Lixiviado de residuos sólidos del relleno sanitario manual de Nauta y su genotoxicidad en Eisenia foetida "lombriz roja";

Establece la genotoxicidad de los lixiviados en celomocitos de Eisenia foetida expuestos al lixiviado del relleno sanitario manual de Nauta; asi como también analiza posibles causas de la genotoxicidad y propone un diseño de tratamiento de lixiviadosTesi

Myrciaria dubia “Camu Camu” Fruit: Health-Promoting Phytochemicals and Functional Genomic Characteristics

Camu camu is a typical Amazon native fruit shrub that possesses a diploid genome, moderate genetic diversity, and population structure. The fruits accumulate several essential nutrients and synthesize L-ascorbic acid (vitamin C) in great quantities and an array of diverse secondary metabolites with corroborated in vitro and in vivo health-promoting activities. These beneficial effects include antioxidative and antiinflammatory activities, antiobesity, hypolipidemic, antihypertensive and antidiabetic effects, DNA damage and cancer protection effects, and other bioactivities. Many health-promoting phytochemicals are biosynthesized in several metabolic pathways of camu camu. Their reconstruction from the fruit transcriptome database was accomplished by our research group. These include basic metabolic pathways such as glycolysis and pentose phosphate pathway, vitamin C biosynthesis pathways, and pathways involved in secondary metabolites production. Due to their agronomic potential and fruits growing demand, recently, based on an ideotype, programs were initiated for their domestication and genetic improvement, but so far with very negligible achievements. Consequently, we propose new strategies to accelerate the processes of domestication and genetic improvement based on state of the art technologies for multiomic data analysis and innovative molecular tools

Estrategias bioinformáticas y moleculares para aislar genes con potencial biotecnológico a partir de especies huérfanas de la ciencia

La amazonía peruana es megabiodiversa y posee millones de genes con potencial biotecnológico que debemos descubrir. Para identificarlos, aislarlos y poder aprovecharlos tenemos que secuenciar los genomas y transcriptomas de las especies más importantes. Sin embargo, hasta concretar este tipo de proyectos, combinando estrategias bioinformáticas y moleculares podemos aislar genes con potencial biotecnológico. El objetivo fue aislar genes involucrados en la biosíntesis de vitamina C en Myrciaria dubia. De acuerdo a las relaciones filogenéticas de M. dubia con otras especies, se buscaron secuencias homólogas en el banco de genes del gen que codifica L-galactono-1,4-lactona deshidrogenasa (L-GalLDH). En base al alineamiento múltiple obtenido, se construyó un filograma consenso y de los clados formados se diseñaron cebadores degenerados. Los frutos fueron obtenidos de una colección de germoplasma y el ARN total se purificó, el ADNc se sintetizó y amplificó con cebadores degenerados. El amplicón sintetizado se clonó y secuenció con técnicas estándares. Con las aproximaciones empleadas se logró aislar, clonar y secuenciar un segmento de 921 pb del gen L-GalLDH de M. dubia. En conclusión, con las estrategias bioinformáticas y moleculares descritas se aisló el segmento de un gen que codifica la enzima L-galactono-1,4-lactona deshidrogenasa de la vía biosintética de vitamina C en M. dubia, especie de la que no se disponía de secuencias génicas. Con estas mismas aproximaciones será posible aislar genes de interés biotecnológico de esta y otras especies amazónicas que aún no cuentan con bases de datos de secuencias nucleotídicas

Inducción de la producción de lípidos totales en microalgas sometidas a estrés nutritivo

