Análisis de genomas de SARS-CoV-2 en muestras de Perú: Analysis of SARS-CoV-2 genomes samples from Peru

Introduction: Genomic analysis of samples from documented COVID-19 cases can be used successfully to help track sources of Sars-Cov-2 infection, which can be quarantined to prevent the recurrent spread of the disease around the world. Objective: To describe the SARS-CoV-2 sequences isolated from Peruvian patients. Methods: All genomes published up to March 2021, uploaded in the GISAID and Nextstrain repository, were selected. All data is on the web in a public way; In addition, the information was filtered by continent, country, region, clade, lineage, and sex from March 2020 to February 2021. Results: It was evidenced that the region with the most isolated genomes was Lima, the most frequent clade is GR, the viral lineage B.1.1 is the most frequent and persistent in time and most of the genomes were isolated from people of the female sex.Conclusions: The clade GR is common to all South American countries and the European and Asian continents, followed by clades G and GH with greater frequency; on the other hand, the most persistent viral lineage in Peru is B.1.1, this being not common with other countries.Introducción: El análisis genómico de muestras de casos documentados de COVID-19 puede usarse con éxito para ayudar a rastrear fuentes de infección por Sars-Cov-2, que pueden ponerse en cuarentena para prevenir la propagación recurrente de la enfermedad en todo el mundo. Objetivo: Describir las secuencias de SARS-CoV-2 aisladas de pacientes peruanos. Métodos: Se seleccionaron todos los genomas publicados hasta marzo del 2021, subidos en el repositorio de GISAID y Nextstrain. Todos los datos están en la web de manera pública; además se filtró la información por continente, país, región, clado, linaje y sexo desde marzo de 2020 hasta febrero de 2021. Resultados: Se evidenció que la región con la mayoría de los genomas aislados fue Lima, el clado más frecuente es el GR, el linaje viral B.1.1 es el más frecuente y persistente en tiempo y la mayor parte de genomas fueron aislados de personas del sexo femenino. Conclusiones: El clado GR es común para todos los países sudamericanos y los continentes europeos y asiáticos, seguido de los clados G y GH con mayor frecuencia; por otro lado, el linaje viral más persistente en Perú es el B.1.1, siendo este dato no común con otros países

Percepción y conocimiento sobre COVID-19: Una caracterización a través de encuestas

Objetive. To describe the perceptions and knowledge about COVID-19. Material and Method: Cross-sectional study, an online survey of 314 participants was conducted, the questionnaire consists of 9 multiple-choice questions, the data were analyzed using descriptive statistics. Results: The average age of the respondents was 26.9 years, the sample comprised more women 161 (51.3%) than men and almost 89% of the respondents belonged to undergraduate, the place of origin of the Covid-19 was well known 94.30%, for half of the respondents 159 (50.6%) it is not a zoonotic disease, concerning the COVID-19 prevention measures the majority of the respondents consider that handwashing is an of the main prevention measures. Conclusion: CAP studies are important for a better understanding of the perception and knowledge of COVID-19. The study revealed that respondents generally have some general knowledge about SARS-CoV-2.Objetivo. Describir las percepciones y conocimientos sobre COVID-19. Material y Métodos: Estudio de corte transversal, se realizó una encuesta online a 314 participantes, el cuestionario consta de 9 preguntas de respuesta múltiple, los datos se analizaron mediante estadística descriptiva. Resultados: La edad promedio de los encuestados fue 26,9 años, la muestra comprendido más mujeres 161 (51,3%) que hombres y casi 89% de los encuestados pertenecían a pregrado, el lugar de origen del Covid-19 era bien conocido 94,30%, para la mitad de los encuestados 159 (50,6%) no se trata de una enfermedad zoonótica, con respecto a las medidas de prevención de COVID-19 la mayoría de los encuestados consideran que el lavado de manos es una de las principales medidas de prevención. Conclusión: Los estudios CAP son importantes para una mejor comprensión de la percepción y conocimiento de COVID-19. El estudio revelo que los encuestados generalmente tienen algún conocimiento general acerca de SARS-CoV-2

Parámetros hematológicos y laboratoriales tempranos asociados con la mortalidad por COVID-19 en una población amazónica del Perú

