Local up-down asymmetrically shaped equilibrium model for tokamak plasmas

A local magnetic equilibrium model is presented, with finite aspect ratio and up-down asymmetrically shaped cross section, that depends on eight free parameters. In contrast with other local equilibria, which provide simple magnetic-surface parametrizations at the cost of complex poloidal-field flux descriptions, the proposed model is intentionally built to afford analytically tractable magnetic-field components. Therefore, it is particularly suitable for analytical assessments of equilibrium-shaping effects on a variety of tokamak-plasma phenomena.Comment: 6 pages, 3 figure

Improving awareness and reinforcing brand positioning in savings and investments in a digital era: Pedagogical case study

The recent Covid19 pandemic put the entire world in lockdown and has been limiting people’s movement. This means that Banks have the urge necessity to increase their online presence and improve the online services provided to attract more clients. With the emergence of the pandemic, BiG needed to adapt to the market needs and adjust in a way that makes sense to BiG's core business. There had to be a migration to digital, since branches had to close "overnight" and invest in non-face-to-face care, which was not a priority until then. With all this happening, I joined the marketing department of Banco de Investimento Global, during the restructuring of the team, to help the bank grow and reinvent itself. Several campaigns were developed to attract new clients and promote BiG trading platforms. We created an ecosystem of digital channels and social networks that portray the bank essence. The impact of our marketing strategy was successful, showing that we put in place effective strategies. Banks do not have to have an aversion to change. They can adapt to new realities in a short period of time.Em 2020 uma pandemia entrou no mundo e fez com que, quer pessoas, quer setores se tivessem que reinventar, colocando o mundo inteiro em confinamento e limitando o movimento das pessoas. No caso do setor bancário, altamente dependente do contacto físico, teve que haver uma mudança de paradigma e mentalidade, de forma que usassem mais os meios digitais. De “um dia para o outro”, as agências tiveram que fechar, e um negócio tão assente nelas teve que se reinventar. Com a deslocalização das pessoas foi essencial investir no atendimento não presencial, algo que não era prioridade até então. Com tudo isto a acontecer, entrei para o departamento de marketing do Banco de Investimento Global, durante a restruturação da equipa, para ajudar o banco a crescer e reinventar, utilizando sempre estratégias que fizessem sentido para o core business do BiG. Foram desenvolvidas diversas campanhas e criado um ecossistema de canais digitais e redes sociais, tendo tido resultados positivos. O banco teve sucesso nas campanhas realizadas e mostrou ter implementado estratégias eficazes. Os bancos não têm que ter aversão à mudança e devem adaptar-se, num curto espaço de tempo, a novas realidades

If you cannot beat them, make them join you : the risks of capture in portuguese regulatory agencies

The rise of the regulatory state (Levi-Faur 2005) led to the global diffusion of independent regulatory agencies – IRAs – (Jordana et al. 2018) which are expected to operate at arm's length from politicians and the regulated businesses (Majone 1997; Thatcher 2002). Diffused across different geographies, sectors, varieties of capitalism, and administrative and political traditions, IRAs became an institutional norm of regulation. However, several crises have questioned their performance and raised concerns over industry capture and politicization (Lodge and Mennicken 2014). This thesis tackles these issues through five questions: i) To what extent are IRAs shielded from capture at the de jure and de facto levels? ii) Have IRAs experienced any changes in independence over the years? iii) In which direction has institutional change moved? iv) Which inputs have contributed to that change? v) Are there sectors that are more likely to be captured than others? The thesis adopts a cross-sectorial and diachronic with-in case study approach, in seeking to understand how eleven Portuguese IRAs in key economic sectors evolved overtime on what concerns their legal and de facto independence vis-à-vis the external stakeholders. Empirically, the study finds that the agencies are subject to a variety of political and industry influences that are exerted through different forms. At the formal level, the regulatory state as a whole and the IRAs, in particular, have shown inconsistencies and shortcomings that can render them fragile. Moreover, the successive legal reforms suggest that agencies continue to show credibility problems, but also that politicians keep safeguarding control mechanisms. At the de facto level, the politicization and industry capture are observable and measurable through the intensity of the revolving door, particularly in the financial and the utilities agencies

Peopling of greek islands: understanding the Bronze Age transition with ancient genomes

