Hepatocyte tissue factor contributes to the hypercoagulable state in a mouse model of chronic liver injury

Patients with chronic liver disease and cirrhosis have a dysregulated coagulation system and are prone to thrombosis. The basis for this hypercoagulable state is not completely understood. Tissue factor (TF) is the primary initiator of coagulation in vivo. Patients with cirrhosis have increased TF activity in white blood cells and circulating microparticles. The aim of our study was to determine the contribution of TF to the hypercoagulable state in a mouse model of chronic liver injury

Prediction of protein assemblies, the next frontier: The CASP14-CAPRI experiment

We present the results for CAPRI Round 50, the fourth joint CASP-CAPRI protein assembly prediction challenge. The Round comprised a total of twelve targets, including six dimers, three trimers, and three higher-order oligomers. Four of these were easy targets, for which good structural templates were available either for the full assembly, or for the main interfaces (of the higher-order oligomers). Eight were difficult targets for which only distantly related templates were found for the individual subunits. Twenty-five CAPRI groups including eight automatic servers submitted ~1250 models per target. Twenty groups including six servers participated in the CAPRI scoring challenge submitted ~190 models per target. The accuracy of the predicted models was evaluated using the classical CAPRI criteria. The prediction performance was measured by a weighted scoring scheme that takes into account the number of models of acceptable quality or higher submitted by each group as part of their five top-ranking models. Compared to the previous CASP-CAPRI challenge, top performing groups submitted such models for a larger fraction (70–75%) of the targets in this Round, but fewer of these models were of high accuracy. Scorer groups achieved stronger performance with more groups submitting correct models for 70–80% of the targets or achieving high accuracy predictions. Servers performed less well in general, except for the MDOCKPP and LZERD servers, who performed on par with human groups. In addition to these results, major advances in methodology are discussed, providing an informative overview of where the prediction of protein assemblies currently stands.Cancer Research UK, Grant/Award Number: FC001003; Changzhou Science and Technology Bureau, Grant/Award Number: CE20200503; Department of Energy and Climate Change, Grant/Award Numbers: DE-AR001213, DE-SC0020400, DE-SC0021303; H2020 European Institute of Innovation and Technology, Grant/Award Numbers: 675728, 777536, 823830; Institut national de recherche en informatique et en automatique (INRIA), Grant/Award Number: Cordi-S; Lietuvos Mokslo Taryba, Grant/Award Numbers: S-MIP-17-60, S-MIP-21-35; Medical Research Council, Grant/Award Number: FC001003; Japan Society for the Promotion of Science KAKENHI, Grant/Award Number: JP19J00950; Ministerio de Ciencia e Innovación, Grant/Award Number: PID2019-110167RB-I00; Narodowe Centrum Nauki, Grant/Award Numbers: UMO-2017/25/B/ST4/01026, UMO-2017/26/M/ST4/00044, UMO-2017/27/B/ST4/00926; National Institute of General Medical Sciences, Grant/Award Numbers: R21GM127952, R35GM118078, RM1135136, T32GM132024; National Institutes of Health, Grant/Award Numbers: R01GM074255, R01GM078221, R01GM093123, R01GM109980, R01GM133840, R01GN123055, R01HL142301, R35GM124952, R35GM136409; National Natural Science Foundation of China, Grant/Award Number: 81603152; National Science Foundation, Grant/Award Numbers: AF1645512, CCF1943008, CMMI1825941, DBI1759277, DBI1759934, DBI1917263, DBI20036350, IIS1763246, MCB1925643; NWO, Grant/Award Number: TOP-PUNT 718.015.001; Wellcome Trust, Grant/Award Number: FC00100

Retrospective evaluation of an observational cohort by the Central and Eastern Europe Network Group shows a high frequency of potential drug-drug interactions among HIV-positive patients receiving treatment for coronavirus disease 2019 (COVID-19)

