Caractérisation de RoBP1 et étude fonctionnelle des ribonucléoprotéines Ro contenant l'ARN hY5

Les Ribonucléoprotéines Ro (RNP Ro) sont la cible d'autoanticorps présents dans le sérum de patients atteints de maladies du tissu conjonctif comme le syndrome de Sjögren et le lupus érythémateux disséminé. Cependant, la fonction des RNP Ro demeure encore obscure. Deux protéines lient les ARN hY (hY1, 3, 4 et 5), soit la protéine Ro60 (60 kDa) et la protéine La de 48 kDa. En utilisant une modification du système triple hybride (RITA) en levure où une recombinante de la protéine Ro60 liée à l'ARN hY5 sert d'appât, une nouvelle protéine se liant au complexe a été identifiée (Bouffard et al ., 2000). Elle fut nommée Ro RNP binding protein 1 (RoBP1). Dans le but de caractériser ce nouveau partenaire, des études de localisation en cellules eucaryotes ont été réalisées. Des études d'épissage in vitro ont été réalisées dans le but de vérifier un rôle possible des RNP Ro au niveau de cette fonction cellulaire. Finalement, les études de localisation ont démontré qu'une surexpression de RoBP1 ralentit la croissance cellulaire."--Résumé abrégé par UM

Impacts de la réforme du réseau québécois de la santé et des services sociaux (2003) sur la représentation qu’ont les gestionnaires de leur travail

Cette thèse porte sur le travail des gestionnaires d’établissements de santé et de services sociaux québécois suite à la réforme de ce secteur mise en œuvre à partir de 2003 par le ministre de l’époque, Philippe Couillard. Le projet de réingénierie de l’État dans lequel s’inscrit cette réforme se fonde sur une certaine représentation des organisations publiques découlant du Nouveau Management Public (NMP). Concrètement la réforme a profondément modifié le contexte dans lequel œuvre le personnel d’encadrement des établissements de ce secteur. En effet, celle-ci a entraîné une modification majeure des structures des établissements composant le système de santé et de services sociaux québécois, des règles encadrant les relations du travail dans ces établissements, des conditions d’exercice du travail du personnel d’encadrement, ainsi que des responsabilités qui leur sont dévolues. Dans ce contexte, l’objectif de cette recherche était de saisir les impacts de cette réforme sur la nature du travail des gestionnaires œuvrant dans les centres de santé et de services sociaux (CSSS). Privilégiant une approche microsociologique et adoptant une posture épistémologique compréhensive, nous nous sommes intéressés aux représentations qu’ont les gestionnaires de leur travail. C’est donc dire que nous avons cherché à comprendre comment les gestionnaires définissent leur travail en terme du rôle qu’ils jouent dans l’organisation. Sur le plan méthodologique, nous avons fait le choix de procéder à une étude de cas multiples. Nous avons sélectionné deux CSSS et y avons réalisé quarante-neuf entrevues semi-dirigées auprès de gestionnaires provenant de tous les secteurs et de tous les niveaux hiérarchiques. De manière à accéder aux représentations qu’ont les gestionnaires de leur travail, deux idéaux types représentant deux conceptions opposées du travail de gestion ont été créés. Ces idéaux types nous ont permis de constater que nous assistons actuellement à une homogénéisation de la représentation qu’ont les gestionnaires de leur travail. Ainsi, suite à la réforme Couillard, les gestionnaires d’établissements de santé et de services sociaux sont de plus en plus nombreux à adhérer à une représentation managériale de leur rôle. Surtout, cette thèse montre comment se réalise cette évolution. Il appert que la structure des CSSS entraîne des conditions d’exercice qui favorisent une certaine représentation du travail de gestion et font obstacle à une autre. Qui plus est, cette nouvelle structure et les conditions d’exercice qui en découlent ont bousculé les rapports de pouvoir au sein même de la catégorie des gestionnaires. Ce faisant, certains sous-groupes voient leur représentation valorisée et sont en mesure d’imposer celle-ci à leurs collègues. Si certains gestionnaires émettent des doutes quant à ces changements, il appert que très peu d’entre eux ont les moyens d’y résister.This thesis focuses on the work of Quebec health and social services centre (CSSS) managers following the implementation of this sector’s reform in 2003, by the Minister at that time, Philippe Couillard. The re-engineering of the state in which this reform occurred was based on a certain representation of public organizations inspired by the New Public Management (NPM). In concrete terms, the reform has profoundly changed the context in which manager’s work in these organisations. In this context, the objective of this research was to understand the impact of this reform on the nature of the work being performed by health and social services centre (CSSS) managers. Using a micro-sociological approach and by adopting a comprehensive epistemological position, we were interested in examining how managers define their work in terms of the role they play within the organization. Moreover, we attempted to understand whether we are witnessing a change or a consolidation in their work representation following the reform. Methodologically, we chose to conduct a multiple case study. We selected two CSSS’s and we conducted forty-nine semi-structured interviews with managers from these CSSS. In order to identify the representation managers have of their work two ideal types representing two opposing work representation were created. These ideal types have allowed us to determine that we are witnessing a homogenization of managers’ representation of their work. In addition, following the Couillard reform, health and social services centre (CSSS) managers are more likely to adhere to a managerial representation of their role. Above all, this thesis shows how this change takes place. It appears that the CSSS structure leads to working conditions that promote management work representation to some degree and impede others. Moreover, this new structure and the working conditions that accompany it have pushed the balance of power among managers. In doing so, certain sub-groups see their representations valued, and are able to impose them on their colleagues. If some managers are skeptical about these changes, it appears that very few of them have the means to resist

