Reference Genes for Accurate Transcript Normalization in Citrus Genotypes under Different Experimental Conditions

Real-time reverse transcription PCR (RT-qPCR) has emerged as an accurate and widely used technique for expression profiling of selected genes. However, obtaining reliable measurements depends on the selection of appropriate reference genes for gene expression normalization. The aim of this work was to assess the expression stability of 15 candidate genes to determine which set of reference genes is best suited for transcript normalization in citrus in different tissues and organs and leaves challenged with five pathogens (Alternaria alternata, Phytophthora parasitica, Xylella fastidiosa and Candidatus Liberibacter asiaticus). We tested traditional genes used for transcript normalization in citrus and orthologs of Arabidopsis thaliana genes described as superior reference genes based on transcriptome data. geNorm and NormFinder algorithms were used to find the best reference genes to normalize all samples and conditions tested. Additionally, each biotic stress was individually analyzed by geNorm. In general, FBOX (encoding a member of the F-box family) and GAPC2 (GAPDH) was the most stable candidate gene set assessed under the different conditions and subsets tested, while CYP (cyclophilin), TUB (tubulin) and CtP (cathepsin) were the least stably expressed genes found. Validation of the best suitable reference genes for normalizing the expression level of the WRKY70 transcription factor in leaves infected with Candidatus Liberibacter asiaticus showed that arbitrary use of reference genes without previous testing could lead to misinterpretation of data. Our results revealed FBOX, SAND (a SAND family protein), GAPC2 and UPL7 (ubiquitin protein ligase 7) to be superior reference genes, and we recommend their use in studies of gene expression in citrus species and relatives. This work constitutes the first systematic analysis for the selection of superior reference genes for transcript normalization in different citrus organs and under biotic stress

Contribuições da fenomenologia para os estudos organizacionais

Este artigo discute elementos que viabilizam outra possibilidade de compreensão dos fenômenos administrativos, através de uma descrição propedêutica da fenomenologia e do método fenomenológico. Objetiva-se, assim, apresentar as principais contribuições e possibilidades da fenomenologia para os estudos organizacionais. Aprofunda-se em considerações sobre a fenomenologia em geral e os diversos tipos de métodos fenomenológicos em particular, buscando esclarecer sobre a filosofia existente nesses temas, para auxiliar os pesquisadores em seu labor diário. Discorre-se também sobre a redução, que na verdade são duas: a eidética e a fenomenológica. Tais reduções são vitais para retirar o homem de sua atitude natural. Outro assunto aqui abordado é a transposição do método fenomenológico do campo filosófico para o campo da pesquisa empírica. Diante dessa contextualização, tem-se o último assunto a ser abordado, que vai diretamente ao encontro do objetivo desta pesquisa, discutindo-se a utilização da fenomenologia no contexto da administração. A título de ilustração, são apresentados diversos estudos que têm a fenomenologia como tema, bem como um método fenomenológico empírico específico da área de estudos organizacionais. Dessa maneira, a temática neste artigo é situada, sendo preciso agora avançar em direção a outras possibilidades