Classification of the coefficients of variation for sugarcane crops

The objective of this paper was to evaluate the range of classification of variation coefficient in experiments with sugarcane. For this study, some of the variables that are mostly used by researchers of the culture were considered. The data was obtained after extensive bibliographical revision from scientific journals, data base from the improvement program of sugarcane from the Federal University of Viçosa, master dissertations, doctorate thesis and technical reports. Classification ranges were proposed according to the Costa method, in which is based the use of a median and pseudo-sigma. The variables tons of stalks per hectare and tons of pol per hectare presented the highest ranges of the classification of the coefficients of variation, while the variable percentage of sucrose presented the lowest range. All of the variables presented specific ranges of classification, showing the need to consider, in the classification of coefficients of variation, the nature of the variable being studied.O objetivo deste trabalho foi avaliar a faixa de classificação do coeficiente de variação em experimentos com cana de açúcar. Para este estudo, foram consideradas algumas das variáveis mais utilizadas por pesquisadores da cultura. Os dados foram obtidos de extensa revisão bibliográfica em revistas científicas, banco de dados do programa de melhoramento de cana de açúcar da Universidade Federal de Viçosa, dissertações de mestrado, teses de doutorado e relatórios técnicos. Foram propostas faixas de classificação segundo o método de Costa, o qual se baseia no uso da mediana e do pseudo-sigma. As variáveis toneladas de colmos e toneladas de sacarose por hectare apresentaram as maiores faixas de classificação dos coeficientes de variação, enquanto que a variável porcentagem de sacarose apresentou a menor faixa dos coeficientes de classificação. Todas as variáveis apresentaram faixas de classificação específica, evidenciando a necessidade de se considerar, na classificação dos coeficientes de variação, a natureza da variável estudada

Efficiency of selection indices to identify superior clones of potato

A maioria dos melhoristas, analíticos ou intuitivos, praticam seleção para múltiplas características no desenvolvimento de cultivares. O objetivo deste trabalho foi avaliar métodos de seleção na identificação de clones de batata (Solanum tuberosum L.) produtivos, com elevados percentuais de tubérculos graúdos, boa aparência geral de tubérculos e alta densidade relativa de tubérculos. Para tanto, foram avaliados em Lavras, MG, 817 clones em delineamento de blocos aumentados. De acordo com os valores mínimos pré-estabelecidos para seleção, empregando-se tanto o método dos níveis independentes de eliminação como o índice de Elston (1963), foi possível selecionar clones dentro dos limites almejados. Entretanto, a população inicial foi drasticamente reduzida podendo ter excluído genótipos com adaptação mais ampla. Pela utilização de alguns índices de seleção, foi possível obter uma melhor distribuição percentual dos ganhos para os caracteres sob seleção em relação à seleção direta para os mesmos. Sugere-se para uso em programas de melhoramento de batata os índices de seleção propostos por Smith (1936), Hazel (1943), Williams (1962), Pesek & Baker (1969) e Mulamba & Mock (1978), empregando-se nos dois primeiros o desvio padrão genético ou sua recíproca como peso econômico.Most breeders, either analytically or intuitively, practice multiple trait selection when developing cultivars. The objective of this paper was to evaluate the selection methods used to identify high yielding potato (Solanum tuberosum L.) clones, with high percentage of large tubers, good general tuber appearance and superior specific gravity. In Lavras, State of Minas Gerais, Brazil, 817 experimental clones were evaluated by means of augmented block designs. Using either independent culling level or Elston (1963) indices allowed selection of clones with defined limits, but the population size was severely reduced possibly excluding genotypes with wide adaptation. Selection indices improved the distribution of genetic gains of important characters compared with direct selection for the same characters. Indices of Smith (1936), Hazel (1943), Williams (1962), Pesek & Baker (1969) and Mulamba & Mock (1978) were indicated to be used in potato breeding programs making use of the genetic standard deviations and or their reciprocals as economic weights

