The C-terminal extension of bacterial flavodoxin-reductases: Involvement in the hydride transfer mechanism from the coenzyme

To study the role of the mobile C-terminal extension present in bacterial class of plant type NADP(H):ferredoxin reductases during catalysis, we generated a series of mutants of the Rhodobacter capsulatus enzyme (RcFPR). Deletion of the six C-terminal amino acids beyond alanine 266 was combined with the replacement A266Y, emulating the structure present in plastidic versions of this flavoenzyme. Analysis of absorbance and fluorescence spectra suggests that deletion does not modify the general geometry of FAD itself, but increases exposure of the flavin to the solvent, prevents a productive geometry of FAD:NADP(H) complex and decreases the protein thermal stability. Although the replacement A266Y partially coats the isoalloxazine from solvent and slightly restores protein stability, this single change does not allow formation of active charge-transfer complexes commonly present in the wild-type FPR, probably due to restraints of C-terminus pliability. A proton exchange process is deduced from ITC measurements during coenzyme binding. All studied RcFPR variants display higher affinity for NADP+ than wild-type, evidencing the contribution of the C-terminus in tempering a non-productive strong (rigid) interaction with the coenzyme. The decreased catalytic rate parameters confirm that the hydride transfer from NADPH to the flavin ring is considerably hampered in the mutants. Although the involvement of the C-terminal extension from bacterial FPRs in stabilizing overall folding and bent-FAD geometry has been stated, the most relevant contributions to catalysis are modulation of coenzyme entrance and affinity, promotion of the optimal geometry of an active complex and supply of a proton acceptor acting during coenzyme binding. © 2013 Elsevier B.V.Peer Reviewe

Percepción de cambio climático en la población rural La Guama, San Sebastián de los Reyes, Aragua, Venezuela

Para determinar el grado de percepción sobre el cambio climático y problemas ambientales de la comunidad agrícola La Guama, ubicada en San Sebastián de los Reyes, Aragua, Venezuela, se diseño una encuesta semiestructurada, que se aplicó al azar a 72 habitantes de la comunidad. Se utilizó análisis descriptivo para obtener información básica inicial y un análisis de correspondencia simple para estudiar la asociación entre los problemas ambientales y climáticos con la edad y nivel educativo de la población encuestada, la cual fue clasificada en tres grupos etarios comprendidos desde 18 a 60 años. La comunidad La Guama es 100% rural, sólo 10% se dedica al trabajo agrícola y 10% no posee grado alguno de educación. Los sectores de la comunidad con educación primaria y secundaria detectaron los problemas ambientales: contaminación del agua (44%), basura (36%) y la contaminación del aire (32%). Al evaluar las condiciones climáticas, la opinión general es actualmente el clima es más cálido, lo cual es soportado por los datos históricos meteorológicos de temperatura. Se detectó una discrepancia entre los grupos etarios encuestados con respecto a los eventos de lluvia. Las personas más jóvenes perciben que las lluvias son más intensas y las sequías más intensas y frecuentes, contrario a la opinión del grupo de mayor edad. La opinión del grupo de edad intermedia no se asoció a ninguno de los otros grupos. Existe una clara percepción de los cambios climáticos en la zona, siendo el aumento del calor el de mayor importancia. Aunque la comunidad tiene claro el valor del cuidado del medio ambiente, la tala no fue considerada un problema ambiental, siendo éste de gran importancia debido a la ubicación geográfica de la población de La Guama

Uso de imágenes satelitales de alta resolución para evaluar parcelas experimentales en ensayos silvopastoriles

Agroforestry systems are an alternative to obtain a sustainable land use. The initial step in research in these systems is the selection of the experimental sites, which must be very well characterized to evaluate the relationships among the components of the system. The objective of this study was to use Ikonos satellite imagery: 1) to delimit the experimental plots and 2) to evaluate the spatial pattern of the arboreal cover. An Ikonos image and a gegraphical information system (GIS) were used to delimit the experimental plots, to obtain the area of each crown tree in the plots delimited, and the spatial distribution of the arboreal strata. The percentage of shade, the crown average, and the spatial distribution of trees in each plot were determined. An exploratory data and a quadrat analyses were employed. Using the Ikonos image and the GIS four plots of 7.31, 5.45, 6.58, and 8.60 ha were delimited. Three densities of shade were determined, that can be considered for effect of this work, as large (30%), medium (20-30%), and low (<10%). It was determined three plots with important arboreal cover and one where herbaceous cover predominated. It was established the occurrence of two spatial patterns, one random and another one cluster.Los sistemas agroforestales son una alternativa para lograr el uso sustentable de la tierra. El paso inicial en la investigación en estos sistemas es la selección de los sitios experimentales, los cuales deben ser caracterizados de forma tal que se pueda evaluar adecuadamente las relaciones entre los componentes del sistema. Este estudio tiene como objetivos usar una imagen satelital para 1) delimitar las parcelas experimentales y 2) evaluar el patrón espacial de la cobertura arbórea. Para ello se utilizó una imagen Ikonos y un sistema de información geográfica (SIG), mediante los cuales se delimitaron los lotes experimentales, la superficie de la copa de cada árbol y la distribución espacial del estrato arbóreo en los lotes del área de estudio. Adicionalmente, se determinaron el porcentaje de sombra, área promedio de la copa, distribución en cada parcela y estadísticos descriptivos. Se realizó un análisis exploratorio de datos y un análisis de cuadrícula. Utilizando la imagen y el SIG se delimitaron cuatro parcelas de 7,31 5,45 6,58 y 8,60 ha, respectivamente. Se determinaron tres niveles de sombra, que pueden ser consideradas para efecto de este trabajo como alta (>30%), media (20-30%) y baja (< 10%). Se tienen tres parcelas con cobertura arbórea importante y solo una donde predomina la cobertura herbácea. Se estableció la ocurrencia de dos patrones espaciales de árboles, uno aleatorio y otro en conglomerado