In Medicago truncatula, water deficit modulates the transcript accumulation of components of small RNA pathways

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Small RNAs (sRNAs) are 20-24 nucleotide (nt) RNAs and are involved in plant development and response to abiotic stresses. Plants have several sRNA pathways implicated in the transcriptional and post-transcriptional silencing of gene expression. Two key enzyme families common to all pathways are the Dicer-like (DCL) proteins involved in sRNAs maturation and the Argonautes (AGOs) involved in the targeting and functional action of sRNAs. Post-transcriptional silencing mediated by AGOs may occur by cleavage or translational repression of target mRNA's, while transcriptional silencing may be controlled by DNA methylation and chromatin remodeling. Thus far, these gene families have not been characterized in legumes, nor has their involvement in adaptation to water deficit been studied.</p> <p>Results</p> <p>A bioinformatic search in <it>Medicago truncatula </it>genome databases, using <it>Arabidopsis thaliana </it>AGO and DCL cDNA and protein sequences, identified three sequences encoding for putative Dicer-like genes and twelve sequences encoding for putative Argonaute genes. Under water deficit conditions and mainly in roots, MtDCL1 and MtAGO1, two enzymes probably involved in the processing and activation of microRNAs (miRNAs), increased their transcript levels. mir162 which target DCL1 mRNA and mir168 which target AGO1 mRNA reduced their expression in the roots of plants subjected to water deficit. Three putative genes, MtDCL3, MtAGO4b and MtAGO4c probably involved in DNA methylation mechanisms, increased their mRNA levels. However, the mRNA levels of MtAGO6 reduced, which probably encodes a protein with functions similar to MtAGO4. MtAGO7 mRNA levels increased and possibly encodes a protein involved in the production of trans-acting small interfering RNAs. The transcript abundance of MtAGO12a, MtAGO12b and MtAGO12c reduced under water deprivation. Plants recovered from water deprivation reacquire the mRNA levels of the controls.</p> <p>Conclusions</p> <p>Our work demonstrates that in <it>M. truncatula </it>the transcript accumulation of the components of small RNA pathways is being modulated under water deficit. This shows that the transcriptional and post-transcriptional control of gene expression mediated by sRNAs is probably involved in plant adaptation to abiotic environmental changes. In the future this will allow the manipulation of these pathways providing a more efficient response of legumes towards water shortage.</p

A produção científica sobre o apoio pedagógico: compreensões sobre a permanência na educação superior

As políticas de expansão e ações afirmativas do ensino superior no Brasil, que resultaram não somente em número maior de estudantes nesse nível de ensino, como também na alteração do perfil desses alunos, exigiu das instituições ações abrangentes com vistas a garantir a permanência dos estudantes de graduação. A atual política de assistência estudantil para o ensino superior define o apoio pedagógico como uma de suas áreas de ação. Cabe a cada instituição, no entanto, definir como desenvolverá as ações de apoio pedagógico. Identificamos que a literatura sobre assistência estudantil e sobre o aluno universitário tem indicado que para garantir a permanência do estudante, somente acesso e apoio financeiro não são suficientes. Além das dificuldades objetivas relacionadas às condições socioeconômicas, pesquisas têm indicado que a permanência no ensino superior envolve diversos fatores, sendo assim, uma política de permanência não pode estar restrita ao aspecto financeiro. Esse trabalho analisou as publicações que abordam as ações de apoio pedagógico nas universidades federais brasileiras, com o objetivo de compreender seu alcance, a forma como essas ações são desenvolvidas e seus resultados. Foram analisados os trabalhos publicados de 2007 a 2017 nas bases de dados Scielo, Periódicos Capes, Banco de Teses Capes. Os resultados demonstram que, embora as universidades federais tenham universalizado ações de apoio pedagógico, há poucos trabalhos, nas bases consultadas, que abordam o tema. As pesquisas localizadas foram importantes para demonstrarem, em suas conclusões, a relevância de ampliar a concepção de assistência estudantil e política de permanência, e a necessidade de fortalecer a área de apoio pedagógico. São variadas as visões que representam o que é ou como deveria ser o apoio pedagógico. Em nossa revisão perceberam-se entendimentos como serviço, como acompanhamento do ensino e relação professor-aluno, como ações de tutoria, reforço, auxílios financeiros, material etc. O termo apoio pedagógico tem sido usado para nomear diferentes iniciativas nas instituições, o que justifica a necessidade de compreensão sobre o que tem sido realizado nas universidades federais dentro desse “guarda-chuva” que, aparentemente, é o&nbsp;termo. Este estudo contribui com as discussões sobre o combate à evasão, fornecendo aos profissionais envolvidos no apoio pedagógico referenciais de ação, subsidiando e sensibilizando gestores para políticas institucionais de permanência, com especial atenção para a dimensão pedagógica. Pode, ainda, contribuir para a reflexão dos gestores quanto à importância do apoio pedagógico profissionalizado e avaliado permanentemente por meio da construção de instrumentos e indicadores que irão subsidiar ações institucionais visando a qualidade da permanência, pautada por um compromisso institucional com a aprendizagem dos alunos

