Multi-character taxonomic review, systematics, and biogeography of the Black-capped/Tawny-bellied Screech Owl (Megascops atricapilla-M. watsonii) complex (Aves Strigidae)

Megascops is the most species-rich owl genus in the New World, with 21 species currently recognized. Phylogenetic relationships within this genus are notoriously difficult to establish due to the considerable plumage similarity among species and polymorphism within species. Previous studies have suggested that the widespread lowland Amazonian M. watsonii might include more than one species, and that the Atlantic Forest endemic M. atricapilla is closely related to the M. watsonii complex, but these relationships are as yet poorly understood. A recently published phylogeny of Megascops demonstrated that M. watsonii is paraphyletic with respect to M. atricapilla and that genetic divergences among some populations of M. watsonii are equal to or surpass the degree of differentiation between some M. watsonii and M. atricapilla. To shed light on the taxonomic status of these species and populations within them, we conducted a multi-character study based on molecular, morphological, and vocal characters. We sequenced three mitochondrial (cytb, CO1 and ND2) and three nuclear genes (BF5, CHD and MUSK) for 49 specimens, covering most of the geographic ranges of M. watsonii and M. atricapilla, and used these sequences to estimate phylogenies under alternative Bayesian, Maximum Likelihood, and multilocus coalescent species tree approaches. We studied 252 specimens and vocal parameters from 83 recordings belonging to 65 individuals, distributed throughout the ranges of M. watsonii and M. atricapilla. We used Discriminant Function Analysis (DFA) to analyze both morphometric and vocal data, and a pairwise diagnostic test to evaluate the significance of vocal differences between distinct genetic lineages. Phylogenetic analyses consistently recovered six statistically well-supported clades whose relationships are not entirely in agreement with currently recognized species limits in M. watsonii and M. atricapilla. Morphometric analyses did not detect significant differences among clades. High plumage variation among individuals within clades was usually associated with the presence of two or more color morphs. By contrast, vocal analyses detected significant differentiation among some clades but considerable overlap among others, with some lineages (particularly the most widespread one) exhibiting significant regional variation. The combined results allow for a redefinition of species limits in both M. watsonii and M. atricapilla, with the recognition of four additional species, two of which we describe here as new. We estimated most cladogenesis in the Megascops atricapilla-M. watsonii complex as having taken place during the Plio-Pleistocene, with the development of the modern Amazonian and Sao Francisco drainages and the expansion and retraction of forest biomes during interglacial and glacial periods as likely events accounting for this relatively recent burst of diversification.Peer reviewe

A posição do núcleo de taxonomia do Comitê Brasileiro de Registros Ornitológicos (CBRO) sobre a validade nomenclatural de Synallaxis whitneyi Pacheco e Gonzaga, 1995.

Submitted by Olímpia Resque ([email protected]) on 2010-12-13T00:41:23Z No. of bitstreams: 1 Revista Brasileira de Ornitologia v16 n4 2008 ALEIXO.pdf: 75883 bytes, checksum: 16de562a43a89db72a266791b7fcb68f (MD5)Approved for entry into archive by Francileila Silva([email protected]) on 2010-12-13T13:13:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Revista Brasileira de Ornitologia v16 n4 2008 ALEIXO.pdf: 75883 bytes, checksum: 16de562a43a89db72a266791b7fcb68f (MD5)Made available in DSpace on 2010-12-13T13:13:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Revista Brasileira de Ornitologia v16 n4 2008 ALEIXO.pdf: 75883 bytes, checksum: 16de562a43a89db72a266791b7fcb68f (MD5) Previous issue date: 2008-1

Historical diversification of floodplain forest specialist species in the Amazon: a case study with two species of the avian genus Xiphorhynchus (Aves: Dendrocolaptidae).

