A basin-wide Black Sea Mnemiopsis leidyi database

A specific marine biological data management tool, the Black Sea Mnemiopsis leidyi database system was created within the European Commission 6th framework Black Sea SCENE project for the Black Sea region and is now being supported by the Permanent Secretariat of the Black Sea Commission. The core team of scientists studying M. leidyi in the Black Sea was brought together and all their available M. leidyi data and metadata were loaded into the common database. This works on the Internet and has a simple user interface. It gives Black Sea scientists the option to load all their corresponding data on the database and to use it as an effective tool to work both with M. leidyi and, in future, with other gelatinous organisms’ data, including another invasive ctenophore Beroe ovata. All loaded metadata and historical data are available to the entire scientific community. More recent data are available to the team members and with some restrictions to other scientists.JRC.H.5-Land Resources Managemen

Iron Behaving Badly: Inappropriate Iron Chelation as a Major Contributor to the Aetiology of Vascular and Other Progressive Inflammatory and Degenerative Diseases

The production of peroxide and superoxide is an inevitable consequence of aerobic metabolism, and while these particular "reactive oxygen species" (ROSs) can exhibit a number of biological effects, they are not of themselves excessively reactive and thus they are not especially damaging at physiological concentrations. However, their reactions with poorly liganded iron species can lead to the catalytic production of the very reactive and dangerous hydroxyl radical, which is exceptionally damaging, and a major cause of chronic inflammation. We review the considerable and wide-ranging evidence for the involvement of this combination of (su)peroxide and poorly liganded iron in a large number of physiological and indeed pathological processes and inflammatory disorders, especially those involving the progressive degradation of cellular and organismal performance. These diseases share a great many similarities and thus might be considered to have a common cause (i.e. iron-catalysed free radical and especially hydroxyl radical generation). The studies reviewed include those focused on a series of cardiovascular, metabolic and neurological diseases, where iron can be found at the sites of plaques and lesions, as well as studies showing the significance of iron to aging and longevity. The effective chelation of iron by natural or synthetic ligands is thus of major physiological (and potentially therapeutic) importance. As systems properties, we need to recognise that physiological observables have multiple molecular causes, and studying them in isolation leads to inconsistent patterns of apparent causality when it is the simultaneous combination of multiple factors that is responsible. This explains, for instance, the decidedly mixed effects of antioxidants that have been observed, etc...Comment: 159 pages, including 9 Figs and 2184 reference

Denizlerin Önemi Hakkında Gelecek Nesillerimizi Bilinçlendirme Çalışmaları

Katı ve sıvı atıkların denizlere bırakılması, doğal kaynaklarımızın bilinçsizce tüketilmesi ve kıyılarımızın doğal yapılarının tahribatı gibi insan kaynaklı baskıların deniz ekosistemi üzerinde etkileri yapılan bilimsel çalışmalarla ortaya konmaktadır. İnsan kaynaklı baskılar sonucu denizlerdeki biyoçeşitlilik azalmakta ve barındırdıkları canlılara geri dönüşü olmayan zararlara neden olmaktadır. Bu yüzden, ileride bilimadamı, politikacı ya da karar verici olacak olan geleceğimizin teminatıçocuklarımıza yönelik yaptığımız uygulamalı deniz bilimleri eğitim faaliyetleri hayati önem taşımaktadır. Bilinçlendirme çalışmaları ile çocukların her birinin doğaya vecanlılar arasındaki ilişkilere bakış açıları değişmekte vecanlıları korumaya yönelik sorumluluk kazanmaktadırlar.Deniz kaplumbağaları için doğal bir üreme alanı olan Enstitümüz (ODTÜ-Deniz Bilimleri Enstitüsü) sahilinin korunması için 2012 senesinde enstitümüzdeki bir grup bilimadamı ilkokul ve ortaokul çocuklarına yönelik bilinçlendirme çalışmalarını başlatmıştır.2 yıldır çocuklara yönelik gerçekleştirilen birçok uygulamalı deniz bilimleri eğitim programından sonra yerel halktan olumlu dönüşler gelmiş, programı ulusal boyuta taşıyarak daha fazla çocuğa ulaşmak için programı İstanbul, İzmir ve Trabzon’da da 2014 yılından bu yana uygulanmaya başlanmıştır. Yaklaşık dört yıldır Mersin başta olmak üzere Trabzon, İzmir ve İstanbul’da yapılan yarım ve tam günlük eğitimler neticesinde 4000’in üzerinde öğrenciye ulaşılmıştır. ‘Denizimi Tanıyorum ve Koruyorum’ Uygulamalı deniz bilimleri eğitim programı iki aşamalı yapılmaktadır. ‘Denizimi Tanıyorum’ ile denizlerin ve deniz bilimlerinin önemi, deniz ekosistemi hakkında temel kavramlar, biyoçeşitliliğin önemi ve insan kaynaklı baskıların denizel çevre üzerindeki olumsuz etkileri anlatılmaktadır. ‘Denizimi Koruyorum’ ile hangi türlerin nesli tehlike altında olduğu ve nasıl korunması gerektiği, denizel çevreyi insan baskılarından nasıl korumamız gerektiği hakkında bilgiler verilmektedir. Çocuklarda farkındalığı artırmak için eğitimler seminerler, posterler, videolar, arazi gözlemleri, oyunlar ve eğitici bilime deneyleri eşliğinde yapılmakta olup donanımlı çevre gönüllüleri olarak yetişmeleri sağlanmaktadır

