Pyrenaearia generoa (Gastropoda, Helicoidea): sistematika molekularra eta morfologikoa, biogeografia eta populazio dinamika

283 p.En esta tesis se abordan la sistemática, la biogeografía y la dinámica poblacional del género de gasterópodos terrestres Pyrenaearia, endémico del norte de la Península Ibérica y restringido a zonas de montaña, que en un contexto de cambio climático se presenta como un excelente taxón centinela para seguir los cambios que están aconteciendo en las zonas de montaña. En primer lugar, se desarrolla un estudio de delimitación de especies integrando métodos moleculares multilocus y morfometría geométrica en 3D de la concha. El estudio determinó que Pyrenaearia está compuesto por 10 especies; una de ellas es nueva para la ciencia y es descrita formalmente bajo el nombre P. guillenae. Se estudia también la sistemática e historia evolutiva de la subfamilia Leptaxinae en la cual se incluye Pyrenaearia. Se presenta una filogenia basada en 2 marcadores mitocondriales y 8 nucleares que es calibrada para obtener los tiempos de divergencia y se emplea también para reconstruir las áreas ancestrales. Estos análisis restringen la subfamilia a dos tribus (Leptaxini y Cryptosaccini) y establecen su origen en la Península Ibérica en el Mioceno, desde donde se coloniza Macaronesia. La ecología, la dinámica poblacional e incluso la biología básica del género son completamente desconocidas por lo que, mediante un estudio de captura-recaptura, se investigan estos aspectos en una especie del género, P. carascalensis. Finalmente, se aborda el grado de integración morfológica de la concha en el género aplicando un estudio multi-nivel mediante morfometría geométrica del que se concluye un alto grado de integración

Pyrenaearia generoa (Gastropoda, Helicoidea): sistematika molekularra eta morfologikoa, biogeografia eta populazio dinamika

283 p.En esta tesis se abordan la sistemática, la biogeografía y la dinámica poblacional del género de gasterópodos terrestres Pyrenaearia, endémico del norte de la Península Ibérica y restringido a zonas de montaña, que en un contexto de cambio climático se presenta como un excelente taxón centinela para seguir los cambios que están aconteciendo en las zonas de montaña. En primer lugar, se desarrolla un estudio de delimitación de especies integrando métodos moleculares multilocus y morfometría geométrica en 3D de la concha. El estudio determinó que Pyrenaearia está compuesto por 10 especies; una de ellas es nueva para la ciencia y es descrita formalmente bajo el nombre P. guillenae. Se estudia también la sistemática e historia evolutiva de la subfamilia Leptaxinae en la cual se incluye Pyrenaearia. Se presenta una filogenia basada en 2 marcadores mitocondriales y 8 nucleares que es calibrada para obtener los tiempos de divergencia y se emplea también para reconstruir las áreas ancestrales. Estos análisis restringen la subfamilia a dos tribus (Leptaxini y Cryptosaccini) y establecen su origen en la Península Ibérica en el Mioceno, desde donde se coloniza Macaronesia. La ecología, la dinámica poblacional e incluso la biología básica del género son completamente desconocidas por lo que, mediante un estudio de captura-recaptura, se investigan estos aspectos en una especie del género, P. carascalensis. Finalmente, se aborda el grado de integración morfológica de la concha en el género aplicando un estudio multi-nivel mediante morfometría geométrica del que se concluye un alto grado de integración

Recombination within the Cepaea nemoralis supergene is confounded by incomplete penetrance and epistasis

Although the land snail Cepaea nemoralis is one of the most thoroughly investigated colour polymorphic species, there have been few recent studies on the inheritance of the shell traits. Previously, it has been shown that the shell polymorphism is controlled by a series of nine or more loci, of which five make a single ‘supergene’ containing tightly linked colour and banding loci and more loosely linked pigmentation, spread band and punctate loci. However, one limitation of earlier work was that putative instances of recombination between loci within the supergene were not easily verified. We therefore generated a new set of C. nemoralis crosses that segregate for colour, banding and pigmentation, and several other unlinked shell phenotype loci. The snails were genotyped using a set of RAD-seq-derived loci that flank the supergene, and instances of recombination tested by comparing inferred supergene genotype against RAD-marker genotype. We found no evidence that suspected ‘recombinant’ individuals are recombinant between loci within the supergene. As point estimates of recombination between both colour/banding, and colour/pigmentation loci are zero, incomplete penetrance and epistasis are a better explanation for the apparent ‘recombinant’ phenotype of some snail shells. Overall, this work, therefore, shows that the architecture of the supergene may not be as previously supposed. It also provides a resource for fine mapping of the supergene and other major shell phenotype loci

Evaluating the functional, sexual and seasonal variation in the chemical constituents from feces of adult Iberian wolves (Canis lupus signatus)

