Acoutic-oceanographic buoy - An easily deployable, reconfigurable, and multifunctional acoustic-oceanographic system

The concept of an easy to use and easy to deploy ocean acoustic tomographic (OAT) system is presented. The system is composed of a network of buoys and a data inversion online processor. This study concerns the individual node of that network—the acoustic-oceanographic buoy (AOB)—the data inversion technique and the testing of the system at sea. The AOB is a lightweight surface buoy with a vertical array of acoustic and temperature sensors to be hand deployed in a free-drifting configuration from a small boat. The data are locally stored and transmitted online to a remote station for processing and monitoring. Data inversion is based on a broadband matched-field tomography technique where known and unknown parameters are simultaneously searched for (focalization). In situ recorded temperature data serve for algorithm initialization and calibration. The AOB was successfully deployed in several consecutive days during two rapid environmental assessment sea trials in 2003 (Mediterranean) and 2004 (Atlantic). Data collected at sea also show that the AOB can be reconfigured as a receiving array for underwater coherent communications in the band up to 15 kHz

Serological survey of Map infection in goats in the Northeast of Portugal

The aim of this work was to study the seroprevalence of paratuberculosis in the Northeast of Portugal in order to discern its economic impact, and to prioritize the allocation of disease control resources. The goat flocks studied were located in the region of Trás-os-Montes e Alto Douro, Northeast of Portugal and included 3 counties (Macedo de Cavaleiros, Mirandela and Alfandega da Fé). In each flock, veterinary practitioners collected blood samples from at least 2 years old goats between May and July 2011. A goat flock was defined to be paratuberculosis seropositive if at least one seropositive adult goat was present. Blood (10 ml) was collected in the jugular vein and serum was separated after clotting by centrifugation at 200 g for 10 min and frozen at−20 ºC until use. All samples were subjected to a commercial enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) test according to the manufacturer’s instructions. In total, 628 samples of goats older than 2 years belonging to 39 goat flocks from 3 counties were investigated for the presence of antibodies against Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis. About 66.7% (26/39) flocks had one or more serologically positive animals. The individual paratuberculosis prevalence was 15.5% (97/628)

Seroprevalência de Mycobacterium avium subespécies paratuberculosis em caprinos de raça Serrana na área de intervenção da ACRIGA-OPP

A paratuberculose foi descrita pela primeira vez em Portugal em 1983. Desde então apenas foram realizadas estudos serológicos pontuais para estimar a prevalência de paratuberculose em algumas regiões. O presente estudo seroepidemiológico foi realizado com o objectivo de calcular a prevalência da doença em caprinos no Nordeste de Portugal, aferir o seu impacto económico e sugerir métodos adequados de controlo da doença. Um total de 1.533 caprinos, pertencentes a 93 rebanhos, foi testado com um kit comercial de ELISA (ID Screen ®). Duzentas e vinte e uma amostras (14,6%, 95% CI: 12,9-16,5%) foram consideradas positivas. Foram detectados animais seropositivos à paratuberculose (um ou mais) em 68 rebanhos (73,1%, IC 95%: 63,3-81,1%). Os valores de prevalência entre os sexos masculino e feminino foram de 10,7 e 15,6%, respectivamente (P>0,05). Em relação aos grupos etários, o valor mais baixo de seroprevalência (0,0%) foi encontrado em animais com mais de 10 anos e o mais elevado (4,7%) em animais com 2-4 anos de idade (P<0,05). Observaram-se ainda diferenças estatisticamente significativas entre municípios e quanto à presença ou não de sinais clínicos. Os resultados indicam que anticorpos contra Mycobacterium avium subespécie paratuberculosis estão amplamente presentes em caprinos criados no Nordeste de Portugal. Na verdade, uma elevada percentagem de animais e de rebanhos foram considerados serologicamente positivos. Deve-se por isso reforçar o controlo desta infecção, em colaboração com Associações de Produtores (OPP), veterinários e produtores, a fim de estabelecer um programa de controlo eficaz e com avaliação regular.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Rapid turnover of life-cycle-related genes in the brown algae.

