317 research outputs found

    Spatial agglomeration and product market competition

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    This paper tests the hypothesis that product market competition has a negative impact on spatial agglomeration. This hypothesis emerges as an interpetation of the models by Combes and Duranton (2001) and Alsleben (2005) which are about firms' location choice in the presence of knowledge spillovers. Using data for German manufacturing industries, the result is that, while controlling for other agglomeration forces, higher industrial concentration, measured by the Herfindahl index of concentration of sales, implies stronger spatial agglomeration, as measured by Ellison and Glaeser's (1997) index of concentration

    Structural analysis of the Swakane Terrane, North Cascades core, Washington

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    Influence of the newly identified Mos10 interaction partner Vps68on ESCRT-III function

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    The endosomal sorting complex required for transport (ESCRT) is a part of the heteromeric complex machinery consisting of ESCRT-0, -I, -II, and -III ensuring functional protein traffic of endocytic and biosynthetic cargo. Stepwise sorting of labeled cargo material inside the lumen of the endosome by invagination and abscission of the endosomal membrane to form intraluminal vesicles (ILVs) is mediated by the ESCRT-III complex. The complex consists of eight members of which Vps20, Snf7, Vps2, and Vps24 are considered ESCRT-III essential subunits, and Chm7, Did2, Ist1, and Mos10/Vps60 are commonly labeled as complex associated proteins. The correct interplay between the proteins ensures cargo sorting into the MVB (multivesicular body) pathway and transport from the late endosome into the vacuolar lumen for degradation. Besides the initial function of vacuolar protein sorting (vps), the complex is involved in a multitude of cellular processes like cell abscission, virus budding, autophagy, and remaining nuclear envelope integrity. The step-wise assembly of the ESCRT-III complex is mediated after the cascade-like ESCRT-0 to ESCRT-II complex formation at the membrane budding site, collecting cargo protein for invagination into the endosomal lumen. ESCRT-III Vps20 is recruited to the membrane by the ESCRT-II member Vps25, then nucleating Snf7 association and oligomerization. Additional assembly of ESCRT-III members like Vps24 and Vps2 further drives membrane bending away from the cytosol to the final abscission event, before being recycled back to cytosolic monomers by Vps4. Although Mos10 has been implicated in the recycling step of the ESCRT-III units by interacting with the Vps4/Vta1 complex, the proteins function remains poorly characterized. This thesis tried to find new insights in Mos10 functionality by finding yet uncharacterized interacting partners, thus connecting the protein to new putative non-endosomal functions or understanding its role in the established ESCRT-III complex. For this purpose, a series of crosslinking experiments with tagged variants of Mos10 were performed. Purification was achieved by IMAC (Immobilized Metal Ion Affinity Chromatography) after adding a poly-his sequence to the protein and by immunoprecipitation of sfGFP tagged Mos10. Both methods revealed a multitude of putative Mos10 interacting partners by MS analysis to be further reduced by applying the SILAC (stable isotope labeling