study of its entire metabolism. This work reports the first manual enzymatic genome-wide re-annotation of A. gossypii as well as the first annotation of membrane transport proteins.RESULTS:After applying a developed enzymatic re-annotation pipeline, 847 genes were assigned with metabolic functions. Comparatively to KEGG's annotation, these data corrected the function for 14% of the common genes and increased the information for 52 genes, either completing existing partial EC numbers or adding new ones. Furthermore, 22 unreported enzymatic functions were found, corresponding to a significant increase in the knowledge of the metabolism of this organism. The information retrieved from the metabolic re-annotation and transport annotation was used for a comprehensive analysis of A. gossypii's metabolism in comparison to the one of S. cerevisiae (post-WGD - whole genome duplication) and Kluyveromyces lactis (pre-WGD), suggesting some relevant differences in several parts of their metabolism, with the majority being found for the metabolism of purines, pyrimidines, nitrogen and lipids. A considerable number of enzymes were found exclusively in A. gossypii comparatively with K. lactis (90) and S. cerevisiae (13). In a similar way, 176 and 123 enzymatic functions were absent on A. gossypii comparatively to K. lactis and S. cerevisiae, respectively, confirming some of the well-known phenotypes of this organism.CONCLUSIONS:This high quality metabolic re-annotation, together with the first membrane transporters annotation and the metabolic comparative analysis, represents a new important tool for the study and better understanding of A. gossypii's metabolism.Research described in this article was financially supported by FEDER and "Fundacao para a Ciencia e a Tecnologia" (FCT): Project AshByofactory (PTDC/EBB-EBI/101985/2008 - FCOMP-01-0124-FEDER-009701), Strategic Project PEst-OE/EQB/LA0023/2013, Project "BioInd - Biotechnology and Bioengineering for improved Industrial and Agro-Food processes, REF.NORTE-07-0124-FEDER-000028" Co-funded by the Programa Operacional Regional do Norte (ON.2 - O Novo Norte), QREN, FEDER and the PhD grant to DG (SFRH/BD/88623/2012)

Compostos derivados de 2-benzil-2-halogenomalonatos, composição, uso e processo de obtenção dos compostos

DepositadaA presente invenção descreve compostos derivados de 2-benzil-2-halogenomalonatos com efeito depressor no sistema nervoso central (SNC), composições compreendendo os ditos compostos, o uso dos compostos e o processo de obtenção dos referidos compostos. A presente invenção situa-se nos campos da química, farmácia e medicina

Revisiting the Sequence Method for Baroreflex Analysis

The sequence method is an important approach to assess the baroreflex function, mainly because it is based on the spontaneous fluctuations of beat-by-beat arterial pressure (for example, systolic arterial pressure or SAP) and pulse interval (PI). However, some studies revealed that the baroreflex effectiveness index (BEI), calculated through the sequence method, shows an intriguing oscillatory pattern as function of the delay between SAP and PI. It has been hypothesized that this pattern is related to the respiratory influence on SAP and/or PI variability, limiting the SAP ramps to 3 or 4 beats of length. In this study, this hypothesis was tested by assessing the sequence method using raw (original) and filtered series. Results were contrasted to the well-established transfer function, estimated between SAP and PI. Continuous arterial pressure recordings were obtained from healthy rats (N = 61) and beat-by-beat series of SAP and PI were generated. Low-pass (LP) and high-pass (HP) filtered series of SAP and PI were created by filtering the original series with a cutoff frequency of 0.8 Hz. Original series were analyzed by either the sequence method or cross-spectral analysis (transfer function) at low- (LF) and high- (HF) frequency bands, while filtered series were evaluated only by the sequence method. Baroreflex sensitivity (BRS) and BEI of original series, calculated by sequence method, was highly (85–90%) determined by HP series, with no significant association between original and LP series. A high correlation (>0.7) was found between the BRS estimated from original series (sequence method) and HF band (transfer function), as well as for LP series (sequence method) and LF band (transfer function). These findings confirmed the hypothesis that the sequence method quantifies only the high-frequency components of the baroreflex, neglecting the low-frequency influences, such as the Mayer waves. Therefore, we propose using both the original and LP filtered time series for a broader assessment of the baroreflex function using the sequence method

