Hb D-Los Angeles [beta121(GH4)Glu>Gln] and Hb Beograd [beta121(GH4)Glu>Val]: Implications for their laboratory diagnosis and genetic origins

Objective: The aim of this study was to determine the laboratory diagnosis and genetic origins of the hemoglobin (Hb) variants, Hb D-Los Angeles and Hb Beograd observed frequently in our region. Material and Methods: Hb variants were investigated in one Hb D-Los Angeles and two Hb Beograd families. These families were unrelated with each other. For the determination of Hb variants, alkaline/acid electrophoresis, HPLC, DE-52 micro-column chromatography procedures were applied. Mutations were determined by non-radioactive fluorescence automated DNA sequencing. Beta globin gene cluster haplotypes were identified by RFLP analysis at seven loci known as ε-Hinc II, Gγ-Hind III, Aγ-Hind III, 5′ψβ-Hinc II, 3′ψβ-Hinc II, β-Ava II ve 3′β-Hinf I. Results: Three novel beta globin gene cluster haplotypes were identified as in relation with Hb D-Los Angeles [--+-+++], Hb Beograd [+----++ and -+-(+/-)(+/-)+(+/-)]. These haplotypes were reported for the first time in the world population Conclusion: In this study we emphasize the importance of DNA seqeuncing and other laboratory procedures for the identification of Hb variants in premarital diagnosis. On the other hand we discuss also the genetic origins of these Hb variants

Türkiye’de gözlenen ilk Hb Tunis [beta124(H2)Pro>Ser] olgusu

Hb Tunis [beta124(H2)Pro>Ser] was reported from Tunisia in 1988. This hemoglobin variant was detected by isoelectric focusing moving just ahead of Hb A. It cannot be identified by standard hemoglobin electrophoresis due to its similar mobility to Hb A. It has normal stability and oxygen affinity and does not produce any clinical symptoms. Here, we report a heterozygous Hb Tunis [beta124(H2)Pro>Ser] case discovered for the first time in Turkey in a premarital screening program. This hemoglobin variant can be identified with high performance liquid chromatography analysis confirmed with DNA sequencing. We emphasize in our study the importance of an interdisciplinary collaborative study at the provincial basis for the success of the hemoglobinopathy control program

Beta thalassemia mutations and associations with beta globin gene cluster haplotypes

