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    A influência de variáveis ambientais no crescimento de espécies/procedências de Eucalyptus spp. nos estados de Minas Gerais e Espírito Santo.

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    Foram analisados onze experimentos de introdução de espécies e procedências potenciais de Eucalyptus instalados em várias localidades dos estados de Minas Gerais e Espírito Santo. O estudo da influência de variáveis ambientais dos locais de introdução no crescimento em altura dessas espécies, aos três anos e meio de idade, permitiu concluir que a altitude do local do experimento foi a variável que mais influenciou o crescimento em altura de Eucalyptus camaldulensis, E. dunnii, E. grandis, E. pellita e E. tereticornis; o déficit hídrico isoladamente influenciou significativamente apenas o crescimento em altura de E. urophylla; a temperatura média e o total anual de precipitações não influenciaram isoladamente o crescimento em altura das oito espécies estudadas, e que é possível prever o comportamento das espécies e procedências em relação ao crescimento em altura, conhecendo-se a altitude, déficit hídrico e total anual médio de precipitações do local de introdução

    Análise estatística de um sistema agroflorestal através do índice de produção equivalente.

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    As interações biológicas, econômicas e ambientais que ocorrem entre as culturas componentes de um sistema agroflorestal) (SAF, implicam em respostas diferenciadas das respectivas culturas, conforme os arranjos aos quais as mesmas estejam submetidas. Num ensaio de avaliação de S SAF' , cada parcela apresenta mais de uma variável a ser estudada e portanto, os dados apresentam-se de forma multidimensional. Assim sedo, a forma mais apropriada para análise desses sistemas é através do uso das técnicas da estatísticas multivariadas. Não obstante, o tipo de analise estatística mais freqüentemente realizado nos sistemas consorciados é através da transformação do problema multivariado em um problema univariado através da obtenção de uma única variável como função resposta das observações das culturas componentes e, a partir da mesma, aplicam-se os testes estatísticos comumente empregados na análise de dados agronômicos

    Análise de um sistema agroflorestal usando estatística multivariada.

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    Os cultivos consorciados onde são cultivados no mesmo espaço, de forma simultânea ou seqüencial, culturas anuais e/ou fruteiras com espécies florestais, com a presença ou não de animais, receberam a denominação específica de sistemas agroflorestais, ou simplesmente, s SAF' . Nas regiões tropicais, parece óbvio as vantagens desses sistemas em relação às outras formas de cultivo, principalmente no que tange a sua sustentabilidade a longo prazo. Não obstante, as análises quantitativas dos efeitos diretos das culturas componentes dos s SAF' , bem como das associações existentes entre essas culturas, são fundamentais para uma melhor compreensão e sistematização desses sistemas de cultivo. Entre os componentes dos s SAF' , há interações biológicas, econômicas e ambientais, entre outras, o que torna complexo as análises e interpretações dos mesmos

    Resposta da videira BRS morena sob cobertura plástica a diferentes sistemas de alerta fitossanitário.

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    O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito do uso de diferentes sistemas de alerta fitossanitário para o controle do míldio na videira cv BRS Morena cultivada sob cobertura plástica impermeável.Resumo expandido

    Polyethylene glycol damages grafted citrus plants based on biometric, physiological, and biochemical responses.

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    Drought tolerance is a major trait for the selection of citrus rootstocks in breeding programs. PEG 4000 solution at 110 g L-1 (osmotic potential of -376 kPa) was used to evaluate biometric, physiological, and biochemical responses of grafted citrus plants in pots. ?Valencia? sweet orange plants grafted onto ?Rangpur? lime (drought tolerant) rootstock showed greater plant growth compared to that on ?Swingle? citrumelo (drought sensitive) rootstock, regardless of PEG-induced stress; however, biological responses to PEG were similar on both rootstocks. Plant dry weight, gas exchange, and leaf and root starch concentrations were reduced by PEG. Water potential at 2:00 p.m. and Fe and Mn leaf concentrations increased with severe phytotoxic symptoms. The results corroborate the limitation of PEG for assessing drought tolerance of citrus plants at the whole plant level

    Exact score distribution computation for ontological similarity searches

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    <p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Semantic similarity searches in ontologies are an important component of many bioinformatic algorithms, e.g., finding functionally related proteins with the Gene Ontology or phenotypically similar diseases with the Human Phenotype Ontology (HPO). We have recently shown that the performance of semantic similarity searches can be improved by ranking results according to the probability of obtaining a given score at random rather than by the scores themselves. However, to date, there are no algorithms for computing the exact distribution of semantic similarity scores, which is necessary for computing the exact <it>P</it>-value of a given score.</p> <p>Results</p> <p>In this paper we consider the exact computation of score distributions for similarity searches in ontologies, and introduce a simple null hypothesis which can be used to compute a <it>P</it>-value for the statistical significance of similarity scores. We concentrate on measures based on Resnik's definition of ontological similarity. A new algorithm is proposed that collapses subgraphs of the ontology graph and thereby allows fast score distribution computation. The new algorithm is several orders of magnitude faster than the naive approach, as we demonstrate by computing score distributions for similarity searches in the HPO. It is shown that exact <it>P</it>-value calculation improves clinical diagnosis using the HPO compared to approaches based on sampling.</p> <p>Conclusions</p> <p>The new algorithm enables for the first time exact <it>P</it>-value calculation via exact score distribution computation for ontology similarity searches. The approach is applicable to any ontology for which the annotation-propagation rule holds and can improve any bioinformatic method that makes only use of the raw similarity scores. The algorithm was implemented in Java, supports any ontology in OBO format, and is available for non-commercial and academic usage under: <url>https://compbio.charite.de/svn/hpo/trunk/src/tools/significance/</url></p
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