Caracterización y aplicación de bacteriófagos líticos en salmonella enterica utilizando un modelo in vitro

Salmonella enterica es uno de los patógenos trasmitidos por alimentos más comunes a nivel mundial y se conocen más de 2500 serovares, sin embargo solo algunos de éstos son responsables por la mayoría de los casos de salmonelosis en humanos. En México este patógeno ha sido reportado en diferentes fuentes, incluyendo carne y vegetales. También la emergencia de aislamientos resistente a múltiples fármacos (MDR) principalmente de S. enterica serovar Typhimurium constituyen una preocupación para la Salud Pública. Una alternativa para lidiar con esto, es el uso de bacteriófagos cuyo potencial ha sido evaluado en años recientes. Los bacteriófagos son virus capaces de lisar diferentes bacterias y aunque generalmente se limitan a ciertas cepas o serovares también hay aquéllos que son capaces de lisar más de un serovar o bacteria de diferente especie y género. El objetivo de este estudio fue aislar, seleccionar y caracterizar bacteriófagos líticos como agentes de control de aislamientos regionales de Salmonella MDR. Un total de 243 aislamientos de S. enterica de diversas fuentes y de dos entidades federativas fueron evaluados en cuanto a su susceptibilidad a diferentes antimicrobianos mediante la prueba de difusión en disco con especial énfasis en antibióticos β-lactámicos y quinolonas, así mismo, se buscaron algunos genes de resistencia antimicrobiana mediante PCR. Para la detección de los bacteriófagos se emplearon aguas residuales obtenidas de ríos en el Estado de México, las cuales fueron sometidas a filtración y enriquecimiento con serovares de S. enterica multirresistentes a los antibióticos con el fin de encontrar bacteriófagos líticos. xii Se encontró una resistencia antimicrobiana para la tetraciclina (TET) del 41.6%, seguido de la ampicilina (AMP) (21.7%), ácido nalidixico (NAL) (21.8%), gentamicina (GEN) (9%), cefotaxina (CTX), ceftazidima (CAZ) y cefoxitina (FOX) (6.6%), mientras que los niveles más bajos de resistencia se observaron para la amikacina (AK) (0.8%). En el caso del ciprofloxacino (CIP), sólo se encontró susceptibilidad intermedia (1.2%). Se realizó una caracterización adicional de 16 aislamientos resistentes a múltiples fármacos. Un total de 10 patrones de MDR fueron identificados, el patrón predominante fue CTX-CAZ-FOXAMP- NA-GEN-TET. La prueba de PCR detectó el gen blaCMY en todos los aislamientos MDR, también se encontró en tres aislamientos la co-presencia con genes blaTEM. Ninguno de los aislamientos fue para positivo para los genes qnr. La relación genética entre los 16 aislamientos MDR mostró que los aislamientos del Estado de México mostraron un índice de similitud mayor en comparación con los aislamientos del Estado de Jalisco. Un bacteriófago, PHA17, fue seleccionado para posterior caracterización. El PHA17 fue capaz de lisar al menos 42% de la colección empleada (219 aislamientos), incluyendo aislamientos de Salmonella Typhi y no tipificables. Otra característica sobresaliente fue la capacidad de lisar aislamientos MDR (de los 16 aislamientos, 13 fueron susceptibles al fago PHA17). En cuanto a la supervivencia de PHA17 a diferentes condiciones de temperatura y de pH revelaron que fue estable a 42°C y 60°C por 24 h, mientras que para el pH fue estable entre pH 4.0 y pH 7.0 por al menos 3 h. Los resultados sugieren que este bacteriófago podría ser empleado como una forma de control de Salmonella spp. con diferentes propósitos (inocuidad alimentaria, aplicaciones clínicas, entre otros), sin embargo se necesita una caracterización genética más exhaustiva

Resistencia a β-lactámicos y quinolonas en aislamientos de escherichia coli obtenidos de canales de bovinos en el estado de México y Jalisco

