Análise das frequências alélicas e genotípicas de polimorfismos nos genes da calpaína e da calpastatina em bovinos de corte.

Trabalho 1

Alternative methodologies for genotyping polymorphisms in the CAST and CAPN1 genes in beef cattle.

The objectives of this study were to genotype single nucleotide polymorphisms (SNP) AF159246:g.2959A>G (CAST/DdeI) and AF248054.2:g.6545C>T (CAPN4751) in beef cattle by PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism), using the restriction enzyme DdeI for both SNP, and describe the use of these genotyping methodologies for the first time. For the SNP located in the CAST gene, new primers were designed, and for the SNP of the CAPN1 gene, the same primers previously described in the literature were used. Bonsmara, Caracu, Senepol, Nelore, and Angus bulls were chosen from among the most used bulls in breeding programs according to their genealogy and the lowest possible degree of parentage between them to ensure an experimental sample representative of the genetic variability in each breed. For the CAST and CAPN1 genes, respectively, the following number of animals were analyzed: Bonsmara (n = 25/22), Caracu (n = 25/26), Senepol (n = 25/24), Nelore (n = 26/26), and Angus (n = 25/24). The accuracy of these methodologies was confirmed by direct sequencing of PCR products generated for the two polymorphisms. The new primers developed for CAST/DdeI SNP detection and the use of DdeI enzyme for CAPN4751 SNP detection were effective in genotyping, since no inconclusive genotypes were observed for these genes. Thus, the genotyping of beef cattle using the PCR-RFLP technique for CAST and CAPN1 genes is robust, relatively inexpensive, and easy to perform in any basic molecular biology laboratory. If the association of these markers with traits of economic interest in beef cattle is confirmed in new studies, these methodologies may contribute to the selection of animals with superior genetics, i.e., with the potential to produce better-quality meat, either by marker-assisted selection or by the inclusion of these polymorphisms in high-density marker panels

Carrapatos de área urbana: um estudo sobre sazonalidade e infecção por rickettsia / urban area ticks: a study about seasonality and rickettsial infection.

This study was made in an urban forest fragment in Campo Grande, Mato Grosso do Sul State, Midwest of Brazil. During a three year period, from 2012 to 2015, the presence of tick species in the environment (vegetation and soil), their seasonality and the occurrence of rickettsial infection in ticks was investigated. 1219 samples were collected, from which 1045 belonged to the Amblyomma sculptum species and 174 belonged to the Amblyomma dubitatum species. The A. sculptum species presented its main annual peak in the periods when rainfall and temperature were the highest, while the A. dubitatum species presented a higher population level in the following season. However, the A. sculptum population decreased during the second year of the study, probably due to the installation of a physical barrier by the end of the first year, what has possibly caused a momentary decrease in the circulation of the ectoparasites? hosts. The A. dubitatum population remained stable. All sampled ticks presented a negative result regarding rickettsia DNA detection using the polymerase chain reaction method

Avaliação do polimorfismo CAST/Xmnl em bovinos de corte.

A utilização de testes de DNA para a identificação precoce de animais que apresentam potencial para produção de carne bovina de qualidade constitui uma importante ferramenta para viabilizar a seleção dos reprodutores e aumentar a qualidade da carne do rebanho comercial. Outro fator que contribui para o aumento da qualidade da carne são os cruzamentos utilizando raças das subespécies Bos taurus indicus e Bos taurus taurus, pois sabe-se que quanto maior a proporção de sangue zebuíno no rebanho, menores são os valores de maciez encontrados. Até o momento, vários genes relacionados com essa característica foram identificados, sendo um deles o gene CAST, que codifica a enzima calpastatina. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi avaliar as frequências alélicas e genotípicas do polimorfismo CAST/XmnI nas raças Bonsmara, Caracu e Senepol (taurinas adaptadas), Nelore (zebuína) e Angus (taurina não adaptada), visando orientar a escolha de uma raça taurina adaptada para produção de carne de qualidade em sistemas de cruzamento. Para a extração do DNA, foram obtidas amostras de sêmen e de sangue de 111 touros escolhidos de acordo com a genealogia e com o menor grau de parentesco possível. A genotipagem foi realizada pela técnica PCR-RFLP e as frequências alélicas e genotípicas foram comparadas utilizando o teste de Qui-quadrado. Houve diferença significativa nas frequências alélicas e genotípicas entre as raças (p<0,05), sendo que as raças Angus e Bonsmara apresentaram os maiores valores de frequência para o alelo A (88,6%). A raça Nelore foi a que apresentou maior frequência para o alelo B (54,2%), seguida pela Caracu (36,4%) e pela Senepol (28,6%). Esse marcador mostrou-se viável para seleção de bovinos, já que a alta frequência do alelo A, observada na população em estudo, permite que o teste seja aplicado, desde que confirmada a associação desse polimorfismo com a maciez da carne

Avaliação do polimorfismo CAST/Xmnl em bovinos de corte.