Objectives The aim of this international multicentre study was to review potential drug-drug interactions (DDIs) for real-life coadministration of combination antiretroviral therapy (cART) and coronavirus disease 2019 (COVID-19)-specific medications. Methods The Euroguidelines in Central and Eastern Europe Network Group initiated a retrospective, observational cohort study of HIV-positive patients diagnosed with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection. Data were collected through a standardized questionnaire and DDIs were identified using the University of Liverpool's interaction checker. Results In total, 524 (94.1% of 557) patients received cART at COVID-19 onset: 117 (22.3%) were female, and the median age was 42 (interquartile range 36-50) years. Only 115 (21.9%) patients were hospitalized, of whom 34 required oxygen therapy. The most frequent nucleoside reverse transcriptase inhibitor (NRTI) backbone was tenofovir disoproxil fumarate (TDF)/tenofovir alafenamide (TAF) with lamivudine or emtricitabine (XTC) (79.3%) along with an integrase strand transfer inhibitor (INSTI) (68.5%), nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor (NNRTI) (17.7%), protease inhibitor (PI) (13.7%) or other (2.5%). In total, 148 (28.2%) patients received COVID-19-specific treatments: corticosteroids (15.7%), favipiravir (7.1%), remdesivir (3.1%), hydroxychloroquine (2.7%), tocilizumab (0.6%) and anakinra (0.2%). In total, 62 DDI episodes were identified in 58 patients (11.8% of the total cohort and 41.9% of the COVID-19-specific treatment group). The use of boosted PIs and elvitegravir accounted for 43 DDIs (29%), whereas NNRTIs were responsible for 14 DDIs (9.5%). Conclusions In this analysis from the Central and Eastern European region on HIV-positive persons receiving COVID-19-specific treatment, it was found that potential DDIs were common. Although low-dose steroids are mainly used for COVID-19 treatment, comedication with boosted antiretrovirals seems to have the most frequent potential for DDIs. In addition, attention should be paid to NNRTI coadministration

Effect of flash calcined alumina support and potassium doping on the activity of Co–Mo catalysts in sour gas shift process

Potassium promoted Co-Mo catalysts supported on flash-calcined alumina for sour WGS process have been prepared. The oxide form of samples has been characterized by ICP-OES method, N_{2} adsorption, temperature-programmed reduction (TPR) and the sulfides form after the catalytic activity test by means of XPS. Catalytic activity measurements were carried out in gradientless reactor in a kinetic region at low partial pressure of reagents. A strong effect of the promoter addition sequence to the support has been observed. The highest activity in the WGS process was determined for the potassium promoted Co-Mo/Al_{2}O_{3} catalyst with a K/Mo ratio of 0.06 obtained by a simultaneous impregnation of flash-calcined alumina with aqueous solution of K and Mo salts. Potassium addition significantly changes reducibility and decreases total surface area of catalysts. XPS results show that the catalyst activity is correlated with the surface concentration of Mo^5^+ and Co-Mo-S species. Potassium addition enhances the formation of such species. The method of potassium incorporation to the catalyst has been suggested and its optimal content has been determined. The catalyst obtained can be implemented in industrial processes of hydrogen and syngas production from feedstocks with high sulfur content

Historia a media. Studium selektywne, t. 3, red. Dominika Gołaszewska, Tomasz Sińczak, Mateusz Zmudziński, Toruń 2017, 163 s.