Análise dialélica parcial entre cultivares de batata nacionais e introduzidas

With the objective of evaluating the genetic potential and combining ability, seven introduced potato (Solanum tuberosum L.) cultivars were crossed by partial diallel scheme, with six national potato cultivars. The trials were conducted in Madre de Deus and Lavras, both in Minas Gerais State, Brazil, employing randomized complete block and augmented block design, respectively. The 57 treatments tested in Madre de Deus consisted of 13 parents, 42 clonal families and two checks, cultivars Achat and Baraka. In Lavras, 817 experimental clones were evaluated along with 13 parents and two common treatments, Achat and Baraka. General combining ability (GCA) was the principal component of variation among families for total and marketable tuber yield per plant, mean of tuber number per plant and specific gravity. For the other traits the contributions of GCA and specific combining abilities (SCA) were similar. Cultivars Baronesa, Mantiqueira and Monalisa had better stability of GCA for yield characters in both places and the families Baronesa x Monalisa and Mantiqueira x Atlantic had better performance for yield potential and good association of alleles as indicated by high values of SCA.Com o objetivo de avaliar o potencial genético e a capacidade de combinação, sete cultivares de batata (Solanum tuberosum L.) introduzidas foram cruzadas em esquema dialélico parcial com seis cultivares nacionais. Os ensaios foram instalados em Madre de Deus e Lavras, ambas em Minas Gerais, em delineamento de blocos casualizados e blocos aumentados, respectivamente. Em Madre de Deus utilizaram-se 57 tratamentos: 13 pais, 42 populações híbridas e duas testemunhas, Achat e Baraka; em Lavras, 817 clones, 13 pais e as cultivares Achat e Baraka. A capacidade geral de combinação (CGC) foi a causa da variação predominante entre famílias para produção total por planta, número de tubérculos médios por planta e densidade de tubérculos. Para as demais variáveis as contribuições relativas das causas de variação, CGC e capacidade específica de combinação (CEC) foram semelhantes. As cultivares Baronesa, Monalisa e Mantiqueira destacaram-se pela estabilidade da CGC para caracteres de produção nos dois locais, e as famílias Baronesa x Monalisa e Mantiqueira x Atlantic, pelo elevado potencial produtivo e boa associação alélica como reflexo da CEC, sendo esta última família promissora também para seleção de clones com maior densidade relativa de tubérculos

Seleção via BLUP individual simulado baseado nos efeitos genotípicos de famílias em cana-de-açúcar

The objective of this work was to propose a new selection strategy for the initial stages of sugarcane improvement, based on the methodology 'simulated individual BLUP (BLUPIS)', which promotes a dynamic allocation of individuals selected in each full-sib family, using BLUP as a base for both the genotypic effects of the referred families and plot effects. The method proposed applies to single full-sib families or those obtained from unbalanced or balanced diallel crosses, half-sib families and self-pollinated families. BLUPIS indicates the number of individuals to be selected within each family, the total number of clones to be advanced, and the number of families to contribute with selected individuals. Correlation between BLUPIS and true BLUP was 0.96, by method validation. Additionally, BLUPIS allows the identification of which replication contains the best individuals of each family.O objetivo deste trabalho foi propor uma nova estratégia de seleção nos estádios iniciais do desenvolvimento da cana-de-açúcar, utilizando-se a metodologia BLUP individual simulado (BLUPIS) que promove a distribuição dinâmica dos indivíduos selecionados em cada família de irmãos-completos, usando BLUP como base para os efeitos genotípicos da família e para os efeitos de parcela. O método proposto se aplica a famílias de irmãos-completos simples ou obtidas de cruzamentos dialélicos desbalanceados ou balanceados, famílias de meios-irmãos e famílias de autofecundação. Por meio do BLUPIS, indica-se o número de indivíduos a ser selecionado por família, o número total de clones a ser avançado e o número de famílias a contribuir com indivíduos selecionados. A validação do método propiciou uma correlação de 0,96 entre o BLUPIS e o BLUP verdadeiro. Além disso, o BLUPIS permite identificar em qual repetição encontram-se os melhores indivíduos de cada família