Se evaluó la producción de lípidos totales en cinco especies de microalgas inducidas por la ausencia de nitrógeno. Las microalgas empleadas fueron Ankistrodesmus sp., Ankistrodesmus nannoselene, Chlorella sp., Scenedesmus sp. y Scenedesmus quadricauda. Estas especies fueron cultivadas en medio CHU10 con y sin nitrógeno. El tiempo de evaluación fue de seis días, determinándose diariamente la densidad microalgal mediante recuento en cámara de Neubahuer. Se determinó la tasa de crecimiento, la biomasa microalgal y el porcentaje de lípidos totales. Los lípidos totales fueron extraídos con solución Cloroformo:metanol (2:1). Los resultados indicaron que las especies con mayor producción de lípidos totales fueron Ankistrodesmus sp. (263,6 mg/g biomasa seca), A. nannoselene (316 mg/g biomasa seca) y Scenedesmus sp. (243,3 mg/g biomasa seca) al ser cultivadas en medios sin nitrógeno. Scenedesmus quadricauda y Chlorella sp., fueron las especies que mostraron mayor producción de biomasa seca (159,1 mg/g biomasa seca y 221,1 mg/g biomasa seca respectivamente) en medios con nitrógeno. La tasa de crecimiento fue variable entre las especies cultivadas en ambas condiciones. En conclusión, Ankistrodesmus sp., mostró la mayor tasa de crecimiento (0,77 dia-1) en medio sin nitrógeno. Bajo las mismas condiciones de cultivo, Scenedesmus sp. obtuvo la mayor producción de biomasa en peso seco (174,7 mg/l) y Ankistrodesmus nannoselene acumuló el mayor porcentaje de lípidos totales.The production of total lipids in five microalgal species was induced by absence of nitrogen. The microalgae Ankistrodesmus sp., Ankistrodesmus nannoselene, Chlorella sp., Scenedesmus sp. and Scenedesmus quadricauda were cultured in CHU10 medium with and without nitrogen. They were evaluated during six days. The microalgae density was daily determined by a Neubahuer chamber. The average growth, total biomass and total lipids were also determined. The total lipids were extracted with chloroform: methanol (2:1). The results indicated that species with production greater amount of total lipids were Ankistrodesmus sp. (263.6 mg/g dry biomass), Ankistrodesmus nannoselene (316 mg/g dry biomass) and Scenedesmus sp. (243.3 mg/g dry biomass) when grown in media without nitrogen. Scenedesmus quadricauda and Chlorella sp. when grown in media with nitrogen showed higher amount of dry biomass (159.1 mg/g dry biomass and 221.1 mg/g dry biomass respectively) compared to those which were grown in media without nitrogen. The growth rate was variable between species grown in both conditions. In conclusion, Ankistrodesmus sp. microalgae experienced the highest growth rate (0.77 day-1) in medium without nitrogen. Under the same culture conditions, Scenedesmus sp., had the highest biomass production in dry weight (174.7 mg/l) and Ankistrodesmus nannoselene accumulated the highest percentage of total lipids

Un método eficiente para la inducción de callos in vitro en Myrciaria dubia (Kunth) Mc Vaugh "Camu Camu"