Tese de mestrado, Bioinformática e Biologia Computacional, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2019O ramo da arqueologia tem sido, ao longo dos anos, alvo de uma revolução proporcionada pelos avanços de estudos genómicos e desenvolvimento de ferramentas computacionais. A possibilidade de extrair ADN de restos arqueológicos datados de há milhares de anos (ancient DNA), permite que se possa reconstruir com bastante detalhe o passado demográfico das populações, como migrações ou eventos de fluxo de genes. No entanto, extrair DNA deste tipo de materiais apresenta diversas dificuldades: i) alguns métodos de extração são bastante destrutivos, pelo que técnicas menos invasivas têm sido desenvolvidas (um exemplo é extrair ADN do osso temporal onde há maiores concentrações de ADN não contaminado); ii) com o decorrer do tempo ocorre degradação do ADN que fica mais fragmentado e danificado, ocorrendo um processo denominado por deaminação que resulta na troca de purinas ( G → A) e pirimidinas (C → T); iii) as amostras contêm sempre contaminação por outras fontes de ADN (bactérias, fungos ou até das pessoas que manuseiam a amostra); iv) as condições ambientais também têm muitas implicações na preservação do ADN, por exemplo zonas com temperaturas baixas conservam melhor o material genético, e ainda é complicado obter amostras de qualidade em zonas mais quentes. Por estes motivos é importante desenvolver métodos computacionais e bioinformáticos que permitam analisar ancient DNA tendo estes aspetos em conta, como o facto de grande parte das amostras apresentarem uma baixa cobertura (depth of coverage) ou os padrões de deaminação poderem causar enviesamentos. Com o aumento de genomas humanos antigos disponíveis vários autores têm tentando perceber a expansão da agricultura na Europa, que começou no Neolítico sensivelmente há 10,500 anos no Crescente Fértil e que coincidiu com o surgimento dos primeiros povos sedentários, que se estabeleceram no Neolítico. No entanto, foi apenas na idade do Bronze (5,500 – 2,500 BCE) que as primeiras civilizações começaram a emergir na Europa, na zona do mar Egeu. Destacam-se três civilizações: os Micénicos, que pertenciam à cultura Heládica que se estendia de norte a sul da atual Grécia, os Minoicos na ilha de Creta e os Cicládicos, nas ilhas Cíclades. O facto de viverem em grandes centros urbanos e do registo arqueológico sugerir que existia contacto entre os povos do Egeu, indica que este período foi associado a um aumento do efetivo populacional. Ao nível genómico, espera-se que indivíduos pertencentes a populações com menor efetivo populacional ou descendentes de cruzamentos de parentes próximos apresentem longas regiões do genoma onde são homozigóticos para posições variáveis sucessivas (Runs of Homozigosity - ROH). Nesta tese investigámos se na Grécia a transição para a Idade do Bronze esteve associada a movimentos de pessoas (e como tal variações de componentes genéticas), ou se ocorreu como parte de um processo de difusão cultural (sem grandes alterações de componentes genéticas). Ao comparar genomas do Neolítico, Idade do Bronze e de populações atuais, caracterizámos como é que a estrutura populacional se alterou ao longo do tempo, permitindo perceber a relação entre os gregos do continente e das ilhas. Com as nossas análises conseguimos ainda avaliar qual a relação entre os habitantes atuais (quer do continente quer das ilhas), com as populações que habitavam as mesmas regiões durante o Neolítico e a Idade do Bronze. Por fim, calculámos ROH de forma a testar se o provável aumento populacional associado a centros urbanos e aumento de comunicação entre populações do mar Egeu se reflete ao nível do genoma, no número e tamanho das ROH. Dado a falta de métodos computacionais para lidar com a limitação de trabalhar com baixa cobertura (low depth of coverage), característica de ancient DNA, desenvolvemos um método heurístico para calcular ROH em genomas de indivíduos com baixa coverage. Analisámos genomas recentemente sequenciados de amostras da idade do Bronze (datadas de 2,890-1,831 BCE) que correspondem às amostras mais antigas pertencentes a cada uma das três civilizações Gregas. As amostras das ilhas Ciclades, Creta e dos Micénicos da região da Peloponésia correspondem ao início da Idade do Bronze, enquanto que as amostras dos Micénicos do norte da Grécia são do Meio da Idade do Bronze. Estes seis indivíduos foram sequenciados pelo método de shotgun whole-genome sequence (WGS). De destacar que as amostras Cicládicas são as primeiras, até à data, a terem sido sequenciadas em indivíduos pertencentes à civilização Cicládica. Os dados genómicos destes indivíduos foram comparados com dados de SNP array (Human Origin Affymetrix array que tem SNPs neutrais e que por isso a frequência alélica nesses SNPs é apenas afectada pela demografia e não por seleção) já publicados de humanos modernos e antigos, desde o Neolítico à idade do Bronze, incluindo Anatólios (atual Turquia), caçadores recolectores (da Escandinávia, Rússia e Europa Oeste), Micénicos e Cretenses do final da Idade do Bronze e povos do Cáucaso, Irão e regiões circundantes, entre outros. Para analisar conjuntamente dados de SNP array e de WGS tendo em conta a baixa cobertura (low depth of coverage) desenvolvemos um script que amostra uma read ao acaso de cada posição variável no genoma para cada individuo. Após juntar as nossas amostras aos dados existentes obtivemos um total de 2,399 indivíduos e 165,447 SNPs. Utilizámos o software ADMIXTURE para detetar clusters e inferir a proporção de cada cluster em cada indivíduo. Esta análise permitiu perceber se a transição do Neolítico para a idade do Bronze está associada a alterações genéticas nas proporções de diferentes clusters e se existem diferenças entre continente e ilhas. Permitiu-nos também perceber a relação entre Gregos e Cretenses modernos com as populações que habitaram a mesma região no Neolítico e na Idade do Bronze. Os nossos resultados indicam que os agricultores Gregos e Anatólios do Neolítico eram bastante homogéneos, com quase 100% de um dos clusters. No entanto, nos Gregos da Idade do Bronze os indivíduos começam a ter proporções de outros clusters, o que indica que têm uma ancestralidade diferente dos Gregos do Neolítico. Os nossos resultados sugerem que ocorreram migrações na zona da Grécia durante a idade do Bronze. De destacar o facto de estimarmos