Ehrlichia canis DNA in domestic cats parasitized by Rhipicephalus sanguineus sensu lato (s.l.) ticks in Brazil - case report

Ectoparasites can transmit pathogens, including bacteria such as Ehrlichia sp., which trigger infectious diseases in domestic animals. Little is known about the epidemiology of feline ehrlichiosis, although several studies have focused on elucidating the pathogenesis and transmission of this disease. This paper presents the first mutual infection by Ehrlichia sp. between a domestic cat and a Rhipicephalus sanguineus sensu lato (s.l.) tick removed from the animal. The cat and tick were tested by Polymerase Chain Reaction (PCR) to detect the dsb gene, and the analyzed sequences revealed samples 100% identical to E. canis. Based on this report, we discussed the importance of cats as E. canis reservoirs s and their position in the cycle of transmission between dogs and cats in Brazil.Os ectoparasitos são capazes de transmitir patógenos incluindo algumas bactérias, como a Ehrlichia sp., causando doenças em animais domésticos. Pouco se conhece sobre a epidemiologia da erliquiose felina, embora alguns estudos já tenham sido realizados para elucidar a sua patogenia e transmissão. Este trabalho relata a primeira infecção mútua por Ehrlichia sp. entre um felino doméstico e o carrapato Rhipicephalus sanguineus sensu lato (s.l.) removido deste animal. Ambos foram testados pela Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR) para detectar o gene dsb, e as sequências analisadas confirmaram amostras 100% idênticas à E. canis. Baseado neste relato é discutida a importância dos gatos como vetores de E. canis e sua posição no ciclo de transmissão de carrapatos entre cães e gatos no Brasil

Achados de imagem na doença de Tay-Sachs: um relato de caso

Objetivos: Revisar os achados de imagem característicos na doença de Tay-Sachs, um distúrbio autossômico recessivo raro. Metodologia: Relato de caso de um paciente do sexo masculino, de 1 ano e 6 meses de idade, com atraso no desenvolvimento neuropsicomotor e convulsões, que realizou exames de imagem no nosso serviço. Resultados: A tomografia computadorizada de crânio revelou, como principal achado, hiperdensidade espontânea nos tálamos, além de hipodensidade simétrica e difusa na substância branca supratentorial. A ressonância magnética de crânio mostrou alteração de sinal na substância branca nas imagens ponderadas em T2, com hipersinal na substância branca periventricular, profunda e subcortical, núcleos da base, cápsulas internas, externas e extremas, com preservação relativa do corpo caloso. Além disso, foi observado hipersinal espontâneo em T1 nos tálamos. Os corpos estriados exibiam volumes aumentados, com múltiplos focos puntiformes hipotensos em T2 (aparência manchada/salpicada). A espectroscopia de prótons revelou diminuição da razão N-acetil aspartato (NAA)/creatina (Cr) e aumento da proporção de mioinositol (mI)/Cr. A fundoscopia demonstrou manchas vermelhas maculares (cherry red spots). Conclusões: A doença de Tay-Sachs está associada a alterações de imagem fortemente sugestivas, podendo ser corroborado pela espectroscopia, devendo ser reconhecidas pelo médico radiologista para adequado diagnóstico diferencial das doenças neurológicas hipomielinizantes da infância

Misdiagnosis of canine monocytic ehrlichiosis: why do we still risk animal lives?