Las enfermedades transmitidas por alimentos (ETAs), especialmente por alimentos de origen animal son un problema vigente que afecta a la población humana. Los microorganismos patógenos responsables de estas enfermedades han desarrollado una gran variedad de mecanismos de resistencia a los antibióticos, entre ellos, destacan las β-lactamasas de espectro extendido (ESBLs), las β-lactamasas AmpC plasmídicas (pAmpC) y la resistencia a quinolonas mediada por plásmidos (PMQR), capaces de diseminarse por medio de elementos genéticos móviles (EGM) como los plásmidos e integrones y de otorgar resistencia a los antibióticos β-lactámicos y quinolonas, los cuales son ampliamanete utilizados para tratar infecciones bacterianas. El objetivo de este estudio fue determinar la resistencia antimicribiana de 155 aislamientos de Escherichia coli obtenidos de canales de bovino en dos entidades federativas de México (Estado de México y Jalisco). La identificación de los aislamientos se realizó por medio de pruebas bioquímicas y agar MacConkey y se corroboraron mediante una prueba de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para detectar el gen uidA, el cual es específico para esta especie. Los aislamientos fueron desafiados con antimicrobianos β-lactámicos (ampicilina, ceftazidima y cefotaxima) y quinolonas (ácido nalidíxico y ciprofloxacino). Se determinó la presencia de genes blaTEM, blaSHV, blaCTX-M, blaOXA, blaCMY, blaMOX, blaLAT, blaBIL, qnrA, qnrB, qnrS, aac(6´)-Ib-cr y qepA mediante PCR. La relación genética de los aislamientos fue determinada mediante electroforesis en gel de campos pulsados (PFGE). Se observó resistencia para ácido nalidíxico (64%), seguida de la ampicilina (32%), ciprofloxacino (10%), ceftazidima y cefotaxima (ambos 1.3%). Los genes que se detectaron fueron: blaCMY (n=1), blaTEM (n=24), qnrB (n=11) y qnrS (n=7). El análisis de los geles de PFGE mostró que la mayoría de los aislamientos tienen un perfil genotípico diferente, a excepción de dos aislamientos que presentaron un perfil similar. Este es el primer reporte de la presencia de los genes qnrB, qnrS y blaCMY en aislamientos de Escherichia coli obtenidos de carne de bovino en México. El estudio realizado en esta tesis pone en evidencia la presencia de aislamientos de E. coli portadores de mecanismos de resistencia transmitidos por plásmidos en productos cárnicos y su probable diseminación en la cadena alimenticia, lo cual constituye un riesgo para la Salud Pública

Serotypes, virulence genes profiles and antimicrobial resistance patterns of Escherichia coli recovered from feces of healthy lambs in Mexico

Articulo que habla de la resistencia a los antibióticos en corderosHealthy lambs are one of the major reservoirs of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) and it is known as the cause of foodborne diseases (FBD). The work objective is to characterize (STEC) isolates obtained from rectal swabs of healthy lambs herds, a total of 183 samples were obtained from sheep production units of the State of Mexico. E. coli isolates were confirmed through the amplification of the uid A gene. antimicrobial sensitivity pattern was determined through Kirby-Bauer (CLSI, 2012) test and the presence stx1, stx2 and eae genes from isolates by multiplex PCR. Serotyping was performed using specific anti-O and anti-H sera (SERUNAM, Mexico) for 185 Somatic and 56 flagellar antigens. 126 isolates biochemically and molecularly identified as E. coli were obtained, of which 80 did not express any virulence factor and 46 expressed at least some (STEC) virulence factor. The highest percentage of E. coli resistance was for tetracycline 48.7% (39/80), followed by nalidixic acid 13.7% (11/80), gentamicin 6.2% (5/80) and Ciprofloxacin 3.7% (3/80). Resistance to amikacin, cefotaxime and ceftazidime were not detected. A frequency of 46 STEC isolates (36.2%) were obtained, of which 28/46 (22.0%) expressed stx1, stx2 3/46 (6.5%), stx1, stx2 13/46 (10.2%) and eae 2/46 (1.6%). Thirty different serotypes were obtained. The three serotypes with the highest number of isolates (four each) were: O76:H19, O118:H27 and O146:H21 which have been identified as a cause of diarrhea in human population. An isolate of serogroup O104 was obtained, with a significant importance for European public health. In virtue of the discovered serotypes and the virulence factors distribution, we can affirm that the obtained isolates from lambs in the State of Mexico are classifiable as atypical STEC of low virulence

