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Preliminary morpho-structural study of a pig population in the province of Corrientes (Argentina)
A preliminary study of the morphostructural characteristics of a sample of the population of Creole Argentine pigs formed by 34 animals of 10 months of age from 12 farms belonging to 3 departments of Corrientes Province, Argentina, based principally on exteriorists and morphologic aspects is presented in this work. The animals presented rectilinear profiles, sub-concave and concave front, Iberian, celtic and asian type ears, red, yellow, white and spotted coats, white, black and white with gray rows hooves, pink and dark mucosaes. They all presented hair and females had between 8 and 15 nipples. The comparative analysis among departments for the quantitative variables and indexes, shows significant differences (p<0.05) for most of them, except for length of the croup, thorax perimeter, facial index, relative depth of the chest, index metacarpus - thoracic and index of load of the cane, in which an homogeneous behaviour was stated in the whole population. It is pending the development of a full work where, the samples of animals are enlarged to achieve a complete description and the genetic characterization of the pigs, to confirm the presence of different varieties and its relationship with the iberic trunk.En este trabajo se presenta un estudio preliminar de las características morfoestructurales de una muestra de la población de cerdos criollos argentinos formada por 34 ejemplares mayores de 10 meses, de 12 establecimientos rurales pertenecientes a 3 departamentos de la Provincia de Corrientes, Argentina, basado principalmente en aspectos exterioristas y morfológicos. Se encontraron perfiles rectilíneos, subconcavilíneos, concavilíneos y ultraconcavilíneos, orejas asiáticas, ibéricas y célticas, capas negras, coloradas y bayas, claras y overas, pezuñas blancas enteras y con vetas de color pizarra, y negras, mucosas rosadas y pigmentadas, todos presentaban pelos y de 8 a 15 mamas las hembras, hallándose mamellas en un porcentaje de la muestra. El análisis comparativo entre departamentos para las variables cuantitativas e índices zoométricos, muestra diferencias significativas (p<0,05) para la mayoría, a excepción longitud de la grupa, perímetro torácico, índice facial, profundidad relativa del pecho, índice metacarpo-torácico e índice de carga de la caña, en las cuales se constató un comportamiento homogéneo en toda la población. Queda pendiente el desarrollo de un trabajo donde, se amplíe la muestra de animales medidos para lograr una descripción completa y donde se profundice en la caracterización genética, para afirmar la presencia de variedades y su relación con el tronco ibérico
Pig local genetic resource in the argentinian ne region
Los parámetros cualitativos muestran que es una población muy homogénea y por lo tanto no pueden establecerse variedades basadas en éstas
Relación altura/edad (frame score) en terneros Brahman del norte argentino
Yostar, E.J.; Capellari, A.; Haynes, A.: Relación altura/edad (frame score) en terneros Brahman del norte argentino.
Rev. vet. 22: 1, 55–59, 2011.
