31 research outputs found

    How Allosteric Control of Staphylococcus aureus Penicillin-Binding Protein 2a Enables Methicillin-Resistance and Physiological Function

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    The expression of penicillin binding protein 2a (PBP2a) is the basis for the broad clinical resistance to the β-lactam antibiotics by methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). The highmolecular mass penicillin binding proteins of bacteria catalyze in separate domains the transglycosylase and transpeptidase activities required for the biosynthesis of the peptidoglycan polymer that comprises the bacterial cell wall. In bacteria susceptible to β-lactam antibiotics, the transpeptidase activity of their penicillin binding proteins (PBPs) is lost as a result of irreversible acylation of an active site serine by the β-lactam antibiotics. In contrast, the PBP2a of MRSA is resistant to β-lactam acylation and successfully catalyzes the DD-transpeptidation reaction necessary to complete the cell wall. The inability to contain MRSA infection with β-lactam antibiotics is a continuing public health concern. We report herein the identification of an allosteric binding domain - a remarkable 60 Å distant from the DD-transpeptidase active site - discovered by crystallographic analysis of a soluble construct of PBP2a. When this allosteric site is occupied, a multiresidue conformational change culminates in the opening of the active site to permit substrate entry. This same crystallographic analysis also reveals the identity of three allosteric ligands: muramic acid (a saccharide component of the peptidoglycan), the cell wall peptidoglycan, and ceftaroline, a recently approved anti-MRSA β-lactam antibiotic. The ability of an anti-MRSA β-lactam antibiotic to stimulate allosteric opening of the active site, thus predisposing PBP2a to inactivation by a second β-lactam molecule, opens an unprecedented realm for β-lactam antibiotic structure-based design.Fil: Otero, Lisandro Horacio. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Instituto de Química Física; España. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaFil: Rojas Altuve, Alzoray. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Instituto de Química Física; EspañaFil: Llarrull, Leticia Irene. University of Notre Dame; Estados Unidos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaFil: Carrasco López, Cesar. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Instituto de Química Física; EspañaFil: Kumarasiri, Malika. University of Notre Dame; Estados UnidosFil: Lastochkin, Elena. University of Notre Dame; Estados UnidosFil: Fishovitz, Jennifer. University of Notre Dame; Estados UnidosFil: Dawley, Matthew. University of Notre Dame; Estados UnidosFil: Hesek, Dusan. University of Notre Dame; Estados UnidosFil: Lee, Mijoon. University of Notre Dame; Estados UnidosFil: Johnson, Jarrod W.. University of Notre Dame; Estados UnidosFil: Fisher, Jed F.. University of Notre Dame; Estados UnidosFil: Chang, Mayland. University of Notre Dame; Estados UnidosFil: Mobashery, Shahriar. University of Notre Dame; Estados UnidosFil: Hermoso, Juan A.. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Instituto de Química Física; Españ

    Time trends in leisure time physical activity and physical fitness in elderly people: 20 year follow-up of the Spanish population national health survey (1987-2006)

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    <p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>To estimate trends in leisure time physical activity and physical fitness between 1987-2006 in older Spanish people.</p> <p>Methods</p> <p>We analyzed data collected from the Spanish National Health Surveys conducted in 1987 (n = 29,647), 1993 (n = 20,707), 1995-1997 (n = 12,800), 2001 (n = 21,058), 2003 (n = 21,650), and 2006 (n = 29,478). The number of subjects aged ≥ 65 years included in the current study was 29,263 (1987: n = 4,958-16.7%; 1993: n = 3,751-17.8%; 1995-97: n = 2,229-17.4%; 2001: n = 4,356-20.7%; 2003: 6,134-28.3%; 2006: 7,835-26.5%). Main variables included leisure-time physical activity and physical fitness. We analyzed socio-demographic characteristics, self-rated health status, lifestyle habit and co-morbid conditions using multivariate logistic regression models.</p> <p>Results</p> <p>Women exhibited lower prevalence of leisure time physical activity and physical fitness compared to men (P < 0.05). The multivariate analysis for time trends found that practising leisure time physical activity increased from 1987 to 2006 (P < 0.001). Variables associated with a lower likelihood of practicing leisure time physical activity were: age ≥ 80 years old, ≥ 2 co-morbid chronic conditions, and obesity. Variables associated with lower physical fitness included: age ≥ 80 years, worse self rated health; ≥ 2 medications (only for walking), and obesity.</p> <p>Conclusions</p> <p>We found an increase in leisure time physical activity in the older Spanish population. Older age, married status, co-morbid conditions, obesity, and worse self-perceived health status were associated with lower activity. Identification of these factors can help to identify individuals at risk for physical inactivity.</p