Bu tez, Pamukkale Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından 2008SBE001 proje numarası ile desteklenmiştir.Kalıtsal kan hastalıkları içerisinde yer alan talasemiler, hemoglobin molekülünün üretimi süresince, alfa (?) ve beta (ß) globin zincir sentezlerindeki düzenlenme dengesizliklerine dayalı, globin zincir sentez bozukluğudur. Beta talasemi mutasyonları molekülsel ve fenotipik açıdan büyük çeşitlilik göstermektedir. Denizli ülkemizde hemoglobinopati kontrol programı uygulanan illerden bir tanesidir. Tezin amacını, Denizli'de gözlenen beta talasemi mutasyonları ile ilişkili beta globin gen ailesi haplotipleri ve Xmn I polimorfizm sıklığının belirlenmesi oluşturmaktadır. Çalışmamızda, beta talasemi majörlü 28, beta talasemi minörlü 210 ve Xmn I polimorfizmi açısından kontrol grubu olarak 100 sağlıklı DNA örneği incelenmiştir. Bu bireylere ait beta globin gen ailesi haplotip yapılarının belirlenmesinde PCR-RFLP yöntemi kullanılmıştır. Bu yöntemde, beta globin gen ailesi içerisinde yer alan, 5'-Epsilon- Hinc II, G gama- Xmn I, G gama, A gama- Hind III, 5' Pseudo beta- Hinc II, 3' Pseudo beta- Hinc II, 5'ß- Ava II, 3'ß- Hinf I olmak üzere, toplam sekiz polimorfik bölge çalışılmıştır. Elde edilen polimorfizm sonuçları, istatistiksel olarak ``Arlequin 3.1 Software'' programı kullanılarak değerlendirilmiştir. Elde edilen veriler doğrultusunda, yöremizde gözlenen beta talasemi mutasyonları ile ilişkili beta globin haplotip sonuçlarına göre, ilimiz beta globin gen ailesi haplotiplerinin Akdeniz türü karakter ortaya koyduğu belirlenmiştir. Bu sonuçlarda, IVS I- 110 (G>A) mutasyonunun haplotip VII (+ - - - - - +), IVS I- 5 (G>C) mutasyonunun haplotip IV (- + - + + - +), Kodon 8/9 (+G) mutasyonunun haplotip I (+ - - - - + +) ile ilişkileri Türkiye'de ilk kez bildirilmektedir. Diğer taraftan; IVS I- 1 (G>A) mutasyonu için ise haplotip VIIa (+ - - - - - -) ile bağlantısı literatürde ilk kez gösterilmektedir. Ayrıca ilimizde Xmn I polimorfizminin düşük oranda saptanması nedeni ile yöremizdeki beta talasemili olgularda uygulanabilecek hidroksiüre tedavisinin, eğer etki Xmn I polimorfizmi üzerinden ise, anlamlı olmayacağı görülmüştür.Thalassemias are hereditary blood diseases due to unbalanced globin chain synthesis. Unbalanced globin chain synthesis is the major cause of low level hemoglobin production leading to anemia. Main cause of the beta thalassemias is the lower amount of beta globin chain synthesis. Denizli province of Turkey is one of the regions in which hemoglobinopathy control program is applied. The aim of this thesis is to identify the beta globin gene cluster haplotypes linked with the beta thalassemia mutations in our province. On the other hand; the Xmn I polymorphism was also determined to be able to understand the place of this polymorphism in between beta thalassemia mutations and also in normal population. In this study, 28 with -thalassemia major, 210 -thalassemia minor and as a control group 100 healthy DNA sample for the Xmn I polymorphism have been studied. In the determination of the haplotype structures of beta globin gene cluster belonging to these individuals, the PCR-RFLP method has been used. Hinc II 5’ to ε, Xmn I 5’ to G , Hind III in the G and A , Hinc II in pseudo , Hinc II 3’ to pseudo, Ava II in β, Hinf I 3’ to β taking place in the beta globin gene cluster in total eight polymorphic site has been investigated. The results of the polymorphic loci have been evaluated statistically with ‘‘Arlequin 3.1 Software’’. According to our results, our region presents Mediterranean character as far as beta globin gene cluster haplotypes are concerned. We determined that IVS I- 110 (G>A) mutation linked with haplotype VII (+ - - - - - +), IVS I- 5 (G>C) mutation with haplotype IV (- + - + + - +), codon 8/9 (+G) linked with haplotype I (+ - - - - + +) for the first time in the Turkish population. On the other hand; linkage of haplotype VIIa (+ - - - - - -) with the IVS I- 1 (G>A) mutation was observed for the first time in the published literature. We also observed that, if Xmn I polymorphism is the major cis-acting element in the hydroxyurea therapy, our region is not suitable locus for such an approach due to the low existence of the effective Xmn I polymorhism both in beta thalassemia mutations and normal population

Travma Sonrası Stres Bozukluğunun Tedavisinde EEG-Dayalı Nörofeedback Yönteminin Kullanımı