Canine Monocytic Ehrlichiosis (CME) is a tick-borne disease caused by Ehrlichia canis that manifests as acute, chronic, or subclinical forms without specific clinical symptoms. This disease is diagnosed using clinical and laboratory findings (blood smears, molecular techniques, and serology). This study aimed to demonstrate the occurrence of false-positive results for Ehrlichia spp. in veterinary clinical practice. Seventy dogs with positive blood smears before treatment for Ehrlichia spp. subjected to doxycycline and imidazole treatment were analyzed using hematological examination, polymerase chain reaction (PCR), and indirect immunofluorescence assay. PCR analysis identified no samples positive for E. canis according to PCR analysis, while serological techniques showed a frequency of 51.4% in dogs with antibodies (IgG) against Ehrlichia spp. There was a correlation between hyperproteinemia and titers > 10,240. Nonspecific changes occurred in 24.3% (17/70) of the patients with CME, such as anemia, leukopenia, and thrombocytopenia. The results indicated that the blood count and blood smear analysis were insufficient for diagnosis and that positive serological results associated with hematological changes suggestive of ehrlichiosis in dogs can be incorrectly assigned by a veterinarian, putting animals at risk.A Erliquiose Monocítica Canina (EMC) é uma doença transmitida por carrapatos causada pela Ehrlichia canis, apresentando formas aguda, crônica ou subclínica, sem sintomatologia clínica específica. O diagnóstico da doença é baseado na associação entre achados clínicos e laboratoriais (esfregaços de sangue, técnicas moleculares e sorologia). O objetivo deste estudo foi demonstrar a ocorrência de resultados falso-positivos para Ehrlichia spp. na prática clínica veterinária. Neste contexto, 70 cães com esfregaços sanguíneos positivos, antes do tratamento, para Ehrlichia spp. submetidos ao tratamento com doxiciclina e/ou imizol foram analisados por exame hematológico, testados por reação em cadeia da polimerase (PCR) e por ensaio de imunofluorescência indireta. Não houve a detecção de amostras positivas para E. canis pela análise de PCR, enquanto as técnicas sorológicas mostraram uma frequência de 51,4% de cães com anticorpos (IgG) contra Ehrlichia spp. Houve correlação entre hiperproteinemia e títulos > 10.240. 24,3% (17/70) apresentaram alterações inespecíficas que ocorreram na EMC, como anemia, leucopenia e trombocitopenia. Os resultados indicaram que o hemograma e a análise do esfregaço sanguíneo não foram suficientes para completar o diagnóstico em cães. No entanto, resultados sorológicos positivos associados a alterações hematológicas sugestivas de erliquiose em cães podem ser erroneamente atribuídos pelo veterinário, o que pode colocar em risco a vida dos animais

ATIVIDADE FÍSICA E CAPACIDADE FUNCIONAL PARA AS ATIVIDADES DA VIDA DIÁRIA DE IDOSOS USUÁRIOS DE UNIDADES BÁSICAS DE SAÚDE

Esse presente estudo teve como objetivo analisar o nível de atividade física e a capacidade funcional dos idosos usuários das Unidades Básicas de Saúde (UBS) de um município do noroeste paranaense. Estudo transversal, realizado com 654 idosos, de ambos os sexos. Foram utilizados o International Physical Activity Questionnaire, a Escala de Katz e a Escala de Lawton. A análise dos dados foi realizada por meio dos testes Kolmogorov-Smirnov. Qui-quadrado, Kruskal-Wallis, “U” de Mann-Whitney e Spearman. Considerou-se um nível de significância de p < 0,05. Os idosos com idade entre 60 a 69 anos e que procuram as UBS para consulta médica apresentaram melhor capacidade funcional nas atividades básicas de vida diária (ABVD) e nas atividades instrumentais de vida diária (AIVD). Os idosos não aposentados e com maior nível de atividade física apresentaram melhor capacidade funcional nas AIVD. Idosos sem histórico de quedas demonstraram melhor capacidade funcional nas ABVD. Existe tendência dos idosos com boa percepção de saúde e independência nas ABVD e AIVD terem nível de atividade física muito ativo/ativo. Variáveis sociodemográficas e condições de saúde estão associadas ao nível de atividade física e à capacidade funcional de idoso