Technological Responses of Neanderthals to Macroclimatic Variations (240,000–40,000 BP)

Using a database of 499 archaeological assemblages from 332 sites in Europe, we statistically test a model of the economic reactivity of the hunter-gatherer production system to climatic variations. This model predicts an increase in the diversity of lithic tools during harsh cold periods, in order to maintain carrying capacity, and a reduction during favorable climatic periods. Diversity was measured from the variations in flint tool distributions in traditional Bordes typological categories, using Shannon’s derived diversity index (D). Reactivity was measured in 190 archaeological assemblages from 103 sites of the Middle Paleolithic in Europe (mainly France). The Neanderthals show technological inertia in the development and use of lithic tools for 200,000 years, despite the four cool to cold macroclimatic periods they experienced

La paléodémographie. Archéologie et démographie : les données paléodémographiques et leur interprétation

Jean-Pierre Bocquet-Appel, directeur de recherche au CNRS Avec la question : « Faire de la démographie avec quoi et comment ? », deux grands thèmes ont été abordés cette année afin de mieux intégrer la démographie et l’archéologie. Les données démographiques écrites couvrent essentiellement les quelques derniers siècles. Depuis la sortie d’Afrique d’Homo ergaster – notre ancêtre humain direct – et son expansion géographique en Eurasie il y a environ 1,8 millions d’années, jusqu’aux périodes s..

Paléodémographie

Jean-Pierre Bocquet-Appel, directeur de recherche au CNRS Ce premier séminaire a été consacré à l’énoncé d’un programme paléodémographique, portant sur les données archéologiques, les techniques d’extraction de l’information démographique et l’esquisse d’une narration historique à l’échelle géographique mondiale. En commençant par la narration historique, pour des raisons pédagogiques, celle-ci a été centrée sur la colonisation globale de la planète, depuis la sortie d’Afrique d’Homo ergaster..

Pour une anthropologie générale

L’association de l’anthropologie biologique, de l’anthropologie sociale-ethnologie et de la préhistoire, sous la forme de pôles de recherche et d’enseignement conjoints ou d’instances d’évaluation partagées, a-t-elle toujours un sens en ce début de xxie siècle, compte tenu des nouveaux objets que tendent à construire les chercheurs se revendiquant de ces champs scientifiques ? Si la réponse demeure positive, autour de quels objectifs et projets communs peuvent-ils se réunir ? Si la réponse es..

Classification of Ancient Mammal Individuals Using Dental Pulp MALDI-TOF MS Peptide Profiling

International audienceBackground The classification of ancient animal corpses at the species level remains a challenging task for forensic scientists and anthropologists. Severe damage and mixed, tiny pieces originating from several skeletons may render morphological classification virtually impossible. Standard approaches are based on sequencing mitochondrial and nuclear targets. Methodology/Principal Findings We present a method that can accurately classify mammalian species using dental pulp and mass spectrometry peptide profiling. Our work was organized into three successive steps. First, after extracting proteins from the dental pulp collected from 37 modern individuals representing 13 mammalian species, trypsin-digested peptides were used for matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry analysis. The resulting peptide profiles accurately classified every individual at the species level in agreement with parallel cytochrome b gene sequencing gold standard. Second, using a 279-modern spectrum database, we blindly classified 33 of 37 teeth collected in 37 modern individuals (89.1%). Third, we classified 10 of 18 teeth (56%) collected in 15 ancient individuals representing five mammal species including human, from five burial sites dating back 8,500 years. Further comparison with an upgraded database comprising ancient specimen profiles yielded 100% classification in ancient teeth. Peptide sequencing yield 4 and 16 different non-keratin proteins including collagen (alpha-1 type I and alpha-2 type I) in human ancient and modern dental pulp, respectively. Conclusions/Significance Mass spectrometry peptide profiling of the dental pulp is a new approach that can be added to the arsenal of species classification tools for forensics and anthropology as a complementary method to DNA sequencing. The dental pulp is a new source for collagen and other proteins for the species classification of modern and ancient mammal individuals

The SIB Swiss Institute of Bioinformatics' resources: focus on curated databases

The SIB Swiss Institute of Bioinformatics (www.isb-sib.ch) provides world-class bioinformatics databases, software tools, services and training to the international life science community in academia and industry. These solutions allow life scientists to turn the exponentially growing amount of data into knowledge. Here, we provide an overview of SIB's resources and competence areas, with a strong focus on curated databases and SIB's most popular and widely used resources. In particular, SIB's Bioinformatics resource portal ExPASy features over 150 resources, including UniProtKB/Swiss-Prot, ENZYME, PROSITE, neXtProt, STRING, UniCarbKB, SugarBindDB, SwissRegulon, EPD, arrayMap, Bgee, SWISS-MODEL Repository, OMA, OrthoDB and other databases, which are briefly described in this article

La transition démographique agricole au Néolithique

L’émergence de l’agriculture coïncide dans les séquences archéologiques mondiales avec une augmentation considérable des vestiges, augmentation qui est depuis longtemps interprétée comme l’indication d’une croissance démographique [Banning 1998 ; Kuijt 2000]. Une première grande question soulevée par la « révolution néolithique » est la suivante : comment expliquer cette croissance démographique ? A-t-elle été graduelle ou bien rapide ? A-t-elle été la même dans les centres d’invention de l’a..

Commentary on Sokal\u27s Ancient Movement Patterns Determine Modern Genetic Variances in Europe (1991)

In this article, Bob Sokal innovates on two points. First, instead of focusing on allele frequencies, understood only as sampled values of the continuum at different localities, he turned to local variations in these frequencies, as estimated in each square of a grid. Second, he created an ethnohistorical database used to quantify the multitude of population movements in localities on the map