Phenotypic and genotypic profile of clinical and animal multidrug-resistant Salmonella enterica isolates from Mexico

Descripción de Salmonella enterica multirresistenteAims: The objective of this study was to obtain a phenotypic and genotypic profile of Salmonella enterica including multidrug-resistant (MDR) isolates from food-producing animals and clinical isolates, as well as their genetic relatedness in two different States of Mexico (Jalisco and State of Mexico). Methods and Results: A total of 243 isolates were evaluated in terms of antimicrobial resistance (AMR) and related genes through a disk diffusion method and PCR respectively; we found 16 MDR isolates, all of them harbouring the blaCMY gene but not qnr genes, these isolates represent less than 10% of the collection. The pulsed-field gel electrophoresis revealed a higher genotypic similitude within isolates of State of Mexico than Jalisco. Conclusions: A low percentage of Salmonella isolates were resistant to relevant antibiotics in human health, nevertheless, the AMR and involved genes were similar despite the different serovars and origin of the isolates. Significance and Impact of the Study: This investigation rovided an insight of the current status of AMR of Salmonella isolates in two States of Mexico and pinpoint the genes involved in AMR and their epidemiological relationship, the information could help to determine an adequate therapy in human and eterinary medicine

Asfixia mecánica traumática por ahorcamiento en un león africano (Phantera leo leo). ¿Un caso de crueldad y maltrato animal negligente?

Se estudió el cadáver de un león africano (Phantera leo leo), juvenil macho de aproximadamente 120 kilos para establecer la causa de muerte del animal en su contexto legal. Se realizó el estudio posmortem bajo el proceso de establecido de diagnóstico patológico y con orientación forense. Los hallazgos del cadáver se documentaron en el protocolo de necropsia, archivo digital del estudio caso y el dictamen judicial pericial legal. Los resultados del estudio zoo métrico (cm) del cadáver fueron: de la base a la punta de la oreja 7.6; circunferencia craneal entre articulación temporo-maxilar derecha e izquierda 36; longitud corporal de la base del cráneo a la base de la cola 83.7 y de la base a la punta de la cola 62; de la punta de la nariz a la punta de la cola de 182; perímetro torácico 107; de la región de la cruz a la base plantar del miembro anterior 67. La condición corporal del cadáver fue buena, la reserva corporal grasa en diferentes regiones corporales se observó entre I y II grados. Capa de pelo sucia con restos de lodo, arena y grava fina; petequias en conjuntiva y hemorragia ocular bilateral; cianosis gingival y lingual, presencia de líquido sero sanguinolento, hematomas multifocales de 1 a 2 cm, y edema de la lengua. En la superficie plantar del miembro anterior derecho abrasión del cojinete plantar. En tejido subcutáneo se observó un hematoma extenso localizado en la región craneal y porción dorsal cervical e infiltración serosa sanguinolenta de origen edematoso. Hematomas localizados en las regiones: pectoral y subescapular. Congestión marcada de la pleura parietal y el pulmón. Ausencia de contenido gástrico, intestinal y cecal. En riñón se apreció marcada congestión renal. Los estudios toxicológicos de las muestras obtenidas del cadáver resultaron negativos. Se concluyó que la muerte del león africano fue ocasionada por una asfixia traumática por ahorcamiento al realizar una contención física inadecuada del animal, asociada al maltrato negligente y crueldad animal