4 research outputs found
R. rugosa์์ gaegurin 4 ์ ์ ์์ ํด๋ก๋๊ณผ ํ๋ก๋ชจํฐ ํ์ฑ์ ๊ดํ ์ฐ๊ตฌ
ํ์๋
ผ๋ฌธ(์์ฌ)--์์ธ๋ํ๊ต ๋ํ์ :ํ๋๊ณผ์ ์ ์ ๊ณตํ์ ๊ณต,1999.Maste
RNAi ๊ธฐ์ ์ ์ด์ฉํ ์ดํ๋ฆฌ ์ ๋ ๋๋จ๋ฐฑ์ง BthD ์ ์ฅ SelH์ ์ ์ ์์ ๊ธฐ๋ฅ ์ฐ๊ตฌ
Thesis (doctoral)--์์ธ๋ํ๊ต ๋ํ์ :ํ๋๊ณผ์ ์ ์ ๊ณตํ์ ๊ณต,2003.Docto
Analysis of Y Chromosomal STR Profiles in Mixed DNA using Next Generation Sequencing
Dept. of Medical Science/๋ฐ์ฌ๋ฒ์์ ์ ํ ๋ถ์ผ์์ ํผํฉ์๋ฃ์ ๋ํ ์ ์ ์๋ถ์์ ๊พธ์คํ ์ฐ๊ตฌ๋์ด ์์ผ๋ ์ฌ์ ํ ๋์ ์ด ๋ง์ ์์ญ์ด๋ค. ํ์ฌ ํผํฉ ์๋ฃ์ ์ ์ ์ ๋ถ์์ ์งง์ ์ฐ์๋ฐ๋ณต(Short tandem repeat, STR)์ ์คํฉํจ์์ฐ์๋ฐ์ ํ ๋ชจ์ธ๊ด ์ ๊ธฐ์๋(Capillary electrophoresis, CE) ๋ถ์์ ํตํด ๊ด์ฐฐ๋ peak์ ์, peak์ ์๋์ ๋์ด์ ๋ํ ์ ๋ณด๋ฅผ ๋ฐํ์ผ๋ก ํ๊ณ ์์ผ๋ CE ๊ธฐ๋ฒ์ ํน์ฑ์ ๋ฐ๋ฅธ ํ๊ณ๊ฐ ์๋ค. ๋์ฉ๋ ์ผ๊ธฐ์์ด์ ์ ๊ณตํ๋ ์ฐจ์ธ๋์ผ๊ธฐ์์ด ๋ถ์๋ฒ(Next Generation Sequencing; NGS)์ ๋ฑ์ฅ์ผ๋ก ๋ฒ์์ ์ ํ ์์ญ์์ CE ํ๊ณ์ ์ ์ด๋ ์ ๋ ๋ณด์ํ๋ฉฐ ํผํฉ ์๋ฃ ๋ถ์์์ ํ์ฉ ๋ ๊ฒ์ผ๋ก ๊ธฐ๋๋๊ณ ์๋ค. ๊ทธ๋ฌ๋ ํ์ฌ๊น์ง ํผํฉ ์๋ฃ ๋ถ์์ NGS ๊ธฐ๋ฒ์ ์ด์ฉํ๋ ๊ฒ์ด ์ค์ ๋ก ์ ์ฉํ์ง์ ๋ํ ์ฐ๊ตฌ๋ ๋ณด๊ณ ๋ ๋ฐ๊ฐ ์์ผ๋ฉฐ NGS ๊ธฐ๋ฒ์ ์ด์ฉํ๊ธฐ ์ํ ์ฒด๊ณ ๋ฐ ๊ธฐ์ค์ด ํ์ํ๋ค.