Phylogeographical and population genetics methods are used to reconstruct the diversification history of two species of the genus Xiphorhynchus (Aves: Dendrocolaptidae) associated with seasonally flooded forest types in Amazonia. Sequences of the mitochondrial gene cytochrome b were assessed for 21 and 30 individuals, belonging to eight and ten populations, of Xiphorhynchus kienerii and Xiphorhynchus obsoletus , respectively. Uncorrected genetic distances among unique haplotypes recovered ranged only from 0.01% to 0.4% for both species. Over 90% of the genetic variation detected in both species was partitioned within populations, and therefore was not structured geographically. Mismatch distributions and values of Tajima’s D -tests indicate that both X. kienerii and X. obsoletus have had small evolutionary effective population sizes, but experienced a recent demographic expansion. These demographic expansions are tentatively dated as occurring over the last 18 000 years BP, a time frame which coincides with the establishment of the early and mid-Holocene age floodplain forest in most of central and eastern Amazonia, following a period of increased river stages throughout the basin. Based on phylogenetic, phylogeographical, and populations genetics data obtained for X. kienerii and X. obsoletus , an evolutionary scenario is proposed to account for the historical diversification of floodplain specialist species in Amazonia

Conceitos de espécie e suas implicações para a conservação

Disponível em: http://www.conservation.org.br/publicacoes/index.php?t=4Estimativas de diferentes parâmetros da biodiversidade têm em comum a utilização de espécies como as unidades mais fundamentais de análise. Consequentemente, políticas de conservação em diferentes níveis geopolíticos se utilizam de espécies como os principais indicadores de vulnerabilidade, desde o nível populacional até a escala de biomas inteiros. Apesar deste papel central que espécies desempenham na biologia da conservação, somente agora os efeitos complicadores na disciplina do grau de incerteza inerente à delimitação de limites inter-específicos começam a ser discutidos mais amplamente. Dois destes principais fatores são: 1) a existência de diferentes conceitos de espécie na biologia, o que resulta em diferentes estimativas de parâmetros da biodiversidade, dependendo do critério adotado; e 2) a grande discrepância no nível de conhecimento taxonômico de diferentes grupos bioló-gicos, fator que impede a aplicação de critérios de delimitação inter-específicos consistentes e unificadores, comprometendo cálculos de parâmetros gerais de biodiversidade não envie-sados por grupos mais bem trabalhados taxonomicamente. Com relação ao primeiro fator, independentemente da discussão acadêmica sobre o tema, uma definição ao mesmo tempo objetiva, pragmática e cientificamente correta de unidades Evolutivas Significativas (uES) a serem consideradas, tanto na biologia da conservação quanto por agências governamentais de proteção ambiental, é necessária e urgente. Essa definição deve ser amplamente discutida com as sociedades científicas botânicas, microbiológicas e zoológicas, que deverão ser esti-muladas a publicar e atualizar periodicamente listas destas unidades evolutivas (não neces-sariamente coincidentes com listas de espécies) para os seus respectivos grupos biológicos de interesse. Com relação ao segundo fator, há uma necessidade urgente da promoção de estudos taxonômicos como ferramentas fundamentais para a biologia da conservação, com a finalidade de aumentar o volume de recursos tanto de agências governamentais quanto de organizações não governamentais para um programa nacional de pesquisa em taxonomia e formação de recursos humanos especializados nesta área

Estrutura e organização de comunidades de aves em areas da Mata Atlantica primitiva e explorada por corte seletivo

