The prevalence of congenital cytomegalovirus infection in newborn infants at an intensive care unit in a public hospital

Suggested citation: Miura CS, Miura E, Mombach AB, Chesky M. The prevalence of congenital cytomegalovirus infection in newborn infants at an intensive care unit in a public hospital. J Pediatr (Rio J). 2006;82:46-50. Abstract Objective: To determine the prevalence of congenital cytomegalovirus infection in newborn infants admitted to an intensive care unit in a public hospital in Porto Alegre. Methods: A cross-sectional study of 261 newborn infants born at a public hospital in the city of Porto Alegre in 2003 and admitted to the intensive care ward. Urine samples were collected within 7 days of birth and a polymerase chain reaction-PCR performed to test for cytomegalovirus DNA. Results: The prevalence of congenital cytomegalovirus infection among the study population was 0.8% (95% CI: 0.097-2.86). It was not possible to assess risk factors because this prevalence was so low. Conclusions: The prevalence of congenital cytomegalovirus infection in an intensive care unit at a public hospital in Porto Alegre was not considered elevated and was comparable with prevalence rates found by other studies. J Pediatr (Rio J). 2006;82(1):46-50: Cytomegalovirus, congenital cytomegalovirus, polymerase chain reaction, newborn, neonate

Primary immunodeficiencies : Review of 15 years clinical experience

A experiência clínica com imunodeficiências primárias acontece ao longo de muitos anos, devido à raridade das entidades patológicas. Os pacientes apresentam, na maioria, infecções de repetição motivadas por defeitos ora no âmbito da imunidade humoral, da imunidade celular, do sistema de fagocitose ora do sistema do complemento sérico. Os métodos de avaliação destes doentes são diversos e evoluíram nos últimos anos. Nossos pacientes foram avaliados de acordo com o quadro clínico e os testes imunológicos disponíveis na época. Observamos 8 7 imunodeficientes, com a seguinte ordem de freqüência: deficiência seletiva de lgA, hipogamaglobulinemia transitória da infância, imunodeficiência comum variável, candidíase mucocutânea crônica, síndrome de Wiskott-Aidrich, ataxia com telangiectasias, imunodeficiência com hiper-lgM, agamaglobulinemia ligada ao sexo, síndrome de Di George. Este trabalho focalizará especialmente as deficiências linfocitárias.The clinic experience with Primary lmmunodeficiencies happens over years due its rarity. Most of the patients shows repeated infections related with the humoral immunity, celular immunity, phagocitosis system or complement system. The evaluation methods o f this patients are various and h ave been increased in the last years. Ou r patients were evaluated depending on the clinicai demonstration of the pathology and the immunological tests avaliable at once. We attended 8 7 immunodeficienty patients with his fre quency arder: Seletive lgA Defience, Transient Hypogammaglobulinemia of lnfancy, Variable lmmunodeficiency, Muco-cutaneous Chronic Candidiasis, WiskottAidrich Syndrome, lmmunodeficiency with ataxiastelangiectasia, lmmunodeficiency with hyper-lgM, Xlinked agammaglobulinemia, DiGeorge's Syndrome

Determinação do Limite Mínimo de Detecção da Técnica de PCR “Nested” para o Vírus da Hepatite B (HBV)