Nowe media otwierają przed historykami, archiwistami, etnologami oraz przedstawicielami innych nauk humanistycznych nowe, wciąż niezbadane, oraz szybko zmieniające się pole badawcze. Druk, a wraz z nim upowszechnienie się prasy sprawiło, że historycy otrzymali kolejne niewyczerpane źródło do badań. Powstanie radia i telewizji, rozwój Internetu, a wreszcie skok cywilizacyjny przełomu XX i XXI wieku przyniosły ogromne materiały źródłowe, które dzisiejsi badacze mają na wyciągnięcie ręki. Konferencje oraz wszelkiego rodzaju inicjatywy podsumowujące wyniki badań nad wykorzystaniem współczesnych mediów, ich przydatnością do badań czy obecnością w warsztacie historyka są inicjatywami, które dostarczają nauce nowych danych i jednocześnie możliwości badawczych. Praca Historia a media. Studium selektywne tom 3 stanowi zbiór artykułów poświęconych szeroko rozumianym relacjom między historią a mediami. Autorami tek-stów są młodzi badacze zaczynający prace badawczą. Niniejszy tom niewątpliwie nie wyczerpuje ogromnej tematyki jaką są powiązania między historią i mediami, jednak stanowi przyczynek do dalszych badań nad tą niezwykle ciekawą i ważną tematyką. Publikacja posiadła układ problemowo-chronologiczny. Zbiór otwierają teksty poświęcone prasie. Pierwszy z nich autorstwa Dominiki Gołaszewskiej-Rusinowskiej zatytułowany Cenzura w okresie restauracji burbońskiej stanowi analizę ustawo-dawstwa prasowego w Hiszpanii na przełomie XIX i XX wieku. Autorka przybliża m.in. wpływ wydarzeń politycznych na rozwój cenzury w omawianym okresie. Artykuł Zuzanny Jaśkiewicz-Jaskowskiej Wybuch II wojny światowej oczami hiszpańskiej prasy skupia się na przedstawieniach tego wielkiego konfliktu w pierwszych dniach działań wojennych. Autorka zgłębiając tematykę sięgnęła do hiszpańskich dzienników takich jak madryckie ABC i La Vanguardia. Zwróciła również uwagę na świadomość społeczeństwa hiszpańskiego w pierwszych dniach września 1939 roku. Artykuł Agaty Łysakowskiej Polska Kronika Filmowa jako źródło historyczne otwiera część monografii poświęconą tak specyficznemu źródłu jakim jest film. Autorka wskazuje nie tylko na propagandową funkcję kroniki, ale również informacyjną i dydaktyczną. Z materiałów Polskiej Kroniki Filmowej korzystała także Agnieszka Laddach przy opracowaniu artykułu Obraz elementów swojskich i obcych w przekazie Polskiej Kroniki Filmowej o kompleksie Elektrowni Żarnowiec. Autorka na podstawie ośmiu produkcji z lat 1975-1990 prezentuje obraz powstającej w Żarnowcu elektrowni. Zwraca zwłaszcza uwagę na występujące w materiałach elementy swojskości i obcości. Natomiast Joanna Antoniak omówiła historię mniejszości etnicznych w Wiel-kiej Brytanii na podstawie wybranych filmów. Autorka skupia się na sytuacji mniej-szości pochodzących z Afryki i Azji. Kolejne artykuły przedstawiają kwestię szeroko rozumianej popularyzacji nauk historycznych. Anna Ambon prezentuje rolę muzyki w nauczaniu historii. Swoje rozważania opiera na twórczości szwedzkiego zespołu Sabaton, który w swoich piosenkach porusza wątki historyczne. Autorką artykułu Blogi o tematyce historycznej jako źródło wiedzy o przeszłości jest Justyna Grzyb. Skupia się ona na przedstawieniu i porównaniu kilku blogów opisujących wydarzenia historyczne. Natomiast Anita Zakrzewska w artykule Kanał “Historia Bez Cenzury”, a wykorzystanie go na lekcjach historii dokonuje analizy materiałów jednego z najpopularniejszych youtuberów. Autor-ka nie tylko analizuje opublikowane materiały, ale na podstawie przeprowadzonych wywiadów wskazuje na walory kanału Historia Bez Cenzury. Rolę promowania działal-ności archiwów państwowych porusza Monika Cołbecka w artykule Nowy wymiar pracy publicznej archiwów czyli o działaniach edukacyjnych archiwów w mediach słów kilka. Autorka wskazuje na największe inicjatywy edukacyjne instytucji, których celem jest przede wszystkim udostępnianie materiałów użytkownikom. Zamykające tom artykuły dotyczą wykorzystania mediów społecznościowych do badań nad przeszłością. Autorką tekstu Egodokumentalność we współczesnych mediach. Dzisiejsze pamiętnikarstwo – czy portale społecznościowe mogę być ego-dokumentami? jest Kamila Siuda. W artykule porównuje wpisy na portalach społeczno-ściowych do pamiętników oraz ukazuje ich funkcję. Tymczasem Katarzyna Bojkowska zapoznaje czytelników z narzędziem jakim jest Google Arts & Culture. Autorka nie tylko podaje zalety i wady projektu, ale porównuje go do innych platform promujących dziedzictwo kulturowe w sieci. Natomiast Tomasz Sińczak prezentuje obecności tematyki bliskowschodniej na portalu społecznościowym Twitter. Zaprezentowane artykuły podejmują nową i nieznaną polskiemu czytelnikowi tematykę. Niewątpliwie tak szeroka tematyka jaką jest zależność między historią a mediami nie została wyczerpana, a prace nad omawianą problematyką będą w przyszłości kontynuowane