Effet de la stimulation du TLR2 et de la sécrétion d'acétate sur la susceptibilité à l'infection au VIH-1 des lymphocytes T CD4+ primaires

Le virus de l'immunodéficience humaine de type 1 (VIH-1), agent causal du syndrome d'immunodéficience humaine (SIDA), est rapidement devenu pandémique suite à son identification en 1981. Les données statistiques publiées par l'Organisation des Nations Unies pour le Syndrome d'Immunodéficience Acquise (ONUSIDA) démontrent que, parmi les 34,3 à 41,4 millions de cas d'infection recensés en 2014, près de 70 % d'entre eux ont été répertoriés en Afrique subsaharienne et environ 6,5 % en Europe et en Amérique du Nord. L'Agence de la santé publique du Canada estimait, quant à elle, à près de 75 500 le nombre de personnes vivant avec le VIH-1 sur son territoire en 2014, dont environ 18 000 résidant au Québec. Malgré l'avènement de trithérapies contrôlant l'infection, à ce jour, aucune médicamentation n'en permet la guérison. La complexité de la pathogenèse virale menant à l'établissement d'une infection latente et à des comorbidités associées à l'état d'inflammation chronique est si considérable qu'aucun traitement ne peut encore enrayer la maladie. La recherche fondamentale et translationnelle, permettant de mieux comprendre le fonctionnement du système immunitaire en réponse à l'infection et d'associer plus efficacement ces avancées faites en laboratoire à la pratique médicale, sont donc primordiales. Les résultats présentés dans cette thèse abondent dans ce sens, puisqu'ils mènent à une meilleure compréhension du rôle que peut avoir le microbiote sur la susceptibilité à l'infection au VIH-1 des lymphocytes T CD4+ primaires, ce qui pourrait inspirer l'élaboration de composés médicamenteux limitant le dialogue entre les bactéries et les cellules permissives au virus. En effet, l'infection au VIH-1 peut être associée à un désordre du tractus gastro-intestinal menant à une translocation de bactéries de la lumière intestinale vers les muqueuses avoisinantes. Cette migration bactérienne semble influencer la susceptibilité à l'infection des lymphocytes T CD4+, mais encore aujourd'hui, tous les mécanismes ne sont pas parfaitement connus. Les deux études présentées dans ce manuscrit contribuent donc à l'avancement des connaissances dans le domaine puisqu'elles démontrent que 1) l'engagement du TLR2 semble entraîner la production de virus par les lymphocytes T CD4+ activés en favorisant l'activité de NF-B et la réplication virale chez les cellules CCR6+ et que 2) la sécrétion d'acétate (petit acide gras produit par la fermentation de composés non digestibles par les bactéries du tractus gastro-intestinal) semble promouvoir l'activation cellulaire et la diminution de l'activité des HDAC de classe 1 et 2 de sorte à accentuer l'intégration de l'ADN proviral dans le génome des lymphocytes T CD4+

Évaluation du programme de D.E.S.S. en administration scolaire par l'Université de Montréal en partenariat avec la Commission scolaire de Montréal

Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal

Modélisation par éléments finis de la micro-indentation du tube pollinique : rôles de paramètres géométriques

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal

Positions des cols bleus à l’endroit de la politique québécoise d’équité en emploi

Peu interventionniste jusqu’aux années 80, la politique québécoise d’équité en emploi a acquis un volet interventionniste et proactif pendant les années 80. Ce volet consiste essentiellement en un dispositif permettant d’établir des objectifs quantitatifs de représentation de membres des quatre groupes cibles reconnus par la charte québécoise et son pendant canadien, la Loi canadienne sur les droits de la personne (LCDP). Pour atteindre ces objectifs cibles, l’employeur peut embaucher de préférence des membres des groupes cibles, « à compétence égale ». Bien que peu d’employeurs y soient contraints, l’intervention de l’État à ce chapitre a engendré controverse et résistance. Les régimes fondés sur de telles mesures ont entraîné des progrès certains pour les femmes, sauf dans les secteurs d’emploi de cols bleus, où leur représentation plafonne. Nous avons sondé au moyen d’entrevues en profondeur les positions de 47 cols bleus quant à l’égalité et quant à ces mesures, dites de redressement. Bien que favorables à l’égalité en emploi entre les sexes en général, les personnes interrogées témoignent d’une adhésion partagée à cette intervention. Cela laisse pendant le problème important de l’emploi des femmes qui ont un niveau de scolarité présecondaire ou secondaire. Les emplois traditionnellement féminins auxquels elles ont accès sont considérablement moins rémunérés et ont de beaucoup moins bonnes conditions de travail que les emplois traditionnellement masculins du même groupe. Pour les travailleurs de ce niveau de scolarité, l’écart entre les emplois féminins et masculins est énorme

