Transcription factor AP-2 activity is modulated by protein kinase A-mediated phosphorylation

AbstractWe recently reported that APOE promoter activity is stimulated by cAMP, this effect being mediated by factor AP-2 [Garcı́a et al. (1996) J. Neurosci. 16, 7550–7556]. Here, we study whether cAMP-induced phosphorylation modulates the activity of AP-2. Recombinant AP-2 was phosphorylated in vitro by protein kinase A (PKA) at Ser239. Mutation of Ser239 to Ala abolished in vitro phosphorylation of AP-2 by PKA, but not the DNA binding activity of AP-2. Cotransfection studies showed that PKA stimulated the effect of AP-2 on the APOE promoter, but not that of the S239A mutant. Therefore, cAMP may modulate AP-2 activity by PKA-induced phosphorylation of this factor

Protein coding potential of retroviruses and other transposable elements in vertebrate genomes

We suggest an annotation strategy for genes encoded by retroviruses and transposable elements (RETRA genes) based on a set of marker protein domains. Usually RETRA genes are masked in vertebrate genomes prior to the application of automated gene prediction pipelines under the assumption that they provide no selective advantage to the host. Yet, we show that about 1000 genes in four vertebrate gene sets analyzed contain at least one RETRA gene marker domain. Using the conservation of genomic neighborhood (synteny), we were able to discriminate between RETRA genes with putative functionality in the vertebrates and those that probably function only in the context of mobile elements. We identified 35 such genes in human, along with their corresponding mouse and rat orthologs; which included almost all known human genes with similarity to mobile elements. The results also imply that the vast majority of the remaining RETRA genes in current gene sets are unlikely to encode vertebrate functions. To automatically annotate RETRA genes in other vertebrate genomes, we provide as a tool a set of marker protein domains and a manually refined list of domesticated or ancestral RETRA genes for rescuing genes with vertebrate functions

Underwater noise studies in the Gulf of Lions region. Anthropogenic contributions to underwater noise due to maritime traffic and offshore windfarm operation

En el marco del proyecto MSPMED se ha llevado a cabo un caso de estudio transfronterizo entre España y Francia en relación al estado de los ecosistemas, el desarrollo de la eólica marina y el ruido submarino,. Este deliverable analiza cómo podría ser el impacto del ruido submarino producido por el tráfico marítimo y la eólica marina en el componente pelágico

MSP Plans in MSPMED; main facts

El objetivo de este informe es la creación de fichas comparativas de los planes nacionales de ordenación del espacio marítimo de los países socios de MSPMED con el fin de detectar los puntos comunes y las principales diferencias entre ellos

Knowledge synthesis about ecological stakes related to seabirds, marine mammals, sea turtles and canyon deep habitats

En el marco del proyecto MSPMED, se ha llevado a cabo un caso de estudio entre España y Francia en el Golfo de Léon. El presente deliverable ha permitido impulsar los conocimientos existentes para ofrecer una visión transfronteriza actualizada de los intereses ecológicos en el Golfo de León

Los Casos Piloto de Ordenación del Espacio Marítimo Transfronterizos y su Implicación en el Proceso Nacional en España

Maritime Spatial Planning processes are already being implemented in many parts of the world being Europe one of the hot spots due to the approval of the Directive 2014/89/EU of the European Parliament and of the Council of 23 July 2014 establishing a framework for maritime spatial planning, which oblige every coastal Member State to have approved plans by March 2021. This Directive does not allocate specific funds for the development of these plans but it supports national processes by funding Maritime Spatial Planning transboundary projects among neighbouring countries. These projects have mainly two benefits, one is to provide states with knowledge, capacity and methodologies to apply in MSP national processes, and another one is to facilitate the coherence along plans of neighbouring countries sharing a sea basin region. As biological and ecological processes in the marine environment are not limited by administrative borders, the transboundary component of Maritime Spatial Planning is of extremely importance to manage marine resources in a sustainable wayVersión del edito

Maritime Spatial Planning Transboundary Pilot Projects and their implication in the national process in Spain