with amino acids in cell culture) technique. After selecting possible Mos10 interacting partners, IP and Co-IP experiments of tagged candidate variants were used to identify an interaction between the two proteins. An interaction between Mos10-6His and Vps68-13myc besides native Mos10 and Vps68-fGFP could be verified by purification of Vps68 and co-precipitating Mos10. The influence of Vps68 on the assembly and composition of the ESCRT-III complex was examined. After Vps68 depletion, an enrichment of the core subunits Snf7, Vps2, and Vps24 in the complex was detected with a reduced number of Did2, Ist1, and Mos10 molecules. Thus, it appears that ESCRT-III disassembly is blocked in ∆vps68 mutant. The influence of VPS68 deletion on the intracellular localization of ESCRT-III proteins was examined by fluorescence microscopy with sfGFP-tagged variants. While the localization of most ESCRT-III proteins was not significantly altered, a marked relocalization was observed for Mos10. In wildtype, Mos10-sfGFP was localized at the vacuolar membrane, while in ∆vps68 it was dispersed into vesicular structures enriched at the cell cortex. Further, the impact of VPS68 deletion on the sorting of the endocytic cargo protein Ste6 was investigated. By cycloheximide chase experiments, it could be shown that Ste6 is strongly stabilized in a ∆vps68 mutant. This indicates that the transport of the protein to the yeast vacuole for degradation is blocked. The ∆vps68 block in endocytic trafficking was compared with other mutants of the vps-pathway, whose site of action has been established. These experiments show that the VPS68 deletion neither leads to a class D phenotype, as in ∆vps21, nor to a class E phenotype, as in ∆snf7. The Ste6-GFP distribution in the ∆vps68 mutant rather resembles wildtype with more pronounced accumulation of endosomal dots. The data taken together suggest that Vps68 acts after the formation of the ESCRT-III complex and is required for cargo delivery from the late endosome to the vacuolar lumen.Der fĂŒr den endosomalen Protein-Transport erforderliche ESCRT (endosomal sorting complex required for transport)-III Komplex ist ein Teil der heteromeren Komplexmaschinerie, die aus ESCRT-0, -I, -II und -III besteht und die Sortierung von endozytischem und biosynthetischem Cargo in intraluminĂ€re Vesikel (ILVs) bewerkstelligt. Der ESCRT-III Komplex besteht aus acht Mitgliedern, von denen Vps20, Snf7, Vps2 und Vps24 als essentielle Untereinheiten des ESCRT-III-Komplexes angesehen werden, wĂ€hrend Chm7, Did2, Ist1 und Mos10/Vps60 gemeinhin als komplexassoziierte Proteine bezeichnet werden. Das korrekte Zusammenspiel der Proteine gewĂ€hrleistet die Sortierung des Cargos in den MVB (multivesicular body)-Weg und den Transport aus dem spĂ€ten Endosom in das vakuolĂ€re Lumen zur Degradation. Neben der ursprĂŒnglichen Funktion der vakuolĂ€ren Proteinsortierung (vps) ist der Komplex an einer Vielzahl von zellulĂ€ren Prozessen wie Zellteilung, Virusknospung, Autophagozytose und Aufrechterhaltung der KernhĂŒllenintegritĂ€t beteiligt. Der schrittweise Aufbau des ESCRT-III-Komplexes erfolgt kaskadenartig beginnend mit ESCRT-0- bis zu ESCRT-II an der Knospungsstelle der Membran und sammelt das Cargo-Protein fĂŒr die Einschleusung in das endosomale Lumen. Das ESCRT-III Protein Vps20 wird durch die ESCRT-II-Untereinheit Vps25 an die Membran rekrutiert, wodurch die Assoziation und Oligomerisierung von Snf7 ausgelöst wird. Weitere ESCRT-III-Mitglieder wie