Palabras clave: ternero, Brahman, Red Brahman, frame score
Detection of prions in skin punch biopsies of Creutzfeldt–Jakob disease patients
Prion real-time quaking-induced conversion (RT-QuIC) is an ultrasensitive assay detecting pathological aggregates of misfolded prion protein in biospecimens. We studied 71 punch biopsy skin samples of 35 patients with Creutzfeldt–Jakob disease (CJD), including five assessed in vitam. The results confirmed the high value of skin prion RT-QuIC for CJD diagnosis (89% sensitivity and 100% specificity) and support its use in clinical practice. Preliminary data based on a limited number of cases suggest that prion-seeding activity in the skin varies according to the prion strain, being higher in sporadic CJD subtypes linked to the V2 strain (VV2 and MV2K) than in typical CJDMM1
Relación entre pastura (Axonopus catarinensi), lapso de suplementación y crecimiento de vaquillonas en sistema silvopastoril
Pantiu, A.J.; Capellari, A.; Giménez L.I.: Relación entre pastura (Axonopus catarinensi), lapso de suplementación y crecimiento de vaquillonas en sistema silvopastoril. Rev. vet. 26: 1, 22-26, 201
Sistemas silvopastoriles del centro y norte de la Provincia de Misiones, Argentina
Los sistemas silvopastoriles representan una modalidad de uso de la tierra donde coexisten interacciones ambientales, económicas y sociales entre los componentes arbóreo, forrajero, ganadero, edáfico y humano, bajo un manejo integrado. El objetivo del trabajo fue establecer la producción física de los sistemas silvopastoriles como una opción para mejorar la rentabilidad del recurso tierra a través de la diversificación productiva, con el menor impacto sobre el uso del suelo y medio ambiente. Mediante un estudio de casos se describe el desarrollo de dos sistemas foresto– ganaderos ubicados en el centro y norte de Misiones, donde se informan variables sobre la producción de carne (categoría animal, biotipo, ganancia de peso total y diaria, carga animal), caracterización de las especies forrajeras (especie, implantación, producción de materia seca, porcentaje de proteína) y caracterización de las especies forestales (especie, longitud de copa, densidad de plantación). Los resultados obtenidos revelan que el estudio de los sistemas silvopastoriles constituye una nueva alternativa para generar modelos productivos más rentables y eficientes en un marco de sustentabilidad, permitiendo obtener dos o más productos en un mismo sitio con menor impacto sobre el uso del suelo y medio ambiente.
Identification of recurrent genetic patterns from targeted sequencing panels with advanced data science: a case-study on sporadic and genetic neurodegenerative diseases
open8noThis work is funded by the University of Bologna, the IRCCS Institute of Neurological sciences of Bologna, and by the European Grants H2020 GenoMed4All [AM1] (Grant N. 101017549) and H2020 MSCA-ITN IMforFUTURE (Grant N. 721815).Background
Targeted Next Generation Sequencing is a common and powerful approach used in both clinical and research settings. However, at present, a large fraction of the acquired genetic information is not used since pathogenicity cannot be assessed for most variants. Further complicating this scenario is the increasingly frequent description of a poli/oligogenic pattern of inheritance showing the contribution of multiple variants in increasing disease risk. We present an approach in which the entire genetic information provided by target sequencing is transformed into binary data on which we performed statistical, machine learning, and network analyses to extract all valuable information from the entire genetic profile. To test this approach and unbiasedly explore the presence of recurrent genetic patterns, we studied a cohort of 112 patients affected either by genetic Creutzfeldt–Jakob (CJD) disease caused by two mutations in the PRNP gene (p.E200K and p.V210I) with different penetrance or by sporadic Alzheimer disease (sAD).
Results
Unsupervised methods can identify functionally relevant sources of variation in the data, like haplogroups and polymorphisms that do not follow Hardy–Weinberg equilibrium, such as the NOTCH3 rs11670823 (c.3837 + 21 T > A). Supervised classifiers can recognize clinical phenotypes with high accuracy based on the mutational profile of patients. In addition, we found a similar alteration of allele frequencies compared the European population in sporadic patients and in V210I-CJD, a poorly penetrant PRNP mutation, and sAD, suggesting shared oligogenic patterns in different types of dementia. Pathway enrichment and protein–protein interaction network revealed different altered pathways between the two PRNP mutations.