Los procesos de Ordenación del Espacio Marítimo (OEM) ya se están aplicando en muchas partes del mundo siendo Europa un punto caliente debido a la aprobación de la Directiva 2014/89/UE del Parlamento Europeo y del Consejo, de 23 de julio de 2014, por la que se establece un marco para la OEM, que obligaba a todos los Estados miembros costeros a tener planes aprobados para marzo de 2021. Para facilitar esto, se asignan fondos europeos específicos para apoyar el desarrollo de proyectos transfronterizos de ordenación del espacio marítimo entre países vecinos. Estos proyectos tienen principalmente dos objetivos, uno es proporcionar a los Estados conocimientos, capacidad y metodologías para aplicarlos en los procesos nacionales de ordenación del territorio, y otro es facilitar la coherencia entre los planes de los países que comparten la misma cuenca marítima. Este trabajo presenta una visión general del proceso español de MSP, y cómo algunos de los resultados que surgieron de estos proyectos piloto pueden ser incorporados al proceso nacional

MSPMED Case Study: Characterizing the ecological stakes and their interactions with offshore activities in the Gulf of Lion to support the Maritime Spatial Planning processes in the Mediterranean Sea

El Golfo de León es una zona transfronteriza entre Francia y España, siendo una zona excepcional para la biodiversidad marina (por ejemplo, aves marinas, cetáceos, tortugas marinas y hábitats bentónicos), así como una zona de desarrollo económico para el sector marítimo, como la pesca, el tráfico marítimo y nuevas actividades como los parques eólicos. Aunque España y Francia han llevado a cabo considerables investigaciones y proyectos en el Golfo de León, todavía hay una falta de conocimiento sobre los intereses ecológicos y sus interacciones con las actividades humanas. Para ello, y en el marco del proyecto MSPMED (Towards the operational implementation of Maritime Spatial Planning in our common Mediterranean Sea) cofinanciado por la Comisión Europea, se está desarrollando un estudio de caso transfronterizo entre España y Francia en una zona extensa del Golfo de León, cuyo objetivo principal se centra en la evaluación del conocimiento disponible sobre el medio marino de la zona y la identificación y caracterización de las interacciones entre los usos marítimos (especialmente los parques eólicos flotantes en alta mar), el ruido submarino, y los componentes del ecosistema marino en el contexto de la ordenación del espacio marino (OEM

Transboundary Impact Assessment in the north-western Iberian Peninsula

En el marco del proyecto SIMAtlantic, se ha llevado a cabo un caso de estudio entre España y Portugal. Este documento describe una metodología propuesta para la Evaluación de Efectos Acumulativos con el fin de evaluar los impactos/efectos acumulativos a escala transfronteriza. El trabajo se llevó a cabo en un caso de estudio específico en la región noroeste de la Península Ibérica, en una zona transfronteriza entre Portugal y España

Transboundary cooperation and Mechanisms for Maritime Spatial Planning implementation. SIMNORAT Project

El proyecto SIMNORAT, Supporting Implementation of Maritime Spatial Planning in the Northern European Atlantic region (SIMNORAT), fue un proyecto cofundado por la UE de ordenación del espacio marítimo desarrollado en la región atlántica. Los objetivos del proyecto eran apoyar a los Estados miembros (EM) para aplicar la Directiva 2014/89/UE del Parlamento Europeo y del Consejo, de 23 de julio de 2014, por la que se establece un marco para la ordenación del espacio marítimo (OEM); y poner en marcha y llevar a cabo iniciativas concretas y transfronterizas de OEM entre los EM participantes en el proyecto (España, Francia y Portugal). Para desarrollar y probar aspectos de la ordenación del espacio marítimo con el fin de elaborar directrices y recomendaciones útiles en un contexto transfronterizo, las autoridades competentes de los países también participaron en el proyecto. Los resultados de SIMNORAT, como el desarrollo de una metodología conceptual para la ordenación del espacio marítimo transfronterizo, el análisis de las herramientas y los datos aplicados en el proceso de ordenación del espacio marítimo, la evaluación de las demandas y tendencias espaciales de los sectores marítimos, y la participación de las partes interesadas, ayudaron a identificar las mejores prácticas en los aspectos científicos, técnicos y sociales de la ordenación del espacio marítimo para una cooperación eficaz, especialmente en las áreas de estudio de casos transfronterizos, para mejorar la aplicación de la Directiva sobre ordenación del espacio marítimo en cada país con esfuerzos de colaboración y una visión común. Esto, a su vez, puede apoyar la creación del marco adecuado para desarrollar una economía azul sostenible en la región, gestionando el sistema socioecológico asociado en un entorno cambiante