Orientador: Jacques M. E. VielliardDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaResumo: o presente estudo objetivou investigar os efeitos do corte seletivo de espécies arbóreas sobre uma comunidade de aves da Mata Atlântica. Para tanto, um levantamento qual i-quantitativo de avifauna foi efetuado em duas áreas distintas. Uma completamente inexplorada (M1) e outra explorada por madereiros (M2). Pretendeu-se documentar o comportamento da avifauna sob efeito do corte seletivo e determinar como esta atividade influenciou o número, a composição e a abundância das espécies presentes. Também foi comparada a abundância relativa das espécies com exigências ecológicas similares ("guildas") nos dois tipos de mata, no intuito de verificar quais perfis ecológicos da avifauna foram mais afetados. Ao longo de 25 meses de levantamento, foi realizado um estudo sobre a composição e os padrões de abundância relativos das espécies nas duas matas estudadas. Além disso, foi efetuada uma caracterização estrutural da vegetação dessas matas, fator que reconhecidamente determina padrões de distribuição e abundância de espécies componentes de comunidades de aves. Apesar da maior parte dos parâmetros estruturais da vegetação sofrer redução em M2, os padrões de riqueza e diversidade das comunidades de aves diferiram pouco entre os dois tipos de mata estudados. Processos dinâmicos, como colonizações e extinções de espécies, explicam diferenças acentuadas na similaridade e na abundância das espécies da avifauna entre as matas estudadas. A composição dos grupos ecológicos da avifauna alterou-se pouco de um modo geral entre as matas, mas na maioria dos grupos pelo menos uma espécie foi prejudicada pelo corte seletivo. Embora índices quantitativos globais da comunidade de aves não sejam alterados significativamente entre M 1 e M2, ainda assim ocorrem alterações importantes na sua composição. Isso ocorre devido ao aspecto dinâmico da sucessão de espécies na comunidade de aves da M2: novas espécies, de guildas iguais àquelas de espécies perdidas pela M2, colonizam continuamente a área alterada. Espécies insetívoras de subosque e de solo compõe o perfil ecológico mais ameaçado, repetindo o mesmo padrão de grupos ecológicos mais prejudicados pela fragmentação florestal. Áreas de Mata Atlântica secundárias e exploradas por corte seletivo podem também, de fato, abrigar comunidades de aves ricas e bastante diversificadas. No entanto, uma análise multivariada evidenciou nítida diferenciação na estrutura dessas comunidades. São feitas recomendações a métodos de retirada seletiva de madeira, no sentido de serem menos danosos a comunidades de aves florestais da Mata Atlântica: (1) Manter a maior proximidade possível entre matas exploradas e matas em bom estado de conservação e não-fragmentadas; (2) Aplicar práticas exploratórias que utilizem o menor número possível de vias de acesso e que reduzam a exploração mecanizada (arraste e transporte das toras) ao estritamente necessário; (3) Estabelecer rodízio nas áreas a serem exploradasAbstract:The purpose of this study was to evaluate the effects of selective logging on a bird community in the Brazilian Atlantic forest. Two areas were selected for avian surveys, both qualitative (presence-absence) and quantitative (censuses): a non-fragmented primary forest (designated M1) and, very near to it (500 m), a selectively logged forest (designated M2). These surveys were designed to answer how selective logging affected the richness and the composition of the bird community and the abundance of the species present. During 25 months, the abundance of species with similar ecological requirements (within the same guilds) were compared and tested between M 1 and M2, to determine which ecological groups were affected. The structure of the vegetation of the sites was also measured, in arder to evaluateits influence on the composition and structure of these bird communities. Though most parameters of the vegetation structure were reduced in M2, patterns of richness and diversity of the bird communities varied little between M1 and M2. The guilds, also showed few changes between the communities studied, but in most guilds at least one member was adversely affected by the selective logging. Even though the indices of richness and diversity were not significantly different between the bird communities of M 1 and M2, important variation was seen in their composition. Dynamic processes such as colonízation and extinction might explain the marked differences detected in the composition of the bird communities, and the abundances of the bird species between the sites. The process of species colonization, detected in M2, led to the replacement of species in the guilds that lost species there due to extinction. Understory and terrestrial insectivores were the most sensitive ecological groups (with most species extinct in M2), as also observed in the process of forest fragmentation in other parts of the Neotropics. Logged and secondary forests in the Atlantic forest can harbor rich and diversified bird communities, but multivariate analysis showed that these communities differ appreciably in structure from those in virgin forest. The following procedures should be adopted to minimize adverse effects of selective logging on bird communities in the Atlantic forest:(1) Logged areas should be elose enough to unfragmented, unlogged forests to allow recolonization of some species. (2) The exploitation of the forest should be carried out using as few roads as possible, limiting the use of mechanized equipment to fell and transport the trees to that strictly necessary. (3) Areas designed for logging should be explored with long-term rotation to allow enough time for regeneration of the forestMestradoEcologiaMestre em Ciências Biológica

On the first records of Xiphorhynchus chunchotambo (Tschudi, 1844) (Dendrocolaptidae) for Brazil.