Travma Sonrası Stres Bozukluğu, hayatı tehdit edici travmatik olayları takiben gelişebilen mental bir bozukluktur.Elektroensefalografi dayalı nörofeedback, farklı bilinç ve duygu durumlarına özgü elektroensefalografi dalga aktivitesimodellerinin, kişinin istenilen becerileri elde etmesi için edimsel (operant) koşullanma çerçevesi içinde biyofeedback yoluile değiştirilmesini amaçlayan, girişimsel olmayan bir yöntemdir. Bu yöntem, travma sonrası stres bozukluğunu da içerenbirçok nöropskiyatrik hastalıklarda alternatif tedavi yöntemi olarak kullanılmaktadır. Bu derlemede, travma sonrası stresbozukluğu tedavisinde elektroensefalografi dayalı nörofeedback yöntemin etkinliğini değerlendirmek için, Pubmed,EMBASE, EBSCOhost, ULAKBİM veri tabanları taranmış ve farklı nörofeedback tedavi protokolleri kullanan 14 çalışmaincelenmiştir. Bu inceleme sonucu, farklı tedavi protokollerine bağlı olarak, özgün olası etki mekanizmaları üzerindenelektroensefalografi dayalı nörofeedback yönteminin uygulanmasının, travma sonrası stres bozukluğu tedavisi vesemptomlarının iyileştirilmesi üzerinde anlamlı derecede olumlu etkiler gösterdiği belirlenmiştir. Elektroensefalografidayalı nörofeedback yöntemimin, travma sonrası stres bozukluğu tedavisi üzerinde kesin etki mekanizmalarını ortayakoyabilmek ve bireye ve/veya hastalığın semptomlarına özgü standardize tedavi protokollerini belirleyebilmek, ilaçkullanımı, terapist-hasta özellikleri ve diğer terapötik süreçleri gibi travma sonrası stres bozukluğu tedavisine etkiedebilecek diğer faktörleri de hesaba katarak, elektroensefalografi dayalı nörofeedback tedavisinin uzun süreli olumluetkisinin araştırılmasına yönelik, daha kapsamlı kontrollü çalışmaların yapılması hedeflenmelidir.Post-traumatic stress disorder is a mental disorder that can develop following life-threatening traumatic events. Electroencephalography-based neurofeedback is a non-invasive method that aims to modify electroencephalography wave activity patterns specific to different states of consciousness and emotion by biofeedback within the framework of operant conditioning to achieve the desired skills. This method is used as an alternative treatment for many neuropsychiatric diseases involving post-traumatic stress disorder. In this review, Pubmed, EMBASE, EBSCOhost, ULAKBIM databases were searched and 14 studies were evaluated using different neurofeedback treatment protocols to evaluate the effectiveness of electroencephalography-based neurofeedback method in the treatment of post-traumatic stress disorder. Findings showed that electroencephalography-based neurofeedback method has significantly different positive effects on the treatment of post-traumatic stress disorder and the improvement of symptoms depending on specific treatment protocols. More comprehensive controlled studies should be aimed at intended for sustained positive effect of electroencephalography-based neurofeedback treatment to put forward the exact mechanisms of electroencephalographybased neurofeedback method on post-traumatic stress disorder treatment and to determine standardized treatment protocols specific to the individual and /or symptoms of the disorder, also taking into using medication therapist-patient characteristics, and other therapeutic processes, including other factors that may affect post- traumatic stress disorder treatment

Applications of Functional Near-Infrared Spectroscopy Based Neurofeedback Training in Neurophsychiatric Disorders