All over the world, the hepatitis B virus (HBV) is considered one of the major problems of public health, despite vaccination. World Health Organization (WHO) estimates that more than 2 billions of persons are infected by HBV. Brazil is classified as an area of intermediary incidence by WHO. However, prevalence studies have detected differences of infection indexes in geographic re-gions: 8% in the Amazonian region, 2,5% in middle-west and Northeast, 2% in Southeast and 1% in South. A sensitive and specific diagnosis is very important to the HBV carrier patients. The aim of this study was to determine the minimum limit of detection of the nested PCR in house technique for HBV. Serial dilutions of one quantified sample of HBV (1000 copies/mL; 750 copies/mL; 500 copies/mL; 250 copies/mL) were submitted to a nested PCR. The target of PCR was viral core and pre-core region. Commercial kit, QiAmp, was employed to purify nucleic acids from the sample. The minimum detection limit found was 500 copies/mL or 10 copies per PCR reaction.Mundialmente, a hepatite pelo vírus B (HBV) é considerada um dos maiores problemas de saúde pública, apesar da vacina-ção. A Organização Mundial da Saúde (OMS) estima que mais de 2 bilhões de pessoas estejam infectadas pelo HBV. O Brasil é classificado como área de incidência intermediária pela OMS. No entanto, estudos de prevalência detectaram diferenças de índices de infecção nas regiões geográficas: 8% na região Amazônica, 2,5% nas regiões Centro-Oeste e Nordeste, 2% na Sudeste e 1% na região Sul. Um diagnóstico sensível e específico é de fundamental importância para os pacientes portadores do HBV. O objetivo deste estudo foi determinar o limite mínimo de detecção da técnica de PCR “nested” “in house” para o HBV. Diluições seriadas de uma amostra quantificada de HBV (1000 cópias/mL; 750 cópias/mL; 500 cópias/mL; 250 cópias/mL) foram submetidas à técnica de PCR “nested”. O alvo da amplificação por PCR foi a região do core e pré-core do vírus. Para extração dos ácidos nucléicos da amostra foi empregado o kit comercial QIAmp. O limite mínimo de detecção encontrado foi de 500 cópias/mL ou 10 cópias por reação de PCR

Molecular analysis of pathogens in cerebrospinal fluid by the polymerase chain reaction in HIV-infected patients

Introdução: A reação em cadeia da polimerase (PCR) foi teste de grande impacto no diagnóstico das meningites e encefalites linfocíticas durante a última década. Esse método foi extensivamente usado no diagnóstico das infecções do sistema nervoso central (SNC), devido a sua habilidade em detectar amostras mínimas de DNA-alvo no líquido cefalorraquiano. Objetivo: O objetivo deste estudo foi identificar a prevalência dos patógenos oportunistas responsáveis por causar problemas neurológicos em pacientes infectados com o vírus da imunodeficiência humana (HIV) e avaliar sua associação com os achados clínicos, laboratoriais e da tomografia computadorizada cerebral (TCC). Pacientes e métodos: Um estudo transversal foi realizado em 203 amostras de líquido cefalorraquiano (LCR) de pacientes do sul do Brasil infectados com HIV e com aparente encefalite e meningite linfocíticas. As amostras foram analisadas para os seguintes agentes pelo método da reação em cadeia da polimerase “nested” ou dupla (N-PCR): citomegalovírus, vírus do Epstein-Barr, vírus do herpes simplex tipos 1 e 2, vírus da varicella zoster, vírus do herpes humano tipo 6, vírus JC, Toxoplasma gondii e micobactérias. Resultado: Pelo menos um patógeno foi encontrado em 77 (38%) dos indivíduos. O Epstein-Barr foi o mais prevalente, com 40 casos (19,7%), seguido pelo citomegalovívus, com 12 casos (15%) e pelo vírus JC, em 9 casos (4,4%). Um N-PCR positivo mostrou associação com aumento de proteínas e de celularidade (P=0,001), meningismo (P=0,017) e tomografia computadorizada anormal (P=0,006). Conclusão: O painel de PCR empregado foi efetivo na identificação de infecções neurológicas severas em pacientes HIV positivos.Introduction: Polymerase chain reaction (PCR) has had great impact on the diagnosis of lymphocytic meningitis and encephalitis over the last decade. It has been extensively used in the diagnosis of central nervous system (CNS) infections for its ability to detect small amounts of target DNA in the cerebrospinal fluid (CSF). Objective: The aim of this study was to identify the prevalence of opportunistic pathogens responsible for neurological disorders in patients infected with human immunodeficiency virus (HIV) and to evaluate its association with clinical, laboratory and cerebral computed tomography (CCT) findings. Patients and methods: A cross-sectional study was performed on 203 cerebrospinal fluids (CSF) from HIV-infected patients from Southern Brazil, with apparent lymphocytic meningitis and encephalitis. CSF samples were analyzed with probes for cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, herpes simplex virus types 1 and 2, varicella zoster virus, human herpes virus type 6, JC virus, Toxoplasma gondii and mycobacterium in nested polymerase chain reaction (N-PCR). Results: At least one pathogen was found in 77 (38.0%) individuals. Epstein-Barr virus was the most prevalent with 40 cases (19.7%), followed by cytomegalovirus with 12 cases (5.9%) and JC virus with 9 cases (4.4%). Positive NPCR showed association with high spinal fluid protein and cell count (P=0.001), meningism (P=0.017) and abnormal CCT (P=0.006). Conclusion: The PCR panel used was effective in screening several neurological infections in HIV positive patients

