Préservation des données de recherche: proposer des services de soutien aux chercheurs du site Uni Arve de l’Université de Genève

Ce travail porte sur les pratiques des chercheurs du site Uni Arve (faculté des sciences) de l’université de Genève concernant la préservation et la réutilisation des données de recherche, et son objectif est d’évaluer les besoins des chercheurs afin de leur proposer des services de soutien appropriés. La préservation des données de recherche s’inscrit dans le mouvement de l’Open Data dont l’objectif est de rendre les données de recherche publiquement accessibles, intelligibles et réutilisables, en particulier lorsque ces données ont été produites grâce à des recherches financées par des fonds publics. Pour ce faire, le FNS demande aux chercheurs de déposer leurs données dans des archives publiques répondant aux principes FAIR. Or, depuis juin 2019, l’université de Genève met à disposition de ses chercheurs une archive institutionnelle, Yareta, répondant aux critères du FNS. Afin de répondre aux mieux aux besoins des chercheurs, une approche en deux temps a été adoptée : (1) une analyse des jeux de données déposés sur Yareta a permis d’identifier les problématiques faisant obstacle à la réutilisation des données. (2) Puis, des entretiens menés avec des chercheurs ont permis d’analyser leurs pratiques de préservation et leurs besoins. Les informations récoltées par ces deux approches ont permis de faire les propositions suivantes: un guide d’archivage portant sur quatre activités permettant de garantir une bonne préservation : format, contexte, métadonnées, licence, la mise en place de ressources additionnelles (page web ou formation) couvrant des notions peu comprises par les chercheurs, la modification de pages web existantes pour des raisons de cohérence, l’ajout d’information dans l’outil Yareta. Ces propositions sont des solutions concrètes, basées sur les ressources existantes de l’université de Genève afin de pouvoir être complémentaires aux services de soutien et aux ressources déjà proposés par l’université de Genève. De plus, ces propositions pourront bénéficier à toute la communauté de l’université de Genève et pas uniquement aux chercheurs du site Uni Arve

Formation en gestion des données de recherche ::propositions de dispositifs d’e-learning pour le projet DLCM

Le projet DLCM financé par Swissuniversities a pour objectif de fournir un soutien et des ressources adaptées à chaque étape du cycle de vie des données, et de permettre aux chercheu-r-se-s académiques suisses d’implémenter une gestion des données de la recherche (GDR). La seconde phase du projet (2019-2020) se concentre sur la définition des approches et la mise en place d’outils et de services pour la GDR les mieux adaptés aux besoins de l’environnement académique suisse. Cet article fournit des recommandations et des propositions d’options pour la conception d’un dispositif de formation e-learning en GDR qui rentre dans le cadre de cette seconde phase du projet DLCM. Il reprend certains résultats du mémoire d’un projet de recherche d’étudiantes du Master of Science HES-SO en Sciences de l’information.The Swissuniversities-funded DLCM project aims at providing support and resources for every step of the data lifecycle and allowing Swiss academic researchers to implement Research Data Management (RDM) practices. The second phase of the project (2018-2020) focuses on specifying strategies and setting up tools and services in RDM most suited to the needs of the Swiss academic environment. This paper makes recommendations and suggestions for the design of an e-learning training in RDM in the frame of the second phase of the DLCM project. It is based on a research project by students of the Master of Science HES-SO in Information Science, and as such, uses some results already presented in the research project report

Formation et éducation en gestion des données de recherche du point de vue du projet DLCM: dispositifs d’e-learning

Le projet DLCM* financé par Swissuniversities a pour objectif de fournir les ressources adaptées à chaque étape du cycle de vie des données et permettant aux chercheuses académiques suisses d’implémenter une gestion des données de la recherche (GDR*). La seconde phase du projet (2019-2020) se concentre sur la définition des approches et la mise en place d’outils et services pour la GDR les mieux adaptés aux besoins de l’environnement académique suisse. Le but de notre projet de recherche est de fournir des recommandations et des propositions d’options pour la conception d’un dispositif e-learning en GDR dans le cadre de cette seconde phase. Après notre revue de la littérature sur les services et les formations* à la GDR, le projet DLCM et l’e-learning*, nous présentons notre inventaire des formations et ressources e-learning en GDR des partenaires DLCM. Il met en évidence la forte part des formations en présentiel ainsi que le faible lien avec les activités de DLCM. Grâce à notre deuxième inventaire à l’international, nous identifions les ressources éventuellement réutilisables pour le dispositif e-learning de DLCM. Ces deux outils nous permettent de dresser un panorama global des activités dans ce domaine, et la typologie des ressources disponibles. A partir de nos études de cas (le suivi de cinq formations e-learning sur la GDR et d’autres sujets variés), nous formulons des recommandations pour le dispositif e-learning de DLCM concernant le contenu de la formation, le parcours de formation, l’environnement d’apprentissage, l’accompagnement* des apprenantes* et les possibilités d’interaction. Nous détaillons ensuite les étapes de projet nécessaires à la réalisation d’une formation e-learning (analyser les besoins pour le projet, concevoir le dispositif, tester le pilote, produire la formation, en faire le suivi) et adaptées au contexte. Nous présentons les choix possibles pour différents aspects des dispositifs e-learning (modalités). Pour chaque modalité, nous émettons des recommandations pour le contexte DCLM. Nous identifions les risques pour le projet et les actions de mitigation de ces risques. A partir de tous ces éléments, après avoir identifié trois profils-types du public cible pour la formation, nous proposons et décrivons trois dispositifs particuliers : SPOC*, MOOC*, formation libre ; nous mettons en évidence, en particulier pour la formation libre, les avantages possibles pour DLCM et ses partenaires

