Genetic diversity of citrus rootstocks based on RAPD marker analysis

This research intended to characterize the genetic diversity of citrus rootstocks from the Experimental Agronomic Station of the Rio Grande do Sul Federal University (EEA/UFRGS) and rootstocks collected in nurseries of the Cai River Valley - Rio Grande do Sul - Brazil. The method used was the Random Amplification of Polymorphic DNA (RAPD) markers. Leaves of nine citrus rootstocks from EEA/UFRGS and ten accesses of trifoliate orange (Poncirus trifoliata) from different nurseries were collected. With the use of nine random primers it was possible to separate the rootstocks in two main groups: one formed by Rangpur lime (Citrus limonia) and the other by trifoliate orange and its hybrids of low genetic similarity. RAPD molecular marker was very efficient for the citrus rootstock characterization and for the trifoliate orange separation from its hybrids. The technique might be used to characterize cultivars, analysis of genetic variability among progenitors in improvement breeding programs of rootstock , and identify zygotic seedlings of trifoliate orange in commercial nurseries.Este trabalho teve como objetivo caracterizar a diversidade genética, através do marcador molecular RAPD, dos porta-enxertos da Coleção de Citros da Estação Experimental Agronômica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul (EEA/UFRGS) e acessos de porta-enxertos cítricos coletados em viveiristas da Região do Vale do Rio Caí do estado do Rio Grande do Sul. Para tanto, coletaram-se folhas de nove porta-enxertos cítricos da EEA/UFRGS e de dez acessos de trifoliata (Poncirus trifoliata) de viveiristas. Com o uso de nove seqüências inicializadoras, foi possível separar os porta-enxertos cítricos em dois grupos principais, um formado pelo limoeiro Cravo e outro pelo trifoliata e seus híbridos, apresentando alta dissimilaridade genética entre os grupos. Marcadores moleculares RAPD foram eficientes para caracterizar variedades de porta-enxertos de citros e para separar o porta-enxerto P. trifoliata de seus híbridos podendo serem utilizados para caracterização de plantas matrizes, análise de variabilidade genética entre genitores em programas de melhoramento genético de porta-enxertos e para identificar a origem sexual ou nucelar de mudas de trifoliata em viveiros comerciais.1437144

Identification of zygotic trifoliate orange seedlings with RAPD molecular markers

O objetivo deste trabalho foi identificar a freqüência de germinação dos embriões zigóticos de sementes de trifoliata [Poncirus trifoliata (L.) Raf.] oriundas de polinização aberta, com o uso de marcador molecular RAPD. Folhas e sementes de trifoliata foram coletadas de cinco viveiros comerciais e de uma coleção experimental de citros. Essas sementes foram colocadas para germinar em tubetes e casa de vegetação, totalizando uma amostra final de 62 plântulas. Foram utilizadas nove seqüências inicializadoras e os resultados foram analisados a partir da comparação dos padrões das bandas geradas pelas plantas germinadas com os da planta matriz. Identificaram-se 3,23% de plântulas oriundas da germinação do embrião zigótico, valor que é aceitável na propagação por sementes deste porta-enxerto cítrico.This work aimed to determine germination frequency of zygotic embryos of seeds originated from open pollinated trifoliate orange [Poncirus trifoliata (L.) Raf.], using RAPD molecular markers. Leaves and seeds of P. trifoliata were collected from five commercial nurseries and from a citrus germplasm collection. The seeds were placed to germinate in plastic tubes in a greenhouse, reaching a final sample of 62 seedlings. Nine primers were used and the band patterns generated from seedlings leaves were compared to progenitor-plant-leaf hands. It was possible to identify 3.23% of seedlings originated from zygotic embryos which is acceptable in propagation by seeds in this rootstock

Identification of zygotic trifoliate orange seedlings with RAPD molecular markers