COVID-19 has a significant impact on the hematopoietic system and hemostasis. Leukocytosis, lymphopenia, and thrombocytopenia are associated with increased severity and even death in COVID-19 cases. Objective: The aim is to examine the laboratory results of COVID-19 patients from a hospital in the Peruvian Amazon and their clinical prognosis. Material and Methods: An analytical cross-sectional study was carried out whose purpose was to identify the laboratory tests of patients with COVID-19 and mortality in a hospital in Ucayali, Peru during the period from March 13 to May 9, 2020, selecting a total of 127 with Covid-19. Mean and the standard deviation was described for age, leukocytes, neutrophils, platelets, RDW-SD; median and interquartile range for the variables lymphocyte, RN / L, fibrinogen, CRP, D-dimer, DHL, hematocrit, monocytes, eosinophils. Results: No differences were observed in this population regarding death and sex (OR: 1.31; 95% CI 0.92 to 1.87), however, it was observed that, for each one-year increase, the probability of death increased by 4% (PR: 1.04, 95% CI 1.03 to 1.05). The IRR (Incidence Risk Ratio) analysis for the numerical variables showed results strongly associated with hematological values such as Leukocytes (scaled by 2500 units) (IRR: 1.08, 95% CI 1.03 to 1.13), neutrophils (scaled by 2500 units) (IRR: 1.08; 95% CI 1.03 to 1.13), on the contrary, it is observed that the increase of 1000 units in lymphocytes, the probability of dying decreased by 48% (IRR: 0.52; 95% CI 0.38 to 071). Conclusions: Parameters such as leukocytes,neutrophils and D-dimer were statistically much higher in patients who died.COVID-19 tiene un impacto significativo en el sistema hematopoyético y la hemostasia. La leucocitosis, la linfopenia y la trombocitopenia se asocian con una mayor gravedad e incluso la muerte en los casos de COVID-19. Objetivo: examinar los resultados de laboratorio de pacientes con COVID-19 de un hospital de la Amazonía peruana y su pronóstico clínico. Material y métodos: Se realizó un estudio transversal analítico cuyo propósito fue identificar las pruebas de laboratorio de pacientes con COVID-19 y mortalidad en un hospital de Ucayali, Perú durante el periodo del 13 de marzo al 9 de mayo del 2020, seleccionando un total de 127 con COVID-19. Se describió la media y la desviación estándar para edad, leucocitos, neutrófilos, plaquetas, RDW-SD; mediana y rango intercuartílico para las variables linfocito, RN/L, fibrinógeno, PCR, dímero D, DHL, hematocrito, monocitos, eosinófilos. Resultados: No se observaron diferencias en esta población en cuanto a muerte y sexo (OR: 1,31; IC 95% 0,92 a 1,87), sin embargo, se observó que, por cada aumento de un año, la probabilidad de muerte aumentaba un 4% (RP: 1,04). , IC del 95%: 1,03 a 1,05). El análisis de RIR (Razón de incidencia de riesgos) para las variables numéricas mostró resultados fuertemente asociados con valores hematológicos como Leucocitos (escala de 2500 unidades) (RRI: 1.08, 95% CI 1.03 a 1.13), neutrófilos (escala de 2500 unidades) (RRI: 1.08; IC 95% 1.03 a 1.13), por el contrario, se observa que al aumento de 1000 unidades en linfocitos, la probabilidad de morir disminuyó en un 48% (TIR: 0.52; IC 95% 0.38 a 071). Conclusiones: Parámetros tales como los leucocitos, los neutrófilos y el dímero D fueron estadísticamente mucho más altos en los pacientes que fallecieron

Prevalencia serológica de anticuerpos al SARS-CoV-2 en una prisión de la amazonia del Perú

Objectives: The objective of this research was to describe the prevalence of antibodies to COVID19 in a prison in Ucayali, Peru. Methods: 325 inmates were selected from the Penitentiary Centerin Pucallpa, Peru through simple random sampling. On 06/25/20 and 07/24/20, the fingerpuncture samples were taken from the inmates for COVID-19, the blood sample was obtainedfor the chemo-luminescent microparticle immunoassay tests. Descriptive statistics were usedfor data analysis with InfoStat software. Results: Of the 325 inmates evaluated, 80 were women(25%) and 245 men (75%), the mean age was 43 years (SD 12.44). Regarding the serologicalresults, 137 (42%) were found with positive IgG and 188 (58%) negative IgG. Regarding positiveIgM 145 (45%) and negative IgM 180 (55%). Regarding the distribution of positive cases by sex,we have 47 women and 141 men with a positive result for IgM or IgG. Conclusion: It is concludedthat there is a high number of inmates who have antibodies against COVID-19.Objetivos: El objetivo de esta investigación fue el de describir la prevalencia de anticuerpos para COVID-19 en una cárcel de Ucayali, Perú. Métodos: Se seleccionaron 325 reclusos del Centro penitenciario en Pucallpa, Perú mediante un muestreo aleatorio simple. Del 25/06/20 y el 24/07/20 se tomaron las muestras punción dactilar de los reclusos para COVID-19, se obtuvo la muestra de sangre para las pruebas de inmunoensayo de micropartículas quimio luminiscentes. Se utilizó estadística descriptiva para en análisis de los datos con el software InfoStat. Resultados: De los 325 reclusos evaluados 80 eran mujeres (25%) y 245 varones (75%), la media de la edad fue de 43 años (DE 12,44). En cuantos a los resultados serológicos se encontraron a con IgG positivo a 137 (42%) e IgG negativo 188 (58%). En cuanto a IgM positivo 145 (45%) e IgM negativo 180 (55%). En cuanto a la distribución de casos positivos por sexo contamos con 47 mujeres y 141 varones con resultado positivo para IgM o IgG. Conclusión: Se concluye con que existe un elevado número de reclusos que tienen anticuerpos contra la COVID-19