o aumento da proporção de duas componentes genéticas na Grécia durante a Idade do Bronze: uma associada a populações relacionadas com caçadores recolectores europeus e outra associada a populações vindas de leste, nomeadamente do Cáucaso e Irão. Nos seis indivíduos sequenciados representantes das três civilizações Gregas foi possível distinguir dois grupos: (i) Minóicos, Cicládicos e Micénicos, do sul da Grécia (Peloponésia), que têm duas componentes genéticas associadas aos povos agrícolas do Neolítico e povos do Cáucaso e Irão; (ii) amostras do norte da Grécia, que para além das duas componentes referidas apresentam uma terceira componente relacionada com os caçadores recolectores europeus e povos das estepes. A elevada proporção da componente relacionada com os caçadores-recolectores nos indivíduos do Norte da Grécia, quando comparado aos restantes, pode-se dever a: (i) um maior efetivo populacional, o que mantém a diversidade genética ancestral; (ii) estrutura populacional resultante de um contacto reduzido das populações do norte da Grécia com as do sul e ilhas; (iii) fluxo genético durante um período mais prolongado com populações de caçadores-recolectores que contêm uma elevada proporção dessa componente. Verificámos ainda que os Gregos e Cretenses modernos apresentam as componentes em proporções semelhantes àquelas que nós encontrámos em amostras da Idade do Bronze no norte da Grécia. De forma a averiguar se o possível aumento dos centros urbanos e comunicação entre populações do mar Egeu se reflete nos níveis de inbreeding, aplicámos o método que desevolvemos para detetar ROHs nos genomas das seis amostras da Idade do Bronze. O método que desenvolvemos, ainda que preliminar, permite detectar ROH para dados com coverage reduzida utilizando genotype likelihoods. Para tal definimos uma probabilidade limiar (P) para considerar um site homozigótico (ex: P > 0.8). O método é flexível e permite considerar que um determinado site, com por exemplo uma probabilidade de ser homozigótico P entre 0.5 e 0.8, seja incluído numa ROH no caso de nas posições circundantes a probabilidade de ser homozigótico seja acima do limiar (P > 0.8). Aplicando este método ao cromossoma 21, as ROHs detectadas são pequenas (a maior com 0.31 Mb). Estas análises para detetar ROH foram limitadas ao cromossoma 21 devido a limitações de tempo. Utilizámos também um método padrão (PLINK) mas com esse método não foi possível detetar ROH. No futuro, seria importante testar o PLINK e o nosso método para os restantes cromossomas. Os scripts que desenvolvemos para analisar dados com baixa cobertura (low depth of coverage) estão disponíveis no github, incluindo o script para juntar dados de WGS com SNP array amostrando uma read ao acaso, assim como o método para detectar ROHs com base em genotype likelihoods.The field of archeology has been revolutionized by genomic studies analyzing ancient DNA from human archeologic findings. Ancient genomes from humans allowed us to reconstruct the past demographic history, revealing major migration events. However, ancient DNA has several preservation problems which usually compromise the sequencing quality of the samples. These problems are more prevalent in warmer regions, like Greece, resulting in a low depth of coverage. Therefore, there is a need to develop bioinformatic tools and pipelines to analyze such low coverage data. On my thesis I focused on the dispersal and spread of farming from Asia into Greece from the Neolithic (10,500-5,000 BP) and the transition to the Bronze age (5,000-2,500 BP). The Neolithic was first characterized by the appearance of farming settlements and later by the appearance of pottery. But it was not until the Bronze Age that the first civilizations started to appear in Europe. According to archeological data, some of the first civilizations that arose in Europe were the Minoans (Crete), the Mycenaeans (mainland Greece) and the Cycladics from the Cycladic Islands. Genomic data can be used to infer population structure and past effective sizes of populations. This can be done by detecting regions of the genome for which an individual is homozygous for successive variable sites (Runs of Homozygosity-ROH). Individuals with more and longer ROH reflect either a low population effective size or consanguinity. In this thesis, we analyzed ancient DNA samples to investigate if the transition from the Neolithic to the Bronze Age in Greece was associated with movement of people (and hence with a genetic component) or if it happened as a cultural diffusion process without a major genetic shift. By comparing ancient samples with other ancient and present-day people we inferred how population structure changed through time. Finally, we estimated ROH to test if there were differences in the inbreeding levels of samples from islands and mainland Greece, which could reflect different effective sizes. Because of the lack of tools to accurately call ROH in low coverage data, we developed a heuristic approach to detected small stretches of homozygous sites using genotype likelihoods. We also developed a pipeline to merge modern and ancient genomes with low depth of coverage by sampling one read per site per individual, and made all scripts publicly available on github. We analyzed six ancient genomes of newly sequenced Greek samples, belonging to three different cultures, from the beginning of the Bronze Age. We then merged them with already published ancient and modern genomic data from other relevant populations, such as Anatolians, Eurasian hunter-gatherers, populations from the steppes and Caucasus. Our results indicate that compared to Neolithic Greeks, during the Bronze Age there is an increase in the proportions of ‘a northern’ European Hunter-Gather related component and an ‘eastern’ Caucasus/Iranian-related component in Greece. This suggests that the transition to Bronze Age was associated with a genetic shift, one related to people from the Caucasus and later one related to European Hunter-Gatherers. Furthermore, we found that modern day Greeks and Cretans share the same ancestry as two of our newly sequenced middle Bronze Age individuals from northern Greece. By applying our ROH method on chromosome 21 we identified small stretches of homozygous sites in the six newly sequenced individuals. However, we only detected small ROH (< 0.31 Mb) and further validation of the method is required

