Sistemas Integrados para o Semiárido: contribuições da Embrapa para a disponibilização de sistemas com alto potencial de inovação.

Os sistemas integrados de produção são uma estratégia para minimizar a vulnerabilidade da pecuária no semiárido. Através desses sistemas é possível gerar produtos de alto valor agregado que trazem novas oportunidades de acesso a mercado, emprego e renda nessa região, que historicamente é afetada pela ocorrência de secas. A Embrapa ao longo dos mais de quarenta anos de existência tem empenhado esforços e conhecimento de sua equipe técnica altamente qualificada no sentido de desenvolver tecnologias de sistemas adaptados às realidades locais, permitindo produtividade e sustentabilidade nos mais diversos ambientes. Em alinhamento com o VII Plano Diretor da Embrapa, atendendo a desafios de inovação presente no portfólio de convivência com a seca, o tema do Sistemas integrados para o semiárido foi tratado em painel de especialistas, organizado pelo Portfolio de convivência com a Seca, aplicando ferramentas de Design Thinking com o objetivo de identificar matriz de problemas e soluções, identificando tecnologias aptas para um processo de prototipagem, acelerando o processo de inovação, a partir da base tecnológica de sistemas integrados já desenvolvida pela empresa. O presente documento traz informações relevantes levantadas por especialistas a partir de demandas qualificadas de stakeholders e a equipe do comitê gestor do Portfólio de Convivência com a Seca disponibiliza para o conhecimento de todos, essas informações, através desse documento, que subsidiará a construção de novos projetos e parcerias dentro do tema pela Embrapa. Uma leitura necessária a todos os interessados em uso de sistemas integrados para a agropecuária no semiárido

Genome of the Avirulent Human-Infective Trypanosome—Trypanosoma rangeli

Background: Trypanosoma rangeli is a hemoflagellate protozoan parasite infecting humans and other wild and domestic mammals across Central and South America. It does not cause human disease, but it can be mistaken for the etiologic agent of Chagas disease, Trypanosoma cruzi. We have sequenced the T. rangeli genome to provide new tools for elucidating the distinct and intriguing biology of this species and the key pathways related to interaction with its arthropod and mammalian hosts.  Methodology/Principal Findings: The T. rangeli haploid genome is ,24 Mb in length, and is the smallest and least repetitive trypanosomatid genome sequenced thus far. This parasite genome has shorter subtelomeric sequences compared to those of T. cruzi and T. brucei; displays intraspecific karyotype variability and lacks minichromosomes. Of the predicted 7,613 protein coding sequences, functional annotations could be determined for 2,415, while 5,043 are hypothetical proteins, some with evidence of protein expression. 7,101 genes (93%) are shared with other trypanosomatids that infect humans. An ortholog of the dcl2 gene involved in the T. brucei RNAi pathway was found in T. rangeli, but the RNAi machinery is non-functional since the other genes in this pathway are pseudogenized. T. rangeli is highly susceptible to oxidative stress, a phenotype that may be explained by a smaller number of anti-oxidant defense enzymes and heatshock proteins.  Conclusions/Significance: Phylogenetic comparison of nuclear and mitochondrial genes indicates that T. rangeli and T. cruzi are equidistant from T. brucei. In addition to revealing new aspects of trypanosome co-evolution within the vertebrate and invertebrate hosts, comparative genomic analysis with pathogenic trypanosomatids provides valuable new information that can be further explored with the aim of developing better diagnostic tools and/or therapeutic targets