WOS: 000518456300024Fonksiyonel yakın-kızılötesi (infrared) spektrokopisi nöropsikiyatrik araştırmalarda, bilişsel (kognitif) bir aktivite ile ilişkili olarak beyin oksijenizasyonundaki hemodinamik değişiklikleri (oksihemoglobin ve deoksihemoglobin) ölçmeye dayanan ve beyin aktivitesinin gerçek zamanlı değerlendirilmesini sağlayan girişimsel olmayan optiksel bir görüntüleme tekniğidir. Fonksiyonel yakın-kızılötesi (infrared) spektrokopisine dayalı nörofeedback, görsel/işitsel/dokunma uyaranları ile birlikte eğitim seanslarının uygulanması sonucu nöropsikiyatrik bozukluklarda beynin etkin bölgelerindeki hemodinamik değişiklerin, edimsel (operant) koşullanma yolu ile kendi-kendine düzenlenmesini sağlamaktadır. Bu derlemenin amacı, güncel literatür verilerine göre sosyal anksiyete bozukluğu, dikkat eksikliği-hiperaktivite bozukluğu, yeme bozukluğu, şizofreni ve otizm spektrum bozukluğunu içeren nöropsikiyatrik rahatsızlıklarda, fonksiyonel yakın-kızılötesi (infrared) spektrokopisi- nörofeedback eğitimi uygulamalarının ve bu eğitimin olası gelişiminin kapsamlı olarak değerlendirilmesidir. Bu doğrultuda, derlemede Pubmed/MEDLINE, ScienceDirect, Web of Knowledge/Web of Science, EMBASE, EBSCOhost ve Scopus veri tabanlarında taratılan konu ile ilgili güncel literatür verileri incelenmiştir. Bu inceleme sonuçlarına göre, farklı uyaranlar ile bilişsel ve davranışsal temelli olarak beynin fonksiyonel aktivitelerinin kendi kendine düzenlenmesine dayalı fonksiyonel yakın-kızılötesi (infrared) spektrokopisi- nörofeedback eğitim protokollerinin, nöropsikiyatrik bozuklukların tedavilerinde, bozukluk/semptom ve/veya bireye özgün olarak uygulandığında umut verici alternatif bir yöntem olabileceği öngörülmektedir. Bu nedenle, nöropsikiyatrik bozukluklarda etkin nörofeedback tedavi uygulayabilmek için fonksiyonel yakınkızılötesi (infrared) spektrokopisi- nörofeedback’in klinik etkilerine ek olarak, farklı beyin ağlarındaki (networks) etkilerin altında yatan mekanizmalara ve aktivite değişikliklerine odaklı çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır. Gelecek çalışmalarda, bu yöntem kullanılarak bu bozukluklarda etkilenmiş olan, prefrontal korteks, dorsolateral prefrontal korteks, posterior-superior temporal girus, inferior frontal girus gibi hedef beyin bölgelerindeki hemodinamik değişikler üzerine odaklanılması hedeflenmelidir.Functional near-infrared spectroscopy is a noninvasive optical imaging technique based on measuring hemodynamic changes (oxyhemoglobin and deoxyhemoglobin) in brain oxygenation concerning cognitive activity and enables real-time evaluation of brain activity in neuropsychiatric studies. Functional near-infrared spectroscopy-based neurofeedback provides self-regulation of hemodynamic changes in the effective regions of the brain as a result of the application of training sessions with visual/auditory/tactile stimuli through operant conditioning in neuropsychiatric disorders. The purpose of this review is to evaluate comprehensively over the possible implementations and development of this neurofeedback training in neuropsychiatric disorders including social anxiety disorder, attention deficit-hyperactivity disorder, eating disorder, schizophrenia, and autism spectrum disorder according to recent literature data. Accordingly, the current literature related to the subject scanned in Pubmed/MEDLINE, ScienceDirect, Web of Knowledge/Web of Science, EMBASE, EBSCOhost and Scopus databases were examined in this review. According to the results of this investigation, it is predicted that functional near-infrared spectroscopy-neurofeedback training protocols based on the self-regulation of the brain's functional activities based on the cognitive and behavioral basis with different stimuli might be a promising alternative method when applied to as specific to disorder/symptom and/or individual in the treatment of neuropsychiatric disorders. Thus, functional near-infrared spectroscopy-neurofeedback studies focusing on the effect mechanisms of different brain networks and activity changes are needed in addition to its clinical effects to perform effective neurofeedback treatment in neuropsychiatric disorders. In future studies, it should be aimed to focus on hemodynamic changes in target brain regions such as prefrontal cortex, dorsolateral prefrontal cortex, posterior-superior temporal gyrus, inferior frontal gyrus, which are affected by these disorders by using this method

Radyofrekans/Mikrodalga Elektromanyetik Radyasyonun Anksiyete ve Depresyon Üzerine Etkileri: Deneysel Hayvan Modellerine Dayalı Çalışmalara Ait Literatür Taraması