Hidropsia fetal não-imune : uma proposta para obter o diagnóstico

25

Imperio : Diario de Zamora de Falange Española de las J.O.N.S.: Año IV Número 923 - 1939 Noviembre 18

Resumo não disponíve

Simultaneous detection of neisseria meningitidis, haemophilus influenzae and streptococcus sp. by polymerase chain reaction for the diagnosis of bacterial meningitis

Avaliamos o desempenho da reação em cadeia da polimerase (PCR) para detecção simultânea da Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae e S t reptococcus sp. no diagnóstico das meningites bacterianas e sua aplicabilidade na rotina diagnóstica. Foi realizado um estudo de coorte com 182 crianças apresentando suspeita de meningite bacteriana. Em 84, havia alterações clínicas e laboratoriais sugestivas de meningite bacteriana. Destas, 65 tiveram o agente etiológico identificado pelos métodos laboratoriais de rotina e 19 ficaram sem diagnóstico etiológico. Em 98 pacientes foi excluído o diagnóstico de meningite bacteriana. Analisando o desempenho da PCR encontramos sensibilidade de 88,1%, especificidade de 99,0% e valores preditivos positivo e negativo de 98,7% e 90,1% respectivamente. Nos 19 pacientes com meningite bacteriana mas sem diagnóstico etiológico a PCR detectou microrganismos em 14, sendo 12 N. meningitidis, um H. influenzae e um S t reptococcus sp. A PCR possui o potencial de poder aumentar os índices de identificação das técnicas tradicionais, principalmente nas situações onde a microscopia dire t a , cultura ou identificação antigênica são negativos ou inconclusivos.The simultaneous detection of Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, and Streptococcus sp. was assessed by polymerase chain reaction (PCR) for the diagnosis of bacterial meningitis, as well as the applicability of PCR as a routine test. A cohort study was carried out with 182 children (2 months to 12 years of age) with suspicion of bacterial meningitis. Routine tests identified the etiologic agent in 65/84 children whose clinical status and laboratory findings suggested the presence of bacterial meningitis. Bacterial meningitis was ruled out in 98 children. In 19 children, the etiologic diagnosis was not possible using stand a rd methods; in 14 of these patients, the etiologic agent was identified by PCR (N. meningitidis=12; H. influen - zae=1; S t reptococcus sp.=1). The sensitivity of PCR was 88.1%; specificity, 99.0%; positive predictive value, 98.7%; and negative predictive, 90.1%. PCR is a useful complementary diagnostic technique, especially when Gram stain, culture, or antigenic detection are negative or inconclusive

Reação em cadeia da polimerase no diagnóstico laboratorial das meningites e encefalites assépticas

