Distribution of the potassium concentration in soil with lysimeters cultivated with peanut

A aplicação de fertilizantes na agricultura pode provocar uma dinâmica de solutos no solo abaixo da zona radicular, podendo, além de provocar prejuízos econômicos, contaminar águas subterrâneas. O presente trabalho teve como objetivo acompanhar o processo de deslocamento do íon potássio (K+) em lisímetros preenchidos com solo de textura arenosa e cultivado com amendoim (Arachis hypogaea L.), sob diferentes condições de atenuação da densidade de fluxo radiante, como a utilização de filmes plásticos com diferentes espessuras (100 e 150 micras). O deslocamento do íon potássio (K+) foi monitorado por extratores de solução instalados em diferentes profundidades (15 e 25 cm), e o manejo da fertirrigação foi realizado com a utilização de tensiômetros. Concluiu-se que a baixa radiação solar incidente nos dois ambientes com coberturas plásticas afetou negativamente a produtividade do amendoim; o período em que o amendoim demanda maior quantidade de potássio ocorre dos 30 aos 55 dias após a semeadura; as plantas de amendoim não apresentaram deficiência nutricional com menor lixiviação de K+ para as camadas mais profundas do solo; nos lisímetros com cobertura plástica de 100 e 150 micras, ocorreu maior concentração de K+ na superfície do solo.The application of fertilizers in agriculture produce some solute displacement below the root zone and this situation has provoked great impacts, besides the economic damages, causing groundwater contamination. The present work has as the objective of monitoring the displacement process of the potassium (K+) in lysimeters filled with soil, sandy texture and cultivated with peanuts (Arachis hypogaea L.) under different conditions of reducing solar radiation by using plastic films with different thickness (100 and 150 µ). The potassium displacement was monitored by soil solution extractors installed in different depths (15 and 25 cm) and the fertigation management was accomplished by tensiometers. It was concluded that low incident solar radiation in the two environments with plastic coverings negatively affected peanut's yield; the period that the peanut demands larger amount of potassium happens from 30 to 55 days after sowing; peanut plants did not present nutritional deficiency with a smaller leaching of K+ for the deepest layers of soil; in the lysimeters with plastic covering of 100 and 150 micras occurred a larger concentration of K+ in the soil surface.CNP

Quantitative real-time RT-PCR and chromogenic in situ hybridization: precise methods to detect HER-2 status in breast carcinoma

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p><it>HER-2 </it>gene testing has become an integral part of breast cancer patient diagnosis. The most commonly used assay in the clinical setting for evaluating HER-2 status is immunohistochemistry (IHC) and fluorescence <it>in situ </it>hybridization (FISH). These procedures permit correlation between <it>HER-2 </it>expression and morphological features. However, FISH signals are labile and fade over time, making post-revision of the tumor difficult. CISH (chromogenic <it>in situ </it>hybridization) is an alternative procedure, with certain advantages, although still limited as a diagnostic tool in breast carcinomas.</p> <p>Methods</p> <p>To elucidate the molecular profile of HER-2 status, mRNA and protein expression in 75 invasive breast carcinomas were analyzed by real time quantitative RT-PCR (qRT-PCR) and IHC, respectively. Amplifications were evaluated in 43 of these cases by CISH and in 11 by FISH.</p> <p>Results</p> <p>The concordance rate between IHC and qRT-PCR results was 78.9%, and 94.6% for qRT-PCR and CISH. Intratumoral heterogeneity of <it>HER-2 </it>status was identified in three cases by CISH. The results of the three procedures were compared and showed a concordance rate of 83.8%; higher discordances were observed in 0 or 1+ immunostaining cases, which showed high-level amplification (15.4%) and <it>HER-2 </it>transcript overexpression (20%). Moreover, 2+ immunostaining cases presented nonamplified status (50%) by CISH and <it>HER-2 </it>downexpression (38.5%) by qRT-PCR. In general, concordance occurred between qRT-PCR and CISH results. A high concordance was observed between CISH/qRT-PCR and FISH. Comparisons with clinicopathological data revealed a significant association between <it>HER-2 </it>downexpression and the involvement of less than four lymph nodes (<it>P </it>= 0.0350).</p> <p>Conclusion</p> <p>Based on these findings, qRT-PCR was more precise and reproducible than IHC. Furthermore, CISH was revealed as an alternative and useful procedure for investigating amplifications involving the <it>HER-2 </it>gene.</p