Regulating Ethics in Parliaments: Measuring Regime Robustness

Ethics regulation in parliaments has grown significantly over the last decades, as a result of political scandals, public outcry, and policy diffusion promoted by international organizations. Ethics regulatory regimes vary according to the focus of the norms (compliance vs. integrity or transparency vs. sanctions) and according to the degree of externalization of oversight and enforcement mechanisms (external to parliament, internal, or mixed). The mere existence of regulation says little about how strong these regimes are. Drawing on original data collected through an institutional checklist of 21 indicators, we develop an Ethics Regulation Robustness Index to measure the scope of norms, the strictness of sanctions, and the powers granted to oversight and enforcement bodies in 17 European parliaments. Our findings suggest that the externality of the oversight and enforcement is not a good predictor of the robustness of the ethics regulations.info:eu-repo/semantics/acceptedVersio

Mapping ethics self-regulation within political parties: Norms, oversight and enforcement

This article introduces the new Party Ethics Self-Regulation database, covering 21 indicators on ethics self-regulation organised into three categories (norms, oversight and enforcement) across 200 political parties of 25 countries available in 2020. Internal self-regulatory efforts developed by political parties have been insufficiently addressed in the literature and remain a blind spot in existing databases on political parties. Our analyses indicate that Radical Right Parties have a lower probability of adopting codes of conduct/ethics when compared to any other party family. It also reveals the strongest effect of country-level factors, with party system institutionalization, political corruption or level of democracy shaping the adoption of at least one form of ethics regulation/body. These findings are relevant because they open the debate about the possibility of incrementing ethics self-regulation within political parties through ethics-targeted public funding and raise the need for further research on the effects of such measures on the parties’ ethical climate and public legitimation.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Lóbi a descoberto : o mercado de influências em Portugal