This work aimed to determine germination frequency of zygotic embryos of seeds originated from open pollinated trifoliate orange [Poncirus trifoliata (L.) Raf.], using RAPD molecular markers. Leaves and seeds of P. trifoliata were collected from five commercial nurseries and from a citrus germplasm collection. The seeds were placed to germinate in plastic tubes in a greenhouse, reaching a final sample of 62 seedlings. Nine primers were used and the band patterns generated from seedlings leaves were compared to progenitor-plant-leaf hands. It was possible to identify 3.23% of seedlings originated from zygotic embryos which is acceptable in propagation by seeds in this rootstock.O objetivo deste trabalho foi identificar a freqüência de germinação dos embriões zigóticos de sementes de trifoliata [Poncirus trifoliata (L.) Raf.] oriundas de polinização aberta, com o uso de marcador molecular RAPD. Folhas e sementes de trifoliata foram coletadas de cinco viveiros comerciais e de uma coleção experimental de citros. Essas sementes foram colocadas para germinar em tubetes e casa de vegetação, totalizando uma amostra final de 62 plântulas. Foram utilizadas nove seqüências inicializadoras e os resultados foram analisados a partir da comparação dos padrões das bandas geradas pelas plantas germinadas com os da planta matriz. Identificaram-se 3,23% de plântulas oriundas da germinação do embrião zigótico, valor que é aceitável na propagação por sementes deste porta-enxerto cítrico.167172Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES

Diversidade genética entre híbridos de laranja-doce e tangor 'Murcott' avaliada por fAFLP e RAPD

The objective of this work was to evaluate the genetic diversity in a population of 148 hybrids of 'Murcott' tangor (Citrus reticulata Blanco x C. sinensis L. Osbeck) and 'Pêra' sweet orange (C. sinensis L. Osbeck), obtained by controlled polination, using fAFLP and RAPD markers. Polymorphic markers (416 fAFLP and 33 RAPD markers) were used to evaluate genetic similarity among the hybrids, calculated by the coefficient of Jaccard, using the UPGMA method. The consistency of each group was determined by software BOOD. There was high genetic similarity within the parents. 'Pêra' sweet orange had a higher number of loci in heterozygosis (132) compared to 'Murcott' tangor (105), supporting the theory of hybrid origin for sweet oranges. Two distinct groups of plants were observed: one group had 80% of the hybrids that displayed higher genetic similarity with 'Pêra' sweet orange. The bootstrap analysis did not show consistence between the groups. The fAFLP markers are more efficient to obtain polymorphism than RAPDs and are more suitable to select hybrids closer to the parents.O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética em uma população de 148 híbridos de tangor 'Murcott' (Citrus reticulata Blanco x C. sinensis L. Osbeck) e laranja 'Pêra' (C. sinensis L. Osbeck) obtidos por polinização controlada, pelo uso de marcadores fAFLP e RAPD. Marcadores polimórficos (416 marcadores fAFLP e 33 RAPD) foram utilizados para avaliar a similaridade genética entre os híbridos, calculada com o coeficiente Jaccard pelo método UPGMA. A consistência de cada agrupamento foi determinada pelo programa BOOD. Houve alta similaridade genética entre os parentais. A laranja 'Pêra' apresentou maior número (132) de loci em heterozigose em relação ao tangor 'Murcott' (105), corroborando a teoria de origem híbrida para a laranja-doce. Observaram-se dois grupos distintos de plantas, e um deles abrangeu 80% dos híbridos com maior similaridade com a laranja 'Pêra'. A análise bootstrap não revelou consistência estatística entre esses grupos. Marcadores fAFLP são mais eficientes na avaliação do polimorfismo, sendo indicados para seleção de indivíduos híbridos mais próximos a um dos parentais