Ongoing prothrombotic state in the portal circulation of cirrhotic patients

Portal thrombosis may complicate the clinical course of cirrhosis, but the pathophysiologic mechanism is unclear. Aim of the study was to evaluate the behavior of clotting system and endotoxemia in portal vein and in peripheral circulation of 11 cirrhotic patients undergoing transjugular port-systemic shunt (TIPS). Portal blood showed higher values of F1+2 [Median (range): 2.5 (1.1-5.3) vs. 1.1 (0.6-2.1) nM, p 1.2 nM (upper limit of control values), all but one had D-dimer > 216 mg/dl (mean + 2 SD of controls) and 100% had values of endotoxemia > 9.6 pg/ml (upper limit of control values). Fibrinogen was lower in the portal circulation compared to peripheral circulation but the difference was not significant [85 (58-195) vs. 134 (75-244) mg/dl, p > 0.05]. Endotoxemia was directly correlated with F1+2 (Rho = 0.92 p < 0.006) and D-dimer (Rho = 0.93, p < 0.005). This study shows that an ongoing prothrombotic state is present in the portal circulation of cirrhotic patients and may play a pivotal role in the thrombotic episodes occurring in this clinical setting

Pharmacological prophylaxis of hepatic encephalopathy after transjugular intrahepatic portosystemic shunt: a randomized controlled study

BACKGROUND/AIMS: Hepatic encephalopathy is a frequent event after transjugular-intrahepatic-portosystemic-shunt (TIPS), especially during the first months. Aim of this study was to compare two different treatments (lactitol 60 g/day, rifaximin 1200 mg/day) with no-treatment in the prevention of post-TIPS hepatic encephalopathy. METHODS: Seventy-five consecutive cirrhotics submitted to TIPS were randomized to receive either one of the above treatments or no-treatment. The main end-point was the occurrence of an episode of overt hepatic encephalopathy during the first month post-TIPS. Before the procedure and weekly thereafter the patients were evaluated by examining their mental status, asterixis, ammonia and trail-making-test Part-A (TMT-A). RESULTS: The three groups were comparable for age, sex, etiology, Child-Pugh-score, post-TIPS porto-systemic gradient, previous hepatic encephalopathy, basal values of ammonia and psychometric performance. Twenty-five patients developed hepatic encephalopathy (33%, CI 95%=22-45%). One-month incidence was similar in the three groups (P=0.97). Previous hepatic encephalopathy (Relative Hazard=3.79;1.27-11.31) and basal-TMT-A Z-score>1.5 (RH=3.55;1.24-10.2) were predictors of post-TIPS encephalopathy at multivariate analysis. A <5 mmHg porto-systemic gradient was also significantly related to the occurrence of encephalopathy. CONCLUSIONS: Our data show that treatment with lactitol or rifaximin is not effective in the prophylaxis of hepatic encephalopathy during the first month after a TIPS

Transjugular intrahepatic portosystemic shunt (tips) versus endoscopic sclerotherapy for the prevention of variceal bleeding in cirrhosis. A randomized multicenter trial.

Abstract: Transjugular intrahepatic portosystemic shunt (TIPS), a new technique for the treatment of portal hypertension, has been successful in preliminary studies to treat acute variceal hemorrhage and to prevent variceal rebleeding. The purpose of this multicenter, randomized controlled trial is to compare the efficacy of TIPS with that of endoscopic sclerotherapy in the prevention of variceal rebleeding in cirrhosis. Eighty-one cirrhotic patients, with endoscopically proven variceal bleeding, were randomized to either TIPS (38 patients) or endoscopic sclerotherapy (43 patients). Randomization was stratified according to the following: if bleeding occurred < 1 week (stratum I); if bleeding: occurred 1 to 6 weeks (stratum II); and if bleeding occurred 6 weeks to 6 months (stratum III) before enrollment. Follow-up included clinical, biochemical, Doppler Ultrasound, and endoscopic examinations every 6 months. During a mean follow-up of 17.7 months, 51% of the patients treated with sclerotherapy and 24% of those treated with TIPS rebled (P = .011). Mortality was 19% in sclerotherapy patients and 24% in TIPS patients (P = .50). Hepatic encephalopathy (HE) developed in 26% and 55%, respectively (P = .006). A separate analysis of the three strata showed that TIPS was significantly more effective than sclerotherapy (P = .026) in preventing rebleeding only in stratum I patients. TIPS is significantly better than sclerotherapy in preventing rebleeding only when it is performed shortly after a variceal bleed; however, TIPS does not improve survival and is associated with a significantly higher incidence of HE. The overall performance of TIPS does not seem to justify the adoption of this technique as a first-choice treatment to prevent rebleeding from esophageal varices in cirrhotic patients