Empresas e indivíduos com os meios e a capacidade de influenciar decisões públicas em Portugal podem fazê-lo sem qualquer receio de eventuais restrições ou regulação. O lóbi não é regulado e a questão ainda nem sequer chegou ao debate público. A construção e obras públicas, o setor financeiro e da energia foram identificados como aqueles em que práticas de lóbi duvidosas ocorrem com mais frequência.A palavra lóbi tem várias conotações, variando consoante o interlocutor. Para o público em geral, o lóbi continua a ser um mistério e assume uma conotação muito negativa. A indústria do lóbi e da representação de interesses em Portugal é ainda incipiente. Os lobistas profissionais não são numerosos e grande parte da atividade é praticada por sociedades de advogados e agências de comunicação. A maioria das tentativas de influenciar os processos legislativo, regulatório e de tomadas de decisão é levada a cabo através de redes de influência interna, contactos informais e apoio pago aos principais escritórios de advocacia do país. O tráfico de influência, “puxar cordelinhos” para obter um serviço ou tráfico de informações privilegiadas, são comuns em Portugal

Clays from Vila Nova da Rainha (Portugal): Appraisal of their relevant properties in order to be used in construction ceramics

The clay deposit of Vila Nova da Rainha (VNR) is included in the lithostratigraphic forma tion named “Argilas de Tomar”, and is located at the lower section of the Tert iary Tagus’ river basin. Clay from one quarry is being extracted for the production of construction ceramics. In this work the firing transformations undergone by VNR cl ays containing quartz, alkaline feldspar, iron oxy-hydroxides, and clay minerals have been studied. Ca rbonates have not been identified in thes e raw materials. The clay layers can be subdivided in three groups based upon composition and ceramic properties. The first group, VNR0, is represented by smectite-kaolinite sandy-silty clay, the second group (VNR1 and VNR2) corresponds to illite-kaolinite bearing clay and the third group (VNR3 and VNR4) is represented by illite-smectite silty clay. The firing process involves the formation of hematite and mu llite both influencing the technical properties of the fired products. With regards to the ceramic properties assessed at 1100 ºC the first group showed the lowest total shrinkage value (7.35 %) the highest water absorption value (12.2 %) and the lo west mechanical bending strength value (12.0 MPa); the same properties assessed in the second group provi ded the highest firing shrinkage values (7.0-5.0 %), the lowest values of water absorption (0.1-0.2 %) and relatively high mechanical bending strength values (47.8-48.0 MPa); the third group showed firing shrinkage values within the range 3.5-4.2 %, water absorption values within the range 1.4-4.5 %, and the highest mechanical bending strength values (49.2-52.0 MPa). The results of the ceramic properties being appraised indicate that the raw materials being studied are suitable for the production of high-quality construction ceramics, such as brick, roof tile and rustic floor tile.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Deterioration of the “Quinta Nova Torres Vedras” wall tile panel – an analytical approach

Wall tile panels were commonly used in recreational open outdoors spaces in 18th Century noble houses I Portugal. The nature of their location and the lack of maintenance of such spaces, which lost their purpose during the 20th century, contributed to their natural deterioration. In order to preserve one such panel and facilitate the conservation treatment, it was removed from its location and transported to the facilities of the Polytechnic Institute of Tomar, Portugal. The interest in studying this particular panel was prompted by the advanced stages of deterioration observed in some tiles, where natural succession of biological colonisation and weathering were registered as some of the main deterioration causes. Furthermore, the advanced deterioration stages indicate that removal was a necessary action, as natural weathering would lead to its destruction. The study involved a thorough analysis of the environmental characteristics of the wall placement, the wall materials themselves, the mortar, the ceramic body and the glaze. The methodologies used involved microscopic and laboratory testing to evaluate the extent of lichen colonisation and its influence in the loss of glaze and posterior deterioration of the ceramic body. Results indicate that natural and environmental characteristics, combined with substrate typology and micro-organisms, contribute to accelerate the deterioration process, though appropriate techniques of preventive conservation can be used in specific panels or broader situations. This study will enable the development of innovative methodological and technical approach to the conservation problem here portrayed.info:eu-repo/semantics/publishedVersio