Submitted by Olímpia Resque ([email protected]) on 2010-11-16T12:40:59Z No. of bitstreams: 1 Rev Bras Ornitol v16 n1 2008 ALEIXO.pdf: 346492 bytes, checksum: c298c602ef83747948b6d9fa77e9c3ad (MD5)Approved for entry into archive by Francileila Silva([email protected]) on 2010-11-24T12:43:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Rev Bras Ornitol v16 n1 2008 ALEIXO.pdf: 346492 bytes, checksum: c298c602ef83747948b6d9fa77e9c3ad (MD5)Made available in DSpace on 2010-11-24T12:43:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rev Bras Ornitol v16 n1 2008 ALEIXO.pdf: 346492 bytes, checksum: c298c602ef83747948b6d9fa77e9c3ad (MD5) Previous issue date: 2008-03We provide here the first documented records of the Tschudi’s Woodcreeper (Xiphorhynchus chunchotambo) for Brazil, all coming from a fairly small area in the southeastern corner of the State of Acre. Several individuals were observed and tape-recorded, and nine specimens were obtained from four different localities. The contrast of those new records with the literature showed that X. chunchotambo and the Ocellated Woodcreeper (X. ocellatus) occur in eastern Acre only within about 80 km of each other, without any signs of intergradation. This finding is consistent with previous studies that showed those two taxa to be very divergent genetically and phenotypically, therefore further supporting their treatment as separate species

Biogeographic implications of new avian records from a patch of white-sand forest in southwestern Brazilian Amazonia.

Campinas constituem um tipo florestal de porte arbóreo reduzido e aspecto geral aberto, que cresce em solos arenosos e lixiviados de toda a Amazônia; apesar de sua ampla distribuição, campinas ocorrem predominantemente nas regiões do alto e médio rio Negro, no noroeste do Amazonas e sul de Roraima, incluindo também o sul da Venezuela e o sudeste da Colômbia. Existem pequenas manchas isoladas de campinas no sudoeste da Amazônia brasileira que ainda não foram estudadas sistematicamente por ornitólogos; portanto, são reportados aqui alguns resultados importantes obtidos durante uma expedição ornitológica a uma mancha de campina no extremo sudoeste do estado do Amazonas (7º22'33,2"S e 73º00'42,5"W). Foram documentados para região os primeiros registros das seguintes espécies: Hemitriccus striaticollis (Lafresnaye, 1853) (Aves, Tyrannidae) e Xenopipo atronitens Cabanis, 1847 (Aves, Pipridae); adicionalmente, foram obtidos registros com as seguintes espécies raras ou de distribuição pouco conhecida no sudoeste da Amazônia: Formicivora grisea (Boddaert, 1783) (Aves, Thamnophilidae), Conopias parvus (Pelzeln, 1868) (Aves, Tyrannidae) e Heterocercus linteatus (Strickland, 1850) (Aves, Pipridae). Como verificado em manchas de campina distribuídas por todo o norte do Peru, a avifauna de campina que ocorre no sudoeste da Amazônia brasileira é também altamente influenciada por espécies associadas à região do alto rio Negro. Entretanto, uma segunda influência biogeográfica também pôde ser notada: aquela de espécies cujo centro de distribuição está localizado nas campinas do centro e leste da Amazônia, ao sul do rio Amazonas. A avifauna das campinas do sudoeste da Amazônia ainda é pouco conhecida; futuros levantamentos de enclaves de campina nesta região podem levar a novas extensões de distribuição e também à descoberta de novos táxons

Avifauna of the Estação Ecológica do Rio Acre, state of Acre, on the Brazil/Peru border: composition, ecological distribution, and noteworthy records.