Differential response of citrus species and hybrids to leprosis

O objetivo deste trabalho foi buscar novas fontes de resistência à leprose-dos-citros, no Banco Ativo de Germoplasma do Centro APTA Citros Sylvio Moreira, Instituto Agronômico, em Cordeirópolis, SP. Foram utilizadas plantas obtidas por sementes de 26 acessos, infectadas com o vírus da leprose-dos-citros (Citrus leprosis virus – CiLV), por meio do seu vetor Brevipalpus phoenicis. O aparecimento de lesões, a partir de 21 dias após a inoculação, foi observado em 11 dos genótipos testados (42,3%). Quinze espécies, entre elas Citrus pennivesiculata e C. celebica, comportaram-se como altamente resistentes, enquanto outras, como C. keraji, foram mais suscetíveis que o padrão C. sinensis. Os dados mostraram grande variação de respostas de Citrus spp. à leprose, com elevado número de espécies resistentes, que podem ser utilizadas como fonte de resistência à doença em programas de melhoramento.The objective of this work was to prospect for new sources of resistance to leprosis in the Citrus Germplasm Bank of Centro APTA Citros Sylvio Moreira, Instituto Agronômico, in Cordeirópolis, SP, Brazil. Plants obtained through seeds from 26 citrus accessions were mite-infected with Citrus leprosis virus (CiLV). Typical lesions started to appear in 11 genotypes (42.3% of the tested accessions) 21 days after inoculation. Fifteen species, among them Citrus pennivesiculata and C. celebica, behaved as highly resistant, while other genotypes, as C. keraji, were more susceptible than the standard C. sinensis. The data showed a wide variation in the response of Citrus spp. to leprosis, with a large number of resistant species, wich can be used as source of resistance to this disease, in breeding programs

TESTE DE PATERNIDADE E AVALIAÇÕES AGRONÔMICAS DE POSSÍVEIS HÍBRIDOS DE TANGERINEIRA ‘SUNKI’

Citrus production is spread all over the world. In Brazil citrus represent the major volume of fruit production. The rootstock is extremely important to establish a good-quality orchard. At the Estação Experimental Agronômica of the Universidade Federal do Rio Grande do Sul was established placed a hybrid citrus plants orchard, originated from open-pollination with ‘Lee’ tangelo [Citrus clementina Hort. ex Tan. x (C. tangerina Hort. ex Tan. x C. paradisi Macf.)] as female parent. Amongst those hybrids, fourteen plants were selected with characteristics alike to those of the rootstock ‘Sunki’ tangerine (Citrus sunki Hort. ex. Tan.) In order to confirm hybrids paternity, single sequence repeat (SSR) markers were used. The molecular analysis allowed to identify eleven hybrids that did not have ‘Sunki’ tangerine as male parent. The hybrids 49, 77 and 92, potencialy hybrids of ‘Sunki’, stood out for higher poliembriony, higher number of emerged seedling per seed and higher number of seeds per fruit in comparison to ‘Sunki’.A produção de citros está espalhada em todos os continentes agricultáveis e no Brasil ela representa o maior volume de frutas produzidas. O porta-enxerto é extremamente importante no estabelecimento de um pomar de boa qualidade. Na Estação Experimental Agronômica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, está localizada uma população de híbridos cítricos, implantada em 1990 e oriunda de polinização aberta, sendo o genitor feminino o tangeleiro ‘Lee’ [Citrus clementina Hort. ex Tan. x (C. tangerina Hort. ex Tan. x C. paradisi Macf.)]. Dentre os híbridos deste pomar foram selecionadas quatorze plantas com características morfológicas semelhantes as do porta-enxerto tangerineira ‘Sunki’ (C. sunki Hort. ex. Tan.). Para confirmar a paternidade dos híbridos foram utilizados marcadores moleculares do tipo microssatélites. A análise molecular permitiu identificar onze híbridos que não tiveram a ‘Sunki’ como parental masculino. Os demais híbridos, potenciais híbridos de tangerineira ‘Sunki’, genótipos 49, 77 e 92, tiveram maior taxa de poliembrionia, maior número de plântulas emergidas por semente e maior número de sementes produzidas por fruto quando comparadas com a tangerineira ‘Sunki’