Designs and model effects definitions in the initial stage of a plant breeding program

O objetivo deste trabalho foi comparar a eficiência relativa da seleção inicial e a estimação de parâmetros genéticos, empregando delineamento em blocos aumentados (DBA), delineamento em blocos aumentados com duas repetições (DBAD) e grupo de experimentos em blocos casualizados com tratamentos comuns (EBCTC), por meio de simulações, considerando o modelo com efeitos fixos e o modelo misto, com tratamentos regulares aleatórios. Trabalhou-se com oito diferentes condições (cenários) com 600 simulações de cada. Foram avaliadas a porcentagem média de coincidência, a estimativa da correlação de Pearson entre as médias ajustadas para o modelo de efeitos fixos e a estimativa da herdabilidade para o modelo misto. O DBAD e o EBCTC foram bastante similares em suas comparações e pouco melhores que o DBA. Considerando os estágios iniciais de seleção em um programa de melhoramento de plantas, o DBA é uma alternativa para seleção dos genótipos superiores, embora nenhum dos delineamentos tenha sido eficaz em estimar herdabilidade em todos os diferentes cenários avaliados.The objective of this work was to compare the relative efficiency of initial selection and genetic parameter estimation, using augmented blocks design (ABD), augmented blocks twice replicated design (DABD) and group of randomised block design experiments with common treatments (ERBCT), by simulations, considering fixed effect model and mixed model with regular treatment effects as random. For the simulations, eight different conditions (scenarios) were considered. From the 600 simulations in each scenario, the mean percentage selection coincidence, the Pearsons´s correlation estimates between adjusted means for the fixed effects model, and the heritability estimates for the mixed model were evaluated. DABD and ERBCT were very similar in their comparisons and slightly superior to ABD. Considering the initial stages of selection in a plant breeding program, ABD is a good alternative for selecting superior genotypes, although none of the designs had been effective to estimate heritability in all the different scenarios evaluated

Sugarcane Production Systems in Small Rural Properties

Sugarcane grown in small rural properties of the Zona da Mata region, located in the southeast of the state of Minas Gerais (MG), is generally intended for animal feed and the production of rapadura, brown sugar, cachaça, and ethanol. This chapter focuses on the authors’ experience on technologies recommended to small farmers for the implantation and management of sugarcane plantations. The following issues are addressed and discussed: planning and preparation of the sugarcane plantation; soil sampling and soil fertility assessment; application of lime and gypsum; setting up seedling nurseries; green fertilization in the areas of planting and renewal of sugarcane plantation; soil preparation, planting and chemical fertilization of plant-cane; weed and pest control; chemical fertilization of ratoon; assessment of sugarcane nutritional status; organic fertilization with crop residues and agroindustrial residues; mineralization of sugarcane straw; assessment of broth quality and sugar production; and renewal of the sugarcane plantation

Análise de trilha usando valores fenotípicos e genotípicos para componentes do rendimento na seleção de famílias de cana-de-açúcar