Research of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis in ultrapasteurized milk for human consumption

Currently, Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis is linked to Crohn's disease in humans as a potential etiologic agent. One route of infection to be considered is by the ingestion of contaminated milk. The objective of the present work was to evaluate Map's presence in commercial homogenized and ultrapasteurized milk for human consumption in supermarkets in the city of Río Cuarto, Córdoba, Argentina. Ninety eight packages of 1 liter of entire, homogenized and ultrapasteurized milk of six commercial brands were sampled. After decontamination by the modified Cornell's method, the samples were cultured in Herrol's medium with and without micobactin. All samples were negative. Possible causes of this result such as the origin of the milk and its probable very low amount of micobacterias, the efficiency of the pasteurization, the processing in the laboratory, among others are here discussed.Fil: Magnano, G.G. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal. Córdoba, ArgentinaFil: Macías, A.F. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal. Córdoba, ArgentinaFil: Perez Zavala, V. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal. Córdoba, ArgentinaFil: Schneider, M.O. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal. Córdoba, ArgentinaFil: Bérgamo, E.G. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal. Córdoba, ArgentinaFil: Giraudo, J.A. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal. Córdoba, ArgentinaFil: Sticotti, E. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal. Córdoba, ArgentinaFil: Mació, M. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal. Córdoba, ArgentinaFil: Bernardelli, A. SENASA. Dirección General de Laboratorio y Control Técnico (DILAB). Laboratorio de Micobacterias. Buenos Aires, ArgentinaActualmente se vincula al Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis como potencial agente etiológico implicado en la enfermedad de Crohn en humanos. Una de las vías de ingreso sería a través de la ingestión de leche contaminada. El objetivo fue evaluar la presencia de Map en leche comercial homogeneizada y ultrapasteurizada para consumo humano en supermercados de la ciudad de Río Cuarto, Córdoba, Argentina. Se muestrearon 98 envases de 1 litro de leche entera homogeneizada y ultrapasteurizada de seis marcas comerciales. Previa descontaminación con el método de Cornell modificado, se sembraron en medio de cultivo Herrold con y sin micobactina. Todas las muestras fueron negativas. Como posibles causas de estos resultados se discuten: el origen de la leche y su probable muy baja carga de micobacterias, la eficacia de la pasteurización, el proceso en el laboratorio, entre otras