Due to the high variability in vitamin C production in Myrciaria dubia "camu camu", biotechnological procedures are necessary for mass clonal propagation of promising genotypes of this species. The aim was to establish an efficient method for in vitro callus induction from explants of M. dubia. Leaf and knot sex plants were obtained from branches grown in the laboratory and from fruit pulp collected in the field. These were desinfected and sown on Murashige-Skoog (1962) medium supplemented with 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D), benzylaminopurine (BAP) and kinetin(Kin). The cultures were maintained at 25±2°C in darkness for 2 weeks and subsequently with a photoperiod of 16 hours in light and 8 hours in dark for 6 weeks. Treatment with 2 mg/L 2,4-D and 0.1 mg/L BAP allowed major callus formation in the three types of explants. Calluswere generated from the first week (knots), fourth week (leaves) and sixth week (pulp) and these were friable (leaves and nodes) and non-friable (pulp). In conclusion, the described method is efficient for in vitro callus induction in leaves, knots and pulp of M. dubia, been leaves and knots explants more suitable for callus obtention.Debido a la alta variabilidad en la producción de vitamina C en Myrciaria dubia "camu camu", es necesario establecer procedimientos biotecnológicos para la propagación clonal masiva de genotipos promisorios de esta especie. El objetivo fue establecer un método eficiente para inducir la formación de callos in vitro a partir de explantes de M. dubia. Los explantes de hojas y nudos se obtuvieron de ramas cultivadas en el laboratorio y la pulpa a partir de frutos colectados en el campo. Estos fueron desinfectados y sembrados en medio Murashige-Skoog (1962) suplementado con ácido 2,4-diclorofenoxiacético (2,4-D), bencilaminopurina (BAP) y kinetina (Kin). Los cultivos fueron mantenidos a 25±2°C, en oscuridad por 2 semanas y posteriormente con un fotoperiodo de 16 horas luz y 8 horas de oscuridad por 6 semanas. El tratamiento con 2 mg/L de 2,4-D y 0,1 mg/L de BAP estimuló mayor callogénesis en los tres tipos de explantes. Los callos se generaron a partir de la primera semana (nudos), cuarta semana (hojas) y sexta semana (pulpa) y estos fueron friables (hojas y nudos) y no friables (pulpa). En conclusión, el método descrito es eficiente para inducir callos in vitro en hojas, nudos y pulpa de M. dubia, siendo los explantes de hojas y nudos los más idóneos para la obtención de callos

Composición de especies y diversidad de peces en tres cuerpos de agua en la cuenca alta del río Itaya

En el presente trabajo se describe sobre la diversidad en tres cuerpos de agua de la cuenca alta del río Itaya, concesión de conservación de la universidad científica del Perú, en una evaluación rápida en los meses de junio y julio del 2012. Se colectaron datos y muestras de peces en Lamas cocha (LC), cocha Anguilla (CA) y Tipishca Luz de Oriente (TLO). Los peces fueron colectados utilizando una batería de redes de diferentes medidas 1.5, 2, 2.5, 3, 3.5 y 4 pulgadas de de abertura de malla. Se reportan 17 familias taxonómicas, de las cuales 9 familias pertenecen al orden Characiformes (53%), 3 familias pertenecen al orden de los Siluriformes (17%), 2 familias pertenecen al orden de los Gymnotiformes (12%) y al orden Perciformes (12%) y una familia pertenece al orden Beloniformes (6%). La predominancia de las familias taxonómicas en los tres ambientes fueron Characidae, Curimatidae, Acestrorhynchidae (Characiformes) y Cichlidae (Perciformes). Sin embargo, la ocurrencia de exclusividad de una determinada familia fue observada en los tres cuerpos de aguas; tenemos de esta forma la familia Hemiodontidae solo tienen ocurrencia en Lamas cocha, la ocurrencia de la familia Prochilodontidae (Characiformes) y Callichthyidae (Siluriformes) en Cocha Anguillal y finalmente la ocurrencia de las familias Pimelodidae (Siluriformes), Sciaenidae (Perciformes) y Belonidae (Beloniformes) en la Tipishca Luz de Oriente

IDENTIFICACIÓN DE MICROALGAS OLEAGINOSAS EN EL ÁREA DE CONCESIÓN PARA CONSERVACIÓN, CUENCA ALTA DEL RÍO ITAYA. LORETO-PERÚ

Las microalgas oleaginosas constituyen una nueva alternativa para la producción de biodiesel, por su alta eficiencia fotobiosintética de triglicéridos y presentan productividades mayores de 10 a 100 veces que los cultivos convencionales. Además, que actúan como sumideros de CO2 y pueden usar aguas servidas para producir biodiesel. Sin embargo, los estudios sobre identificación de este tipo de microalgas en la amazonía son escasos. El objetivo del presente trabajo de investigación fue identificar especies de microalgas oleaginosas con potencial aplicación para la producción de biodiesel que se encuentran en ambientes acuáticos del Área de Concesión para Conservación de la Universidad Científica del Perú (UCP). La colecta de las muestras se realizó del 27/06/12 al 03/07/12 entre las 12 y 15 h utilizando red planctónica tipo cono y como preservante formol al 3%. La identificación microscópica se realizó en el Laboratorio de Ciencias Básicas de la UCP. La densidad de las microalgas fue realizada en base a su conteo en cámaras de Neubauer y Sedgwick-Rafter. Los resultados muestran la presencia de 20 especies de microalgas, de las cuales cinco son microalgas oleaginosas. Correspondiente a las del género Chlorella quienes presentaron la mayor densidad promedio (6x104 células/ml) en las tres cochas evaluadas