Conclusions
We propose this workflow as a possible approach to gain deeper insights into the genetic information derived from target sequencing, to identify recurrent genetic patterns and improve the understanding of complex diseases. This work could also represent a possible starting point of a predictive tool for personalized medicine and advanced diagnostic applications.openTarozzi, M.; Bartoletti-Stella, A.; Dall’Olio, D.; Matteuzzi, T.; Baiardi, S.; Parchi, P.; Castellani, G.; Capellari, S.Tarozzi, M.; Bartoletti-Stella, A.; Dall’Olio, D.; Matteuzzi, T.; Baiardi, S.; Parchi, P.; Castellani, G.; Capellari, S
Terneza, grasa intramuscular y de cobertura en carne de novillos faenados en Corrientes (Argentina)
La terneza de la carne es el atributo más apreciado por los consumidores, encontrándose condicionada por muchos factores. El objetivo de este trabajo fue generar información sobre terneza objetiva post maduración de la carne bovina y determinar valores de grasa intramuscular y de cobertura en animales de diferentes biotipos y edades faenados en Corrientes. El trabajo se realizó en un frigorífico tipo A y en la Facultad de Ciencias Veterinarias de la UNNE. Se evaluó el músculo longisimus dorsi de novillos tipo Brangus y Braford, de 4, 6 y 8 dientes. Se registró el peso individual de res caliente, así como la conformación y terminación. Las muestras divididas en dos fueron maduradas durante 7 y 14 días envasadas al vacío. La terneza se evaluó por la cizalla de Warner-Bratzler, la grasa total por el método de Soxhlet y la grasa de cobertura con un escalímetro. Se utilizó el análisis de la covarianza a tres vías incluyendo el peso de la res como covariable. El periodo de maduración afectó la terneza. Se registraron diferencias estadísticas entre tratamientos a los 14 días, no así a los 7 días. Durante este periodo, la diferencia de peso lograda se atribuyó al número de dientes y la covariable. El espesor de grasa dorsal se vio afectado por el número de dientes al igual que en la grasa intramuscular, donde además afectó la covariable. La maduración al vacío mejoró la terneza de la carne, siendo este efecto manifiesto en individuos más jóvenes, incrementándose la grasa de cobertura con la edad, no así la grasa intramuscular. La carne producto de animales faenados en la Provincia de Corrientes debe ser considerada de buena calidad, ya que según características de terneza y porcentajes de grasa intramuscular y de cobertura encontradas, responde a las más altas exigencias del mercado
Antemortem CSF Aβ42/Aβ40 ratio predicts Alzheimer's disease pathology better than Aβ42 in rapidly progressive dementias
Objective: Despite the critical importance of pathologically confirmed samples for biomarker validation, only a few studies have correlated CSF Aβ42 values in vivo with postmortem Alzheimer's disease (AD) pathology, while none evaluated the CSF Aβ42/Aβ40 ratio. We compared CSF Aβ42 and Aβ42/Aβ40 ratio as biomarkers predicting AD neuropathological changes in patients with a short interval between lumbar puncture and death. Methods: We measured CSF Aβ40 and Aβ42 and assessed AD pathology in 211 subjects with rapidly progressive dementia (RPD) and a definite postmortem diagnosis of Creutzfeldt-Jakob disease (n = 159), AD (n = 12), dementia with Lewy bodies (DLB, n = 4), AD/DLB mixed pathologies (n = 5), and various other pathologies (n = 31). Results: The score reflecting the severity of Aβ pathology showed a better correlation with ln(Aβ42/Aβ40) (R 2 = 0.506, β = −0.713, P < 0.001) than with ln(Aβ42) (R 2 = 0.206, β = −0.458, P < 0.001), which was confirmed after adjusting for covariates. Aβ42/Aβ40 ratio showed significantly higher accuracy than Aβ42 in the distinction between cases with or without AD pathology (AUC 0.818 ± 0.028 vs. 0.643 ± 0.039), especially in patients with Aβ42 levels ≤495 pg/mL (AUC 0.888 ± 0.032 vs. 0.518 ± 0.064). Using a cut-off value of 0.810, the analysis of Aβ42/Aβ40 ratio yielded 87.0% sensitivity, 88.2% specificity in the distinction between cases with an intermediate-high level of AD pathology and those with low level or no AD pathology. Interpretation: The present data support the use of CSF Aβ42/Aβ40 ratio as a biomarker of AD pathophysiology and noninvasive screener for Aβ pathology burden, and its introduction in the research diagnostic criteria for AD