Vps24 und Vps2 sorgen dafĂŒr, dass sich die Membran bis zur endgĂŒltigen Abtrennung der ILVs vom Zytosol zum Lumen hin verbiegt. Sodann wird der Komplex durch Vps4 wieder aufgelöst. Mos10 wird eine Funktion bei der Auflösung der ESCRT-III Komplexe ĂŒber den Vps4/Vta1 Komplex zugesprochen, doch ist die Funktion des Proteins nach wie vor unzureichend geklĂ€rt. In dieser Arbeit wurde durch Identifizierung bislang nicht charakterisierter Interaktionspartner versucht, neue Einblicke in die FunktionalitĂ€t von Mos10 zu gewinnen, um einerseits Verbindungen zu neuen nicht-endosomalen Funktionen herzustellen oder auch, um andererseits seine Rolle im etablierten ESCRT-III Komplex besser zu verstehen. Dazu wurden eine Reihe von Quervernetzungsexperimenten mit markierten Varianten von Mos10 durchgefĂŒhrt. Die Reinigung erfolgte durch IMAC (Immobilisierte Metallionen-AffinitĂ€ts-Chromatographie) nach HinzufĂŒgen einer Poly-his-Sequenz zum Protein und durch ImmunprĂ€zipitation von sfGFP-markiertem Mos10. Beide Methoden ergaben eine Vielzahl von möglichen Interaktionspartnern von Mos10 durch MS-Analyse, die durch Anwendung der SILAC-Technik (Stable Isotope Labeling with Amino Acids in Cell Culture) weiter reduziert werden konnte. Nach der Auswahl möglicher Mos10-Interaktionspartner wurden IP- und Co-IP-Experimente an markierten Kandidatenvarianten durchgefĂŒhrt, um eine Interaktion zwischen den beiden Proteinen zu identifizieren. Eine Interaktion zwischen Mos10-6His und Vps68-13myc konnte neben nativem Mos10 und Vps68-fGFP durch Aufreinigung von Vps68 und Ko-PrĂ€zipitation von Mos10 nachgewiesen werden. Der Einfluss von Vps68 auf den Aufbau und die Zusammensetzung des ESCRT-III Komplexes wurde untersucht. Es zeigte sich, dass in der VPS68 Deletionsmutante die Core-Untereinheiten Snf7, Vps2 und Vps24 im Komplex angereichert waren, wĂ€hrend die ESCRT-III assoziierten Protein Did2, Ist1 und Mos10 abgereichert waren. Das deutet darauf hin, dass die Auflösung des ESCRT-III Komplexes in der ∆vps68-Mutante blockiert ist. Der Einfluss der VPS68-Deletion auf die intrazellulĂ€re Lokalisierung der ESCRT-III-Proteine wurde durch Fluoreszenzmikroskopie mit sfGFP-markierten Varianten untersucht. WĂ€hrend die Lokalisation der meisten ESCRT-III-Proteine nicht signifikant verĂ€ndert war, wurde fĂŒr Mos10 eine deutliche Relokalisation beobachtet. Im Wildtyp war Mos10-sfGFP an der Vakuolenmembran lokalisiert, wĂ€hrend es in ∆vps68 in vesikulĂ€ren Strukturen verteilt war, die am Zellkortex angereichert waren. Außerdem wurde untersucht, wie sich die Deletion von VPS68 auf die Sortierung des endozytischen Cargo-Proteins Ste6 auswirkt. Durch Cycloheximid-Chase-Experimente konnte gezeigt werden, dass Ste6 in einer ∆vps68-Mutante stark stabilisiert ist. Dies deutet darauf hin, dass der Transport des Proteins in die Hefevakuole zum Abbau blockiert ist. Die ∆vps68-Blockade des endozytischen Transports wurde mit anderen Mutanten des vps-Wegs verglichen, deren Wirkort bereits bekannt ist. Diese Experimente zeigen, dass die Deletion von VPS68 weder zu einem Klasse-D-PhĂ€notyp, wie bei ∆vps21, noch zu einem Klasse-E-PhĂ€notyp, wie bei ∆snf7, fĂŒhrt. Die Ste6-GFP-Verteilung in der ∆vps68-Mutante Ă€hnelt eher dem Wildtyp mit einer ausgeprĂ€gteren Akkumulation von endosomalen Punkten. Die Daten deuten darauf hin, dass Vps68 nach der Bildung des ESCRT-III-Komplexes wirkt und dass es fĂŒr den Transport von Cargo-Proteinen aus dem spĂ€ten Endosom in das Vakuolen-Lumen benötigt wird

