Estudio proteómico de factores moleculares que coordinan la reprogramación génica estacional del pez Cyprinus carpio

Tesis (Doctor en Biociencias Moleculares)RESUMEN: El pez Cyprinus carpio es un ectotermo euritermal que habita los ríos de la zona central y sur de Chile. En este escenario, se ve enfrentado a las variaciones físicas del medio ambiente propias de un clima con las estaciones claramente diferenciadas. El fenómeno de plasticidad fenotípica concomitante a las variaciones estacionales se conoce como aclimatización, el cual se ve reflejado a nivel fisiológico, celular y molecular. En la carpa, el cambio más notable se observa en el reordenamiento ultraestructural que sufre el nucléolo, el cual durante la estación veraniega presenta sus componentes integrados (con una alta actividad transcripcional), mientras que en invierno sus componentes se observan segregados (representativo de una baja tasa transcripcional). Nuestra hipótesis de trabajo sostiene que la homeostasis que caracteriza la adaptación estacional de la carpa, implica cambios en el repertorio de proteínas nucleares y en él se representan los factores moleculares centrales para la coordinación de la reprogramación génica estacional de C. carpio. Este estudio, permitió demostrar los cambios que sufre el proteoma nuclear de la carpa concomitante a la adaptación estacional, observándose que aproximadamente un 10% de las proteínas presentes en ambas estaciones son reguladas. Adicionalmente, hemos identificado cinco proteínas, dos no mostraron variación estacional y tres se sobre expresaron durante el invierno. Las identidades de estas proteínas nos sugieren la participación de diversos mecanismos regulatorios de la expresión génica en el proceso de aclimatización. La subunidad Rpb7 es necesaria para el inicio de transcripción y Spt4 participa de la elongación de la transcripción, Pur b se ha descrito como represor de ciertos genes en células musculares, mientras que CENP-A y Actina1 muestran funciones asociadas la estructura de la cromatina. Paralelamente, hemos evidenciado que la histona variante H2A.Z presenta una regulación estacional durante el proceso adaptativo. En particular, esta variante de histona se encuentra enriquecida en los genes ribosomales de la carpa (principalmente en verano), y su relación a través de ensayo de reChIp con marcadores epigenéticos de activación (AcK12H4) y represión (DimetK27H3), nos sugiere su participación en la modulación de la actividad transcripcional de los genes ribosomales durante el fenómeno de aclimatización. Las funciones descritas para estas proteínas, nos sugieren que la regulación de la expresión génica se llevaría a cabo a través de factores XII transcripcionales específicos y de la modulación de la estructura de la cromatina. Esto nos indica la concertación de diversos procesos nucleares, los cuales sustentarían la reprogramación génica cíclica como una de las respuestas compensatorias centrales frente a los cambios medioambientales al que debe hacer frente el pez C. carpio.ABSTRACT: The ectotherm eurithermal fish Cyprinus carpio lives in the rivers of the central and south areas of Chile. It faces clearly differentiated seasons and it is subjected to selective pressure impose by environmental fluctuations. The carp adaptative response to this phenomenon is a complex mechanism that involves physiological, cellular and molecular adjustments. The phenotypic plasticity of the carp concomitant to seasonal variations is known as acclimatization. This process involves profound nucleolar adjustments and remarkable changes in RNA synthesis, which affects ribosomal biosynthesis. The hypothesis proposes that the homeostasis which characterizes the seasonal adaptation of the C. carpio in winter and summer, involves changes in the repertory of nuclear proteins and those changes include the central molecular factors for coordinating the seasonal gene reprogramming in C. carpio. This study has demonstrated the changes experienced by the nuclear proteome concomitant upon seasonal acclimatization. It has been observed that 10% of the proteins present in both seasons are regulated. In addition, this work identified five proteins; two without seasonal changes y three were overexpressed during the winter. The identities of these proteins suggest the involvement of various mechanisms of gene expression in the process of acclimatization. Rpb7 is required for the initiation of transcription; Purb has been described as a repressor of certain genes in muscle cells, while CENP-A and Actina1-A shows the functions associated to the chromatin’s structure. Parallel to this, it was shown that H2A.Z presents a seasonal regulation during the adaptative process. This histone variant was demonstrated to be associated with ribosomal genes, mainly in summer. Also, its relationship, tested by reChIp, with activation (AcK12H4) and repression (DimetK27H3) epigenetic markers suggests its involvement in the modulation of ribosomal genes transcription during seasonal acclimatization. The functions of these proteins suggest that gene expression regulation would be carrying out through specific transcriptional factors and changes in chromatin structure. This indicate the diverse nuclear processes coordination, which support the cyclical gene reprogramming as a compensatory response to changes in the physical environment that affects fish C. carpio

Obstacle detection algorithm of low computational cost for Guanay II AUV

Obstacle detection is one of the most important stages in the obstacle avoidance system. This work is focused to explain the operation of a designed and implemented for the overall detection of objects with low computational cost strategy. This strategy of low computational cost is based on performing a spatial segmentation of the information obtained by the SONAR and determine the minimum distance between the SONAR (AUV) and the obstacle.Postprint (published version