A INTERNACIONALIZAÇÃO DE CURITIBA: UMA ANÁLISE A PARTIR DE EQUIPAMENTOS URBANOS DE CONSUMO E LAZER

A mudança na dinâmica urbana curitibana foi responsável por reforçar a centralidade exercida pela metrópole em detrimento dos demais municípios do aglomerado metropolitano. Esse processo que ganhou força nos últimos 20 anos mantém intima relação com a reestruturação econômica imposta pela dinâmica da globalização, responsável por provocar importantes efeitos na Geografia das cidades alterando suas configurações espaciais, não só ao que tange as atividades produtivas e econômicas, como também a distribuição da população e, sobretudo os padrões deestratificação social e os estilos da vida cotidiana. Nesse contexto, Curitiba ganha novos espaços destinados ao consumo e lazer, comandados pela lógica da internacionalização, onde diversas empresas de atuação mundial passaram a integrar o mercado local. Estes novos equipamentos, comumente considerados protagonistas da expansão urbana, ao serem instalados distantes dos grandes centros, no caso curitibano apresentam uma lógica reversa, ou seja, a sua concentração predominante no município reforçou a centralidade já existente. Por sinal, essa centralidade expõe a relação indissociável entre a localização dos empreendimentos e as diretrizes do planejamento urbano que privilegiou as classes mais abastadas, “restando” aos mais desprovidos ocupar as áreas fora do interesse direto do capital especulativo

Ontogenetic variations in the venom proteome of the Amazonian snake Bothrops atrox

BACKGROUND: Bothrops atrox is responsible for the majority of snakebite accidents in the Brazilian Amazon region. Previous studies have demonstrated that the biological and pharmacological activities of B. atrox venom alter with the age of the animal. Here, we present a comparative proteome analysis of B. atrox venom collected from specimens of three different stages of maturation: juveniles, sub-adults and adults. RESULTS: Optimized conditions for two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) of pooled venom samples were achieved using immobilized pH gradient (IPG) gels of non-linear 3–10 pH range during the isoelectric focusing step and 10–20% gradient polyacrylamide gels in the second dimension. Software-assisted analysis of the 2-DE gels images demonstrated differences in the number and intensity of spots in juvenile, sub-adult and adult venoms. Although peptide mass fingerprinting (PMF) failed to identify even a minor fraction of spots, it allowed us to group spots that displayed similar peptide maps. The spots were subjected to a combination of tandem mass spectrometry and Mascot and MS BLAST database searches that identified several classes of proteins, including metalloproteinases, serine proteinases, lectins, phospholipases A(2), L-amino oxidases, nerve growth factors, vascular endothelial growth factors and cysteine-rich secretory proteins. CONCLUSION: The analysis of B. atrox samples from specimens of different ages by 2-DE and mass spectrometry suggested that venom proteome alters upon ontogenetic development. We identified stage specific and differentially expressed polypeptides that may be responsible for the activities of the venom in each developmental stage. The results provide insight into the molecular basis of the relation between symptomatology of snakebite accidents in humans and the venom composition. Our findings underscore the importance of the use of venoms from individual specimen at various stages of maturation for the production of antivenoms

Development of a new class of stable and adaptable free-standing fibre mats with high room-temperature hydroxide-ion conductivity.

For alkaline anion-exchange membrane electrolysers and fuel cells to become a technological reality, hydroxide-ion (OH-) conducting membranes that are flexible, robust, affording high OH- conductivity, and synthesised in a low-cost and scalable way must be developed. In this paper, we engineer a stable, self-supporting, and flexible fibre mat using a low-cost ZIF-8 metal-organic framework composited with ionic liquid tetrabutylammonium hydroxide and widely used polyacrylonitrile as polymeric backbone. We obtain mats with a high intrinsic OH- conductivity for a metal-organic framework-based material already at room temperature, without added ion-conductor polymers. This approach will contribute to the development of low-cost and tuneable ion-conducting membranes

Haptoglobin Phenotype, Preeclampsia Risk and the Efficacy of Vitamin C and E Supplementation to Prevent Preeclampsia in a Racially Diverse Population

Haptoglobin's (Hp) antioxidant and pro-angiogenic properties differ between the 1-1, 2-1, and 2-2 phenotypes. Hp phenotype affects cardiovascular disease risk and treatment response to antioxidant vitamins in some non-pregnant populations. We previously demonstrated that preeclampsia risk was doubled in white Hp 2-1 women, compared to Hp 1-1 women. Our objectives were to determine whether we could reproduce this finding in a larger cohort, and to determine whether Hp phenotype influences lack of efficacy of antioxidant vitamins in preventing preeclampsia and serious complications of pregnancy-associated hypertension (PAH). This is a secondary analysis of a randomized controlled trial in which 10,154 low-risk women received daily vitamin C and E, or placebo, from 9-16 weeks gestation until delivery. Hp phenotype was determined in the study prediction cohort (n = 2,393) and a case-control cohort (703 cases, 1,406 controls). The primary outcome was severe PAH, or mild or severe PAH with elevated liver enzymes, elevated serum creatinine, thrombocytopenia, eclampsia, fetal growth restriction, medically indicated preterm birth or perinatal death. Preeclampsia was a secondary outcome. Odds ratios were estimated by logistic regression. Sampling weights were used to reduce bias from an overrepresentation of women with preeclampsia or the primary outcome. There was no relationship between Hp phenotype and the primary outcome or preeclampsia in Hispanic, white/other or black women. Vitamin supplementation did not reduce the risk of the primary outcome or preeclampsia in women of any phenotype. Supplementation increased preeclampsia risk (odds ratio 3.30; 95% confidence interval 1.61-6.82, p<0.01) in Hispanic Hp 2-2 women. Hp phenotype does not influence preeclampsia risk, or identify a subset of women who may benefit from vitamin C and E supplementation to prevent preeclampsia