Nonsense-Mediated mRNA Decay Modulates Immune Receptor Levels to Regulate Plant Antibacterial Defense

SummaryNonsense-mediated mRNA decay (NMD) is a conserved eukaryotic RNA surveillance mechanism that degrades aberrant mRNAs. NMD impairment in Arabidopsis is linked to constitutive immune response activation and enhanced antibacterial resistance, but the underlying mechanisms are unknown. Here we show that NMD contributes to innate immunity in Arabidopsis by controlling the turnover of numerous TIR domain-containing, nucleotide-binding, leucine-rich repeat (TNL) immune receptor-encoding mRNAs. Autoimmunity resulting from NMD impairment depends on TNL signaling pathway components and can be triggered through deregulation of a single TNL gene, RPS6. Bacterial infection of plants causes host-programmed inhibition of NMD, leading to stabilization of NMD-regulated TNL transcripts. Conversely, constitutive NMD activity prevents TNL stabilization and impairs plant defense, demonstrating that host-regulated NMD contributes to disease resistance. Thus, NMD shapes plant innate immunity by controlling the threshold for activation of TNL resistance pathways

Identification of Hyaloperonospora arabidopsidis Transcript Sequences Expressed during Infection Reveals Isolate-Specific Effectors

Biotrophic plant pathogens secrete effector proteins that are important for infection of the host. The aim of this study was to identify effectors of the downy mildew pathogen Hyaloperonospora arabidopsidis (Hpa) that are expressed during infection of its natural host Arabidopsis thaliana. Infection-related transcripts were identified from Expressed Sequence Tags (ESTs) derived from leaves of the susceptible Arabidopsis Ws eds1-1 mutant inoculated with the highly virulent Hpa isolate Waco9. Assembly of 6364 ESTs yielded 3729 unigenes, of which 2164 were Hpa-derived. From the translated Hpa unigenes, 198 predicted secreted proteins were identified. Of these, 75 were found to be Hpa-specific and six isolate Waco9-specific. Among 42 putative effectors identified there were three Elicitin-like proteins, 16 Cysteine-rich proteins and 18 host-translocated RXLR effectors. Sequencing of alleles in different Hpa isolates revealed that five RXLR genes show signatures of diversifying selection. Thus, EST analysis of Hpa-infected Arabidopsis is proving to be a powerful method for identifying pathogen effector candidates expressed during infection. Delivery of the Waco9-specific protein RXLR29 in planta revealed that this effector can suppress PAMP-triggered immunity and enhance disease susceptibility. We propose that differences in host colonization can be conditioned by isolate-specific effectors

Arabidopsis EDR1 Protein Kinase Regulates the Association of EDS1 and PAD4 to Inhibit Cell Death

ENHANCED DISEASE SUSCEPTIBILITY1 (EDS1) and PHYTOALEXIN DEFICIENT4 (PAD4) are sequence-related lipase-like proteins that function as a complex to regulate defense responses in Arabidopsis by both salicylic acid–dependent and independent pathways. Here, we describe a gain-of-function mutation in PAD4 (S135F) that enhances resistance and cell death in response to infection by the powdery mildew pathogen Golovinomyces cichoracearum. The mutant PAD4 protein accumulates to wild-type levels in Arabidopsis cells, thus these phenotypes are unlikely to be due to PAD4 over accumulation. The phenotypes are similar to loss-of-function mutations in the protein kinase EDR1 (Enhanced Disease Resistance1), and previous work has shown that loss of PAD4 or EDS1 suppresses edr1-mediated phenotypes, placing these proteins downstream of EDR1. Here, we show that EDR1 directly associates with EDS1 and PAD4 and inhibits their interaction in yeast and plant cells. We propose a model whereby EDR1 negatively regulates defense responses by interfering with the heteromeric association of EDS1 and PAD4. Our data indicate that the S135F mutation likely alters an EDS1-independent function of PAD4, potentially shedding light on a yet-unknown PAD4 signaling function

An EDS1 heterodimer signalling surface enforces timely reprogramming of immunity genes in Arabidopsis

CC and TIR-domain type NLR receptors trigger plant immunity in response to pathogen effectors. Here, Bhandari et al. show that the EP-domain surface of EDS1 heterodimers signals downstream of both receptor types and ensures a rapid transcriptional response in TIR-NLR immunity to bacteria

What determines a decision about Facility Management? : A survey of factors that affect companies’ decision regarding outsourcing of Facility Management

Bakgrund: Denna uppsats är skriven på uppdrag från Coor AB. Uppdragsgivaren är intresserad av att veta varför vissa företag väljer att outsourca medan andra väljer att bedriva Facility Management-enheten i egen regi. Outsourcad Facility Management ökar i Sverige, men vad är det egentligen som skiljer företag som väljer att outsourca från de företag som inte gör det? Syfte: Syftet med studien är att via intervjuer identifiera och utifrån vald teori analysera vilka strategiska faktorer som påverkar företagens beslut kring outsourcing av Facility Management-funktionen. Genomförande: Denna studie är intervjubaserad och omfattar sju intervjuer med operativa chefer från olika företag som antingen outsourcar eller bedriver Facility Management-tjänsterna i egen regi. Resultat: Studiens resultat påvisar att det är strategiskt klokt att köpa en tjänst av en extern leverantör om en extern leverantör utför tjänsten bättre och billigare än företaget själva, vilket indikerar att ekonomi är en strategisk faktor som påverkar ett outsourcingbeslut. Det visade sig även att det är hur föränderliga företagets produkter är, var företaget befinner sig i förädlingskedjan och hur stor del av förädlingskedjan som företaget verkar inom som avgör vilka strategiska faktorer som spelar in. Även konkurrensen på marknaden och rådande konjunkturen är strategiska faktorer som påverkar ett outsourcingbeslut. De kostnader som uppstår med outsourcing är olika typer av transaktionskostnader och dessa kostnader varierar från företag till företag. Andra förhållanden som påverkar ett outsourcingbeslut är möjlighet att bevara kunskap inom företaget, att kunna samla allt på ett ställe, att kunna bibehålla servicenivån och närhet samt viljan att värna om lokal förankring