Günümüzde anksiyete ve/veya depresyon dünyada en yaygın gözlenen duygusal (emosyonel) davranış bozukluklarıdır.Bu derlemede, radyofrekans/mikrodalga-elektromanyetik radyasyonun (RF/MW-EMR) deneysel hayvan modellerindeanksiyete ve depresyon bozuklukları üzerindeki etkilerinin araştırılması amaçlanmıştır. Derlemede, 2005-2019 yıllarıarasında yayınlanmış toplam 31 çalışma incelenmiş olup, bu çalışmalara ait uygulanan frekans aralığı, spesifikabsorbsiyon oranı, güç yoğunluğu veya elektrik alan, radyasyon maruziyet kurulumu, maruziyet süresi ve bölgesi,hayvan modeli ve yaşı, ölçülen deneysel parametreler ile çalışmaların sonuçları değerlendirilmiştir. Değerlendirilenliteratür verilerindeki anksiyete ve/veya depresyon üzerine RF/MW-EMR maruziyetinin etkileri incelendiğinde,EMR’nun 19 anksiyete çalışması ile bir depresyon çalışmasında pozitif etkileri, beş anksiyete çalışması ile birdepresyon çalışmasında negatif etkileri belirlenirken, dokuz anksiyete çalışması ile üç depresyon çalışmasında EMRmaruziyetinin anlamlı derecede bir etkisi gözlenmemiştir. Ayrıca değerlendirilen bu çalışmaların sekizinde, deneyselhayvan modeli özellikleri, radyasyon maruziyet koşulları, davranış testleri ve nörogelişimsel süreçlere bağlı olarakdeğişken sonuçlar saptanmıştır. Sonuç olarak derlemede, RF/MW-EMR maruziyetinin anksiyete ve/veya depresyonbozukluklarının oluşumunu etkileyebileceği gözlenmiş olup, literatürdeki mevcut veriler ışığında, nöral ve molekülermekanizmalara dayalı ileri araştırmaların yararlı olabileceği düşünülmektedir.Anxiety and/or depression are the most common emotional behavior disorders in the world. This review aimed to investigate the effects of radiofrequency/microwave-electromagnetic radiation (RF/MW-EMR) on anxiety and depression disorders in the experimental animal models. In the review, a total of 31 studies published between 2005- 2019 were examined and frequency range, specific absorption rate, power density or electric field, setup, time and region of radiation exposure, animal model and age, measured experimental parameters and results related to these studies were evaluated. Regarding the effects of RF/MW-EMR exposure on anxiety and/or depression in the literature, the EMR effects were found positive in 19 studies on anxiety and one study on depression and negative in five studies on anxiety and one study on depression, while no significant effect of EMR exposure was observed in nine studies on anxiety and three studies on depression. Additionally, in eight studies, various results were found depending on experimental animal model characteristics, radiation exposure conditions, behavior tests, and neurodevelopmental processes. Consequently, the current findings show that RF/MW-EMR exposure may affect the occurrence of anxiety and/or depression disorders so suggest that further research based on neural and molecular mechanisms may be useful in the light of available data in the literature

Differential molecular diagnostic of the hemoglobin D- Los Angeles [ 121(GH4) GluGln] mutation with surface plasmon resonance (SPR) spectroscopy