Comparación de técnicas diagnósticas para brucella en caprinos

La brucelosis caprina es una enfermedad infecto-contagiosa crónica producida por Brucellamelitensis, esta bacteria encuentra en el caprinoa su huésped natural, aunque tiene la capacidad de infectar gran cantidad de especies animales y al humano, constituyendo una de las zoonosis de mayor importancia en el mundo. En el caso de los pequeños rumiantes, afecta a los sexualmente maduros, con signos clínicos como aborto, retención de placenta y nacimiento de crías débiles,con excreción de los microorganismos a través de las descargas uterinas y por leche; en los machos produce orquitis y epididimitis. La transmisiónal hombre se produce principalmente por contacto directo a través de las mucosas con productos del aborto o por consumo de productos lácteos o sus derivados contaminados y no pasteurizados, esta zoonosis se torna relevante en los sistemas de producción de subsistencia. El objetivo de este trabajo fue estimar la concordancia entre técnicas serológicas para la detección de brucelosis en caprinos. Se procesaron 75 sueros de cabras enviadas a faena por diagnostico presuntivo de brucelosis provenientes de un hato con antecedentes de aislamiento y tipificación de B. Melitensis biovar 1. Las muestras se procesaron en ellaboratorio de Patología Animal de la FAV-UNRC. Se utilizaron técnicas serológicas tamiz BPA y RBy como confirmatorias SAT/2-ME y FPA. Los resultados obtenidos de las pruebas tamiz fueron analizados para evaluar concordancia mediante la estimación del índice Kappa de Cohen utilizando el software epidat 3.1; de la misma manera se evaluaron los resultados de las pruebas confirmatorias.Del total de sueros analizados, 66 y61 resultaron positivos a las técnicas de BPA yRB, respectivamente. De las muestras resultantes positivas a BPA, se obtuvieron 58 positivas tanto para SAT/2-ME como para FPA, mientras que, de las muestras positivas a RB, 57 fueron confirmadas por SAT/2-ME y 58 por FPA. La concordancia entre las pruebas BPA y RB resultó enun Kappa de 0,745 (IC 95% 0,53-0,95), para las pruebas complementarias fue de 0,858 (IC 95%0,82-1,0) y 0,849 (IC 95% 0.80-1,0) según las muestras fueran del conjunto de positivas a BPAo RB, respectivamente. La concordancia de los resultados de las pruebas tamiz fue buena, mientras que para las pruebas complementarias fue superior, permitiendo clasificarla como muy buena según lo propuesto por Landis y Koch en 1977. En base a estos resultados, las pruebas BPA y RB son igualmente elegibles como pruebas tamizpara el diagnóstico de B. Melitensis, y son semejantes en operatividad y valor económico, sin embargo,BPA posee mayor sensibilidad (87%) que RB (78,9%), siendo similares en especificidad.SAT/2-ME y FPA son igualmente elegibles comopruebas complementarias respecto de la concordancia observada, pero FPA tiene respecto deSAT/2-ME mejor sensibilidad (96,6% vs 81,5%) y especificidad (99,1% vs 97,7%). SAT y 2-ME son técnicas más laboriosas, con mayor riesgo por la toxicidad y efectos cancerígenos que poseen, pero de menor costo. Si bien, FPA es más costosa y requiere de un equipamiento especializado, es menos compleja y los resultados se obtienen en menor tiempo.Fil: Alvarado, Wanda. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Santa Fe. Instituto de Investigacion de la Cadena Lactea. - Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Santa Fe. Estacion Experimental Agropecuaria Rafaela. Instituto de Investigacion de la Cadena Lactea.; ArgentinaFil: Vissio, Claudina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Instituto para el Desarrollo Agroindustrial y de la Salud. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto para el Desarrollo Agroindustrial y de la Salud; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal; ArgentinaFil: Mació, Mauro Nahuel. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal; ArgentinaFil: Bérgamo, E.. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal; ArgentinaFil: Moisso, N.. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal; ArgentinaFil: Aparicio, L.. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal; ArgentinaFil: Salinas, A.. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal; ArgentinaFil: Giraudo, Jose. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal; ArgentinaFil: Sticotti, Erika. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Departamento de Patología Animal; ArgentinaXI Jornadas de Jóvenes InvestigadoresBuenos AiresArgentinaUniversidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinaria

Circulation and salt intrusion in the Piacaguera Channel, Santos (SP)

Analysis of thermohaline properties and currents sampled at an anchor station in the Piaçaguera Channel (Santos Estuary) in the austral winter was made in terms of tidal (neap and spring tidal cycles) and non-tidal conditions, with the objective to characterize the stratification, circulation and salt transport due to the fortnightly tidal modulation. Classical methods of observational data analysis of hourly and nearly synoptic observations and analytical simulations of nearly steady-state salinity and longitudinal velocity profiles were used. During the neap tidal cycle the flood (v<0) and ebb (v>0) velocities varied in the range of -0.20 m/s to 0.30 m/s associated with a small salinity variation from surface to bottom (26.4 psu to 30.7 psu). In the spring tidal cycle the velocities increased and varied in the range of -0.40 m/s to 0.45 m/s, but the salinity stratification remained almost unaltered. The steady-state salinity and velocity profiles simulated with an analytical model presented good agreement (Skill near 1.0), in comparison with the observational profiles. During the transitional fortnightly tidal modulation period there was no changes in the channel classification (type 2a - partially mixed and weakly stratified), because the potential energy rate was to low to enhance the halocline erosion. These results, associated with the high water column vertical stability (RiL >20) and the low estuarine Richardson number (RiE=1.6), lead to the conclusions: i) the driving mechanism for the estuary circulation and mixing was mainly balanced by the fresh water discharge and the tidal forcing associated with the baroclinic component of the gradient pressure force; ii) there was no changes in the thermohaline and circulation characteristics due to the forthnigtly tidal modulation; and iii) the nearly steady-state of the vertical salinity and velocity profiles were well simulated with a theoretical classical analytical model