Negatively Charged Hadron Spectra in Au+Au Collisions at sqrt(s_NN) = 130 GeV

Negatively charged hadron (h-) production in Au+Au collisions at BNL-RHIC is studied with the STAR experiment. Results are presented on h- multiplicity, pseudorapidity and transverse momentum distributions at sqrt(s_NN) = 130 GeV.Comment: 4 pages, 4 figures. Presented at Quark Matter 200

RNA microarray analysis in prenatal mouse cochlea reveals novel IGF-I target genes: implication of MEF2 and FOXM1 transcription factors

Background: Insulin-like growth factor-I (IGF-I) provides pivotal cell survival and differentiation signals during inner ear development throughout evolution. Homozygous mutations of human IGF1 cause syndromic sensorineural deafness, decreased intrauterine and postnatal growth rates, and mental retardation. In the mouse, deficits in IGF-I result in profound hearing loss associated with reduced survival, differentiation and maturation of auditory neurons. Nevertheless, little is known about the molecular basis of IGF-I activity in hearing and deafness. Methodology/Principal Findings: A combination of quantitative RT-PCR, subcellular fractionation and Western blotting, along with in situ hybridization studies show IGF-I and its high affinity receptor to be strongly expressed in the embryonic and postnatal mouse cochlea. The expression of both proteins decreases after birth and in the cochlea of E18.5 embryonic Igf1(-/-) null mice, the balance of the main IGF related signalling pathways is altered, with lower activation of Akt and ERK1/2 and stronger activation of p38 kinase. By comparing the Igf1(-/-) and Igf1(+/+) transcriptomes in E18.5 mouse cochleae using RNA microchips and validating their results, we demonstrate the up-regulation of the FoxM1 transcription factor and the misexpression of the neural progenitor transcription factors Six6 and Mash1 associated with the loss of IGF-I. Parallel, in silico promoter analysis of the genes modulated in conjunction with the loss of IGF-I revealed the possible involvement of MEF2 in cochlear development. E18.5 Igf1(+/+) mouse auditory ganglion neurons showed intense MEF2A and MEF2D nuclear staining and MEF2A was also evident in the organ of Corti. At P15, MEF2A and MEF2D expression were shown in neurons and sensory cells. In the absence of IGF-I, nuclear levels of MEF2 were diminished, indicating less transcriptional MEF2 activity. By contrast, there was an increase in the nuclear accumulation of FoxM1 and a corresponding decrease in the nuclear cyclin-dependent kinase inhibitor p27(Kip1). Conclusions/Significance: We have defined the spatiotemporal expression of elements involved in IGF signalling during inner ear development and reveal novel regulatory mechanisms that are modulated by IGF-I in promoting sensory cell and neural survival and differentiation. These data will help us to understand the molecular bases of human sensorineural deafness associated to deficits in IGF-I

Resonance expansions in quantum mechanics

The goal of this contribution is to discuss various resonance expansions that have been proposed in the literature.Comment: 10 pages and 1 figure; presented at the Istanbul workshop on pseudo-Hermitian Hamiltonian

Identificación de una proteína ribosomal con actividad antimicrobiana, producida por Streptomyces lividans TK24

