26 research outputs found

    Identification of importin (IPO-8) as the most accurate reference gene for the clinicopathological analysis of lung specimens

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    Abstract Background: The accurate normalization of differentially expressed genes in lung cancer is essential for the identification of novel therapeutic targets and biomarkers by real time RT-PCR and microarrays. Although classical "housekeeping" genes, such as GAPDH, HPRT1, and beta-actin have been widely used in the past, their accuracy as reference genes for lung tissues has not been proven. Results: We have conducted a thorough analysis of a panel of 16 candidate reference genes for lung specimens and lung cell lines. Gene expression was measured by quantitative real time RTPCR and expression stability was analyzed with the softwares GeNorm and NormFinder, mean of |ΔCt| (= |Ct Normal-Ct tumor|) ± SEM, and correlation coefficients among genes. Systematic comparison between candidates led us to the identification of a subset of suitable reference genes for clinical samples: IPO8, ACTB, POLR2A, 18S, and PPIA. Further analysis showed that IPO8 had a very low mean of |ΔCt| (0.70 ± 0.09), with no statistically significant differences between normal and malignant samples and with excellent expression stability. Conclusion: Our data show that IPO8 is the most accurate reference gene for clinical lung specimens. In addition, we demonstrate that the commonly used genes GAPDH and HPRT1 are inappropriate to normalize data derived from lung biopsies, although they are suitable as reference genes for lung cell lines. We thus propose IPO8 as a novel reference gene for lung cancer samples

    « Un moment au centre du monde ». Dublinesca ou la quĂȘte vertigineuse du centre

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    « Je me demande : oĂč est le centre de ma ville, oĂč est mon centre ? Je ne suis pas sĂ»r d’en avoir un ».J.B. Pontalis« Chacun de nous est au centre de myriades de mondes. Nous sommes toujours au centre dumonde, d’instant en instant ».Shunryu Suzuki Le 19 septembre 1963, alors que ma place dans l’univers paraĂźt encore trĂšs improbable, Salvador Dali entre en gare de Perpignan comme on entre en religion : « J’ai eu Ă  la gare de Perpignan, [dĂ©clare-t-il], une espĂšce d’extase cosmogonique plus fort..

    Je me souviens... de Françoise

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    A ma marraine en HumanitĂ©s « Tout, au monde, existe pour aboutir Ă  un livre » StĂ©phane MallarmĂ© « Tout simplement littĂ©rature, poursuite de la bibliothĂšque, prĂ©sence des morts et regard lucide sur les vivants ». BĂ©atrice CommengĂ© Je me souviens que la lecture de Je me souviens de Georges Perec avait engendrĂ© chez moi le dĂ©sir d’écrire mes propres « je me souviens », ainsi que l’auteur invitait son lecteur Ă  le faire, dans la premiĂšre Ă©dition du livre, en 1978, chez Hachette, dans la collectio..

    Un Ă©blouissement

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    « Ce qui ne m’empĂȘche pas de continuer Ă  tituber ».Enrique Vila-Matas, AbrĂ©gĂ© d’histoire de la littĂ©rature portative. 106. Dans quel fameux ouvrage le lecteur peut-il lire une « prĂ©face de l’auteur » au Livre III, chapitre XX ? VoilĂ  un fait assez inĂ©dit pour ĂȘtre soulignĂ©. Mais diffĂ©rons aussitĂŽt la rĂ©ponse pour poser une autre question au sujet de ses destinataires : A qui peut-elle bien s’adresser, ainsi placĂ©e ? Voici un premier indice : « Et maintenant, anti-shandiens, chers et trĂšs comp..

    Kundera ou le rire en Ă©clats

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    « Le comique est un des plus clairs signes sataniques de l’homme »Charles Baudelaire« Tout comme la mĂ©lancolie est la tristesse devenue lĂ©gĂšre, l’humour est le comique dĂ©barrassĂ© de la pesanteur corporelle [...] capable de mettre en doute tant le moi que le monde, avec tout le rĂ©seau de relations qui les constitue l’un et l’autre. »Italo Calvino PROLOGUE J’aurais pu intituler cette communication « La Plaisanterie », « Risibles amours », « Personne ne va rire » ou encore « Le jour oĂč Panurge n..

    GĂ©ographies du vertige dans l'Ɠuvre d'Enrique Vila-Matas

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    Ce livre propose une sĂ©lection de travaux prĂ©sentĂ©s lors du colloque international qui s'est tenu Ă  l'UniversitĂ© de Perpignan Via Domitia en mars 2012 en prĂ©sence d'Enrique Vila-Matas et de son traducteur AndrĂ© Gabastou. On y trouvera, outre un texte inĂ©dit de l'auteur, des contributions de spĂ©cialistes de son Ɠuvre qui montrent combien la gĂ©ographie, qu'elle soit mentale ou physique, littĂ©raire ou virtuelle, est un motif particuliĂšrement fĂ©cond pour cet Ă©crivain funambule qui n'a pas d'Ă©quivalent et dont les textes, mĂȘme soumis Ă  l'Ă©tude, ne laissent pas d'ĂȘtre vertigineux
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