Diseño de pavimento flexible de la carrera 8ª entre calles 64 y 67 barrio Parrales - Torremolino en el municipio de Ibagué, mediante el uso del método Shell

Trabajo de investigaciónLa causa fundamental del deterioro de la carrera 8a entre calles 64 Y 67 de la ciudad de Ibagué, fue la no intervención a tiempo de la estructura de pavimento. Ya que esta vía, debido al crecimiento de la población en este sector y lógicamente la del parque automotor, se convirtió en una alternativa de evacuación, para aquellos vehículos que no desearan transitar por las Avenidas Guabinal y Quinta. Ocasionándose así la pérdida de capacidad estructural de la estructura de pavimento, reflejada en el deterioro actual. Por lo que el Consorcio Vial Ibagué 2011, para el estudio del tramo en mención, realizo pruebas de laboratorio, para determinar la composición del material empleado en la estructura del pavimento fallado, basados en ensayos a las capas granulares y a la capa de fundación o subrasante. Además del estudio de transito realizado por el investigador, para conocer la composición del determinación del componente vehicular, son las herramientas necesarias para la realización de un diseño óptimo.EspecializaciónEspecialista en Ingeniería de Pavimento

Rezago empresarial frente a la internacionalización

Rezago empresarial frente a la internacionalización El proceso de internacionalización de la economía colombiana, iniciado con la apertura comercial de 1991 e impulsado con los nuevos procesos de integración con Estados Unidos, Chile, Centroamérica y la Unión Europea, entre otros, ha tenido un fuerte impacto en la forma como las organizaciones empresariales enfrentan la competencia. Según los investigadores del Grupo de Internacionalización de la Empresa de la Facultad de Administración de la Universidad del Rosario (GIIE), el proceso de globalización ha permitido constatar que para la mayoría de las empresas nacionales el éxito aún continúa en el mercado local y que las posibilidades que ofrece el mercado internacional están muy lejanas En aras de comprender mejor los procesos de globalización de la economía y de ofrecer alternativas a las empresas colombianas, los investigadores han desarrollado un modelo de internacionalización que responda a las necesidades de los mercados, tanto locales como externos. Para el investigador Andrés Mauricio Castro Figueroa, la incertidumbre de las empresas colombianas radica en que los procesos de internacionalización no consisten solamente en exportar productos hacia otros países, esto es apenas una etapa inicial. Todo parte de la realidad de la empresa, de su preparación para competir y para afrontar los retos de un mundo cada vez más globalizado, donde las alianzas de las grandes multinacionales para atacar mercados emergentes) están a la orden del día, agrega. Es necesario, entonces, que las organizaciones locales sepan cuáles son sus factores diferenciadores en los diferentes mercados y realicen una gestión centrada principalmente en las necesidades de los clientes actuales y potenciales (...)

Aproximación al proceso de internacionalización de las empresas : el caso colombiano

Desde los años 60 y otras décadas atrás, cuando los académicos de la Escuela Nórdica de Uppsala iniciaron el estudio del comportamiento internacional de las multinacionales de esta área europea, y aún hasta la actualidad, se han propuesto modelos que acercan, en teoría, al proceso de internacionalización de las empresas tan diversos que, hoy por hoy, este puede cuestionarse si es entendido como un “proceso”. ¿Cuál es realmente el camino que persiguen las empresas que comienzan un proceso de internacionalización? Al parecer, es siempre el mismo, responderían entonces los economistas de la escuela de Uppsala

Abstract Certification of Java Programs in Rewriting Logic

In this thesis we propose an abstraction based certification technique for Java programs which is based on rewriting logic, a very general logical and semantic framework efficiently implemented in the functional programming language Maude. We focus on safety properties, i.e. properties of a system that are defined in terms of certain events not happening, which we characterize as unreachability problems in rewriting logic. The safety policy is expressed in the style of JML, a standard property specification language for Java modules. In order to provide a decision procedure, we enforce finite-state models of programs by using abstract interpretation. Starting from a specification of the Java semantics written in Maude, we develop an abstraction based, finite-state operational semantics also written in Maude which is appropriate for program verification. As a by-product of the verification based on abstraction, a dependable safety certificate is delivered which consists of a set of rewriting proofs that can be easily checked by the code consumer by using a standard rewriting logic engine. The abstraction based proof-carrying code technique, called JavaPCC, has been implemented and successfully tested on several examples, which demonstrate the feasibility of our approach. We analyse local properties of Java methods: i.e. properties of methods regarding their parameters and results. We also study global confidentiality properties of complete Java classes, by initially considering non--interference and, then, erasure with and without non--interference. Non--interference is a semantic program property that assigns confidentiality levels to data objects and prevents illicit information flows from occurring from high to low security levels. In this thesis, we present a novel security model for global non--interference which approximates non--interference as a safety property.Alba Castro, MF. (2011). Abstract Certification of Java Programs in Rewriting Logic [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/13617Palanci