Produção de maracujazeiro-amarelo sob diferentes densidades de plantio

O adensamento de plantas em cultivos do maracujazeiro-amarelo é importante por propiciar maior rentabilidade em menor área. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de diferentes densidades de plantio na produção, qualidade dos frutos e rentabilidade do maracujazeiro-amarelo. O experimento foi instalado e conduzido em pomar comercial da Fazenda Sant'ana, Município de São Tiago, MG. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados com cinco tratamentos e quatro repetições. Os tratamentos constituíram-se de diferentes espaçamentos na linha de plantio: T1, 1,0 m (3.330 plantas/ha); T2, 1,5 m (2.220 plantas/ha); T3, 2,0 m (1.660 plantas/ha); T4, 3,0 m (1.100 plantas/ha) e T5, 4,0 m (830 plantas/ha). O espaçamento entre linhas foi de 3,0 m em todos os tratamentos. Cada parcela foi constituída de 12 m de comprimento por 3,0 m de largura (36 m²). O plantio foi realizado em outubro de 2001, e a colheita, a partir de abril, estendendo-se até agosto de 2002. A maior produtividade foi estimada em 11,9 t/ha na densidade de 1.841 plantas/ha. O adensamento não altera a qualidade do fruto. A máxima eficiência econômica foi alcançada na densidade de 1.340 plantas/ha, com rentabilidade de R$ 1.321,92/ha

Broadened T-cell Repertoire Diversity in ivIg-treated SLE Patients is Also Related to the Individual Status of Regulatory T-cells

Intravenous IgG (ivIg) is a therapeutic alternative for lupus erythematosus, the mechanism of which remains to be fully understood. Here we investigated whether ivIg affects two established sub-phenotypes of SLE, namely relative oligoclonality of circulating T-cells and reduced activity of CD4 + Foxp3+ regulatory T-cells (Tregs) reflected by lower CD25 surface density.Octapharma research funding; Fundação para a Ciência e a Tecnologia postdoctoral fellowships: (SFRH/BPD/20806/2004, SFRH/BPD/34648/2007); FCT Programa Pessoa travel grant

Spatio-Temporal Tracking and Phylodynamics of an Urban Dengue 3 Outbreak in São Paulo, Brazil

The dengue virus has a single-stranded positive-sense RNA genome of ∼10.700 nucleotides with a single open reading frame that encodes three structural (C, prM, and E) and seven nonstructural (NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B, and NS5) proteins. It possesses four antigenically distinct serotypes (DENV 1–4). Many phylogenetic studies address particularities of the different serotypes using convenience samples that are not conducive to a spatio-temporal analysis in a single urban setting. We describe the pattern of spread of distinct lineages of DENV-3 circulating in São José do Rio Preto, Brazil, during 2006. Blood samples from patients presenting dengue-like symptoms were collected for DENV testing. We performed M-N-PCR using primers based on NS5 for virus detection and identification. The fragments were purified from PCR mixtures and sequenced. The positive dengue cases were geo-coded. To type the sequenced samples, 52 reference sequences were aligned. The dataset generated was used for iterative phylogenetic reconstruction with the maximum likelihood criterion. The best demographic model, the rate of growth, rate of evolutionary change, and Time to Most Recent Common Ancestor (TMRCA) were estimated. The basic reproductive rate during the epidemics was estimated. We obtained sequences from 82 patients among 174 blood samples. We were able to geo-code 46 sequences. The alignment generated a 399-nucleotide-long dataset with 134 taxa. The phylogenetic analysis indicated that all samples were of DENV-3 and related to strains circulating on the isle of Martinique in 2000–2001. Sixty DENV-3 from São José do Rio Preto formed a monophyletic group (lineage 1), closely related to the remaining 22 isolates (lineage 2). We assumed that these lineages appeared before 2006 in different occasions. By transforming the inferred exponential growth rates into the basic reproductive rate, we obtained values for lineage 1 of R0 = 1.53 and values for lineage 2 of R0 = 1.13. Under the exponential model, TMRCA of lineage 1 dated 1 year and lineage 2 dated 3.4 years before the last sampling. The possibility of inferring the spatio-temporal dynamics from genetic data has been generally little explored, and it may shed light on DENV circulation. The use of both geographic and temporally structured phylogenetic data provided a detailed view on the spread of at least two dengue viral strains in a populated urban area