    Der Biomarker IP-10 fĂŒr die Diagnose der aktiven Tuberkulose und der latenten Tuberkuloseinfektion im Kindesalter

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    Einleitung: Zur in-vitro Diagnostik der Tuberkulose (TB) und latenten TB Infektion (LTBI) im Kindesalter werden derzeit zunehmend „Interferon-gamma (IFN-Îł) release assays“ (IGRA) verwendet. Die SensitivitĂ€t der IGRA insbesondere im Kindesalter ist umstritten. Auch eine diagnostische Unterscheidung zwischen TB und LTBI ist mittels IGRA und anderen bisherigen basierten Testverfahren nicht möglich. In vorangegangen Studien zeigte sich der Biomarker „IFN-Îł-inducible-protein-10“ (IP-10) als viel versprechend zur Diagnose der TB und LTBI. Ziele: In der vorliegenden Dissertationsschrift wurden die IP-10-Plasmakonzentrationen von Kindern mit TB, LTBI, Atemwegsinfektion (AWI) oder nicht-tuberkulöse Mykobakterien (NTM)-Erkrankung ohne Stimulation der Proben, nach unspezifischer Mitogen-Stimulation und nach spezifischer Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis)-Antigen-Stimulation bestimmt. Die Antigen-stimulierten IP-10-Plasmakonzentrationen der TB- und LTBI-Gruppe wurden mit denen der NTM- und AWI-Gruppe verglichen. DarĂŒberhinaus wurde beurteilt, ob eine Unterscheidung zwischen TB und LTBI anhand der IP-10-Plasmakonzentration möglich ist. Außerdem wurde die Konkordanz und Korrelation zwischen dem IP-10-ELISA und QuantiFERONÂź -TB Gold In-Tube (QFT-IT) Test beurteilt und untersucht, ob der Biomarker IP-10 altersabhĂ€ngig sezerniert wird. Material & Methoden: 48 Kinder wurden in die Studie eingeschlossen. Das mittlere Alter der Studienteilnehmer war 54 Monate. Alle Studienteilnehmer wurden zuvor in Deutschland entweder mit einer TB (n=11), LTBI (n=14), NTM (n=8) oder AWI (n=15) diagnostiziert. UnabhĂ€ngig von der vorliegenden Studie wurden bei allen teilnehmenden Kindern IFN-Îł-Werte mittels des QFT-IT-Testes bestimmt. Im Rahmen des QFT-IT wurden die fĂŒr den Test notwendigen Blutproben entweder nicht stimuliert, mit einer unspezifischen Mitogenen-Substanz oder mit spezifischen M.tuberculosis-Antigenen stimuliert. Die jeweiligen Plasma-ÜberstĂ€nde wurden asserviert und zur Bestimmung von IP-10 verwendet. Die IP-10-Konzentrationen wurden, in Zusammenarbeit mit dem Klinischen Forschungszentrums der UniversitĂ€t von Kopenhagen, mittels einem zu Forschungszwecken entwickelten ELISAs gemessen. Ergebnisse: Die IP-10-Plasmakonzentrationen ohne Stimulation, mit unspezifischer Mitogen- und spezifischer Antigen-Stimulation betrug fĂŒr die TB-Gruppe 704 pg/ml, 12.966 pg/ml und 12.702 pg/ml; fĂŒr die LTBI-Gruppe 366,5 pg/ml, 10.232 pg/ml und 9.109 pg/ml; fĂŒr die NTM-Gruppe 309 pg/ml, 11.197 pg/ml und 97 pg/ml; und fĂŒr die AWI-Gruppe 694 pg/ml, 5.401 pg/ml und 84 pg/ml. Es konnte kein signifikanter Unterschied zwischen der IP-10-Konzentration der TB- und LTBI-Gruppe festgestellt werden (p-Wert= 0,24). Die IP-10- und IFN-Îł- Plasmakonzentrationen der Kinder mit TB und LTBI korrelierten stark miteinander (rsp=0,65; p-Wert = 0,03 und rsp=0,79; p-Wert < 0,001). Der IP-10-ELISA und QFT-IT Test zeigten ebenso eine hohe Konkordanz (Îș =0,96). Die IP-10-Sekretion war 18fach höher im Vergleich zur IFN-Îł-Sekretion. Es konnte keine Korrelation zwischen dem Alter und der Mitogen-stimulierten IP-10-Konzentration nachgewiesen werden. Schlussfolgerungen: Die IP-10-Plasmakonzentration von Kindern mit TB und LTBI im Vergleich zu Kindern mit NTM und AWI ist signifikant nach spezifischer M.tuberculosis-Antigen-Stimulation erhöht (p-Wert > 0,001). Die qualitativen und quantitativen Testergebnisse des IP-10-ELISAs korrelieren stark mit denen des QFT-IT-Testes. Im Vergleich zu IFN-Îł scheint IP-10 in höheren Konzentrationen und möglicherweise unabhĂ€ngig vom Alter sezerniert zu werden. Das legt die Vermutung nahe, dass IP-10 zur Diagnose der TB und LTBI im Kindesalter in Zukunft Verwendung finden könnte

    Untersuchung der Biosynthese von Phenolen und Terpenen in borkenkÀferresistenten Fichten aus dem Böhmerwald

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    Let’s talk – mit GruppengesprĂ€chen zur QualitĂ€tsentwicklung in Studium und Lehre