Submitted by Olímpia Resque ([email protected]) on 2011-03-03T13:19:54Z No. of bitstreams: 1 B MPEG C Nat 5(3)2010 Aleixo.pdf: 705534 bytes, checksum: 5e8644b86b18cc2e929c1fb7c3e8e062 (MD5)Approved for entry into archive by Francileila Silva([email protected]) on 2011-03-04T13:06:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 B MPEG C Nat 5(3)2010 Aleixo.pdf: 705534 bytes, checksum: 5e8644b86b18cc2e929c1fb7c3e8e062 (MD5)Made available in DSpace on 2011-03-04T13:06:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 B MPEG C Nat 5(3)2010 Aleixo.pdf: 705534 bytes, checksum: 5e8644b86b18cc2e929c1fb7c3e8e062 (MD5) Previous issue date: 2010-09Um levantamento da avifauna foi executado na Estação Ecológica do Rio Acre (ESEC Rio Acre), uma unidade de conservação remota situada na região sul do estado do Acre, na fronteira com o Peru, com a finalidade de subsidiar o seu plano de manejo. Os trabalhos de campo foram realizados nas épocas seca (agosto de 2005) e chuvosa (fevereiro de 2006), com a realização de levantamentos qualitativos (observações e gravações de vocalizações) e quantitativos, por meio da captura com redes de neblina (mist-nets). Após o acúmulo de 180 horas de observações qualitativas e cerca de 2.500 horas.rede de capturas distribuídos em 26 dias de amostragem, registrou-se 365 espécies de aves. Vários dos registros obtidos na ESEC Rio Acre são aqui discutidos em detalhes em função da sua relevância biogeográfica e para a conservação. Os resultados gerais obtidos, aliados ao registro de grandes populações de espécies de aves com alto valor cinegético, indicam que a ESEC Rio Acre encontra-se ainda em ótimo estado de conservação. Infelizmente, essa situação pode mudar rapidamente caso a expansão madeireira, atualmente em curso no lado Peruano da fronteira (em área limítrofe à unidade), seja direcionada ilegalmente para o território brasileiro

Uma nova família para o gênero monotípico Donacobius (Passeriformes, Oscines).

Submitted by Olímpia Resque ([email protected]) on 2010-11-15T21:37:15Z No. of bitstreams: 1 Rev Bras Ornitol v14 2006 ALEIXO FamilyNameDonacobius.pdf: 134378 bytes, checksum: 23a6fce3969439bc7bf009bd3e2d8774 (MD5)Approved for entry into archive by Francileila Silva([email protected]) on 2010-11-16T12:32:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Rev Bras Ornitol v14 2006 ALEIXO FamilyNameDonacobius.pdf: 134378 bytes, checksum: 23a6fce3969439bc7bf009bd3e2d8774 (MD5)Made available in DSpace on 2010-11-16T12:32:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rev Bras Ornitol v14 2006 ALEIXO FamilyNameDonacobius.pdf: 134378 bytes, checksum: 23a6fce3969439bc7bf009bd3e2d8774 (MD5) Previous issue date: 2006-06Hipóteses fi logenéticas publicadas recentemente indicam que o gênero monotípico Donacobius, de posicionamento sistemático tradicionalmente instável, não é aparentado a nenhuma das três famílias de Passeriformes Oscines onde esteve classifi cado em períodos diferentes desde o século XIX (Turdidae, Troglodytidae e Mimidae); na verdade, Donacobius constitui aparentemente uma linhagem própria, parte dos Oscines Sylvioidea do Velho Mundo. Uma vez que essas afi nidades fi logenéticas implicam um longo período de evolução independente de outras linhagens de Oscines neotropicais, propomos que o gênero Donacobius seja classifi cado numa família monotípica própria