The use of antimicrobial proteins and peptides is considered an alternative to replace traditional antibiotics that are currently ceasing to be effective in the presence of resistant pathogenic microorganisms. These molecules are effective against a broad spectrum of infectious bacterial, viral, fungal, and parasitic pathogens. The development of this project originated from the discovery of an antimicrobial compound around 10 kDa, this molecule was found in the biomass-free extract of a Streptomyces lividans TK24 culture. In the first stage we showed that this molecule contained in ELB acts against Bacillus subtilis, Bacillus cereus, Kokuria rhizophila, Clostridium sporogenes and Clavibacter michiganensis (phytopathogenic bacteria responsible for bacterial canker), all these bacteria are Grampositive. Antimicrobial activity was observed only when glycerol and glucose were used as carbon source. As a second stage a partial protein purification was performed, starting with ammonium sulfate precipitation followed by ion exchange chromatography, then hydroxyapatite chromatography. By SDS-PAGE gel (under non-denaturing conditions) coupled to an antimicrobial activity assay, it was determined that the band with antimicrobial activity corresponds to a size of 12.6±1.26 kDa. On the other hand, by liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry, we identified that 11 proteins were within the interval of 11.3-13.9 kDa. Through a functional analysis we selected 4 proteins as those possibly responsible for the antimicrobial activity. In stage three, a gene expression analysis was made to determine the expression levels of the genes that code for the selected proteins and see the relationship with the antimicrobial activity, using culture conditions that showed antimicrobial activity and culture conditions that did not show antimicrobial activity. Altogether, protein fractionation, correlation analysis between antimicrobial activity and abundance of selected proteins, as well as gene expression (semi-quantitative and quantitative analyses) and a prediction of the antimicrobial potential of peptides, indicate that the 50S ribosomal protein L19 is the main candidate responsible for the antimicrobial activity. Keywords: Antimicrobial protein; moonlighting protein; Streptomyces lividans; Clavibacter michiganensis.El uso de proteínas y péptidos antimicrobianos se considera una alternativa para sustituir a los antibióticos tradicionales que actualmente están dejando de ser efectivos ante la presencia de microorganismos patógenos resistentes. Estas moléculas son efectivas hacia un amplio espectro de patógenos bacterianos, virales, fúngicos y parasitarios. El desarrollo de este proyecto surgió por el descubrimiento de un compuesto con actividad antimicrobiana mayor a 10 kDa, dicha molécula se encontró en el extracto libre de biomasa (ELB) de un cultivo de Streptomyces lividans TK24. En la primera etapa demostramos que esta molécula contenida en el ELB actúa contra Bacillus subtilis, Bacillus cereus, Kokuria rhizophila, Clostridium sporogenes y Clavibacter michiganensis (bacteria fitopatógena responsable del cancro bacteriano), todas son bacterias Gram-positivas, y que la actividad antimicrobiana se presentaba solo cuando se utilizaba glicerol y glucosa como fuente de carbono. En la segunda etapa se realizó una purificación parcial de proteínas, iniciando con una precipitación con sulfato de amonio seguida de cromatografía de intercambio iónico y una cromatografía con hidroxiapatita. Mediante gel SDS-PAGE (en condiciones no desnaturalizantes) acoplado a una prueba de actividad antimicrobiana se determinó que la banda con actividad antimicrobiana corresponde a un tamaño de 12.6±1.26 kDa. Por otro lado, mediante cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas en tándem identificamos que 11 proteínas se encontraban dentro del intervalo de 11.3-13.9 kDa. A través de un análisis funcional seleccionamos 4 proteínas como las posibles responsables de la actividad antimicrobiana. En la etapa 3 se hizo un análisis de expresión génica para determinar los niveles de expresión de los genes que codifican a las proteínas seleccionadas y ver la relación con la actividad antimicrobiana, empleando condiciones de cultivo que mostraron actividad antimicrobiana y condiciones de cultivo que no mostraron actividad antimicrobiana. En conjunto, el fraccionamiento de proteínas, el análisis de correlación entre la actividad antimicrobiana y la abundancia de las proteínas seleccionadas, el análisis de expresión génica (análisis semicuantitativo y cuantitativo) y una predicción del potencial antimicrobiano de péptidos, indican que la proteína 50S ribosomal L19 es la principal candidata responsable de la actividad antimicrobiana. Palabras clave: Proteína antimicrobiana; proteínas moonlighting; Streptomyces lividans; Clavibacter michiganensis

Diseño y evaluación de un medio de cultivo tipo industrial para la producción heteróloga de un péptido con actividad antimicr0biana en Streptomyces lividans TK24