In-depth sequencing of the siRNAs associated with peach latent mosaic viroid infection

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>It has been observed that following viroid infection, there is an accumulation of viroid-derived siRNAs in infected plants. Some experimental results suggest that these small RNAs may be produced by the plant defense system to protect it from infection, indicating that viroids can elicit the RNA-silencing pathways. The objective of this study is to identify in the peach latent mosaic viroid (PLMVd), a model RNA genome, the regions that are most susceptible to RNA interference machinery.</p> <p>Results</p> <p>The RNA isolated from an infected tree have been used to sequence in parallel viroid species and small non-coding RNA species. Specifically, PLMVd RNAs were amplified, cloned and sequenced according to a conventional approach, while small non-coding RNAs were determined by high-throughput sequencing. The first led to the typing of 18 novel PLMVd variants. The second provided a library of small RNAs including 880 000 sequences corresponding to PLMVd-derived siRNAs, which makes up 11.2% of the sequences of the infected library. These siRNAs contain mainly 21-22 nucleotide RNAs and are equivalently distributed between the plus and the minus polarities of the viroid. They cover the complete viroid genome, although the amount varies depending on the regions. These regions do not necessarily correlate with the double-stranded requirement to be a substrate for Dicer-like enzymes. We noted that some sequences encompass the hammerhead self-cleavage site, indicating that the circular conformers could be processed by the RNA-silencing machinery. Finally, a bias in the relative abundance of the nature of the 5' nucleotides was observed (A, U >> G, C).</p> <p>Conclusions</p> <p>The approach used provided us a quantitative representation of the PLMVd-derived siRNAs retrieved from infected peach trees. These siRNAs account for a relatively large proportion of the small non-coding RNAs. Surprisingly, the siRNAs from some regions of the PLMVd genome appear over-represented, although these regions are not necessarily forming sufficiently long double-stranded structures to satisfy Dicer-like criteria for substrate specificity. Importantly, this large library of siRNAs gave several hints as to the components of the involved silencing machinery.</p

Development of a highly optimized procedure for the discovery of RNA G-quadruplexes by combining several strategies

Abstract : RNA G-quadruplexes (rG4s) are non-canonical secondary structures that are formed by the selfassociation of guanine quartets and that are stabilized by monovalent cations (e.g. potassium). rG4s are key elements in several post-transcriptional regulation mechanisms, including both messenger RNA (mRNA) and microRNA processing, mRNA transport and translation, to name but a few examples. Over the past few years, multiple high-throughput approaches have been developed in order to identify rG4s, including bioinformatic prediction, in vitro assays and af nity capture experiments coupled to RNA sequencing. Each individual approach had its limits, and thus yielded only a fraction of the potential rG4 that are further con rmed (i.e., there is a signi cant level of false positive). This report aims to bene t from the strengths of several existing approaches to identify rG4s with a high potential of being folded in cells. Brie y, rG4s were pulled-down from cell lysates using the biotinylated biomimetic G4 ligand BioTASQ and the sequences thus isolated were then identi ed by RNA sequencing. Then, a novel bioinformatic pipeline that included DESeq2 to identify rG4 enriched transcripts, MACS2 to identify rG4 peaks, rG4-seq to increase rG4 formation probability and G4RNA Screener to detect putative rG4s was performed. This work ow uncovers new rG4 candidates whose rG4-folding was then con rmed in vitro using an array of established biophysical methods. Clearly, this work ow led to the identi cation of novel rG4s in a highly specic and reliable manner

Beyond the Pixel: a Photometrically Calibrated HDR Dataset for Luminance and Color Prediction

Light plays an important role in human well-being. However, most computer vision tasks treat pixels without considering their relationship to physical luminance. To address this shortcoming, we introduce the Laval Photometric Indoor HDR Dataset, the first large-scale photometrically calibrated dataset of high dynamic range 360{\deg} panoramas. Our key contribution is the calibration of an existing, uncalibrated HDR Dataset. We do so by accurately capturing RAW bracketed exposures simultaneously with a professional photometric measurement device (chroma meter) for multiple scenes across a variety of lighting conditions. Using the resulting measurements, we establish the calibration coefficients to be applied to the HDR images. The resulting dataset is a rich representation of indoor scenes which displays a wide range of illuminance and color, and varied types of light sources. We exploit the dataset to introduce three novel tasks, where: per-pixel luminance, per-pixel color and planar illuminance can be predicted from a single input image. Finally, we also capture another smaller photometric dataset with a commercial 360{\deg} camera, to experiment on generalization across cameras. We are optimistic that the release of our datasets and associated code will spark interest in physically accurate light estimation within the community. Dataset and code are available at https://lvsn.github.io/beyondthepixel/