Sexual life cycles in eukaryotes involve a cyclic alternation between haploid and diploid phases. While most animals possess a diploid life cycle, many plants and algae alternate between multicellular haploid (gametophyte) and diploid (sporophyte) generations. In many algae, gametophytes and sporophytes are independent and free-living and may present dramatic phenotypic differences. The same shared genome can therefore be subject to different, even conflicting, selection pressures during each of the life cycle generations. Here, we analyze the nature and extent of genome-wide, generation-biased gene expression in four species of brown algae with contrasting levels of dimorphism between life cycle generations. We show that the proportion of the transcriptome that is generation-specific is broadly associated with the level of phenotypic dimorphism between the life cycle stages. Importantly, our data reveals a remarkably high turnover rate for life-cycle-related gene sets across the brown algae and highlights the importance not only of co-option of regulatory programs from one generation to the other but also of a role for newly emerged, lineage-specific gene expression patterns in the evolution of the gametophyte and sporophyte developmental programs in this major eukaryotic group. Moreover, we show that generation-biased genes display distinct evolutionary modes, with gametophyte-biased genes evolving rapidly at the coding sequence level whereas sporophyte-biased genes tend to exhibit changes in their patterns of expression. Our analysis uncovers the characteristics, expression patterns, and evolution of generation-biased genes and underlines the selective forces that shape this previously underappreciated source of phenotypic diversity

Correction to: Rapid turnover of life-cycle-related genes in the brown algae.

Following publication of the original article [1], it was noticed that the author names were published with initials instead of full names. The article [1] has been updated

Efeito do ensacamento dos frutos no controle de pragas e doenças e na qualidade e maturação de maçãs ‘Fuji Suprema’.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência de embalagens de diferentes materiais para a proteção contra pragas e doenças e seu efeito sobre a qualidade físico-química, maturação e teor de cálcio (Ca) em maçãs ‘Fuji Suprema’. O experimento foi desenvolvido nas safras de 2007/2008 e 2008/2009, em pomar manejado sob o sistema orgânico, localizado na região de São Joaquim (SC). O pomar era composto por plantas de dez anos de idade da cultivar Fuji Suprema, sobre porta-enxerto ‘Marubakaido’, com interenxerto ‘EM-9’. Depois do raleio manual, aproximadamente 40 dias após a plena floração, os frutos foram ensacados com embalagens plásticas transparentes microperfuradas ou de tecido não texturizado (TNT). Os frutos foram mantidos ensacados até a colheita. A testemunha foi constituída por frutos não ensacados. Na colheita, os frutos foram avaliados quanto aos danos provocados por mosca-das-frutas (Anastrepha fraterculus), mariposa oriental (Grapholita molesta) e lagarta enroladeira (Bonagota salubricola). As doenças foram avaliadas pela incidência de sarna da macieira (Venturia inaequalis), podridão amarga (Colletotrichum gloeosporioides) e podridão carpelar (Alternaria sp., Fusarium sp.). Também foi avaliada a incidência de distúrbios fisiológicos “russeting” e “bitter pit”, atributos físico-químicos de maturação e qualidade e o teor de Ca nos frutos. Independentemente do tipo de embalagem verificou-se que o ensacamento é prática eficaz na proteção contra o ataque de insetos, mas não reduz a incidência e o desenvolvimento de doenças nos frutos. Na safra de 2008/2009, o ensacamento dos frutos aumentou o teor de Ca e reduziu a incidência de “bitter pit”, e aumentou a incidência do “russeting”. O ensacamento dos frutos antecipou a maturação, especialmente com embalagem plástica transparente microperfurada, e reduziu a coloração vermelha, especialmente com embalagem TNT

Seroprevalência de Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis em caprinos de raça Serrana em Portugal