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    Das mehrstufige Evaluationsprojekt FORUM bringt alle relevanten Akteur*innen eines Fachbereichs zusammen, um den Austausch ĂŒber qualitĂ€tsrelevante Themen aus dem Bereich Studium und Lehre zu fördern. Der durch die Mitarbeitenden des QualitĂ€tsmanagements Studium und Lehre initiierte Dialog dient dazu, die beteiligten Fachbereiche bei der Weiterentwicklung ihres Lehrangebots und dessen Rahmenbedingungen zu unterstĂŒtzen. Durch das Verfahren kann eine multiperspektivische Betrachtung ĂŒber Statusgruppen hinweg ermöglicht und eine positive Feedbackkultur innerhalb des Fachbereichs gefördert werden

    Long-term course and outcome of obsessive-compulsive patientsafter cognitive-behavioral therapy in combination with eitherfluvoxamine or placebo: A 7-year follow-up of a randomized double-blind trial

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    Longitudinal studies with very long follow-up periods of patients with obsessive-compulsive disorder (OCD) who have received adequate treatment are rare. In the current study, 30 of 37 inpatients (81%) with severe OCD were followed up 6-8 years after treatment with cognitive-behavioral therapy (CBT) in combination with either fluvoxamine or placebo in a randomized design. The significant improvements (with large effectsizes) in obsessive-compulsive symptoms from pre- to post-treatment (41% reduction on the Y-BOCS) remained stable at follow-up (45 %). Responder rates, defined as ≄35% reduction on the Y-BOCS, were 67% and 60%, respectively. Depressive symptoms decreased significantly not only from pre- to post-treatment but also during follow-up. Re-hospitalization, which occurred in 11 patients (37 %), was associated with more severe depressive symptoms at pre-treatment and living without a partner. Full symptom remission at follow-up, defined as both Y-BOCS total score ≀ 7 and no longer meeting diagnostic criteria for OCD, was achieved by 8 patients (27 %). Patients without full remission at follow-up had a significantly longer history of OCD, assessed at pretreatment, compared to remitted patients. The shortterm treatment outcome had no predictive value for the long-term course. Throughout the naturalistic follow-up, nearly all patients (29 patients) received additional psychotherapy and/or medication. This might indicate that such chronic OCD patients usually need additional therapeutic support after effective inpatient treatment to maintain their improvements over long period

    Adenocarcinoma arising in a heterotopic pancreas (Heinrich type III): a case report

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    <p>Abstract</p> <p>Introduction</p> <p>Heterotopic pancreatic cancer in the duodenum is a very rare disease. Only twelve cases have been reported worldwide to date. We report a rare case of malignant transformation of heterotopic pancreas (Heinrich type III) in the duodenum with long-term survival of the patient, and review the 12 cases in the literature.</p> <p>Case presentation</p> <p>A 75-year-old Japanese man was admitted to our hospital complaining of nausea and vomiting. Endoscopy and upper gastrointestinal contrast study showed marked duodenal stenosis. A pylorus-preserving pancreaticoduodenectomy was performed. Histopathological examination of the surgically resected specimen showed malignant transformation of heterotopic pancreas (Heinrich type III) in the duodenum. The postoperative course was uneventful, and the patient was discharged from the hospital on postoperative day 30. He is well and shows no signs of recurrence at the time of writing, six years after the surgery.</p> <p>Conclusion</p> <p>Adenocarcinoma arising within the heterotopic pancreas appears to be rare. It is difficult to obtain a correct diagnosis preoperatively. The management of heterotopic pancreas depends on the presence or absence of symptoms. If the patient is asymptomatic or benign, conservative treatment with regular follow-up is recommended. When the patient is symptomatic or there is a suspicion of malignancy, surgical management with intra-operative frozen section diagnosis is indicated.</p

    Viking Age garden plants from southern Scandinavia: diversity, taphonomy and cultural aspects

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    Plant finds recovered from archaeological sites in southern Scandinavia dated to the Viking Age reflect the diversity of useful plants that were cultivated and collected. This review presents the results of 14 investigations of deposits that are dated between AD 775 and 1050. The site types are categorized as agrarian, urban, military and burials. Garden plants are unevenly distributed, as the greatest diversity is recorded in features from urban contexts. We argue that taphonomic processes played an important role in the picture displayed. Archaeobotanical research results from neighbouring regions suggest that Viking Age horticulture has its roots in older traditions, and that the spectrum of garden plants is influenced by central and north-western European horticultural customs, which were to a great extent shaped by Roman occupation
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