    Un examen actualizado de la percepción de las barreras para la implementación de la farmacogenómica y la utilidad de los pares fármaco/gen en América Latina y el Caribe

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    La farmacogenómica (PGx) se considera un campo emergente en los países en desarrollo. La investigación sobre PGx en la región de América Latina y el Caribe (ALC) sigue siendo escasa, con información limitada en algunas poblaciones. Por lo tanto, las extrapolaciones son complicadas, especialmente en poblaciones mixtas. En este trabajo, revisamos y analizamos el conocimiento farmacogenómico entre la comunidad científica y clínica de ALC y examinamos las barreras para la aplicación clínica. Realizamos una búsqueda de publicaciones y ensayos clínicos en este campo en todo el mundo y evaluamos la contribución de ALC. A continuación, realizamos una encuesta regional estructurada que evaluó una lista de 14 barreras potenciales para la aplicación clínica de biomarcadores en función de su importancia. Además, se analizó una lista emparejada de 54 genes/fármacos para determinar una asociación entre los biomarcadores y la respuesta a la medicina genómica. Esta encuesta se comparó con una encuesta anterior realizada en 2014 para evaluar el progreso en la región. Los resultados de la búsqueda indicaron que los países de América Latina y el Caribe han contribuido con el 3,44% del total de publicaciones y el 2,45% de los ensayos clínicos relacionados con PGx en todo el mundo hasta el momento. Un total de 106 profesionales de 17 países respondieron a la encuesta. Se identificaron seis grandes grupos de obstáculos. A pesar de los continuos esfuerzos de la región en la última década, la principal barrera para la implementación de PGx en ALC sigue siendo la misma, la "necesidad de directrices, procesos y protocolos para la aplicación clínica de la farmacogenética/farmacogenómica". Las cuestiones de coste-eficacia se consideran factores críticos en la región. Los puntos relacionados con la reticencia de los clínicos son actualmente menos relevantes. Según los resultados de la encuesta, los pares gen/fármaco mejor clasificados (96%-99%) y percibidos como importantes fueron CYP2D6/tamoxifeno, CYP3A5/tacrolimus, CYP2D6/opioides, DPYD/fluoropirimidinas, TMPT/tiopurinas, CYP2D6/antidepresivos tricíclicos, CYP2C19/antidepresivos tricíclicos, NUDT15/tiopurinas, CYP2B6/efavirenz y CYP2C19/clopidogrel. En conclusión, aunque la contribución global de los países de ALC sigue siendo baja en el campo del PGx, se ha observado una mejora relevante en la región. La percepción de la utilidad de las pruebas PGx en la comunidad biomédica ha cambiado drásticamente, aumentando la concienciación entre los médicos, lo que sugiere un futuro prometedor en las aplicaciones clínicas de PGx en ALC.Pharmacogenomics (PGx) is considered an emergent field in developing countries. Research on PGx in the Latin American and the Caribbean (LAC) region remains scarce, with limited information in some populations. Thus, extrapolations are complicated, especially in mixed populations. In this paper, we reviewed and analyzed pharmacogenomic knowledge among the LAC scientific and clinical community and examined barriers to clinical application. We performed a search for publications and clinical trials in the field worldwide and evaluated the contribution of LAC. Next, we conducted a regional structured survey that evaluated a list of 14 potential barriers to the clinical implementation of biomarkers based on their importance. In addition, a paired list of 54 genes/drugs was analyzed to determine an association between biomarkers and response to genomic medicine. This survey was compared to a previous survey performed in 2014 to assess progress in the region. The search results indicated that Latin American and Caribbean countries have contributed 3.44% of the total publications and 2.45% of the PGx-related clinical trials worldwide thus far. A total of 106 professionals from 17 countries answered the survey. Six major groups of barriers were identified. Despite the region’s continuous efforts in the last decade, the primary barrier to PGx implementation in LAC remains the same, the “need for guidelines, processes, and protocols for the clinical application of pharmacogenetics/pharmacogenomics”. Cost-effectiveness issues are considered critical factors in the region. Items related to the reluctance of clinicians are currently less relevant. Based on the survey results, the highest ranked (96%–99%) gene/drug pairs perceived as important were CYP2D6/tamoxifen, CYP3A5/tacrolimus, CYP2D6/opioids, DPYD/fluoropyrimidines, TMPT/thiopurines, CYP2D6/tricyclic antidepressants, CYP2C19/tricyclic antidepressants, NUDT15/thiopurines, CYP2B6/efavirenz, and CYP2C19/clopidogrel. In conclusion, although the global contribution of LAC countries remains low in the PGx field, a relevant improvement has been observed in the region. The perception of the usefulness of PGx tests in biomedical community has drastically changed, raising awareness among physicians, which suggests a promising future in the clinical applications of PGx in LAC