Realizou-se um estudo da seroprevalência de Mycobacterium avium subespécie paratuberculosis em rebanhos de caprinos no Nordeste de Portugal. A paratuberculose foi descrita pela primeira vez em Portugal em 1983, e desde então apenas foram realizadas até hoje estudos serologicos pontuais para estimar a prevalência de paratuberculose em algumas regiões. O presente estudo seroepidemiológico foi realizado com o objectivo de calcular a prevalência da doença em caprinos no Nordeste de Portugal, aferir o seu impacto económico e sugerir métodos adequados de controle da doença. Um total de 971 animais de 95 rebanhos foram testados com um kit comercial de ELISA segundo as instruções do fabricante. Cento e cinquenta (15,4%, 95% CI: 13,3-17,8) amostras foram consideradas positivas. Foram detectados animais seropositivos à paratuberculose (um ou mais) em 70 rebanhos (73,7%, IC 95%: 64,5-81,5%). Os valores de prevalência entre os sexos masculino e feminino foram de 10,7 e 15,6%, respectivamente (p = 0,604). Em relação aos grupos etários, o valor mais baixo de seroprevalência (0,0%) foi encontrada em animais com mais de 10 anos, e o mais elevado (4,7%) em caprinos de 2-4 anos de idade, e essas diferenças foram estatisticamente significativas (p = 0,012) . Observaram-se ainda diferenças estatisticamente significativas entre municípios e quanto à presença ou não de sinais clínicos. Os resultados deste estudo indicam que anticorpos contra M. avium subespécie paratuberculosis detectados por ELISA estão amplamente presentes em caprinos no Nordeste de Portugal com uma elevada percentagem de animais e de rebanhos a serem considerados serologicamente positivos. Deve por isso reforçar-se o controlo efetivo desta infecção em colaboração com associações de agricultores (OPP) veterinários e produtores, a fim de estabelecer um programa de controlo eficiente e com avaliação regular.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Seroprevalência de Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis em caprinos de raça Serrana em Portugal

Realizou-se um estudo da seroprevalência de Mycobacterium avium subespécie paratuberculosis em rebanhos de caprinos no Nordeste de Portugal. A paratuberculose foi descrita pela primeira vez em Portugal em 1983, e desde então apenas foram realizadas até hoje estudos serologicos pontuais para estimar a prevalência de paratuberculose em algumas regiões. O presente estudo seroepidemiológico foi realizado com o objectivo de calcular a prevalência da doença em caprinos no Nordeste de Portugal, aferir o seu impacto económico e sugerir métodos adequados de controle da doença. Um total de 971 animais de 95 rebanhos foram testados com um kit comercial de ELISA segundo as instruções do fabricante. Cento e cinquenta (15,4%, 95% CI: 13,3-17,8) amostras foram consideradas positivas. Foram detectados animais seropositivos à paratuberculose (um ou mais) em 70 rebanhos (73,7%, IC 95%: 64,5-81,5%). Os valores de prevalência entre os sexos masculino e feminino foram de 10,7 e 15,6%, respectivamente (p = 0,604). Em relação aos grupos etários, o valor mais baixo de seroprevalência (0,0%) foi encontrada em animais com mais de 10 anos, e o mais elevado (4,7%) em caprinos de 2-4 anos de idade, e essas diferenças foram estatisticamente significativas (p = 0,012) . Observaram-se ainda diferenças estatisticamente significativas entre municípios e quanto à presença ou não de sinais clínicos. Os resultados deste estudo indicam que anticorpos contra M. avium subespécie paratuberculosis detectados por ELISA estão amplamente presentes em caprinos no Nordeste de Portugal com uma elevada percentagem de animais e de rebanhos a serem considerados serologicamente positivos. Deve por isso reforçar-se o controlo efetivo desta infecção em colaboração com associações de agricultores (OPP) veterinários e produtores, a fim de estabelecer um programa de controlo eficiente e com avaliação regular.info:eu-repo/semantics/publishedVersio