Aplicabilidade de marcadores SSR em estudos genéticos em Gossypium Mustelinun Miers.

bitstream/CNPA/20279/1/COMTEC345.pd

Distância genética ente algumas variedades brasileiras de algodão medida por marcadores RAPDs.

bitstream/CNPA/19677/1/COMTEC254.pd

Distância genética entre linhagens avançadas de germoplasma de algodão com uso de marcadores de RAPD e microssatélites.

O objetivo deste trabalho foi selecionar coeficientes de similaridade para serem aplicados a conjuntos de genótipos de algodoeiro com baixa diversidade genética. Analisou-se um conjunto de 65 linhagens e 4 cultivares de algodão, com marcadores de RAPD e SSR, e estimou-se a similaridade genética de acordo com sete coeficientes de similaridade: Coincidência Simples, Rogers & Tanimoto, Ochiai, Hamman, Jaccard, Dice e Russel & Rao. A adequação dos coeficientes ao conjunto de genótipos foi verificada por correlação entre as matrizes de distância, índice de consenso entre os dendrogramas e otimização de Tocher. As análises mostraram que o coeficiente de Russel e Rao foi divergente em relação aos demais e seu uso não é recomendável. Entre os parâmetros usados para avaliar a qualidade de informação de cada coeficiente, apenas o índice de consenso estabeleceu diferenças e os classificou em dois grupos: aquele em que a ausência simultânea é considerada e aquele em que ela é desconsiderada. Considerando-se a presença de apenas dois alelos microssatélites por loco e os maiores índices de consenso, os coeficientes de Coincidência Simples, Hamman e Rogers & Tanimoto devem ser preferidos, quando em conjuntos de genótipos de algodoeiro melhorados e com baixa diversidade

Caracterização genética de algodoeiro verdão.

Esta publicação teve como objetivo documentar características genéticas de algodoeiro verdão armazenados em banco de germoplasma da Embrapa e de genótipos com línter verde coletados ainda sem classificação, para facilitar seu uso efetivo como recurso genético.bitstream/item/202686/1/DOC275AlgodoeiroVerdao.pd

Marcadores moleculares polimórficos entre algodoeiros mocós e herbáceos.

Programas de melhoramento genético de algodão vêm sendo utilizados para desenvolver cultivares do gênero Gossypieae que atendam aos produtores e à indústria têxtil. Este trabalho visou avaliar marcadores moleculares, analisando uma população F2 segregante do cruzamento entre o algodoeiro herbáceo Codetec 401 e o algodoeiro mocó CNPA 6M. Sementes de 93 indivíduos F2 foram plantadas e seu DNA foi extraído. Para a amplificação dos fragmentos de DNA foram utilizados 62 pares de primers microssatélites (SSR) e RAPD que foram, posteriormente e respectivamente, separados por eletroforese em gel de poliacrilamida e agarose. Vinte e seis marcadores microssatélites (42%) foram polimórficos. Um total de 325 marcadores RAPD foram obtidos, com uma média de 9,8 marcadores por primer. Foram polimórficos 101 (31%) marcadores RAPD. O cruzamento entre algodoeiros mocó e herbáceo possui uma quantidade razoável de marcadores segregantes, portanto pode ser usado para mapeamento molecular. Além disso, por sua relativa proximidade ao algodoeiro herbáceo, pode ser um bom candidato ao uso em programas de premelhoramento, e os marcadores então usados em seleção genômica

Traditional fabric and medicinal use are the leading factors of in situ conservation of Gossypium barbadense in Central Brazil.

ABSTRACT - The Sea Island cotton Gossypium barbadense has been present in Brazil for at least 750 years. Cultivated worldwide, the fibres present superior quality; therefore, farmers’ seeds are an important genetic resource and in situ maintenance is essential to complement ex situ conservation. To understand how the species has been conserved in situ and investigate the socio-economic aspects which may ensure the continuity of its conservation, we conducted expeditions to three different municipalities situated in Brazilian Cerrado, Goiás state, Brazil—one of which is a traditional community, the quilombo Kalunga community—interviewed plant maintainers and compared our results with data from the Brazilian Institute of Geography and Statistics. There is hand spinning and hand weaving for home uses and commercialization within and outside the traditional community, which contribute to the continuity of the in situ conservation of Gossypium barbadense. Medicinal use is more determinant than hand weaving in deciding to keep plants and seeds. Fabric handicraft is a predominantly female, low-income activity. Interviews with cotton hand spinners indicated that in situ maintenance may be favoured by access to weaving looms and improvement in the marketing and sale of their products. Policies valuing handicrafts can ensure the continuity of biodiversity and disseminate and vivify traditions in addition to maintaining an income for the artisans

Association of Genetic Variants With Primary Open-Angle Glaucoma Among Individuals With African Ancestry.

Importance:Primary open-angle glaucoma presents with increased prevalence and a higher degree of clinical severity in populations of African ancestry compared with European or Asian ancestry. Despite this, individuals of African ancestry remain understudied in genomic research for blinding disorders. Objectives:To perform a genome-wide association study (GWAS) of African ancestry populations and evaluate potential mechanisms of pathogenesis for loci associated with primary open-angle glaucoma. Design, Settings, and Participants:A 2-stage GWAS with a discovery data set of 2320 individuals with primary open-angle glaucoma and 2121 control individuals without primary open-angle glaucoma. The validation stage included an additional 6937 affected individuals and 14 917 unaffected individuals using multicenter clinic- and population-based participant recruitment approaches. Study participants were recruited from Ghana, Nigeria, South Africa, the United States, Tanzania, Britain, Cameroon, Saudi Arabia, Brazil, the Democratic Republic of the Congo, Morocco, Peru, and Mali from 2003 to 2018. Individuals with primary open-angle glaucoma had open iridocorneal angles and displayed glaucomatous optic neuropathy with visual field defects. Elevated intraocular pressure was not included in the case definition. Control individuals had no elevated intraocular pressure and no signs of glaucoma. Exposures:Genetic variants associated with primary open-angle glaucoma. Main Outcomes and Measures:Presence of primary open-angle glaucoma. Genome-wide significance was defined as P < 5 × 10-8 in the discovery stage and in the meta-analysis of combined discovery and validation data. Results:A total of 2320 individuals with primary open-angle glaucoma (mean [interquartile range] age, 64.6 [56-74] years; 1055 [45.5%] women) and 2121 individuals without primary open-angle glaucoma (mean [interquartile range] age, 63.4 [55-71] years; 1025 [48.3%] women) were included in the discovery GWAS. The GWAS discovery meta-analysis demonstrated association of variants at amyloid-β A4 precursor protein-binding family B member 2 (APBB2; chromosome 4, rs59892895T>C) with primary open-angle glaucoma (odds ratio [OR], 1.32 [95% CI, 1.20-1.46]; P = 2 × 10-8). The association was validated in an analysis of an additional 6937 affected individuals and 14 917 unaffected individuals (OR, 1.15 [95% CI, 1.09-1.21]; P < .001). Each copy of the rs59892895*C risk allele was associated with increased risk of primary open-angle glaucoma when all data were included in a meta-analysis (OR, 1.19 [95% CI, 1.14-1.25]; P = 4 × 10-13). The rs59892895*C risk allele was present at appreciable frequency only in African ancestry populations. In contrast, the rs59892895*C risk allele had a frequency of less than 0.1% in individuals of European or Asian ancestry. Conclusions and Relevance:In this genome-wide association study, variants at the APBB2 locus demonstrated differential association with primary open-angle glaucoma by ancestry. If validated in additional populations this finding may have implications for risk assessment and therapeutic strategies