    5to. Congreso Internacional de Ciencia, Tecnología e Innovación para la Sociedad. Memoria académica

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    El V Congreso Internacional de Ciencia, Tecnología e Innovación para la Sociedad, CITIS 2019, realizado del 6 al 8 de febrero de 2019 y organizado por la Universidad Politécnica Salesiana, ofreció a la comunidad académica nacional e internacional una plataforma de comunicación unificada, dirigida a cubrir los problemas teóricos y prácticos de mayor impacto en la sociedad moderna desde la ingeniería. En esta edición, dedicada a los 25 años de vida de la UPS, los ejes temáticos estuvieron relacionados con la aplicación de la ciencia, el desarrollo tecnológico y la innovación en cinco pilares fundamentales de nuestra sociedad: la industria, la movilidad, la sostenibilidad ambiental, la información y las telecomunicaciones. El comité científico estuvo conformado formado por 48 investigadores procedentes de diez países: España, Reino Unido, Italia, Bélgica, México, Venezuela, Colombia, Brasil, Estados Unidos y Ecuador. Fueron recibidas un centenar de contribuciones, de las cuales 39 fueron aprobadas en forma de ponencias y 15 en formato poster. Estas contribuciones fueron presentadas de forma oral ante toda la comunidad académica que se dio cita en el Congreso, quienes desde el aula magna, el auditorio y la sala de usos múltiples de la Universidad Politécnica Salesiana, cumplieron respetuosamente la responsabilidad de representar a toda la sociedad en la revisión, aceptación y validación del conocimiento nuevo que fue presentado en cada exposición por los investigadores. Paralelo a las sesiones técnicas, el Congreso contó con espacios de presentación de posters científicos y cinco workshops en temáticas de vanguardia que cautivaron la atención de nuestros docentes y estudiantes. También en el marco del evento se impartieron un total de ocho conferencias magistrales en temas tan actuales como la gestión del conocimiento en la universidad-ecosistema, los retos y oportunidades de la industria 4.0, los avances de la investigación básica y aplicada en mecatrónica para el estudio de robots de nueva generación, la optimización en ingeniería con técnicas multi-objetivo, el desarrollo de las redes avanzadas en Latinoamérica y los mundos, la contaminación del aire debido al tránsito vehicular, el radón y los riesgos que representa este gas radiactivo para la salud humana, entre otros

    Precariedad, exclusión social y diversidad funcional (discapacidad): lógicas y efectos subjetivos del sufrimiento social contemporáneo (II). Innovación docente en Filosofía

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    El PIMCD "Precariedad, exclusión social y diversidad funcional (discapacidad): lógicas y efectos subjetivos del sufrimiento social contemporáneo (II). Innovación docente en Filosofía" se ocupa de conceptos generalmente eludidos por la tradición teórica (contando como núcleos aglutinantes los de la precariedad laboral, la exclusión social y diversidad funcional o discapacidad), cuyo análisis propicia nuevas prácticas en la enseñanza universitaria de filosofía, adoptando como meta principal el aprendizaje centrado en el estudiantado, el diseño de nuevas herramientas de enseñanza y el fomento de una universidad inclusiva. El proyecto cuenta con 26 docentes de la UCM y otros 28 docentes de otras 17 universidades españolas (UV, UNED, UGR, UNIZAR, UAH, UC3M, UCA, UNIOVI, ULL, EHU/UPV, UA, UAM, Deusto, IFS/CSIC, UCJC, URJC y Univ. Pontificia de Comillas), que permitirán dotar a las actividades programadas de un alcance idóneo para consolidar la adquisición de competencias argumentativas y dialécticas por parte de lxs estudiantes implicados en el marco de los seminarios previstos. Se integrarán en el PIMCD, aparte de PDI, al menos 26 estudiantes de máster y doctorado de la Facultad de Filosofía, a lxs que acompañarán durante el desarrollo del PIMCD 4 Alumni de la Facultad de Filosofía de la UCM, actualmente investigadores post-doc y profesorxs de IES, cuya experiencia será beneficiosa para su introducción en la investigación. Asimismo, el equipo cuenta con el apoyo de varixs profesorxs asociadxs, que en algunos casos son también profesores de IES. Varixs docentes externos a la UCM participantes en el PIMCD poseen una dilatada experiencia en la coordinación de proyectos de innovación de otras universidades, lo que redundará en beneficio de las actividades a desarrollar. La coordinadora y otrxs miembros del PIMCD pertenecen a la Red de Innovación Docente en Filosofia (RIEF), puesta en marcha desde la Universitat de València (http://rief.blogs.uv.es/encuentros-de-la-rief/), a la que mantendremos informada de las actividades realizadas en el proyecto. Asimismo, lxs 6 miembros del PAS permitirán difundir debidamente las actividades realizadas en el PIMCD entre lxs estudiantes Erasmus IN del curso 2019/20 en la Facultad de Filosofía, de la misma manera que orientar en las tareas de maquetación y edición que puedan ser necesarias de cara a la publicación de lxs resultados del PIMCD y en las tareas de pesquisa bibliográfica necesarias para el desarrollo de los objetivos propuestos. Han manifestado su interés en los resultados derivados del PIMCD editoriales especializadas en la difusión de investigaciones predoctorales como Ápeiron y CTK E-Books