Foi desenvolvido um protocolo de PCR para analisar os principais patógenos que infectam o sistema nervoso central (SNC). Foram testadas 383 amostras de líquido-cefalorraquidiano (LCR), para detecção de: adenovirus, Borrelia burgdorferi, enterovirus, vírus Epstein Barr , citomegalovírus, vírus herpes simplex, herpes humano tipo 6, vírus JC, Leptospira interrogans, Listeria monocytogenes, vírus da coriomeningite linfocitária, vírus do sarampo, vírus da caxumba, Mycobacterium sp, Mycoplasma pneumoniae, Toxoplasma gondii e vírus da varicela zoster. Das 383 amostras de LCR testadas a PCR foi positiva em 46 (12,0%). Os microrganismos detectados foram: citomegalovírus, enterovirus, vírus Epstein Barr , herpes simplex, herpes humanao tipo 6, vírus JC, Listeria monocytogenes, Mycobacterium sp, Toxoplasma gondii e varicela zoster. A introdução da técnica de PCR através de um protocolo para análise do LCR otimizou o diagnóstico etiológico das infecções do SNC e tem se revelado um instrumento de grande potencial diagnóstico. Estudos futuros necessitam ser realizados para melhor avaliar os resultados da PCR em pacientes imunocomprometidos e assim determinar o valor preditivo positivo deste ensaio neste grupo de pacientes.A protocol for testing cerebrospinal fluid specimens using a range of PCR assays for the diagnosis of central nervous system infection was developed and used to test prospectively 383 specimens. PCR assays were used for the detection of adenovirus, Borrelia burgdorferi, enteroviruses, Epstein Barr virus, cytomegalovirus, herpes simplex virus, human herpes virus type 6, JC virus, Leptospira interrogans, Listeria monocytogenes, lymphocytic choriomeningitis virus, measles virus, mumps virus, Mycobacterium sp., Mycoplasma pneumoniae, Toxoplasma gondii and varicella zoster virus. Of the 383 specimens tested in this study, 46 (12.0%) were found to be positive. The microorganisms detected were CMV, enterovirus, Epstein Barr virus, herpes simplex virus, human herpes virus type 6, JC virus, L. monocytogenes, Mycobacterium genus, Toxoplasma gondii and varicella zoster virus. The introduction of the PCR protocol described has improved the diagnosis of a range of central nervous system infections in our laboratory. We believe however that further evaluation of these assays in immunocompromised patients is necessary to better determine the predictive value of positive PCR results in these patient groups

Simultaneous detection of Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae and Streptococcus sp. by polymerase chain reaction for the diagnosis of bacterial meningits Detecção simultânea da Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae e Streptococcus sp. pela reação em cadeia da polimerase no diagnóstico das meningites bacterianas

The simultaneous detection of Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, and Streptococcus sp. was assessed by polymerase chain reaction (PCR) for the diagnosis of bacterial meningitis, as well as the applicability of PCR as a routine test. A cohort study was carried out with 182 children (2 months to 12 years of age) with suspicion of bacterial meningitis. Routine tests identified the etiologic agent in 65/84 children whose clinical status and laboratory findings suggested the presence of bacterial meningitis. Bacterial meningitis was ruled out in 98 children. In 19 children, the etiologic diagnosis was not possible using standard methods; in 14 of these patients, the etiologic agent was identified by PCR (N. meningitidis=12; H. influenzae=1; Streptococcus sp.=1). The sensitivity of PCR was 88.1%; specificity, 99.0%; positive predictive value, 98.7%; and negative predictive, 90.1%. PCR is a useful complementary diagnostic technique, especially when Gram stain, culture, or antigenic detection are negative or inconclusive.Avaliamos o desempenho da reação em cadeia da polimerase (PCR) para detecção simultânea da Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae e Streptococcus sp. no diagnóstico das meningites bacterianas e sua aplicabilidade na rotina diagnóstica. Foi realizado um estudo de coorte com 182 crianças apresentando suspeita de meningite bacteriana. Em 84, havia alterações clínicas e laboratoriais sugestivas de meningite bacteriana. Destas, 65 tiveram o agente etiológico identificado pelos métodos laboratoriais de rotina e 19 ficaram sem diagnóstico etiológico. Em 98 pacientes foi excluído o diagnóstico de meningite bacteriana. Analisando o desempenho da PCR encontramos sensibilidade de 88,1%, especificidade de 99,0% e valores preditivos positivo e negativo de 98,7% e 90,1% respectivamente. Nos 19 pacientes com meningite bacteriana mas sem diagnóstico etiológico a PCR detectou microrganismos em 14, sendo 12 N. meningitidis, um H. influenzae e um Streptococcus sp. A PCR possui o potencial de poder aumentar os índices de identificação das técnicas tradicionais, principalmente nas situações onde a microscopia direta, cultura ou identificação antigênica são negativos ou inconclusivos