Amaç: Bu çalışmada, Hb D-Los Angeles anormal hemoglobin (Hb) türünün laboratuar tanısında kullanılan molekülsel yaklaşımlar irdelenerek, bu hemoglobin türünün gen düzeyinde hızlı ve güvenilir tanısında, biyosensör tabanlı yüzey plazmon rezonans (SPR: Surface Plasmon Resonance) spektroskopisi kullanılabilirliğinin gösterilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Bu çalışmada, aralarında akrabalık ilişkisi olmayan, sağlıklı (Hb AA, n:5) ve heterozigot Hb D- Los Angeles [ 121(GH4) GluGln] (n:5)'lı bireyler incelenmiştir. Hb D- Los Angeles mutasyonunun protein düzeyinde tanımlanmasında, alkali/asit hemoglobin elektroforezleri, DE-52 mikrokolon kromatografisi yöntemleri kullanılmıştır. Mutasyonun gen düzeyinde saptanmasında ise, polimeraz zincir reaksiyonu (PCR: Polymerase Chain Reaction) tabanına dayalı Eco RI restriksiyon enzimi/ tek nükleotit polimorfizmi (SNP: Single Nucleotide Polymorphism) ve flüoresan işaretli DNA dizi analiz yöntemleri kullanılmıştır. SPR spektroskopisi kullanılarak, Hb AA ve Hb AD- Los Angeles olgulara ait biyotinli primerler ile işaretlenmiş PCR ürünleri ile mutasyon odağına özgü Eco RI restriksiyon enzim etkileşimi gerçek zamanlı olarak incelenmiştir. Bulgular: SPR spektroskopisi ile Hb AD-Los Angeles ve Hb AA olguları arasındaki farklılıklar gerçek zamanlı olarak belirlenmiştir. Elde edilen verilere göre, SPR spektroskopisi yöntemi, HbAA ve Hb ADLos Angeles mutasyonu arasındaki değişiklikleri algılayabilmektedir. Bağlanma eğrilerinden, Hb AA PCR ürünü ile Eco RI restriksiyon enzimi etkileşimi sonucu 400 arc saniyelik, heterozigot Hb AD -Los Angeles olgusunda ise, EcoRI enzimi ve hedef PCR ürünleri arasında 300 arc saniyelik rezonans kayıtları alınmıştır. Aradaki 100 arc saniyelik rezonans fark, Hb D- Los Angeles mutasyonundan kaynaklanmaktadır. Sonuç: Molekülsel tanı yöntemlerinde anormal hemoglobin bozukluklarının doğru biçimde tanımlanması önemlidir. Molekülsel tanı yöntemlerinde anormal hemoglobin bozukluklarının doğru biçimde tanımlanması önemlidir. Bu yöntemlerden protein ve gen düzeyindeki tanı yöntemlerinde, birçok hemoglobin türü benzer davranış sergilediklerinden kesin tanı yöntemi DNA dizi analizidir. DNA dizi analizi ise pahalı bir yöntem olması, analizin uzun zaman alması ve deneyimli kullanıcı gereksinimi nedeni ile her laboratuarda rutin biçimde kullanılamamaktadır.Bu doğrultuda, SPR spektroskopisi yönteminin geliştirilerek, Hb D- Los Angeles ya da benzeri anormal hemoglobin bozukluklarının kısa sürede ve gerçek zamanlı tanısında, rutin uygulamalarda kullanılabileceği sonucuna varılmıştır.Objective: In this study, we aimed to determine the molecular approaches used in the laboratory diagnosis of Hb D- Los Angeles and to show rapid and reliable diagnosis of the mutation by SPR (Surface Plasmon Resonance) spectroscopy based biosensor. Materials and Methods: In this study, we were investigated with heterozygote Hb D- Los Angeles [ 121(GH4) Glu>Gln] (n:5) and healthy (Hb AA, n:5) individuals. These individuals were unrelated with each other. For the determination of the Hb D- Los Angeles mutation alkaline/acid electrophoresis DE-52 microcolumn chromatography procedures were applied at the protein level. This mutation were determinated by Eco RI restriction enzyme/SNP (Single Nucleotide Polymorphism) and labelled fluorescence automated DNA sequencing methods based on PCR (Polymerase Chain Reaction) at the gene level. We were examined by using SPR spectroscopy as real-time interactions in between biotinylated PCR products and the restriction enzyme Eco RI. Results: Differences between Hb AD-Los Angeles and Hb AA samples were determined with SPR spectroscopy as the real-time. According to our results, SPR spectroscopy method can detect the changes in between Hb AA and Hb AD Los Angeles mutation. The resonance recordings have been given 400 arc second as a result of interaction HbAA PCR products with Eco RI restriction endonuclease, whereas between Eco RI enzyme and target PCR products have been given 300 arc second in the case of heterozygous Hb D Los Angeles from the binding curves. In between them, 100 arc second of the resonance difference were caused by Hb D- Los Angeles mutation. Conclusion: Molecular diagnostic methods are important tools for the identification of the abnormal hemoglobins. Since abnormal hemoglobins present some similar results with electrophoretic and chromatographic methods, precise identification method is DNA sequencing analysis. DNA sequence analysis is not used to every laboratory routinely, because of the need for an experienced user, to give long term results and to be expensive. In this regard, we have been concluded that SPR spectroscopy can be used as routine applications in short period of time and real-time detection in the model of Hb D Los Angeles. Similar approaches based on SPR can be also developed for the abnormal hemoglobins