AISLAMIENTO DE ADN GENÓMICO DE Myrciaria dubia (HBK) “CAMU CAMU” APROPIADO PARA ANÁLISIS MOLECULARES

Myrciaria dubia “camu-camu”, una especie nativa de la Amazonía que produce frutos con alto contenido de vitamina C y otras sustancias importantes. Sin embargo, los estudios moleculares de esta planta son escasos, por falta de un protocolo reproducible para purificar sus ácidos nucléicos. El objetivo de este trabajo fue establecer un protocolo para aislar el ADN genómico a partir de hojas de M. dubia, apropiado para análisis moleculares. El ADN se purificó con un protocolo modificado, la calidad y cantidad se estimó por espectrofotometría y electroforesis en gel de agarosa. Adicionalmente, la calidad se evaluó mediante RAPD. El ratio de calidad (A260/A280) promedio del ADN fue 1.9±0.1 y el espectro de absorción UV/Vis presentó un único pico de máxima absorbancia a 260nm. Mediante electroforesis el ADN fue íntegro y sin ARN. También, la síntesis de amplicones RAPD nos sugiere ausencia de inhibidores para polimerasas. La concentración promedio del ADN fue 99±33 ng/ml y el rendimiento promedio fue 237±80 mg ADN/g hoja. En conclusión, se ha establecido un protocolo de aislamiento de ADN genómico a partir de hojas de Myrciaria dubia “camu camu”, caracterizado por permitirnos obtener ADN de alta calidad y cantidad suficiente para análisis moleculares como el RAPD

Diversidad genética de Dioscorea trifida “sachapapa” de cinco cuencas hidrográficas de la amazonía peruana

Dioscorea trifida “sachapapa” es una de las especies promisorias amazónicas que podemos considerarla huérfana de la ciencia, por las escasas investigaciones que hay sobre esta especie. El objetivo de esta investigación fue determinar la diversidad genética intra e interpoblacional de D. trifida de cinco cuencas hidrográficas de la amazonía peruana. Las hojas fueron colectadas de una colección de germoplasma y purificó el ADN con métodos estándares. El polimorfismo genético se evaluó con la técnica RAPD y los parámetros de genética poblacional fueron estimados con el programa POPGENE. Los análisis espectrofotométrico (A260/A280=1,7±0,1) y electroforético (bandas de ADN íntegras) mostraron que el ADN purificado fue de alta calidad. Asimismo, la cantidad obtenida fue apropiada para estudios de diversidad genética (rendimiento promedio = 582±248 mg ADN/mg hojas). La diversidad genética intrapoblacional más alta se encontró en la cuenca del Itaya (h = 0,24±0,11) y la más baja en la cuenca del Marañón (h = 0,10±0,04). Adicionalmente, la diversidad genética interpoblacional más alta se registró entre las poblaciones de Itaya vs Ucayali (GST = 1,00), mientras que la más baja entre las poblaciones de Nanay vs Tapiche (GST = 0,07). En conclusión, D. trifida muestra variación en su diversidad genética intra e interpoblacional en las cinco cuencas hidrográficas de la amazonía peruana, siendo la cuenca del Itaya la que presenta mayor diversidad genética intrapoblacional y las poblaciones de Itaya vs Ucayali las que presentan mayor diversidad genética interpoblacional, que en parte se atribuyen al flujo de genes diferencial entre las poblaciones analizadas