La producción heteróloga de péptidos antimicrobianos (AMPs) actualmente, es una herramienta muy atractiva en procesos industriales; los AMPs son una alternativa prometedora por poseer principalmente actividad antimicrobiana en una amplia gama de microorganismos. Sin embargo, a pesar de este amplio espectro de acción, el cual es debido a su mecanismo de acción, estos no afectan a las células eucarióticas haciéndolos biotecnológicamente atractivos para su producción. En este sentido, los sistemas de expresión heteróloga son utilizados frecuentemente para la producción de moléculas de importancia industrial debido a que pueden alcanzar mayores niveles de producción que la fuente original, sin embargo, los rendimientos de las proteínas recombinantes varían dependiendo de la proteína específica y del sistema de expresión seleccionado. Actualmente, se ha logrado diseñar un sistema de expresión de un AMP catiónico en S. lividans TK24, basado principalmente en el uso de un péptido señal (vsi) el cual, mostró ser eficaz para la secreción de grandes cantidades de AMPs. El péptido de interés (PepB15); cuya secuencia es Phe-Lys-Cys-Arg-Arg-Trp-Gln-Trp-Arg-Met-LysLys-Leu-Ala-Ala no es tóxico para plantas y animales, tiene una actividad de amplio espectro contra bacterias Gram-positivas y Gram-negativas, así como hongos. El interés principal sobre PepB15 es implementarlo contra fitopatógenos en el sector agrícola.En el presente trabajo se diseñó un medio de cultivo tipo industrial que cumpliera con los factores nutricionales requeridos por la cepa modelo de estudio S. lividans TK24 (cepa parental y cepa transformante) en la etapa de producción. El medio de producción UP (DGA) fue el medio probado en la etapa de producción de PepB15 con la cepa transformante, los resultados obtenidos muestran que es un medio que induce 10 la producción de PepB15 mostrando incluso mayor actividad antimicrobiana que con el medio R2 (comparación de halos de inhibición) tomado como control positivo. Como control negativo se cultivó a la cepa parental (S. lividans TK24). Para la cepa transformante, se evaluó el efecto de las fuentes de carbono y nitrógeno para la biosíntesis de PepB15 en S. lividans TK24-PepB15. Modificar la fuente de carbono no resulta favorable para la producción del péptido ya que se presenta menor actividad si es modificada por glucosa o sacarosa, por otro lado, se observa mayor actividad antimicrobiana al cambiar la fuente de nitrógeno original (triptona) por extracto de levadura grado industrial. Se realizaron pruebas piloto en biorreactores de 14 L para la producción de PepB15 utilizando medio UP como medio de producción y empleando las siguientes condiciones: aireación 1vvm, agitación de 150 rpm, 30 °C, pH constante de 7 ± 0.2. Bajo estas condiciones se comprobó actividad antimicrobiana contra B. subtilis.Se determinó la razón por la cual la producción de PepB15 se detiene y disminuye a determinado tiempo. Con base en los resultados obtenidos al realizar cultivos por lote alimentado, se determinó que la producción de PepB15 disminuye debido a que la cepa hospedera resultó ser sensible a determinadas concentraciones de este péptido presente en el medio extracelular. Por otro lado, con la cepa parental (S. lividans TK24) se obtuvieron resultados totalmente inesperados al realizar bioensayos de actividad, donde se observó actividad antimicrobiana. Para ello, se evaluó el efecto de la fuente de carbono y nitrógeno sobre la expresión de la molécula con actividad antimicrobiana; modificar tanto la fuente de carbono como la fuente de nitrógeno desfavorece la biosíntesis de esta molécula que de forma natural es secretada al medio extracelular utilizando el medio UP sin ninguna modificación

Verdad canonica, discurso politico, y demonstracion legal del iusto sentimiento que deve causar a la razon ... el acelerado consejo verbal que cierto incognito Moralista dio à algunos Capitulares dela Santa Iglesia de N. ...

Autor tomado de fin de texto.Va fechado al fin en Zamora, Agosto 29 de 1698 y la aprobación eclesiástica a 5 de septiembre.Sign.: A-Q\p2\s

Serum and bal beta-d-glucan for the diagnosis of Pneumocystis pneumonia in HIV positive patients

Background/purposeThe diagnosis of patients with pulmonary infiltrates and human immunodeficiency virus (HIV) infection remains a challenge. In current clinical practice the gold standard for Pneumocystis jirovecii pneumonia (PCP) diagnosis remains the identification of the organism in bronco alveolar lavage (BAL) using microscopy (e.g., silver stain). (1->3)-β -d-glucan (BG) is a polysaccharide that is present within the cell wall of Pneumocystis and other fungi.MethodsWe analyzed serum and BAL lavage fluid from a cohort of 119 patients that did have HIV, a diagnosis of pneumonia and underwent bronchoscopy (FOB) for diagnosis of PCP.ResultsThe discriminative power of serum BG for the diagnosis of PCP in this group of patients was very high. Using a cutoff of 300 pg/mL, the sensitivity, specificity, positive predictive value (PPV) and negative predictive value (NPV) were 91%, 92%, 89% and 93% respectively. A model for ROC with just serum BG (N = 108) had an AUC of 0.95. Serum procalcitonin (PCT) and BAL BG were not as accurate for the diagnosis of PCP. For BAL BG using a cutoff of 783 pg/mL, the sensitivity, specificity, positive predictive value (PPV) and negative predictive value (NPV) were 72%, 79%, 72% and 79% respectively. The differences between the medians for serum PCT between the group with a without PCP did not reach statistical significance (p = 0.6137).ConclusionThe measurement of serum BG should be incorporated in the diagnostic work up of HIV positive patients with dyspnea and infiltrates on chest X X-ray. Our study confirms the diagnostic value of serum BG previously reported by others but we add a cutoff value that we believe is more accurate for patients with AIDS and suspicion of PCP