Erdemli Zaman Serisi Deniz Araştırmaları 2017

Denizel ortam önemli bir ekonomik kaynak olmasının yanı sıra su, karbon ve ısı döngüsünün bölgesel ve küresel iklim değişimleri belirlenmesinde önemli bir role sahiptir. Kaynakların aşırı kullanımı, kirlilik ve iklim değişikliği gibi etkenlerin denizel ortamlarda meydana getirdiği değişimlerin düzenli ve uzun süreli gözlemlenmesi, bu gözlemleri destekleyecek sayısal modeller ile öngörü yapılması bilimsel açıdan önemli olduğu kadar denizle doğrudan yada dolaylı olarak ilişkili tüm sosyo-ekonomik alanlar içinde önem arz etmektedir. Doğu Akdeniz’de yaklaşık 25 yıldır sürdürülen çalışmalar, özellikle yaz kış tabakalaşmalarında önemli değişimler olduğunu ve tabaklaşma döneminin uzadığını göstermektedir. Şüphesiz fiziksel ortamdaki bu ciddi değişikliğin kısa ve uzun dönemde deniz canlılarını ve tüm sistem dinamiklerini etkileyecektir. Bu değişimlerin gözlenmesi ve ileride hem iklim değişikliği hem de sistemin nasıl evrileceğini anlamak ve gerekli tedbirleri almak için zaman serisi çalışması tek yöntemdir. Erdemli Zaman Serisi çalışması kapsamında toplanacak ve üretilecek veriler bir çok analize ve son ürün olarak da model çalışmalarına temel girdi sağlayacaktır. Sonuç olarak, bu çalışma kapsamında yapılacak çalışmalar, ileride yapılacak ileri analizler ve modeller için temel girdi sağlayacaktır. Bunun yanında gerek tür çeşitliliğindeki değişimler ve mevsimlere bağlı olan bir çok canlının (balık ve diğer deniz ürünleri dahil), üreme dönemlerinde sapmalar gözlenecektir

A basin-wide Black Sea Mnemiopsis leidyi database

A specific marine biological data management tool, the Black Sea Mnemiopsis leidyi database system was created within the European Commission 6th framework Black Sea SCENE project for the Black Sea region and is now being supported by the Permanent Secretariat of the Black Sea Commission. The core team of scientists studying M. leidyi in the Black Sea was brought together and all their available M. leidyi data and metadata were loaded into the common database. This works on the Internet and has a simple user interface. It gives Black Sea scientists the option to load all their corresponding data on the database and to use it as an effective tool to work both with M. leidyi and, in future, with other gelatinous organisms' data, including another invasive ctenophore Beroe ovata. All loaded metadata and historical data are available to the entire scientific community. More recent data are available to the team members and with some restrictions - to other scientists.Publisher's Versio

The REM-sleep-related characteristics of narcolepsy: a nation-wide multicenter study in Turkey, the REMCON study

Introduction: Narcolepsy type 1 (NT1) is caused by hypocretin deficiency, the pathophysiology of narcolepsy type 2 (NT2) has not been delineated. Except for the hypocretin deficiency and cataplexy, all clinical and laboratory features used in the diagnosis of NT2 are identical to those used for NT1. The aim of this study was to assess the rapid eye movement (REM) sleep-related characteristics in the patients with narcolepsy; the characteristics of REM sleep in polysomnography (PSG) and multiple sleep latency test (MSLT) recordings, the quantification of REM sleep without atonia (RSWA) and atonia index, and the analysis of rapid eye movements (REMs) during REM sleep