O objetivo deste trabalho foi investigar o uso de valores fenotípicos e genotípicos na análise de trilha envolvendo características agronômicas em cana-de-açúcar, nos estágios de cana-planta e cana-soca. Sob esses dois enfoques, foram computados os efeitos diretos e indiretos dos componentes de produção – número de colmos por parcela, diâmetro médio de colmos e altura média de colmos – sobre a produtividade de colmos por hectare. Para garantir uma melhor consistência nos resultados, os dados foram obtidos em dois experimentos, no delineamento em blocos casualizados com cinco repetições. Os experimentos foram alocados no Centro de Experimentação em cana-de-açúcar da UFV, em Oratórios, MG, Brasil. Cada experimento foi constituído de 22 famílias de irmãos completos de cana-de-açúcar. Os coeficientes de determinação foram elevados em todas as análises de trilha, indicando que os componentes avaliados explicam grande parte da variação existente na produção de colmos. Praticamente não houve diferença de interpretações e conclusões entre as análises baseadas nas matrizes de correlações fenotípicas ou genotípicas. Pela análise dos efeitos diretos fenotípicos e genotípicos, o número de colmos foi o caractere que melhor se correlacionou com toneladas de cana por hectare, em ambos os experimentos e estágios. Isso demonstra a possibilidade de obtenção de ganhos significativos por meio da seleção indireta para toneladas de cana por hectare via número de colmos. Houve variação em relação às estimativas de correlação na comparação entre os experimentos, o que provavelmente se deve à origem diferenciada das famílias avaliadas em cada experimento.The aim of this study was to investigate the use of phenotypic and genotypic values in the path analysis involving agronomic characteristics in sugarcane at the stages of plant cane and ratoon cane. Under these two approaches it was calculated the direct and indirect effects of yield components - number of stalks per plot, diameter of stalk and average height of stalk - on sugarcane yield per hectare. To ensure a better consistency of results, data were obtained in two experiments in randomized blocks with five replications. The experiments were carried out at the Center of Sugarcane Experimentation of the UFV, Oratórios, MG, Brazil. Each experiment consisted of 22 full-sib families of sugarcane. The coefficients of determination were high in all path analysis, indicating that the evaluated components explain most of the variation in straw yield. Practically there was no difference in interpretations and conclusions from the analysis based on arrays of genotypic or phenotypic correlations. From the analysis of the direct phenotypic and genotypic effects, number of stalks was the variable that best correlated with sugarcane yield per hectare in both experiments and harvest stages, demonstrating the possibility of obtaining significant gains by means of indirect selection of sugarcane yield per hectare using number of stalks. There was variation in the estimates of correlation in the comparison between experiments, probably due to different origin of the families surveyed in each experiment

Produtividade e qualidade da matéria prima de cultivares de cana-de-açúcar submetida à aplicação de herbicidas

Herbicides may cause toxicity to the crop and also negative effects on yield characteristics and industrial quality of sugarcane. This study evaluated the effects ametryn, trifloxysulfuron-sodium, ametryn + trifloxysulfuron-sodium and sulfentrazone herbicides over quality and stalk yield of RB867515, SP801816, SP803280, RB937570 and RB925211 cultivars. The experiment was conducted at the Federal University of Viçosa, Viçosa County, Minas Gerais State. A distinct behavior was observed for the cultivars in the presence of herbicides, both for quality as for the stalk yield. The quality showed greater variability among cultivars than among herbicide treatments that act directly on stalk production and indirectly in sugar production, being ametryn and sulfentrazone herbicides the ones that caused higher negative interference. SP803280 cultivar was the genotype with the lowest susceptibility to herbicides.Os herbicidas podem causar intoxicação à cultura e também efeitos negativos nas características produtivas e na qualidade industrial da cana-de-açúcar. Neste trabalho avaliou-se os efeitos dos herbicidas ametryn, trifloxysulfuron-sodium, ametryn + trifloxysulfuron-sodium e sulfentrazone sobre a qualidade e produtividade de colmos das cultivares RB867515, SP801816, SP803280, RB937570 e RB925211. O experimento foi conduzido na área experimental da Universidade Federal de Viçosa, Viçosa-MG. Observou-se comportamento distinto das cultivares na presença dos herbicidas, tanto para a qualidade quanto para a produtividade de colmos. A qualidade apresentou maior variabilidade entre as cultivares do que entre os tratamentos com herbicidas, esses que atuam diretamente na produção de colmos e indiretamente na produção de açúcar, sendo que o ametryn e o sulfentrazone causaram maiores interferências negativas. A cultivar SP803280 foi a que apresentou a menor suscetibilidade aos herbicidas