Investigation of ENOS Exon (G894T) Polymorphism in Patients with Migraine in Düzce Province

Amaç: Düzce ili migrenli hastalarda eNOS ekzon (G894T) polimorfizm-hastalık ilişkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya 51 migrenli hasta ve 51 sağlıklı birey dâhil edilmiştir. Bireylerin DNA'sı izole edilerek, eNOS ekzon (G894T) polimorfizmini içeren gen bölgesi PCR yöntemi ile çoğaltıldıktan sonra, Mbo I restriksiyon enzim kesim reaksiyonu ile genotip analizleri gerçekleştirilmiştir. Bulgular: Migren ve kontrol grupları arasında yaş (p0,70), cinsiyet (p0,529), homosistein (p0,250) ve trigliserit (p0,575) değerleri açısından anlamlı bir farklılık bulunmamıştır. Kontrol ve migren grubu arasında eNOS ekzon (G894T) polimorfizmi açısından anlamlı bir farklılık (p0,0001) gözlenirken, migren auralı (MA) ve migren aurasız (MO) grubu arasında anlamlı bir farklılık (p0,377) saptanmamıştır. Bu polimorfizm ile hem cinsiyet (p0,760) hem de aile öyküsü arasında (p0,380) bir farklılık belirlenmemiştir. Sonuç: Düzce ili popülasyonundaki migrenli hastalar ile eNOS ekzon (G894T) polimorfizmi arasında anlamlı bir ilişki (p0,0001) belirlenmiştir. Gelecek araştırmalarda, migren oluşumunu tetikleyici diğer aday genlerin de (MTHFR, ACE vb) yöremizdeki daha fazla hasta serisinde çalışılması öngörülmektedir.Objective: Determination of relation between disease and polymorphism has been aimed through investigation of eNOS exon (G894T) polymorphism frequency in Duzce province. Materials and Methods: In this study, 51 patients with migraine and 51 healthy individuals were included. The genomic DNA of individuals were isolated and the gene region including eNOS exon (G894T) polymorphism were amplified by PCR (Polymerase Chain Reaction) method and analysed after digesting by MboI restriction enzyme. Results: There was no difference between migraine and control groups among age (p0,70), sex (p0,529) homocysteine (p0,250) and triglyceride (p0,575) values. While the eNOS exon (G894T) gene polymorphism between migraine and control groups were significant (p0,0001), no difference was observed between MA and MO groups for related gene polymorphism (p0,377). Also, no difference was detected between this polymorphism and both sex (p0,760) and family history(p0,380). Conclusion: A significant relationship was determinated between eNOS exon (G894T) gene polymorphism and patients with migraine (p0,0001). Research on other candidate genes (MTHFR, ACE etc.), having role as trigger in migraine, is being planned to be studied using a great number of patients

High ionic strength depresses muscle contractility by decreasing both force per cross-bridge and the number of strongly attached cross-bridges