์ด๋ฌํ ๋ชฉ์ ์ ์ํด์ ๋ณธ ์ฐ๊ตฌ์์๋ PowerPlexยฎ Y23์ Y ์ผ์์ฒด ์งง์ ์ฐ์๋ฐ๋ณต(Y chromosomal short tandem repeat, Y-STR) ํ์ง์ ๋ฐ 1๊ฐ Y ์ผ์์ฒด ๋จ์ผ ์ผ๊ธฐ ๋คํ์ฑ(Y chromosome single nucleotide polymorphism, Y-SNP) ์ ๋์์ผ๋ก ํ๋ NGS ๋ถ์์ฉ ๋ค์ค ์คํฉํจ์์ฐ์๋ฐ์ ์ฒด๊ณ๋ฅผ ๋ฐํ์ผ๋ก ํ๊ตญ์ธ ๋จ์ฑ ํผํฉ์๋ฃ๋ฅผ ์ด์ฉํ์ฌ NGS ๊ธฐ๋ฒ์ ์ ์ฉ์ฑ์ ํ๊ฐํด ๋ณด์๋ค. ๋ ๋ช
์ ํ๊ตญ์ธ ๋จ์ฑ ํผํฉ ์๋ฃ๋ฅผ 15๊ฐ์ง์ ๋น์จ๋ก 11๊ฐ ์ธํธ๋ฅผ ์ ์กฐํ์์ผ๋ฉฐ 20๋ช
์ ํ๊ตญ์ธ ๋จ์ฑ ๋จ์ผ ์๋ฃ๋ฅผ ํฌํจํ์ฌ NGS๋ฅผ ์ํํ์๋ค. ํ๊ตญ์ธ ๋จ์ฑ ๋จ์ผ ์๋ฃ๋ก ํ๋ํ NGS ์๋ฃ ๋ถ์์ ํตํด stutter ๋น์จ ๋ฐ ๋
ธ์ด์ฆ ๋น์จ์ ์กฐ์ฌํ์๋ค. ์กฐ์ฌ๋ ๋
ธ์ด์ฆ ๋ฐ stutter ๋น์จ์ ๋ถ์ฐ๋ฌผ ๋ฆฌ๋๋ฅผ ์ ๊ฑฐํ๊ธฐ ์ํ ๋ถ์์ ํ๊ณ์น ๋น์จ ๋ฐ ํด์์ ํ๊ณ์น ๋น์จ๋ก ๋์
ํ์์ผ๋ฉฐ, ์ด๋ฅผ ์ด์ฉํ์ฌ ํผํฉ ์๋ฃ์ ๋๋ฆฝ์ ์ ์ํ์ ๊ฒฐ์ ํ์๋ค.
๋ฐ๋ผ์ ๋ณธ ์ฐ๊ตฌ์์๋ NGS ๊ธฐ๋ฐ Y-STR ์ฒด๊ณ์์ ํผํฉ ์๋ฃ ๋ถ์์ ํ์ํ ํ๊ณ์น ๋น์จ์ด ์ ์๋์๋ค. ๋ํ ํผํฉ ์๋ฃ ๋ด ๋ฏธ๋ ์๋ฃ ๋ถ์์ ์์ด ๊ฐ Y-STR์ ๋ฏผ๊ฐ๋๊ฐ ๋ค๋ฆ์ ํ์ธ ํ์๊ณ ๋๋ถ๋ถ์ Y-STR์ 1:14์ ํผํฉ ๋น์จ๊น์ง ๋ ์๋ฃ์ ๋๋ฆฝ์ ์ ์ํ ๊ฒฐ์ ์ด ๊ฐ๋ฅํ์๋ค. ๊ทธ๋ฌ๋ NGS ๋ฆฌ๋ ์๋ฅผ ์ด์ฉํ ํผํฉ ๋น์จ ์ถ์ ์๋ ํ๊ณ๊ฐ ์์๊ณ , PCR์ด ์๋ฐ ๋ STR์ NGS ๋ถ์์์๋ STR์ stutter ์์ฑ๊ณผ ๋ฏธ๋ ์๋ฃ ์ฆํญ์์์ ํ๋ฅ ์ ํจ๊ณผ์ ๋ฐ๋ฅธ ์ํฅ์ ๊ณ ๋ คํ์ฌ NGS ์๋ฃ๋ฅผ ํด์ํด์ผ ํจ์ ์ ์ ์์๋ค.
๋ณธ ์ฐ๊ตฌ๋ฅผ ํตํ์ฌ NGS๋ฅผ ์ด์ฉํ ํผํฉ ์๋ฃ ๋ถ์์ ๋ํ ๊ธฐ์ด ์๋ฃ ๋ฐ ์ง์นจ์ ์ ์ํ์ฌ NGS ๋ถ์์ ํผํฉ ์๋ฃ ๋ถ์ ์ ์ฉ์ ๋ํ ๊ฐ๋ฅ์ฑ์ ๋ณด์ฌ์ฃผ์๋ค๊ณ ์๊ฐํ๋ค. ๋์๊ฐ ๋ฒ์ํ ์ค๋ฌด์์ ์ ํ ์ ์๋ ํผํฉ ์๋ฃ ๋ถ์์ ์ ์ฉํ๊ฒ ์ ์ฉํ ์ ์์ ๊ฒ์ผ๋ก ๊ธฐ๋๋๋ค.ope