Chemical signals deposited in feces play an important role in intraspecific and interspecific communication of many mammals. We collected fresh feces of adult wolves from wild breeding groups. All samples visually identified as belonging to wolves were subsequently identified to species level by sequencing a small fragment of mtDNA and sexed typing DBX6 and DBY7 sex markers. Using gas chromatography-mass spectrometry (GC–MS), we identified 56 lipophilic compounds in the feces, mainly heterocyclic aromatic organic compounds, such as indole or phenol, but also steroids, such as cholesterol, carboxylic acids and their esters between n-C4 and n-C18, aldehydes, alcohols and significant quantities of squalene and α-tocopherol, which would increase the chemical stability of feces on humid substrates. There was variability in the number and proportions of compounds between sexes, which could be indicative of their function as chemical signals. We also found variability in different reproductive states, especially in odorous compounds, steroids and α-tocopherol. Feces with a presumed marking function had higher proportions of α-tocopherol and steroids than feces with non-marking function. These compounds could be involved in intragroup and intergroup communication of wolves and their levels in feces could be directly related with the wolf’s sex and physiological and reproductive status.Financial support was provided by the project MCI-CGL2008-02119/BOS

Molecular phylogeny of the genus Chondrina (Gastropoda, Panpulmonata, Chondrinidae) in the Iberian Peninsula

[EN] Chondrina Reichenbach, 1828 is a highly diverse genus of terrestrial molluscs currently including 44 species with about 28 subspecific taxa. It is distributed through North Africa, central and southern Europe, from Portugal in the West to the Caucasus and Asia Minor in the East. Approximately 70% of the species are endemic to the Iberian Peninsula constituting its main center of speciation with 34 species. This genus includes many micro endemic taxa, some of them not yet described, confined to limestone habitats (being strictly rock-dwelling species). They are distributed on rocky outcrops up to 2000 m.a.s.l. It is a genus of conical-fusiform snails that differ mainly in shell characters and in the number and position of teeth in their aperture. So far, molecular studies on Chondrina have been based exclusively on the mitochondrial Cytochrome Oxidase subunit I region (COI). These studies gave a first view of the phylogeny of the genus but many inner nodes were not statistically supported. The main objective of the study is to obtain a better understanding of the phylogeny and systematics of the genus Chondrina on the Iberian Peninsula, using multilocus molecular analysis. Partial sequences of the COI and 16S rRNA genes, as well as of the nuclear Internal Transcribed Spacer 1 (ITS1-5.8S) and Internal Transcribed Spacer 2 (5.8S-ITS2-28S) were obtained from individuals of all the extant Chondrina species known from the Iberian Peninsula. In addition to this, the newly obtained COI sequences were combined with those previously published in the GenBank. Phylogenetic relationships were inferred using maximum likelihood and Bayesian methods. The reconstructed phylogenies showed high values of support for more recent branches and basal nodes. Moreover, molecular species delimitation allowed to better define the studied species and check the presence of new taxa.This work was partially funded by the Basque Government through the Research group on “Systematics, Biogeography and Population Dynamics” (IT575-13) and “Systematics, Biogeography, Behavioural ecology and Evolution” (IT1163-19). E. Somoza Valdeolmillos was supported by a PhD fellowship awarded in 2015 by the University of the Basque Country (UPV/EHU)

Pyrenaearia generoa (Gastropoda, Helicoidea): sistematika molekularra eta morfologikoa, biogeografia eta populazio dinamika

283 p.En esta tesis se abordan la sistemática, la biogeografía y la dinámica poblacional del género de gasterópodos terrestres Pyrenaearia, endémico del norte de la Península Ibérica y restringido a zonas de montaña, que en un contexto de cambio climático se presenta como un excelente taxón centinela para seguir los cambios que están aconteciendo en las zonas de montaña. En primer lugar, se desarrolla un estudio de delimitación de especies integrando métodos moleculares multilocus y morfometría geométrica en 3D de la concha. El estudio determinó que Pyrenaearia está compuesto por 10 especies; una de ellas es nueva para la ciencia y es descrita formalmente bajo el nombre P. guillenae. Se estudia también la sistemática e historia evolutiva de la subfamilia Leptaxinae en la cual se incluye Pyrenaearia. Se presenta una filogenia basada en 2 marcadores mitocondriales y 8 nucleares que es calibrada para obtener los tiempos de divergencia y se emplea también para reconstruir las áreas ancestrales. Estos análisis restringen la subfamilia a dos tribus (Leptaxini y Cryptosaccini) y establecen su origen en la Península Ibérica en el Mioceno, desde donde se coloniza Macaronesia. La ecología, la dinámica poblacional e incluso la biología básica del género son completamente desconocidas por lo que, mediante un estudio de captura-recaptura, se investigan estos aspectos en una especie del género, P. carascalensis. Finalmente, se aborda el grado de integración morfológica de la concha en el género aplicando un estudio multi-nivel mediante morfometría geométrica del que se concluye un alto grado de integración