Kawai, Masataka/0000-0002-3219-3527WOS: 000356379900002PubMed: 25836331An increase in ionic strength (IS) lowers Ca2+ activated tension in muscle fibres, however, its molecular mechanism is not well understood. In this study, we used single rabbit psoas fibres to perform sinusoidal analyses. During Ca2+ activation, the effects of ligands (ATP, Pi, and ADP) at IS ranging 150-300 mM were studied on three rate constants to characterize elementary steps of the cross-bridge cycle. The IS effects were studied because a change in IS modifies the inter- and intra-molecular interactions, hence they may shed light on the molecular mechanisms of force generation. Both the ATP binding affinity (K (1)) and the ADP binding affinity (K (0)) increased to 2-3x, and the Pi binding affinity (K (5)) decreased to 1/2, when IS was raised from 150 to 300 mM. The effect on ATP/ADP can be explained by stereospecific and hydrophobic interaction, and the effect on Pi can be explained by the electrostatic interaction with myosin. The increase in IS increased cross-bridge detachment steps (k (2) and k (-4)), indicating that electrostatic repulsion promotes these steps. However, IS did not affect attachment steps (k (-2) and k (4)). Consequently, the equilibrium constant of the detachment step (K (2)) increased by similar to 100 %, and the force generation step (K (4)) decreased by similar to 30 %. These effects together diminished the number of force-generating cross-bridges by 11 %. Force/cross-bridge (T (56)) decreased by 26 %, which correlates well with a decrease in the Debye length that limits the ionic atmosphere where ionic interactions take place. We conclude that the major effect of IS is a decrease in force/cross-bridge, but a decrease in the number of force generating cross-bridge also takes place. The stiffness during rigor induction did not change with IS, demonstrating that in-series compliance is not much affected by IS.National Institutes of HealthUnited States Department of Health & Human ServicesNational Institutes of Health (NIH) - USA [HL070041]; The American Heart AssociationAmerican Heart Association [13GRNT16810043]; Higher Educational Council of TurkeyMinistry of National Education - Turkey [82444403-299-1926]This work was supported by grants from the National Institutes of Health HL070041 (MK), and The American Heart Association 13GRNT16810043 (MK). This study was carried out during Dr. Anzel Bahadir's visit to The University of Iowa with a scholarship (82444403-299-1926) funded by Higher Educational Council of Turkey. The content is solely the responsibility of the authors and does not necessarily reflect the official views of the funding organizations

Investigation of ENOS Exon (G894T) Polymorphism in Patients with Migraine in Düzce Province

Amaç: Düzce ili migrenli hastalarda eNOS ekzon (G894T) polimorfizm-hastalık ilişkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya 51 migrenli hasta ve 51 sağlıklı birey dâhil edilmiştir. Bireylerin DNA'sı izole edilerek, eNOS ekzon (G894T) polimorfizmini içeren gen bölgesi PCR yöntemi ile çoğaltıldıktan sonra, Mbo I restriksiyon enzim kesim reaksiyonu ile genotip analizleri gerçekleştirilmiştir. Bulgular: Migren ve kontrol grupları arasında yaş (p0,70), cinsiyet (p0,529), homosistein (p0,250) ve trigliserit (p0,575) değerleri açısından anlamlı bir farklılık bulunmamıştır. Kontrol ve migren grubu arasında eNOS ekzon (G894T) polimorfizmi açısından anlamlı bir farklılık (p0,0001) gözlenirken, migren auralı (MA) ve migren aurasız (MO) grubu arasında anlamlı bir farklılık (p0,377) saptanmamıştır. Bu polimorfizm ile hem cinsiyet (p0,760) hem de aile öyküsü arasında (p0,380) bir farklılık belirlenmemiştir. Sonuç: Düzce ili popülasyonundaki migrenli hastalar ile eNOS ekzon (G894T) polimorfizmi arasında anlamlı bir ilişki (p0,0001) belirlenmiştir. Gelecek araştırmalarda, migren oluşumunu tetikleyici diğer aday genlerin de (MTHFR, ACE vb) yöremizdeki daha fazla hasta serisinde çalışılması öngörülmektedir.Objective: Determination of relation between disease and polymorphism has been aimed through investigation of eNOS exon (G894T) polymorphism frequency in Duzce province. Materials and Methods: In this study, 51 patients with migraine and 51 healthy individuals were included. The genomic DNA of individuals were isolated and the gene region including eNOS exon (G894T) polymorphism were amplified by PCR (Polymerase Chain Reaction) method and analysed after digesting by MboI restriction enzyme. Results: There was no difference between migraine and control groups among age (p0,70), sex (p0,529) homocysteine (p0,250) and triglyceride (p0,575) values. While the eNOS exon (G894T) gene polymorphism between migraine and control groups were significant (p0,0001), no difference was observed between MA and MO groups for related gene polymorphism (p0,377). Also, no difference was detected between this polymorphism and both sex (p0,760) and family history(p0,380). Conclusion: A significant relationship was determinated between eNOS exon (G894T) gene polymorphism and patients with migraine (p0,0001). Research on other candidate genes (MTHFR, ACE etc.), having role as trigger in migraine, is being planned to be studied using a great number of patients