The Isl1/Ldb1 complex orchestrates heart-specific chromatin organization and transcriptional regulation

Cardiac stem/progenitor cells hold great potential for regenerative therapies however the mechanisms regulating their expansion and differentiation remain insufficiently defined. Here we show that the multi-adaptor protein Ldb1 is a central regulator of cardiac progenitor cell differentiation and second heart field (SHF) development. Mechanistically, we demonstrate that Ldb1 binds to the key regulator of SHF progenitors Isl1 and protects it from proteasomal degradation. Furthermore, the Isl1/Ldb1 complex promotes long-range promoter-enhancer interactions at the loci of the core cardiac transcription factors Mef2c and Hand2. Chromosome conformation capture followed by sequencing identified surprisingly specific, Ldb1-mediated interactions of the Isl1/Ldb1 responsive Mef2c anterior heart field enhancer with genes which play key roles in cardiac progenitor cell function and cardiovascular development. Importantly, the expression of these genes was downregulated upon Ldb1 depletion and Isl1/Ldb1 haplodeficiency. In conclusion, the Isl1/Ldb1 complex orchestrates a network for heart-specific transcriptional regulation and coordination in three-dimensional space during cardiogenesis

Γενετικά αίτια των παθήσεων του νεφρικού σπειράματος

Εισαγωγή: Μια από τις κυριότερες σπειραματοπάθειες είναι το νεφρωσικό σύνδρομο. Η βλάβη παρατηρείται στo σπείραμα των νεφρώνων, οι οποίοι είναι οι ανατομικές και λειτουργικές μονάδες των νεφρών. Το νεφρωσικό σύνδρομο είναι μια νόσος που χαρακτηρίζεται από μαζική πρωτεϊνουρία και υποαλβουμιναιμία. Το ιδιοπαθές νεφρωσικό σύνδρομο είναι μια υποκατηγορία της νόσου η οποία αποτελεί την πιο κοινή σπειραματική ασθένεια σε παιδιά. Κατηγοριοποιείται με βάση τα ιστολογικά ευρήματα σε εστιακή σπειραματοσκλήρυνση, νόσο ελάχιστων αλλοιώσεων και σε μεμβρανώδη νεφροπάθεια. Περεταίρω, κατηγοριοποιείται επίσης και με βάση την κλινική αντιμετώπιση σε νεφρωσικό σύνδρομο ανθεκτικό στα στεροειδή, εξαρτώμενο στα στεροειδή, ευαίσθητο στα στεροειδή και νεφρωσικό σύνδρομο με συχνές υποτροπές. Οι βασικές παραλλαγές που οδηγούν στην εμφάνιση της νόσου παρατηρούνται σε γονίδια του θυριδωτού διαφράγματος. Σκοπός: Ο σκοπός της διπλωματικής αυτής είναι η διερεύνηση των γενετικών αιτιών των παθήσεων του νεφρικού σπειράματος, λόγω όμως της ευρύτητας του θέματος αυτού κρίθηκε σκόπιμο να διερευνηθούν τα γενετικά αίτια που οδηγούν στην εμφάνιση του νεφρωσικού συνδρόμου σε παιδική ηλικία και να καταγραφούν τα γονίδια και οι παθογόνες γενετικές παραλλαγές που την προκαλούν. Μεθοδολογία: Πηγή υλικού αποτέλεσε η βιβλιογραφική ανασκόπηση επιστημονικών μελετών για την γενετική διερεύνηση των ασθενών με νεφρωσικό σύνδρομο με βάση τις γονιδιακές παραλλαγές και η σύγκριση αποτελεσμάτων. Αποτελέσματα: Τα γενετικά αίτια του νεφρωσικού συνδρόμου οφείλονται κυρίως σε παραλλαγές γονιδίων που σχετίζονται με τη σπειραματική διήθηση όπως το NPHS1, NPHS2, WT1, LAMB2 και PLCE1 και λιγότερο συχνά τα ACTN4 και TRPC6.Οι διαγνωστικοί μέθοδοι που χρησιμοποιούνται γα την ανίχνευση των παραλλαγών αυτών είναι το Sanger Sequencing, Next Generation Sequencing, panel γονιδίων και Whole Exome Sequencing. Συμπεράσματα: Η ταυτοποίηση των παραλλαγών που οφείλονται σε εμφάνιση νεφρωσικού συνδρόμου παρέχει βοήθεια στην κατανόηση της παθοφυσιολογίας της νόσο, στον καθορισμό της ηλικίας έναρξης των συμπτωμάτων, την ανταπόκριση σε θεραπέια και την πορεία της γενετικής διάγνωσης.Backgound: One of the main glomerulopathies than can occur is nephrotic syndrome. Damage occurs in the glomerulus of the nephron, which is the anatomical and functional unit of the kidney. Nephrotic syndrome is a disease characterized by massive proteinuria and hypoalbuminaemia. Idiopathic nephrotic syndrome is a subcategory of the disease, appearing to be the most common glomeruli infection in children. It is categorized based on histological classification to focal segmental glomerulosclerosis, minimal change disease and membranous nephropathy. Furthermore it is also categorized based on clinical classification to steroid resistant, steroid dependent, steroid sensitive and nephrotic syndrome with frequent relapses. The mutations that mainly take place in the appearance of the disease are located in the glomerular slit diaphragm. Aim: The main goal of this dissertation is to investigate the inquiry of the genetic causes that lead to the emergence of diseases of the renal glomerulus, although due to the subject range it was considered appropriate to analyse the genetic causes that lead to nephrotic syndrome in childhood and the registration of the pathogenic genetic mutations that are causing the disease. Methodology: The source of subject matter included literature review from scientific studies including genetic analysis of patients with nephrotic syndrome, based on genetic mutations and result comparison. Results: Genetic causes of nephrotic syndrome are mainly due to mutations in genes which are associated with the glomerular slit diaphragm such as NPHS1, NPHS2, WT1, LMB2 and PLCE1 and less often ACTN4 and TRPC6. The diagnostic methods used for the detection of these mutations are Sanger Sequencing, Next Generation Sequencing, gene panels and Whole Exome Sequencing Conclusion: Identification of the mutations causative of the emergence of nephrotic syndrome is helpful for the understanding of the pathophysiology of the disease, determination of age of onset, response to treatment and the overall course of genetic diagnosis