    Actualidad y prospectiva de la investigación científica en el Centro Universitario Amecameca de la Universidad Autónoma del Estado de México

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    Con responsabilidad, se organizó un programa cuya finalidad fuera publicitar con transparencia dichos avances, a través de un esfuerzo de rendición de cuentas a la comunidad inmediata, la universitaria, y a la comunidad abierta, la sociedad que la principal referencia para tal efecto. El programa se concretiza a través del presente libro, conformado con una inspiración de investigación multidisciplinaria; sin embargo, para llegar a tal fin, el reto es realizar el proceso de búsqueda y generación de conocimiento transitando hacia la colaboración de los cuerpos académicos, que puedan construir nuevos conocimientos fortalecidos por la convergencia de diferentes campos del saber. En consecuencia, la primera etapa de esta estrategia es la publicidad de los trabajos investigativos ejercidos, para hacer un balance al día, pero también proyectar el futuro de cada campo y área del conocimiento. La organización explicativa está organizada por tres bloques representativos del quehacer en la generación de conocimiento del Centro Universitario, un primer bloque centra el interés en las humanidades, educación y sustentabilidad; el segundo bloque lo integra la reflexión científica sobre la construcción democrática, derechos humanos y equidad de género; en el tercer segmento se destina a la seguridad alimentaria, salud pública y sistemas agropecuarios. La actualidad de la investigación eleva la producción lograda y lo que en el momento se encuentra en construcción y los alcances que produce para la docencia, la investigación misma, y para la sociedad en general. La prospectiva es un área que todos los capítulos desarrollan con el propósito de delinear los alcances innovadores por andar en teoría, metodología e incluso en los saberes mismo

    Effectiveness of a specific manual approach to the suboccipital region in patients with chronic mechanical neck pain and rotation deficit in the upper cervical spine: study protocol for a randomized controlled trial

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    Abstract Background Mechanical neck pain is a highly prevalent problem in primary healthcare settings. Many of these patients have restricted mobility of the cervical spine. Several manual techniques have been recommended for restoring cervical mobility, but their effectiveness in these patients is unknown. The aim of the present study is to compare the effectiveness of two types of specific techniques of the upper neck region: the pressure maintained suboccipital inhibition technique (PMSIT) and the translatory dorsal glide mobilization (TDGM) C0-C1 technique, as adjuncts to a protocolized physiotherapy treatment of the neck region in subjects with chronic mechanical neck pain and rotation deficit in the upper cervical spine. Methods A randomized, prospective, double-blind (patient and evaluator) clinical trial. The participants (n = 78) will be randomly distributed into three groups. The Control Group will receive a protocolized treatment for 3 weeks, the Mobilization Group will receive the same protocolized treatment and 6 sessions (2 per week) of the TDGM C0-C1 technique, and the Pressure Group will receive the same protocolized treatment and 6 sessions (2 per week) of the PMSIT technique. The intensity of pain (VAS), neck disability (NDI), the cervical range of motion (CROM), headache intensity (HIT-6) and the rating of clinical change (GROC scale) will be measured. The measurements will be performed at baseline, post-treatment and 3 months after the end of treatment, by the same physiotherapist blinded to the group assigned to the subject. Discussion We believe that an approach including manual treatment to upper cervical dysfunction will be more effective in these patients. Furthermore, the PMSIT technique acts mostly on the musculature, while the TDGM technique acts on the joint. We expect to clarify which component is more effective in improving the upper cervical mobility. Trial registration ClinicalTrials.gov NCT02832232 . Registered on July 13th, 2016