CO2 Hydrogenation to Methane over Ni-Catalysts: The Effect of Support and Vanadia Promoting

Within the Waste2Fuel project, innovative, high-performance, and cost-effective fuel production methods are developed to target the “closed carbon cycle”. The catalysts supported on different metal oxides were characterized by XRD, XPS, Raman, UV-Vis, temperature-programmed techniques; then, they were tested in CO2 hydrogenation at 1 bar. Moreover, the V2O5 promotion was studied for Ni/Al2O3 catalyst. The precisely designed hydrotalcite-derived catalyst and vanadia-promoted Ni-catalysts deliver exceptional conversions for the studied processes, presenting high durability and selectivity, outperforming the best-known catalysts. The equilibrium conversion was reached at temperatures around 623 K, with the primary product of reaction CH4 (>97% CH4 yield). Although the Ni loading in hydrotalcite-derived NiWP is lower by more than 40%, compared to reference NiR catalyst and available commercial samples, the activity increases for this sample, reaching almost equilibrium values (GHSV = 1.2 × 104 h–1, 1 atm, and 293 K)

Vaccination against HBV and HAV as mode of hepatitis prevention among people living with HIV - Data from ECEE Network Group

(1) Background: Viral hepatitis C (HCV) and viral hepatitis B (HBV) are common co-infections in people living with HIV (PLWH). All PLWH should be vaccinated against HBV and hepatitis A (HAV) and treated for HBV and HCV. We aimed to compare testing, prophylaxis and treatment of viral hepatitis in PLWH in Central and Eastern Europe (CEE) in 2019 and 2022. (2) Methods: Data was collected through two on-line surveys conducted in 2019 and 2022 among 18 countries of the Euroguidelines in CEE (ECEE) Network Group. (3) Results: In all 18 countries the standard of care was to screen all PLWH for HBV and HCV both years; screening of HAV was routine in 2019 in 54.5% and in 2022 47.4% of clinics. Vaccination of PLWH against HAV was available in 2019 in 16.7%, in 2022 in 22.2% countries. Vaccination against HBV was available routinely and free of charge in 50% of clinics both in 2019 and 2022. In HIV/HBV co-infected the choice of NRTI was tenofovir-based in 94.4% of countries in both years. All clinics that responded had access to direct-acting antivirals (DAAs) but 50% still had limitations for treatment. (4) Conclusions: Although testing for HBV and HCV was good, testing for HAV is insufficient. Vaccination against HBV and especially against HAV has room for improvement; furthermore, HCV treatment access needs to overcome restrictions

Chronic Kidney Disease and Nephrology Care in People Living with HIV in Central/Eastern Europe and Neighbouring Countries—Cross-Sectional Analysis from the ECEE Network

Chronic kidney disease (CKD) is a significant cause of morbidity and mortality among patients infected with human immunodeficiency virus (HIV). The Central and East Europe (CEE) region consists of countries with highly diversified HIV epidemics, health care systems and socioeconomic status. The aim of the present study was to describe variations in CKD burden and care between countries. The Euroguidelines in the CEE Network Group includes 19 countries and was initiated to improve the standard of care for HIV infection in the region. Information on kidney care in HIV-positive patients was collected through online surveys sent to all members of the Network Group. Almost all centres use regular screening for CKD in all HIV (+) patients. Basic diagnostic tests for kidney function are available in the majority of centres. The most commonly used method for eGFR calculation is the Cockcroft–Gault equation. Nephrology consultation is available in all centres. The median frequency of CKD was 5% and the main cause was comorbidity. Haemodialysis was the only modality of treatment for kidney failure available in all ECEE countries. Only 39% of centres declared that all treatment options are available for HIV+ patients. The most commonly indicated barrier in kidney care was patients’ noncompliance. In the CEE region, people living with HIV have full access to screening for kidney disease but there are important limitations in treatment. The choice of dialysis modality and access to kidney transplantation are limited. The main burden of kidney disease is unrelated to HIV infection. Patient care can be significantly improved by addressing noncompliance