Single vs replicate Real-Time PCR SARS-CoV-2 testing: Lessons learned for effective pandemic management.

Coronavirus Disease 19 (COVID-19) caused by the SARS-CoV-2 virus remains a global pandemic having a serious impact on national economies and healthcare infrastructure. Accurate infection detection protocols are key to policy guidance and decision making. In this pilot study, we compared single versus replicate PCR testing for effective and accurate SARS-CoV-2 infection detection. One-Step Real-Time RT-PCR was employed for the detection of SARS-CoV-2 RNA isolated from individual nasopharyngeal swabs. A total of 10,014 swabs, sampled from the general public (hospital admissions, A&E, elective surgeries, cancer patients, care home residents and healthcare staff), were tested using standard replicate testing. Our analysis demonstrates that approximately 19% of SARS-CoV-2 infected individuals would have been reported as false negative if single sample Real-Time PCR testing was used. Therefore, two replicate tests can substantially decrease the risk of false negative reporting and reduce hospital and community infection rates. As the number of variants of concern increases, we believe that replicate testing is an essential consideration for effective SARS-CoV-2 infection detection and prevention of further outbreaks. A strategic approach limiting the number of missed infections is crucial in controlling the rise of new SARS-CoV-2 variants as well as the management of future pandemics

Activation of NF-kappa B driven inflammatory programs in mesenchymal elements attenuates hematopoiesis in low-risk myelodysplastic syndromes

Activation of NF-κB signaling in mesenchymal cells is common in LR-MDS.Activation of NF-κB in mesenchymal cells leads to transcriptional overexpression of inflammatory factors including negative regulators of hematopoiesis.Activation of NF-κB attenuates HSPC numbers and function ex vivo