Evaluación del desempeño reproductivo en vacas y vaquillonas cruza índica con protocolo convencional y J-Synch
The objective of this study was evaluate the reproductive performance of índics cross cows and heifers with a conventional protocol and prolonged proestrus in a breeding system at Chaco. Were used 264 cows without calf and 236 heifers with body condition 4 to 6 (scale 1-9). On day 0 a device with 0.5 g of progesterone (DIB) and 2 mg of estradiol benzoate was applied. Animals were randomly distributed into 2 groups: a) conventional: day 8: DIB was withdrawn, D-Cloprostenol (PG) (150μg) and estradiol cypionate (0.5 mg) were administered. Artificial insemination (AI) was performed 48 to 54 hours after withdrawal DIB. b) J-Synch: day 6 DIB was withdrawn, PG (150 μg) and equine chorionic gonadotropin (eCG) (300 or 400 IU) were applied in heifers and cows respectively. The sacro-coccygeal region was painted to determine estrus manifestation, performing AI on the unpainted ones at 60 h and 72 hand in those that were still painted at 72 h in addition to AI buserelin acetate (10 μg) was applied. Ultrasonography diagnosis was made 40 days post-AI. Using Chi 2 test were compared the effect of treatment (conventional vs. J-Synch without eCG) and category (heifer and cow) on the rates of pregnancy and in J-Synch (without vs. with eCG) in addition to estrus manifestation. No association was found between treatments evaluated with reproductive performance with pregnancies of 43% vs 54% in cows and 59% vs 51% in heifers with conventional and J-Synch respectively. In J-Synch of 52 and 56% in cows (54 vs 62%) and heifers (51 vs 50%) without and with eCG respectively. The general pregnancy was 55% in animals that showed estrus and 44% in those that did not. In conclusion, the cows had a tendency to perform better with J-Synch where the use of eCG had no influence on pregnancy.El objetivo de este estudio fue evaluar el desempeño reproductivo en vacas y vaquillonas cruza índica con protocolo convencional y de proestro alargado, en un sistema de cría de Chaco. Se utilizaron 264 vacas secas y 236 vaquillonas, con condición corporal 4 a 6 (escala 1-9). El día 0 se aplicó dispositivo con 0,5 g de progesterona (DIB) y 2 mg de benzoato de estradiol. Los animales se distribuyeron aleatoriamente en 2 grupos: a) convencional (día 8) se retiró DIB, administrándose D-Cloprostenol (PG) (150 μg) y cipionato de estradiol (0,5 mg). La inseminación artificial (IA) se realizó de 48 a 54 h del retiro, b) J-Synch: día 6 se retiró DIB, aplicándose PG (150 μg) y gonadotrofina coriónica equina (eCG: 300 y 400 UI) en vaquillonas y vacas, respectivamente. Se pintó la región sacrocoxígea para determinar manifestación de celo, inseminando a las 60 h y 72 h a las despintadas y en las que seguían pintadas a las 72 h además de IA se aplicó acetato de buserelina (10μg). El diagnóstico por ultrasonografía se efectuó 40 días post-IA. Mediante prueba Chi 2, 3 se comparó el efecto tratamiento (convencional vs J-Synch sin eCG) y categoría (vaquillona y vaca) sobre el porcentaje de preñez y en J-Synch (sin vs con eCG), además de manifestación de celo. No se encontró asociación de los tratamientos evaluados con el desempeño reproductivo, con preñeces del 43% vs 54% en vacas y en vaquillonas del 59% vs 51% con convencional y J-Synch, respectivamente. En J-Synch de 52 y 56%, en vacas (54 vs 62%) y vaquillonas (51 vs 50%) sin y con eCG, respectivamente. La preñez general fue de 55% en animales que manifestaron celo y 44% en aquellos que no lo hicieron. Como conclusión las vacas tuvieron una tendencia a desempeñarse mejor con J-Synch, donde la utilización de eCG no tuvo influencias sobre la preñez
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