EFICIÊNCIA DE ÍNDICES DE SELEÇÃO UTILIZANDO A METODOLOGIA REML/BLUP NO MELHORAMENTO DA CANA-DE-AÇÚCAR

This study aimed to compare the efficiency of three selection indexes constructed from the estimated variance components and predicted genotypic values by the REML/BLUP procedure, on three first clonal populations in sugarcane. The populations were evaluated at the experimental area of the Sugarcane Research and Breeding Center – CECA of the Federal University of Viçosa, using the augmented block design. The traits number of stems per meter (NSM), average stem mass (ASW), total soluble solids content (BRIX) and  production of BRIX per hectare (TBH) were evaluated in the cane plant and sugar cane ratoon-cycle in the A and B populations and the cane plant in the C population. The first three traits were used to construct the following selection indexes: classic index, multiplicative index and the index based on sum of ranks. The genetic-statistics analyses were carried by the GENES and Selegen - REM/BLUP programs. The multiplicative index showed higher selection efficiency as it presented larger coefficient of coincidence of genotypes selected with the selection strategy for TBH, larger direct gains from selection and larger indirect gains for TBH. However, the rate of selection efficiency of a certain index should be considered as an intrinsic characteristic of the studied population.Neste estudo objetivou-se comparar a eficiência de três índices de seleção construídos a partir de componentes de variância estimados e valores genotípicos preditos pela metodologia REML/BLUP, em três populações (A, B e C) de primeira geração clonal de cana-de-açúcar. As populações foram avaliadas na área experimental do Centro de Pesquisa e Melhoramento da Cana-de-açúcar – CECA da Universidade Federal de Viçosa, utilizando o delineamento experimental em blocos aumentados. Os caracteres número de colmos por metro (NCM), massa média do colmo (MMC), teor de sólidos solúveis totais (BRIX) e produção de BRIX por hectare (TBH) foram avaliados nos ciclos de cana-planta e de cana-soca nas populações A e B e apenas no ciclo de cana-planta na população C. Os três primeiros caracteres foram utilizados para construir os seguintes índices de seleção: clássico, multiplicativo e com base na soma de postos.  As análises genético-estatísticas foram realizadas pelos programas GENES e Selegen - REM/BLUP. O índice multiplicativo foi o que mostrou maior eficiência de seleção, uma vez que, apresentou maior coeficiente de coincidência de genótipos selecionados com a estratégia de seleção para o caráter TBH, maiores ganhos diretos de seleção e maiores ganhos indiretos para TBH. No entanto, a eficiência de seleção de determinado índice deve ser considerada como característica inerente à população estudada

Prevalência do subtipo molecular triplo negativo em pacientes com Câncer de Mama em hospital de referência da Amazônia / Prevalence of triple negative molecular subtype in patients with Breast Cancer in a reference hospital in the Amazônia

Introdução: O subtipo triplo negativo é conhecido por apresentar um comportamento agressivo e se refere a tumores que não expressam receptores de estrogênio, progesterona e HER2. Metodologia: É um estudo epidemiológico observacional, transversal e retrospectivo que abrange o período de 2010 a 2014. Foram analisados 1208 prontuários de pacientes com câncer de mama primário dispensados pelo Laboratório de Patologia da FCECON. A tabulação dos dados foi feita através do Microsoft® Office Excel 2013 e a análise foi conduzida através do software estatístico R versão 3.5.3 (R Core Team). Objetivos: Avaliar a frequência do subtipo triplo negativo e correlacionar com a idade, tipo histológico, estadiamento e tratamento inicial das pacientes com câncer de mama da FCECON-AM. Resultados: Dos prontuários analisados, 147 (12,2%) das mulheres possuiam subtipo triplo negativo, a idade das pacientes variou de 33 a 85 anos, com idade média de 53,6 ± 11,9 anos, mediana igual a 52 e a maioria das pacientes eram procedentes de Manaus (60%). No que concerne ao tipo histológico, o ductal foi o mais frequente(86,4%); em relação ao estadiamento clínico, os estádios IIA e IIIB foram os mais frequentes, com 25,9% e 27,2% respectivamente; sobre a abordagem terapêutica inicial, a mastectomia esteve presente em 57,8% dos casos. Conclusão: Conclui-se que a faixa etária de 41 a 48 anos foi a que mais apresentou o subtipo triplo negativo (23,8%). Além disso, o tratamento inicial mais frequente foi a mastectomia