    Effectiveness of a specific manual approach to the suboccipital region in patients with chronic mechanical neck pain and rotation deficit in the upper cervical spine: study protocol for a randomized controlled trial

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    Atlantoaxial joint; Cervical vertebrae; Range of motion; Suboccipital muscle inhibitionArticulación atlantoaxial; Vértebras cervicales; Rango de movimiento; Inhibición del músculo suboccipitalArticulació Atlantoaxial; Vèrtebres cervicals; Rang de moviment; Inhibició muscular suboccipitalBACKGROUND: Mechanical neck pain is a highly prevalent problem in primary healthcare settings. Many of these patients have restricted mobility of the cervical spine. Several manual techniques have been recommended for restoring cervical mobility, but their effectiveness in these patients is unknown. The aim of the present study is to compare the effectiveness of two types of specific techniques of the upper neck region: the pressure maintained suboccipital inhibition technique (PMSIT) and the translatory dorsal glide mobilization (TDGM) C0-C1 technique, as adjuncts to a protocolized physiotherapy treatment of the neck region in subjects with chronic mechanical neck pain and rotation deficit in the upper cervical spine. METHODS: A randomized, prospective, double-blind (patient and evaluator) clinical trial. The participants (n = 78) will be randomly distributed into three groups. The Control Group will receive a protocolized treatment for 3 weeks, the Mobilization Group will receive the same protocolized treatment and 6 sessions (2 per week) of the TDGM C0-C1 technique, and the Pressure Group will receive the same protocolized treatment and 6 sessions (2 per week) of the PMSIT technique. The intensity of pain (VAS), neck disability (NDI), the cervical range of motion (CROM), headache intensity (HIT-6) and the rating of clinical change (GROC scale) will be measured. The measurements will be performed at baseline, post-treatment and 3 months after the end of treatment, by the same physiotherapist blinded to the group assigned to the subject. DISCUSSION: We believe that an approach including manual treatment to upper cervical dysfunction will be more effective in these patients. Furthermore, the PMSIT technique acts mostly on the musculature, while the TDGM technique acts on the joint. We expect to clarify which component is more effective in improving the upper cervical mobility. TRIAL REGISTRATION: ClinicalTrials.gov NCT02832232. Registered on July 13th, 2016

    Disruption of Allosteric Response as an Unprecedented Mechanism of Resistance to Antibiotics

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    Ceftaroline, a recently approved β-lactam antibiotic for treatment of infections by methicillinresistant Staphylococcus aureus (MRSA), is able to inhibit penicillin-binding protein 2a (PBP2a) by triggering an allosteric conformational change that leads to the opening of the active site. The opened active site is now vulnerable to inhibition by a second molecule of ceftaroline, an event that impairs cell-wall biosynthesis and leads to bacterial death. The triggering of the allosteric effect takes place by binding of the first antibiotic molecule 60 Å away from the active site of PBP2a within the core of the allosteric site. We document, by kinetic studies and by determination of three X-ray structures of the mutant variants of PBP2a that result in resistance to ceftaroline, that the effect of these clinical mutants is the disruption of the allosteric trigger in this important protein in MRSA. This is an unprecedented mechanism for antibiotic resistance.Fil: Fishovitz, Jennifer. University of Notre Dame. Department of Chemistry and Biochemistry; Estados UnidosFil: Rojas Altuve, Alzoray. Consejo Superior de Investigaciones Cientificas. Instituto de Quimica Fisica; EspañaFil: Otero, Lisandro Horacio. Consejo Superior de Investigaciones Cientificas. Instituto de Quimica Fisica; España. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Dawley, Matthew. University of Notre Dame. Department of Chemistry and Biochemistry; Estados UnidosFil: Carrasco López, Cesar. Consejo Superior de Investigaciones Cientificas. Instituto de Quimica Fisica; EspañaFil: Chang, Mayland. University of Notre Dame. Department of Chemistry and Biochemistry; Estados UnidosFil: Hermoso, Juan Antonio. Consejo Superior de Investigaciones Cientificas. Instituto de Quimica Fisica; EspañaFil: Mobashery, Shahriar. University of Notre Dame. Department of Chemistry and Biochemistry; Estados Unido
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