O objetivo deste trabalho foi avaliar as frequências alélicas e genotípicas do polimorfismo CAST/XmnI nas raças Bonsmara, Caracu e Senepol (taurinas adaptadas), Nelore (zebuína) e Angus (taurina não adaptada), visando orientar a escolha de uma raça taurina adaptada para produção de carne de qualidade em sistemas de cruzamento. Para a extração do DNA, foram obtidas amostras de sêmen e de sangue de 111 touros escolhidos de acordo com a genealogia e com o menor grau de parentesco possível

Cattle tick infestation in Brangus cattle raised with Nellore in central Brazil.

The present study evaluated the behavior of Rhipicephalus microplus naturally infesting Brangus cattle raised with Nellore animals in the municipality of Água Clara, state of Mato Grosso do Sul, Central Brazil. For the field experiment composed of a group with 15 Brangus animals and 15 Nellore animals and a control group with 30 Brangus cattle, all at the post-weaning stage. The 2 groups were kept for 6 months in 2 adjacent paddocks, naturally infested with ticks, at a stocking rate of approximately 0.6 of an animal unit per hectare (AU/ha). Every 18 days, the animals were weighed, and ticks on both sides of each bovine were counted. Every 36 days, blood was collected for hematocrit measurement and molecular diagnosis of the 3 pathogens that cause tick fever. The Brangus animals had 6.8 times more ticks than the Nellore cattle. No significant difference was observed in the weight gain of the Brangus and Nellore animals, and no correlation between the number of ticks and weight was observed in either group. During the 6 months of the study, all animals presented normal hematocrit, were positive for Babesia bigemina and Anaplasma marginale, and were negative for Babesia bovis. Animals in Group 1 produced 27% fewer ticks than the animals in Group 2. The production rate of engorged female ticks in Nellore and Brangus cattle was 0.83% and 2.01%, respectively. Considering the infestation pattern required to produce 10 engorged females/day/animal, the Nellore and Brangus animals required 1,204 and 497 larvae/day, respectively. Our estimates showed that Brangus cattle need only 11.3% of the larvae in the pastures with Nellore cattle to maintain the infestation level observed in the present study. Brangus animals raised with Nellore cattle do not have a lower parasitic load and continue to suffer from tick infestation. Finally, Nellore cattle raised with Brangus cattle do not act as a cleaner because this grouping does not contribute to a reduced infestation in the Brangus animals. Key words: Bovine. Cattle tick. Control. Infestation.Título em português: Infestação de carrapatos em bovinos Brangus criados com Nelore no Brasil central

Frequências alélicas e genotípicas do polimorfismo CAST/XmnI em bovinos de corte.

A identificação precoce de animais que apresentam potencial para produção de carne de qualidade, pela utilização de testes de DNA, constitui uma importante ferramenta para viabilizar a seleção dos reprodutores que possuem estas características, aumentando, assim, a qualidade da carne do rebanho comercial. O gene CAST codifica a proteína calpastatina que é responsável pela inativação das enzimas calpaínas (amaciadoras da carne), contribuindo para que a carne endureça no processo post-mortem. Neste trabalho, foram avaliadas as frequências alélicas e genotípicas do polimorfismo CAST/XmnI entre as raças Bonsmara, Caracu e Senepol (taurinas adaptadas), Nelore (zebuína) e Angus (taurina não adaptada) em 111 touros escolhidos de acordo com o menor grau de parentesco possível. A genotipagem foi realizada por PCR-RFLP e as freqüências alélicas e genotípicas foram comparadas utilizando o teste de Qui-quadrado. Houve diferença significativa nas frequências alélicas e genotípicas entre as raças (p<O,05), sendo que as raças Angus e Bonsmara apresentaram os maiores valores de frequência para o alelo A (88,6%). A raça Nelore foi a que apresentou maior frequência para o alelo B (54,2%), seguida pela Caracu (36,4%) e pela Senepol (28,6%). Esse marcador mostrou-se viável para seleção de bovinos, já que a alta frequência do alelo A, observada na população em estudo, permite que o teste seja aplicado, desde que confirmada a associação desse polimorfismo com a maciez da carne

Avaliação de polimorfismos de nucleotídeos únicos (snps) em genes relacionados às características de qualidade de carne em bovinos de corte.

Este trabalho tem como objetivo avaliar as freqüências alélicas e genotípicas de SNPs nos genes CAPN1, CAST, TG, DGAT1 e LEP, e a associação desses com características como maciez, marmoreio e deposição de gordura na carcaça em 200 animais (machos e fêmeas) cruzados